Mecansmos

Epigenticos
Maestra en Ciencias Bioqumicas Victor M. del Castillo Falconi
La asociacin entre la
estructura y su funcin
Las enjuntas de San Marcos y El paradigma panglossiano
Steven G. Gould
Qu es a lo que debemos
poner atencin?
Qu es a lo que debemos
poner atencin?
Silenciamiento Gnico
Qu es a lo que debemos
poner atencin?
Represin Gnica
Qu es a lo que debemos
poner atencin?
Activacin Gnica
Metilacin del DNA
Uno de los primeros mecanismos estudiados en epigentica
es la metilacin de la Citocina en el carbono 5 (mC-5). Este
mecanismo se da en las pares de bases Citosina-Guanina
(CpG), dentro del genoma de eucariontes.

En 1969, Griffitn y Mahler plantearon que la metilacin del
DNA es un evento importante que participa en la herencia de
memoria a largo plazo.

Un alto grado de metilacin se asocia con el silenciamiento de
genes.
Holliday, 2005
Metilacin del DNA
Modelos de silenciamiento gnico dados por
metilacin del DNA
Modificaciones pos-
traduccionales de histonas
Condensacin de la cromatina
Descondensacin de la cromatina
Grupo
acetilo
Acetilacin de histonas

Metilacin de histonas
Modelo delescritor y el
lector
Escritor Lector
Modificaciones de la
cromatina
Residuo modificado Funcin asociada
Acetilacin K-ac Transcripcin, reparacin, replicacin y condensacin
Metilacin (lisinas) K-me1 K-me2 K-me3 Transcripcin, reparacin
Metilacin (argininas) K-me1 K-me2a K-me2s Transcripcin
Fosforilacin S-fosf T-fosf Transcripcin, reparacin y condensacin
Ubiquitinacin K-ub Transcripcin, reparacin
Sumoilacin K-su Transcripcin

El cdigo de histonas
Cdigo de histonas
Modificaciones de la
cromatina
Residuo modificado Funcin asociada
Acetilacin K-ac Transcripcin, reparacin, replicacin y condensacin
Metilacin (lisinas) K-me1 K-me2 K-me3 Transcripcin, reparacin
Metilacin (argininas) K-me1 K-me2a K-me2s Transcripcin
Fosforilacin S-fosf T-fosf Transcripcin, reparacin y condensacin
Ubiquitinacin K-ub Transcripcin, reparacin
Sumoilacin K-su Transcripcin

Kouzarides T. (2007) Cell 128: 693-705.
Binda O. (2013 Epigenetics. 8: 457-463.
Y no solo eso, los diferentes
procesos de regulacin epigentica,
actan de manera cooperativa.
Greener (2005) The scientist
Preguntas?
Variantes de Histona
Kamakaka R. T. y Biggins, S. (2005) Genes. Dev. 19, 295-310.
Stellfox, et al., (2012) Cell Mol Life SciDOI 10.1007/s00018-012-1048-8

Histona
cannica
Variante de
histona
Efecto en la
cromatina
Funcin
H2A MacroH2A Condensacin de
la cromatina
Inactivacin del cromosoma X
H2A.X Condensacin de
la cromatina
Reparacin del DNA/ Recombinacin/
Represin de la transcripcin
H2A.Z Condensacin de
la cromatina
Activacin de la transcripcin/ represin,
segregacin de los cromosomas.
H3 H3.3 Cromatina abierta Transcripcin
CENP-A Formacin del cinetocoro

Variantes de Histona
Preguntas?
RNAs no codificantes (ncRNA)
ncRNA
sRNA < 200 nt.
lncRNA > 200 nt.
70-90% del genoma humano es transcrito y solo el
1.5% corresponde a genes que codifican protenas.
ncRNAs pequeos (sRNA)
sRNA
miRNA
Silenciamiento
pos-trancripcional
piRNA
Silenciamiento
pos-trancripcional
siRNA
Silenciamiento
transcripcional y
pos-transcipcional
RNAs no codificantes largos
(lncRNA)
Wang K. C. and Chang H. Y. (2011) Mollecular cell. 16;43 (6), 904-914

Mohammad, F., Mondal, T., and Kanduri, C. (2009). Epigenetics 4, 277286.

Estos lncRNAs funcionan como
seales moleculares:

-Impronta gnica.
-Se expresan bajo ciertas
condiciones muy especficas.
-Se expresan durante una fase
especfica del desarrollo.
Estos lncRNAs, se unen y titulan a sus
protenas blanco que son factores de
transcripcin, modificadores de la
cromatina y reguladores de la transcripcin;
evitando que se unan a su secuencia de
DNA blanco.
Este tipo de lncRNAs funciona de gua para protenas como remodeladores de la
cromatina y otros ncRNA. Pueden ser transcritos y sirven como gua en el mismo
locus o pueden transcribirse en un locus y servir como gua en otro.

Estos lncRNAs sirven como
plataforma en donde se ensamblan
mltiples protenas efectoras.
Preguntas?
Hay territorios cromosmicos y fbricas de
transcripcin nuclear
INSULATORS: Regiones de DNA capaces de reclutar TFs y co activadores.