Ejemplos de

Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

La F1 es de flor roja y hoja dentada

X
F2

136

13

16

35

En la F2 aparecen los cuatro tipos de plantas con las frecuencias que se indican

Se cruzan dos lneas puras de una planta. La lnea 1, de flor roja y hoja de borde dentado, con la lnea 2, de flor blanca y hoja de borde liso.
Queremos saber: 1.- Si la diferencia entre los parentales en cuanto al color de la flor se debe a un solo gen. 2.- Si la diferencia entre los parentales en cuanto a la forma de la hoja se debe a un solo gen. 3.- Si los dos caracteres segregan independientemente

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado liso 13

Segregacin observada del color de la flor

La F1 es de flor roja y hoja dentada

136 rojo

149

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

16

35

51

152

48

200

136

13

16

35

Nmero total de individuos analizados

Para solucionar este problema podemos colocar los resultados obtenidos en la F2 en forma de tabla de contingencia:
Los totales de las filas son la segregacin observada para el color de la flor Los totales de las columnas son la segregacin observada para la forma de la hoja El nmero total de individuos analizados resulta de sumar los totales de filas o de columnas.

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado liso 13

Segregacin observada del color de la flor

La F1 es de flor roja y hoja dentada

136 rojo

149

150

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

16

35

51

50

152

48

200

200

136

13

16

35

Segregacin esperada del color de la flor

Ahora podemos comprobar si la segregacin observada para el color de la flor se ajusta a la esperada en el supuesto de que los parentales difieran en un solo gen para ese carcter Es obvio que la distribucin esperada deber tener el mismo nmero total de individuos que la distribucin observada. Por tanto, para construir dicha distribucin esperada debemos tomar de la muestra el nmero total de individuos. Si los parentales difieren en un solo gen, el color rojo sera dominante frente al blanco y en la F2 las probabilidades de los fenotipos rojo y blanco seran 3/4 y 1/4, respectivamente. Por ello, la segregacin esperada ms probable es: Flor roja= 3/4 x 200= 150; Flor blanca = 1/4 x 200= 50

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado liso 13

Segregacin observada del color de la flor

La F1 es de flor roja y hoja dentada

136 rojo

149

150

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

16

35

51

50

152

48

200

200

136

13

16

35

Segregacin esperada del color de la flor

Una vez construida la segregacin esperada, podemos compararla con la observada mediante el correspondiente Chi-cuadrado

Este Chi-cuadrado tiene un grado de libertad

Ejemplos de

2 y prueba de contingencia
Color de la flor Forma de la hoja dentado 136 rojo 16 blanco
Segregacin observada de la forma de la hoja

En temas relacionados con la comparacin entre distribuciones observadas y esperadas, el trmino grados de libertad puede entenderse como la libertad de que se dispone, dentro de determinadas restricciones, para construir una distribucin esperada. Si tenemos una F2 con una distribucin de fenotipos compuesta por 149 individuos de color rojo y 51 de color blanco, tenemos un total de 200 individuos. Es obvio que cualquier distribucin esperada con la que queramos comparar esta distribucin observada deber tener la restriccin de tener el mismo nmero total de individuos: 200. Como la distribucin no tiene ms que dos clases que deben sumar 200, si asignamos libremente un valor a una de estas clases, el valor de la otra clase estar tambin determinado. Si la hiptesis es que la clase de color rojo est constituida por 3/4 del total, la otra clase esperada tiene que estar constituida por el resto de los individuos: 1/4 del total. Es decir, cualquier hiptesis en la que basemos la construccin de la distribucin esperada tendr un grado de libertad. En general, si la distribucin tiene n clases el nmero de grados de libertad es n-1

Segregacin observada del color de la flor

liso 13 149 150

35

51

50

152

48

200

200

Segregacin esperada del color de la flor

Una vez construida la segregacin esperada, podemos compararla con la observada mediante el correspondiente Chi-cuadrado

Este Chi-cuadrado tiene un grado de libertad

Ejemplos de

2 y prueba de contingencia

En la tabla de Chi cuadrado, para un grado de libertad el valor obtenido, 0.027, est comprendido entre 0.02 y 0.06 y se corresponde con una probabilidad entre 0.90 y 0.80 Esto significa que la probabilidad (p) de obtener una desviacin igual o mayor que la observada es: 0.9 > p > 0.8 Es decir, si la hiptesis fuera cierta y repitiramos el experimento 100 veces, en ms de 80 ocasiones obtendramos un resultado igual al obtenido o an ms diferente de la segregacin esperada. Por tanto, no hay razones para rechazar la hiptesis de que la diferencia entre los parentales para el color de la flor se debe a un solo gen. Se considera que la desviacin es significativa cuando la probabilidad est comprendida entre 0.05 y 0.01. Si la probabilidad es inferior a 0.01 se considera que la desviacin es altamente significativa. Este Chi-cuadrado tiene un grado de libertad

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13

Segregacin observada del color de la flor

AA
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aa rojo Aa

149

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

16

35

51

152

48

200

A-

A-

aa

aa

136

13

16

35

En resumen, el resultado obtenido en el Chicuadrado se ajusta a la hiptesis de que la diferencia entre los parentales para el color de la flor se debe a un solo gen.

Podemos llamar A,a a ese gen. El alelo dominante, A, determina color rojo, y el alelo recesivo, a, determina color blanco.

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13

Segregacin observada del color de la flor

AABB AA
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aa aabb rojo Aa AB/ab

149

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

16

35

51

152 150

48 50

200 200

AA-B-

AA-bb

aa aaB-

aa aabb

136

13

16

35

Segregacin esperada de la forma de la hoja

Ahora podemos comprobar si la segregacin observada para la forma de la hoja se ajusta a la esperada en el supuesto de que los parentales difieran en un solo gen para ese carcter La distribucin esperada se construye de forma similar al caso anterior. Se trata de una F2 y la alternativa de hoja dentada es dominante frente a la de hoja lisa. con un grado de libertad, y al que El Chi cuadrado es: corresponde una probabilidad (p): 0.8 > p > 0.7 Por tanto podemos concluir que la diferencia entre los parentales para la forma de la hoja se debe a un solo gen, al que podemos llamar B,b

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13

Segregacin observada del color de la flor

AABB
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aabb rojo AB/ab

149

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

16

35

51

152

48

200

A-B-

A-bb

aaB-

aabb

136

13

16

35

Ahora vamos a analizar si estos dos genes se transmiten de forma independiente En la tabla de contingencia tenemos la segregacin observada, considerando los dos caracteres. Vamos a tomar de los datos la segregacin para el color (149 rojo : 51 blanco) y la segregacin para la forma de la hoja (152 dentado : 48 liso), y a partir de ellos vamos a construir la segregacin esperada en el supuesto de independencia. Es decir, vamos a construir la segregacin esperada, considerando exclusivamente la hiptesis de independencia.

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13

Segregacin observada del color de la flor

AABB
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aabb rojo AB/ab

149

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

16

35

51

152

48

200

A-B-

A-bb

aaB-

aabb

136

13

16

35

Como en 200 individuos F2 han aparecido 149 de flor roja, la probabilidad (Pr) de que un individuo sea de flor roja es: Pr= 149/200

Del mismo modo, como en 200 individuos F2 han aparecido 152 de hoja dentada, la probabilidad (Pd) de que un individuo tenga hoja dentada es: Pd= 152/200
En el supuesto de independencia, la probabilidad (Prd) de que aparezcan individuos que, simultneamente, tengan flor roja y hoja dentada es el producto de las probabilidades individuales: Prd= 149/200 x 152/200 Y el nmero de individuos esperado (Erd) en un total de 200 individuos F2 es: Erd= 149/200 x 152/200 x 200 = 149 x 152 / 200 = 113.2

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13

Segregacin observada del color de la flor

AABB
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aabb rojo AB/ab

149

113.2 16 35 51

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

152

48

200

A-B-

A-bb

aaB-

aabb

136

13

16

35

Como en 200 individuos F2 han aparecido 149 de flor roja, la probabilidad (Pr) de que un individuo sea de flor roja es: Pr= 149/200

Del mismo modo, como en 200 individuos F2 han aparecido 152 de hoja dentada, la probabilidad (Pd) de que un individuo tenga hoja dentada es: Pd= 152/200
En el supuesto de independencia, la probabilidad (Prd) de que aparezcan individuos que, simultneamente, tengan flor roja y hoja dentada es el producto de las probabilidades individuales: Prd= 149/200 x 152/200 Y el nmero de individuos esperado (Erd) en un total de 200 individuos F2 es: Erd= 149/200 x 152/200 x 200 = 149 x 152 / 200 = 113.2 Es fcil calcular los valores esperados de cada casilla: total de la fila x total de la columna / total general

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13 35.8 35 12.2 48

Segregacin observada del color de la flor

AABB
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aabb rojo AB/ab

149

113.2 16

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

51

38.8 152

200

A-B-

A-bb

aaB-

aabb

136

13

16

35

Como en 200 individuos F2 han aparecido 149 de flor roja, la probabilidad (Pr) de que un individuo sea de flor roja es: Pr= 149/200

Del mismo modo, como en 200 individuos F2 han aparecido 152 de hoja dentada, la probabilidad (Pd) de que un individuo tenga hoja dentada es: Pd= 152/200
En el supuesto de independencia, la probabilidad (Prd) de que aparezcan individuos que, simultneamente, tengan flor roja y hoja dentada es el producto de las probabilidades individuales: Prd= 149/200 x 152/200 Y el nmero de individuos esperado (Erd) en un total de 200 individuos F2 es: Erd= 149/200 x 152/200 x 200 = 149 x 152 / 200 = 113.2 Es fcil calcular los valores esperados de cada casilla: total de la fila x total de la columna / total general

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13 35.8 35 12.2 48 48

Segregacin observada del color de la flor

AABB
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aabb rojo AB/ab

149 149 51 51 200 200

113.2 16

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

38.8 152 152

A-B-

A-bb

aaB-

aabb

136

13

16

35

Para la construccin de la distribucin esperada se han tomado como ciertas las segregaciones individuales del color y la forma. Es decir, en la tabla de contingencia, los totales de filas y columnas de la distribucin esperada deben ser iguales a los de la distribucin observada. Lo que se est probando es la independencia, no las segregaciones individuales de color y forma. Por ello, en este caso hay un solo grado de libertad. Asignado el valor esperado de una casilla en esta tabla de contingencia, el resto de los valores quedan fijados, ya que los totales de filas y columnas de la distribucin esperada deben ser iguales a los de la distribucin observada. En general, en una tabla de contingencia de n filas y m columnas el nmero de grados de libertad es: (n-1) x (m-1)

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13 35.8 35 12.2 48

Segregacin observada del color de la flor

AABB
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aabb rojo AB/ab

149

113.2 16

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

51

38.8 152

200

A-B-

A-bb

aaB-

aabb

136

13

16

35

Una vez construida la distribucin esperada, se puede calcular el chi cuadrado de contingencia:

2= [(136 - 113.2)2 / 113.2] + [(13 - 35.8)2 / 35.8] + [(16 - 38.8)2 / 38.8] + [(35 - 12.2)2 / 12.2] = 74.75
Este chi cuadrado tiene un grado de libertad y se corresponde con una probabilidad inferior a 0.001

Ejemplos de
Lnea 1

2 y prueba de contingencia
X
Lnea 2

Color de la flor

Forma de la hoja dentado 136 liso 13 35.8 35 12.2 48

Segregacin observada del color de la flor

AABB
La F1 es de flor roja y hoja dentada

aabb rojo AB/ab

149

113.2 16

X
blanco
F2 Segregacin observada de la forma de la hoja

51

38.8 152

200

A-B-

A-bb

aaB-

aabb

136

13

16

35

Una vez construida la distribucin esperada, se puede calcular el chi cuadrado de contingencia:

2= [(136 - 113.2)2 / 113.2] + [(13 - 35.8)2 / 35.8] + [(16 - 38.8)2 / 38.8] + [(35 - 12.2)2 / 12.2] = 74.75
Este chi cuadrado tiene un grado de libertad y se corresponde con una probabilidad inferior a 0.001 Por tanto, puede concluirse que hay una diferencia altamente significativa entre las segregaciones observada y esperada en el supuesto de independencia. Es decir, tenemos razones para rechazar la hiptesis de independencia. O, dicho de otra forma, los genes no se transmiten de forma independiente. La forma en que se produce la desviacin (exceso de individuos A-B- y aabb, y defecto de individuos A-bb y aaB-) es la que se espera en una F2 obtenida a partir de un doble heterozigoto AB/ab, si los dos genes estn ligados.