Tcnicas estadsticas

multivariantes: de la
visualizacin al contraste de
hiptesis

Tcnicas multivariantes:
especie
s

muestra
s

aa
aa

b
bb
c
c

matriz
triangular de
similitudes

ordenaci
n
a
a
b

Ordenacin
y
clasificacin son formas
de
explorar/visualizar
las
relaciones
de
similitud
entre

b
c

clasificaci
n
2

Clasificacin (anlisis
clster)

Clasificacin (anlisis clster)

Tcnicas para agrupar/separar grupos
de objetos (e.g. muestras/especies) en
paquetes basadas en su similitud (se
basan en ndices de similitud)
Genera en dendograma basado en una
clasificacin generalmente jerrquica:
pequeos grupos de objetos (p.e.
muestras/especies) dentro de grupos
mayores y estos a su vez dentro de
grupos mayores; y aglomerativa: se
parte de tantas clases como objetos
tengamos que clasificar y en pasos
sucesivos vamos obteniendo clases de4

Clasificacin: un ejemplo

Diseo experimental y anlisis estadstico: su aplicacin en biologa marina

Clasificacin: merece la pena?

No slo depende del tipo de distancia
que seleccionemos, sino tb de las muchos
estrategias
para
construir
el
dendograma. Y hay muchsimas

Escepticismo respecto a la clasificaci

"The availability of computer packages of classification techniques
has led to the waste of more valuable scientific time than any other
statistical innovation (with the possible exception of multiple
regression techniques)." Cormack (1971) A review of classification.
Journal of the Royal Statistical Society A 134, 321-367.

Diseo experimental y anlisis estadstico: su aplicacin en biologa

marina

Un
dendograma
pueden
ser
reestructurado alrededor de cualquier
interseccin/nodo
y
objetos
que
aparecan distantes pueden aparecer
cerca

En estudios de ecologa la mejor

clasificacin es una ordenacin
Diseo experimental y anlisis estadstico: su aplicacin en biologa
marina

 PCA/MDS/cluster son tcnicas de

visualizacin de patrones: no permite
contraste de hiptesis
Necesidad de un test para contrastar
las diferencias entre grupos que
acompae
a
una
tcnica
de
visualizacin de patrones
Rutina ANOSIM

Por ejemplo, diferencias entre

tratamientos 1 y 2?

Ho = tratamientos son iguales

Ha = tratamientos NO son iguales
Tratamiento 1
Tratamiento 2
9

Ho = verdad

variabilidad entre
tratamientos = o <
variabilidad dentro de cada
tratamiento
10

Ha = verdad

variabilidad dentro de
tratamientos < variabilidad
entre tratamientos

Diseo experimental y anlisis estadstico: su aplicacin en biologa marina

11

ANOSIM

12

ANOSIM
Tcnica de contraste hipottico que
proporciona un p-valor para contrastar
la hiptesis:
Ho = tratamientos son iguales
Ha = tratamientos NO son iguales
Podemos ejecutar tantos contraste
como pares de niveles queramos
contrastar. Obtengo un estadstico (R) y
lo importante: un p-valor asociado
13

Rutina BIOENV
(regresin mltiple
multivariante)

14

BIOENV
Anlisis directo de gradientes: explicar la
variabilidad de la matriz Y (bitica) en trminos
de variables predictoras Xs
(abitica)
X (matriz
abitica)
Y (matriz bitica)
A

rpli sp sp sp 3 sp 4 sp
ca
1 2
5
A1 B1 1

sp n

rpli V 1 V 2 V 3 V 4
ca
A1 B1 1

A1 B1 2

A1 B1 2

A1 B2 1

A1 B2 1

A1 B2 2

A1 B2 2

A1 B3 1

A1 B3 1

A1 B3 1

A1 B3 1

A2 B1 1

A2 B1 1

A2 B1 2

A2 B1 2

A2 B2 1

A2 B2 1

A2 B2 2

A2 B2 2

A2 B3 1

A2 B3 1

A2 B3 2

A2 B3 2

15

RDA: cmo acta

Problema: colinealidad; muchas X estn
correlacionadas. Por ello, uso RDA
siempre en combinacin la regresin
multivariante mltiple para seleccionar
las X apropiadas (rutina/freeware DISTLM
que veremos en las prcticas) = buscar el
modelo con mayor parsimonia

16

Tcnicas
multivariantes:
resumiendo

Diseo experimental y anlisis estadstico: su aplicacin en biologa marina

17

Variables
(muestras)
Objetos
(especies)

aa
aa

b
bb
c
c

matriz triangular de
similitudes

ordenaci
n
a
a
b
b
c

clasificaci
n
18

Ordenacin: casos tipo y sus

diferencias
Similitudes
Objetivo/casos tipo
PCA

Distancia
euclidiana
(asumo relacin
lineal entre
variables y ejes)

Visualizacin de diferencias entre

muestras/tratamientos usando variables
abiticas/ambientales. Puedo saber el % de
variabilidad explicada por cada eje
(componente)

nmMDS

Cualesquiera
(no asumo
relacin lineal);
trabajo con
rangos

Visualizacin de diferencias entre

muestras/tratamientos usando matrices
biticas: respuestas a nivel de comunidad
(datos se portan muy mal)

19

Ordenacin: casos tipo y sus tests de

contraste
PCA, nm-MDS,
anlisis indirecto
de gradientes

Test = ANOSIM

BIOENV
anlisis
directo de
gradientes

Test = reg.
mltiple
Multivariante

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