Introduccin al

metabolismo
Metabolismo
La suma de todas las transformaciones
qumicas que ocurren en una clula u
organismo, las cuales se llevan cabo en
una serie de reacciones consecutivas
catalizadas por enzimas que constituyen
las vas metablicas.
El proceso global a travs del cual los
sistemas vivos adquieren y utilizan la
energa libre que se necesita para realizar
sus funciones.
Estado estacionario
Los organismos vivos no estn en
equilibrio. Sino que requieren de un influjo
continuo de energa para mantener el orden
en un universo inclinado al desorden
mximo.
Esto se realiza acoplando las reacciones
exergnicas de la oxidacin de los
nutrimentos a los procesos endergnicos
requeridos para mantener el estado vivo
como la realizacin del trabajo mecnico, el
transporte activo y la biosntesis de
molculas complejas.
Cmo obtienen los organismos vivos la
energa?
Los fottrofos (plantas y ciertas bacterias)
adquieren la energa del sol a travs de la
fotosntesis, en el cual la luz impulsa un
proceso endergnico entre el CO
2
y el H
2
O
para formar carbohidratos.
Los quimitrofos obtienen su energa por la
oxidacin de compuestos orgnicos
(carbohidratos, lpidos y protenas)
obtenidos de otros organismos, en ltima
instancia, fottrofos.
Vas metablicas
Cada uno de los pasos en una va
metablica produce un cambio qumico
especfico y pequeo, generalmente es
la remocin, transferencia o adicin de
un tomo especfico, grupo funcional o
molcula.
En esta secuencia de pasos (la va), un
precursor es convertido en un producto
a travs de una serie de intermediarios
metablicos (metabolitos).
Etapas en la extraccin de energa de los
alimentos (degradacin de nutrimentos)
1. Las grandes molculas de alimentos
se hidrolizan en unidas pequeas o
bloques constructores. Protenas a
aminocidos, polisacridos a glucosa.
No se genera energa til.
2. Estos bloques se degradan a una
unidad simple que juega un papel
central en el metabolismo (unidad
acetilo en forma de acetil-CoA). Se
genera una pequea cantidad de ATP en
esta etapa comparado con el obtenido
de la oxidacin completa de la unidad
acetilo de acetil-CoA.
3. Consiste del ciclo del cido ctrico y de la
fosforilacin oxidante que son las vas finales
comunes de la oxidacin de molculas de
combustible. La acetil-CoA introduce las
unidades de acetilo al ciclo del cido ctrico,
donde se oxidan a CO
2.
Se transfieren 4 pares de e
-
por cada grupo
acetilo oxidado. El ATP se sintetiza cuando los
electrones fluyen hasta el O
2
. Ms del 90 % del
ATP producido por la degradacin de los
nutrimentos se produce en esta etapa.
DIFERENCIAS ENTRE VIAS CATABOLICAS Y
ANABOLICAS
1. La va involucrada en la degradacin de una
biomolcula puede ser energticamente
imposible para su biosntesis.
2. Las dos vas deben regularse
independientemente.
3. En algunos casos las dos vas toman lugar
en diferentes partes de la clula.
Regulacin de vas metablicas
1. Actividad enzimtica
2. Concentracin de enzimas.
3. Regulacin hormonal.
4. Disponibilidad de sustrato.
a) Regulacin alostrica
b) Regulacin covalente
Caractersticas de las vas
metablicas
Irreversibles.
Tienen un paso comprometido.
Estn reguladas.
Se llevan a cabo en sitios celulares
especficos.
Reacciones limitadas por enzimas
(lejos del equilibrio)
Reacciones limitadas por sustratos
(en o cerca del equilibrio)
La energa libre es la que puede hacer trabajo durante
una reaccin a presin y temperatura constantes.
El G
o
es el cambio de energa libre estndar (cuando
la concentracin de cada componente es 1 M, el pH es
7.0 y la temperatura 298 K).
Ejercicio 1. Clculo de Gcon una
constante de equilibrio
Calcule los cambios de energa libre estndar de
las siguientes reacciones catalizadas por enzimas
metablicamente importantes a 25C y pH 7.0,
utilizando las constantes de equilibrio dadas.
Ejercicio 2. Clculo de la constante de
equilibrio del G
Calcule las constantes de equilibrio Keq para cada
una de las siguientes reacciones a pH 7.0 y 25 C,
usando los valores de Gde la tabla 13-4.
El G es el cambio de energa libre en
condiciones celulares. El G
o
es un valor
caracterstico y constante de cada reaccin,
pero el G de una reaccin qumica dada es
una funcin de la concentracin y de la
temperatura que prevalecen en la reaccin y
que no son necesariamente las estndar.
Ejercicio 3. Diferencia entre Gy G
Considere la siguiente interconversin, que
ocurre en la gliclisis:
Fructosa 6-fosfato glucosa 6-fosfato
Keq=1.97
a) Cul es el Gpara la reaccin (a 25C)?
b) Si la concentracin de la fructosa 6-fosfato es
ajustada a 1.5 M y la de la glucosa 6-fosfato a
0.50 M Cul es el G?
c) Por qu Gy G son diferentes?
Ejercicio 4. G para reacciones
acopladas
La glucosa 1-fosfato se convierte en fructosa 6-
fosfato en dos reacciones sucesivas:
Glucosa 1-fosfato Glucosa 6-fosfato
Glucosa 6-fosfato Fructosa 6-fosfato
Usando los valores de la tabla 13-4, calcule la Keq
para la suma de las dos reacciones a 25C.
Glucosa 1-fosfato Fructosa 6-fosfato
(phosphoenolpyruvate)
Nuclesido difosfato cinasa
(difosfocinasa)
NTP+NDP NDP+NTP
Nuclesido monofosfato cinasa
ATP+NMP ADP+NDP
Adenilato cinasa (miocinasa)
ATP+AMP ADP+ADP
Oxidaciones Biolgicas
Transferencia de electrones:
-Directamente como electrones.
-Como tomos de hidrgeno.
-Como iones hidruro.
-A travs de la combinacin directa con
el oxgeno.
Oxidacin
Ganancia de oxgeno:
C + O
2
CO
2
(el carbono es oxidado a dixido
de carbono)
Prdida de electrones:
Na Na
+
+ e
-
(el tomo de sodio es oxidado al
in sodio)
O
2
.-
O
2
+ e
-
(el radical superxido es
oxidado a oxgeno)
Reduccin
Prdida de oxgeno:
CO
2
+ C 2CO (El CO
2
es reducido a
monxido de carbono; el C es oxidado a CO).
Ganancia de hidrgeno:
C + 2H
2
CH
4
(el carbono es reducido a
metano).
Reduccin
Ganancia de electrones:
Cl + e
-
Cl
-
(El tomo de cloro es reducido
al in cloro).
O
2
+ e
-
O
2
-
(El oxgeno es reducido al
radical superxido).
Relacin entre G y E
G = energa libre
n = nmero de electrones transferidos en la reaccin
F = constante de Faraday (96.48 kJ/ V mol)
E= potencial de reduccin
G = - nF E
G= - nF E
Ejercicio 5. Potencial estndar de
reduccin
El potencial estndar de reduccin, E, de cualquier
par redox est definido por la reaccin de semicelda:
Agente oxidante + n electrones agente reductor
Los valores de E para los pares conjugados de
NAD
+
/NADH y piruvato/lactato son -0.32 V y -0.19 V,
respectivamente.
a) Cul par conjugado tiene mayor tendencia a perder
electrones? Explique.
b) Cul es el agente oxidante ms fuerte? Explique.
Ejercicio 6. Potenciales estndar de
reduccin
c) Iniciando con concentraciones 1.0 M de cada
reactivo y producto a pH 7.0 En qu direccin
proceder la siguiente reaccin?
Piruvato + NADH + H
+
Lactato + NAD
+
E
NAD+/NADH
= -0.32 V E
piruvato/lactato
= -0.185
V
d) Cul el G a 25 C para la conversin de
piruvato a lactato?
e) Cul es la Keq para esta reaccin?
Ejercicio 7. Afinidad electrnica de
los compuestos
Ordena las siguientes sustancias (en orden
decreciente) en cuanto a su tendencia a aceptar
electrones.
a) -cetoglutarato + CO
2
(formando isocitrato)
b) oxaloacetato
c) O
2
d) NADP
+
Ecuacin de Nernst
E
0
= Potencial en condiciones estndar.
R = Constante de los gases.
T = Temperatura absoluta (escala Kelvin).
n = Cantidad de moles de electrones que participan en la
reaccin.
F = Constante de Faraday (aproximadamente 96500 C/mol).
Q = Cociente de reaccin:
As para la reaccin a A + b B c C + d D, la expresin de Q
es:
Anillo de isoaloxazina