Fig.1. Calidad de los cidos nucleicos de cada ADN prueba
Tabla1. Cantidad de los cidos nucleicos de cada ADN prueba ADN vegetal animal Escherichia coli MIX Concentracin(ng/l) 1130 870 pureza 7.53 1.824
Discusin de resultados En caso del ADN vegetal se observa que el ADN genmico se encuentra totalmente degradado ya que se observa la formacin de una columna: barras continuas de cada peso molecular. Adems la intensidad del ADN es proporcional con la cantidad de ADN que se carga en cada pocillo. En caso de plantas como las ccadas es difcil extraer y purificar ADN de buena calidad debido a la pre- sencia adems de los polisacridos, de grandes cantidades de metabolitos secundarios, protenas as como taninos, alcaloides y polifenoles. Estos compuestos interfieren al precipitar junto con el ADN, por lo tanto degradan su calidad y reducen su rendimiento (Katterman and Shattuck, 1983). El mtodo ms comn de purificacin de DNA es extrayendo la preparacin con fenol para remover la protena contaminante. El fenol tiene una absorcin mxima a 270nm. Las preparaciones que contienen residuos de fenol pueden dar lecturas artificiales altas a A260 y la concentracin de DNA ser sobrestimada. Esto puede explicar tambin en valor de A260 /A280 =7.53, ya que por ser un tejido vegetal presenta una gran cantidad de fenoles. Esto segn Sanchez, 2012, puede revertirse usando NaCl al inicio de la extraccin que facilita la lisis celular y optimiza la extraccin de ADN por la liberacin de los materiales nucleares y la precipitacin de los polisacridos, lo que mejora la calidad del extracto y por lo tanto, de los productos de amplificacin. El alto valor de esta relacin tambin puede ser explicado por la gran cantidad de sales que ocasiono la precipitacin del ADN, lo que peritio posiblemente q la gran cantidad de fenoles degrade la muestra de ADN genmico. Respecto al ADN de Escherichia coli se observa que si hay ADN genmico no degradado por las presencia de una sola barra en la parte superior del gel. Adems se observa la presencia de ARN degradado en la parte inferior de hasta 200pb. Este es debido posiblemente a que el ARN, a diferencia de ADN, es un material inestable y por tanto se observa tanto ARNm, ARNt como ARNr degradado por un inadecuado almacenamiento. Respecto a ADN de las bacterias extradas del suelo, se observa que al igual que la Escherichia coli presenta ADN genmico y ARN degradado. Pero a diferencia de la Escherichia coli, la intensidad del ADN es mucho menor. Por tanto la concentracin de ADN es menor que la de Eschericia coli Respecto al ADN animal, se observa ADN genmico y que la concentracin de ADN es abundante debido a que la carga de ADN puesto en los pocillos lo sobrepasa lo que se observa en pocillo de 3 l es porque no se puso toda la carga en el pozo, por tanto el ADN no atraves el gel y corri a travs de la superficie del gel
Conclusiones La degradacin de ADN vegetal es debido a la gran cantidad de sales como fenoles presentes en la muestra. El alto valor de esta relacin A260/A280 >2 tambin es explicado por la gran cantidad de sales as como la de fenoles. Es necesario saber la concentracin de ADN para evitar una sobrecarga en los pozos de gel de electroforesis. El ADN genmico de microorganismos del suelo a pesar que es ms abundante presenta una menor concentracin de ADN g de una sola especie de bacteria E El ADN genmico de microorganismos del suelo debe tener un mtodo de extraccin especial para la bacteria predominante en el suelo para mejorar la extraccin de cidos nucleicos. El uso de ARNasas es importante para evitar la contaminacin y obtener una medicin de las absorbancias ms fidedigno. El ADNg de las gnadas masculinas de la concha de abanico es abundante por la gran cantidad de clulas presentes en el tejido
Bibliografia
Nadia Guadalupe Snchez-Coello,2012, OPTIMIZACIN DE UN PROTOCOLO DEL AISLAMIENTO DEL ADN Y DE UN SISTEMA DE AMPLIFICACIN ISSR-PCR PARA Ceratozamia mexicana Brongn. (Zamiaceae). http://www.ibt.unam.mx/sintesis/cuantificacion.html http://biomodel.uah.es/an/plasmido/0/probl.htm