III) La informacin celular

4) Sint. protenas

4) TRASCRIPCIN Y TRADUCCIN DE LA INFORMACIN GENTICA

CONCEPTO MOLECULAR DEL GEN. ESTRUCTURA DE LOS GENES EN EUCARIOTAS Concepto molecular de gen: La mayora de los genes son fragmentos de la molcula de ADN que determinan la sntesis de una protena, otros realizan funciones reguladoras. Estructura de los genes en eucariotas: La estructura de los genes en eucariotas es compleja. La secuencia de nucletidos que constituye un gen, y los propios genes entre s, no se disponen linealmente en los cromosomas sino espaciados por fragmentos de ADN que no poseen informacin que pueda ser transcrita. En todo gen, adems, distinguiremos las siguientes regiones: - La regin promotora o promotor (P) - La regin codificadora (C) - La regin terminadora o terminador (T)

C Gen 1

Molcula de ADN

Gen 2 P C T

P C Gen 3

Regin codificadora Promotor

ATG TAC

E1

I1

E2

I2

E3
TAG ATC

Terminador

Estructura del Gen 2 Fig. 1 Estructura de un gen. P) regin promotora; C) regin codificadora; T) regin terminadora; E) exones; I) intrones.

a)La regin promotora es una porcin del ADN situada al principio del gen y que, sin codificar ningn aminocido, sirve para que las enzimas que realizan la transcripcin reconozcan el principio del gen. b)La regin codificadora es la parte del gen que contiene la informacin para la sntesis de la protena. En la regin codificadora van a existir fragmentos de ADN que no contienen informacin: los intrones, y fragmentos que s que contienen informacin: los exones. Considerando la hebra 5'-> 3 ', el principio de esta regin viene marcado por la secuencia de bases nitrogenadas ATG y el final por una de estas tres tripletas: TAA, TAG, TGA; tripletas que se

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denominan de paro,

sin sentido o secuencias stop.

c)La regin terminadora. Marca el final del gen.

TRANSCRIPCIN DE LA INFORMACIN DEL ADN El ADN se encuentra en el ncleo celular y la sntesis de protenas tiene lugar en el citoplasma, en el hialoplasma concretamente. Es por esto que la informacin contenida en la estructura primaria del ADN debe transcribirse a una mol cula de ARN denominada ARN mensajero (ARNm). Tambin se sintetizan en el ncleo el ARNr y el ARNt , necesarios para la sntesis proteica. Los procesos de sntesis de ARN a partir del ADN constituyen la transcripcin de la informacin gentica.
1 3 2

ncleo
4 5
AAAAAAAAAAAAA

AAAAAAAAAAAAA

Citoplasma
AAAAAAAAAAAAA

Fig. 2 Transcripcin y traduccin de un gen en eucariotas. 1) ADN; 2) ARN polimerasa; 3) ARNmp ; 4) ARNm ; 5) ARNm maduro; 6) Protena; 7) Ribosoma.

MECANISMO DE LA TRANSCRIPCIN EN EUCARIOTAS Destaquemos, en primer lugar, que para cada gen, slo una de las cadenas, de las dos que posee el ADN, se transcribe. El mecanismo se realiza de la siguiente manera:
ARN mensajero ARN polimerasa

A U G C C G

Direccin de la trascripcin
U C C

ADN

G A A G A C U

T A

C C A G T G C T T A G G U C A C G A A U

3
U
U

Nucletidos trifosfato

Fig. 3

Trascripcin del ADN (sntesis de ARNm).

1. Iniciacin: Una ARN-polimerasa comienza la sntesis del precursor del ARN a partir de unas seales de iniciacin "secuencias de consenso " que se encuentran en el ADN 2. Alargamiento: La sntesis de la cadena contina en direccin 5' 3'. Despus de 30 nucletidos se le aade al ARN una cabeza (caperuza o lder) de metil-GTP en el

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extremo 5'. Esta cabeza parece tener una funcin protectora para que las enzimas exonucleasas que destruyen los ARN no lo ataquen. Una vez que esto ha ocurrido, contina la sntesis del ARN en direccin 5 3 3. Finalizacin: Una vez que la enzima (ARN polimerasa) llega a la regin terminadora del gen, finaliza la snte sis del ARN. Entonces, una poliA-polimerasa aade una serie de nucletidos con adenina, la cola poliA, y el ARN, llamado ahora ARNm precursor, se libera. 4. Maduracin: El ARNm precursor contiene tanto exones como intrones. Se trata, por lo tanto, de un ARNm no apto para que la informacin que contiene sea traducida y se sintetice la correspondiente molcula proteica. En el proceso de maduracin un sistema enzimtico reconoce, corta y retira los intrones y las ARN-ligasas unen los exones, formndose el ARNm maduro.
m-GTP

ARNpolimerasa

T A

A U

C G

G C

A U

A U

C G

T A

T A

G C

C G

A U

C G

G C

Fig. 4

Alargamiento.

poliA-polimerasa

m-GTP

A U G C U

C G U G U A G A A A A A

ARNm precursor

Fig. 5

Adicin de la cola de poli A.

Regin codificadora del gen

ADN
Promotor E1 ATC I1 E2 I2 E3 Terminador

TAG

Cabeza E1 ARNm precursor

AUG

I1

E2

I2

E3
UAG

cola
AAAAAA

ARNm maduro

Cabeza
AUG UAG

cola
AAAAAA

Fig. 6

Mecanismo de maduracin del ARNm.

Todo esto se ha producido en el ncleo celular. El ARNm maduro, que a partir de ahora ser simplemente el ARNm o, tambin, el transcrito, pasar al hialoplasma donde su informacin servir para la sntesis de una protena concreta. Esto es, la informacin que se encuentra en forma de una cadena de nucletidos se traducir a una cadena de aminocidos.

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LA TRANSCRIPCIN EN PROCARIOTAS: DIFERENCIAS CON EUCARIOTAS 10) En los procariotas el ARNm no tiene ni caperuza ni cola. 20) Tampoco tiene intrones y por lo tanto no requiere de un mecanismo de maduracin. 30) Al mismo tiempo que el ARNm se transcribe se est ya traduciendo. 40) Los genes son policistrnicos, esto es, un ARNm contienen informacin para varias protenas.
a

3 2

4 c 5 d

Fig. 7 Transcripcin y traduccin en procariotas. 1) ADN; 2) ARNm; 3) Sub. menor del ribosoma; 4) sub. mayor; 5) protena. a) Extremo 5'; b) extremo 3'; c) extremo carboxilo; d) extremo amino (P.A.U. junio del 99).

EL CDIGO GENTICO
AUG CAA UGC UUA CGA AUU UAG

AAAAAA

El ARNm tiene una estructura primaria complementaria de una de las cadenas del ADN. Esta disposicin de las bases nitrogenadas en el ARNm es la que codifica la secuencia de aminocidos de la protena.

stop

H Met Gln Cys Leu Arg Ile - OH

Fig. 8 Ejemplo de codificacin de un pptido de seis aminocidos.

CRICK demostr que los aminocidos en las protenas van a estar codificados por secuencias de tres bases nitrogenadas consecutivas de las cadenas de ARNm, a partir de la secuencia de iniciacin AUG, complementaria de la secuencia de iniciacin TAC del ADN. Cada una de estas secuencias de tres bases se llaman tripletas o codones. Debe de tenerse en cuenta que, al haber en las protenas 20 aminocidos distintos, una o dos bases no seran suficientes para codificarlos. Al tener los cidos nucleicos cuatro bases diferentes (la adenina, la guanina, la citosina y el uracilo), que representaremos por A, G, C y U respectivamente, existirn 64 codones o combinaciones de tres bases y como solamente hay 20 aminocidos distintos, se deduce, que varias tripletas codificarn un mismo aminocido. Este cdigo, que relaciona la secuencia de bases del ARN con la secuencia de aminocidos en las protenas, recibe el nombre de cdigo gentico.

CARACTERSTICAS DEL CDIGO GENTICO 10 El cdigo gentico es universal. Todos los seres vivos lo emplean; con ciertas excepciones, por ejemplo, el de las mitocondrias, que tiene algunas diferencias. 20 Se trata de un cdigo degenerado pues el nmero de tripletas (64) es superior al de aminocidos existentes en las prote nas (20). 30 Existen tres tripletas que no codifican ningn aminocido, son las tripletas " sin sentido", de " paro" o " stop". Estas tripletas marcan el final de la regin a traducir, esto es, el final de la molcula proteica. 40 La secuencia AUG codifica el principio de la regin que se va a traducir y al mismo tiempo sirve para codificar al aminocido metionina. Por lo tanto, todas las protenas comienzan por la metionina. Ahora bien, posteriormente, esta metionina que ocupa la posicin inicial puede ser eliminada.

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EL CDIGO GENTICO Segunda base U P r i m e r a b a s e U Phe Phe Leu Leu Leu Leu Leu Leu UUU UUC UUA UUG CUU CUC CUA CUG Ser Ser Ser Ser Pro Pro Pro Pro Thr Thr Thr Thr Ala Ala Ala Ala C UCU UCC UCA UCG CCU CCC CCA CCG ACU ACC ACA ACG GCU GCC GCA GCG A Tyr UAU Tyr UAC Stop UAA Stop UAG His His Gln Gln CAU CAC CAA CAG Cys Cys Stop Trp Arg Arg Arg Arg G UGU UGC UGA UGG CGU CGC CGA CGG U C A G U C A G U C A G U C A G T e r c e r a b a s e

Ile AUU Ile AUC Ile AUA Met AUG Val Val Val Val GUU GUC GUA GUG

Asn AAU Asn AAC Lys AAA Lys AAG Asp GAU Asp GAC Glu GAA Glu GAG

Ser AGU Ser AGC Arg AGA Arg AGG Gly Gly Gly Gly GGU GGC GGA GGG

EL CDIGO GENTICO (orden alfabtico)

AMINOCIDO Alanina (Ala) Arginina (Arg) Asparragina (Asn) cido asprtico (Asp) Cistena (Cys) cido glutmico (Glu) Glutamina (Gln) Glicocola (Gly) Histidina (His) Isoleucina (Ile) Leucina (Leu Lisina (Lys) Metionina (Met) Fenilalanina (Phe) Prolina (Pro) Serina (Ser) Treonina (Thr) Triptfano (Trp) Tirosina (Tyr) Valina (Val) Sin sentido (Stop)

TRIPLETA O CODN GCU, CGU, AAU, GAU, UGU, GAA, CAA, GGU, CAU, AUU, UUA, AAA, AUG UUU, CCU, UCU, ACU, UGG UAU, GUU, GCC, CGC, AAC GAC UGC GAC CAG GGC, CAC AUC, UUG, AAG GCA, GCG CGA, CGG, AGA, AGG

GGA, GGG AUA, CUU, CUC, CUA, CUG

UUC CCC, CCA, CCG UCC, UCA, UCG, AGU, AGC ACC, ACA, ACG UAC GUC, GUA, GUG

UAA, UAG, UGA

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MECANISMO DE LA TRADUCCIN DE LA INFORMACIN GENTICA. Consiste en la sntesis de una protena a partir de la informacin contenida en el ARNm. Se trata de un proceso que se produce en el hialoplasma. Consta de las siguientes fases: 10) Activacin de los aminocidos: La formacin del enlace peptdico es un proceso endergnico. Para que pueda realizarse, los aminocidos (aa) deben de ser activados, activacin que se realiza por medio del GTP segn la siguiente ecuacin:
Aminocido

UAC
ARNt

Bucle del anticodn

et

Fig. 9 ARN de transferencia unido a un aminocido tipo. Ver la posicin que ocupa el anticodn.

COOH

aa + GTP

aa-GMP +

PPi

H2N

C CH2 H

Los aminocidos activados se unen a una mol cula de ARNt (ARN de transferencia). Estos polinucletidos poseen en su estructura una secuencia de tres bases, el anticodn, complementaria de los correspondientes codones o tripletas del ARNm. Cada aminocido se une, por lo tanto, a un ARNt especfico, que ser aquel que lleve el anticodn correspondiente. 20) Iniciacin: La subunidad pequea del ribosoma se une a la regin lder del ARNm y el ARNm se desplaza hasta que al llegar al codn AUG, que codifica el principio de la protena. Se les une el complejo formado por el ARNt -metionina. La unin se produce entre el codn del ARNm y el anticodn del ARNt que transporta el aminocido. Por ltimo, se une la subunidad mayor a la menor completndose el ribosoma. 30) Elongacin. pasos: Consta de los siguientes

Anticodn Codn

Fig. 10 Iniciacin de la traduccin: Acoplamiento entre la enzima, el ARNt de un aminocido, la fenilalanina, por ejemplo, y el aminocido.
Subunidad menor del ribosoma

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG UAC

Anticodn Codn

ARNt

ARNm

et
1er aminocido

Fig. 11

Traduccin: Iniciacin.

Subunidad menor del ribosoma

P
5

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG UAC GUU

a) El complejo ARNt -aminocido 2 (ARNt -aa2 ) se sita enfrente del codn correspondiente. La regin del ribosoma en la que se une se le llama regin aminoacil (A).

et

Gl

Fig. 12

Traduccin: Elongacin 1.

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b)

Se

forma el enlace peptdico y la metionina se une al segundo aminocido (aa2 ).

P
5

ARNm

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAAUGC UUA CGA UAG UAC GUU

c) El ARNm se traslada como la cinta de una mquina de escribir y el complejo ARNt2 -aa2 -met queda situado en la regin peptidil del ribosoma y la posicin aminoacil queda libre para la entrada del complejo ARNt -aa3 . El ARNt de la metionina se libera. De esta manera se van a ir aadiendo el resto de los aminocidos que constituyen la protena hasta llegar al codn de finalizacin. 40) Finalizacin: Cuando el ribosoma llega al codn de finalizacin, uno de los codones sin sentido: UAA, UAG, UGA, la protena se libera y las subunidades del ribosoma se disocian y se separan del ARNm. La estructura terciaria y cuaternaria de las protenas se va adquiriendo segn estas se van sintetizando Es de destacar, que varios ribosomas, de 4 a 6, a veces incluso 100, pueden estar traduciendo al mismo tiempo una cadena de ARNm. La funcin de los ribosomas no se conoce con exactitud, pero, podra ser, la de recibir las instrucciones genticas y traducirlas a prote nas. Para ello es necesario que se unan al ARNm, procesen la informacin, incorporen los aminocidos y los unan entre s mediante enlaces peptdicos.

Gl

nM

et

Fig. 13

Traduccin: Elongacin 2.

P
5

ARNm

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG GUU

UA C

Gl

n-

et

Fig. 14

Traduccin: Elongacin 3.

ARNm 5

AAAAAAAAAAA

AUG CAA UGC UUA CGA UAG GCU

AA U

Arg-Leu-Cys-Gln-Met

Fig. 15

Traduccin: Finalizacin.

ribosoma

pptido

Fig. 16 Actuacin de varios ribosomas sobre un mismo ARNm.

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TRADUCCIN DE LA INFORMACIN GENTICA

1-Iniciacin
5

Subunidad menor del ribosoma

AAAAAAAAAAA 3

Unin del ARNt que transporta la metionina. La unin se produce entre el codn del ARNm y el anticodn del ARNt .
Anticodn

AUG CAA UGC UUA CGA UAG UAC

Codn

ARNt

ARNm

et
1er aminocido

2-Elongacin
Subunidad menor del ribosoma

Unin del complejo ARNt -Gln (Glutamina) a la regin aminoacil (A) del ribosoma.

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG UAC GUU

et

Gl

Formacin del enlace peptdico entre el grupo carboxilo de la metionina (Met) y el grupo amino del segundo aminocido: la glutamina (Gln). El ARNt de la metionina se libera.

P
5

ARNm

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG GUU

UA C

Gl

nM

et

El ARNm se traslada hacia el codn siguiente, el 31. El complejo ARNt Gln-Met queda situado en la regin peptidil (P) del ribosoma y la posicin aminoacil (A) queda libre, entrando el complejo ARNt -Cys del siguiente aminocido (cistena).
Gl nM et Cy s
P
5

ARNm

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG GUU ACG

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(continuacin)

Formacin del enlace peptdico entre el grupo carboxilo del dipptido (Met-Gln) y el grupo amino de la cistena (Cys). Liberacin del ARNt de la glutamina.
5

ARNm

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG ACG

GU U

Cy sGl

nM

et

Desplazamiento del ARNm a la siguiente posicin y entrada del complejo ARNt -Leu, correspondiente al cuarto aminocido: leucina. El proceso contina as hasta llegar al codn de finalizacin (UAG).
5

ARNm

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG ACG AAU

Cy sGl

nM

et

Leu

3-Finalizacin
ARNm 5

AAAAAAAAAAA 3

El ribosoma llega al codn de finalizacin, uno de los codones sin sentido. El pptido se encuentra ya totalmente sintetizado.

AUG CAA UGC UUA CGA UAG GCU

AA U

Arg-Leu-Cys-Gln-Met

La cadena polipeptdica se libera y las subunidades del ribosoma se disocian y se separan del ARNm.
ARNm 5

Subunidad menor

AAAAAAAAAAA 3

AUG CAA UGC UUA CGA UAG

Subunidad mayor del ribosoma

Arg-Leu-Cys-Gln-Met
(pptido sintetizado)

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REGULACIN DE LA ACCIN DE LOS GENES: HIPTESIS DEL OPERN Todas las clulas de un organismo pluricelular, excepto los gametos, poseen la misma informacin gentica. Ahora bien, no todos los genes se encuentran activos durante el ciclo celular. Muchos genes no actan nunca y otros actan slo en determinados momentos, pudiendo permanecer durante largos periodos de tiempo inactivos. Para poder comprender el mecanismo de accin de los genes veamos a continuacin estos dos modelos de regulacin:

I) Regulacin de la actuacin del opern LAC en la bacteria Escherichia coli La -galactosidasa es una enzima que rompe el enlace O-glicosdico entre la galactosa y la glucosa en la lactosa. Si no hay lactosa en el medio, E. coli apenas dispone de unas pocas molculas de enzima, una o dos solamente. Sin embargo, si aadimos lactosa al medio donde se encuentra la bacteria, al cabo de unos pocos minutos los niveles de galactosidasa suben hasta alcanzar las 5000 molculas por clula, aproximadamente. Aparecen adems otras dos enzimas: una permeasa que facilita la absorcin de la lactosa a travs de la membrana plasmtica de la clula y una transacetilasa, necesaria tambin para el metabolismo de la lactosa. Jacob y Monod interpretaron estos resultados planteando la hiptesis del opern. Segn esta hiptesis la actividad de varios genes que codifican enzimas relacionadas entre s, genes estructurales, sera desencadenada por la accin de un gen operador , contiguo a los genes estructu rales en la molcula de ADN. El conjunto formado por los genes estructu rales y el gen operador recibe el nombre de opern. Si el gen operador se encuentra libre, los genes estructu rales se transcriben. A su vez, el gen operador estara controlado por un gen regulador, que puede estar situado lejos del opern. Este gen va a sintetizar un ARNm que servir para la sntesis de una protena: el represor. Si el represor se encuentra activo se unir al gen operador inhibindolo, con lo que

Opern LAC Regulador Operador Gen x Gen y Gen a

ARNm Si no hay lactosa los Genes no se transcriben

Represor activo

Fig. 17 Regulacin del opern LAC en E. coli. Si no hay lactosa el represor est activo, se une al operador, y los genes estructurales no se transcriben.

Opern LAC Regulador Operador Gen x Gen y Gen a

ARNm Transcripcin

Represor

Traduccin

Represor inactivo Lactosa

Enzimas para metabolizar la lactosa

Fig. 18 Regulacin del opern LAC en E. coli. Si hay lactosa, sta se une al represor, lo inactiva, y los genes estructurales se transcriben, sintetizndose las enzimas que metabolizan la lactosa.

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4) Sint. protenas

los genes estructurales no se transcribirn. El opern LAC en E. coli constara de tres genes estructurales que codificaran respectivamente: la -galactosidasa (gen z), la permeasa (gen y) y la transacetilasa (gen a). Si no hay lactosa en el medio, el gen regulador se Opern reprimible traducira en una protena, el represor, Regulador Gen b Gen c Operador Gen a con dos centros activos. Por uno de ellos sera capaz de unirse al gen ARNm operador inhibiendo la sntesis de los ARNm codificados por los genes enzimas Represor estructurales z, y, a. Por el otro centro inactivo activo podra unirse a la lactosa cuando Va metablica del triptfano la hubiese. La lactosa cambiara la estructura del represor inactivndolo e impidiendo que ste pudiese unirse al triptfano gen operador. De esta manera los genes estructurales se transcribiran producindose la sntesis de las tres Fig. 19 Opern reprimible: El regulador sintetiza enzimas que metabolizan la lactosa en un represor inactivo que no se puede unir al operador. E. coli. Los genes estructurales se trascriben y se traducen,
sintetizndose las enzimas necesarias para la sntesis de la sustacia A: triptfano, en este caso.

II) Los operones reprimibles.

Opern reprimible Como es el caso de la regulacin de Regulador Gen b Gen c los genes responsables de los procesos Operador Gen a Los genes no se trascriben de sntesis. Supongamos que la clula ARNm necesita producir una determinada cantidad de una sustancia A y que no interesa que haya un exceso de A ni Represor inactivo que sta falte. Supongamos tambin que cuando ya hay suficiente triptfano para sintetizar A se necesitan tres enzimas: a, b y c. En estos casos, la Represor activo triptfano protena que acta como represor del gen operador se encuentra normalmante en estado inactivo, permitiendo que los Fig. 20 Opern reprimible: Cuando ya hay un genes a, b y c se transcriban y que A exceso de triptfano, ste se une al represor y lo activa. se sintetice. Cuando A alcanza unos El represor activo se une al operador y los genes a, b y c no se transcriben. niveles elevados, se une al represor, activndolo. El represor activo se une al operador y los genes estructurales a, b y c no se transcriben. Esto hace descender la cantidad de A, con lo que el represor vuelve a estar inactivo, los genes estructurales vuelven a traducirse y vuelve a sintetizarse A. De esta manera la clula mantiene unas determinadas cantidades de A.

Como se ve, se trata de un mecanismo que funciona como un termostato, manteniendo unos niveles adecuados de una determinada sustancia, en este caso A, necesaria para la clula.

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