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Enzimas PDF
Enzimas PDF
Anhidrasa carbnica
Corismato mutasa
Triosafosfato isomerasa
Carboxipeptidasa A
AMP nucleosidasa
Nucleasa estafilococal
Velocidad en
ausencia de
enzima
Velocidad de
reaccin
catalizada
Rendimiento
1.3 X 10 1
2.6 X 10 5
4.3 X 10 6
3.0 X 10 9
1.0 X 10 11
1.7 X 10 -13
1.0 X 106
50
4300
578
60
95
7.7 X 106
1.9 X 106
1.0 X 109
1.9X 1011
6.0 X 1012
5.6 X 1014
Caractersticas de los
enzimas
- Casi todos son protenas. Los ribozimas, son los nicos enzimas no
proteicos.
- Tienen elevado peso molecular.
- No se consumen durante la reaccin.
- Muy activos. Tpicamente, cada molcula de enzima es capaz de
transformar cada segundo de 100 a 1000 molculas de sustrato en
producto. El nmero de estas molculas transformadas a producto por
molcula de enzima en cada segundo, se conoce como el nmero de
recambio.
- Actan a temperatura ambiente.
- Son muy especficos.
Accin enzimtica
La sustancia sobre la que
acta el enzima se llama
sustrato.
S+E
El sustrato se une al
enzima, formando el
complejo sustrato-enzima.
S-E
P+E
Ciclo de un enzima:
sacarasa
enzima
complejo sustrato-enzima
enzima
Enzima y
productos
P
E
S2
S2
a)
P
S2
S1
S1
b)
E
Complejo binario
Complejo ternario
S1 + E
S1-E
S2
P1-E
S2- E
P1
P2 + E
Nomenclatura
1.- A los primeros enzimas que se descubrieron se les dio un nombre propio. Este nombre, los
relacionaba, o no, con la procedencia anatmica donde fueron descubiertos: ptialina de la saliva,
tripsina pancretica, rubisco...
2.- El primer intento de sistematizar la nomenclatura, fue utilizar un nombre con dos partes. La
primera parte es el nombre del sustrato especfico o general sobre el que actan y la segunda
parte es la terminacin asa: ureasa, lipasa, proteasa...
3.- Al descubrirse que un mismo enzima puede realizar catalizar distintas reacciones, se ampli el
nombre, aadiendo la funcin que realiza antes de la terminacin asa, por ejemplo Isoctrico
descarboxilasa. Al enzima rubisco, se le denomina ribulosa difosfato carboxilasa o bien ribulosa
difosfato oxidasa, segn la reaccin que catalice.
4.- Un nuevo avance el nomenclatura se logra dando informacin complementaria, al indicar el
coenzima que utiliza: malato NAD+ oxidoreductasa.
5.- La sistematizacin completa del nombre, se hace, nombrando a los enzimas con un numero
clave (E.C.) que caracteriza al tipo de reaccin segn la clase (primer digito), subclase (segundo
digito) y subsubclase (tercer digito). El cuarto digito es para lel enzima especifico. Asi, en la E.C.
2.7.1.1: el 2 indica que se trata de una transferasa, el 7 indica que transfiere fosfato, el primer 1
que el alcohol es el aceptor del fosfato y el ltimo 1 indica que es una hexoquinasa o ATPasa.
Tambin se le denomina D-hexosa-6-fosforotransferasa, enzima que cataliza la transferencia
de fosfato desde el ATP al grupo hidroxilo de carbono 6 de la glucosa.
Tipos de enzimas
Segn su composicin se pueden clasificar en tres grupos:
1.- Ribozimas: compuestos por pequeas molculas de ARN, que tienen actividad cataltica.
2.- Enzimas simples o estrictamente proteicos: son aquellos que estn compuestos
exclusivamente por aminocidos.
3.- Enzimas complejos u holoenzimas: son los compuestos por una parte proteica (Apoenzima) y
un grupo prosttico, parte no formada por aminocidos, (Cofactor).
Coenzimas
Son cofactores orgnicos que quedan modificados en la reaccin ya que actan de transportadores
de grupos qumicos. Al ser modificados suelen actuar de coenzimas para otros enzimas. En esta
segunda reaccin se regeneran y pueden actuar de nuevo de coenzimas para la primera enzima. No
suelen ser especficos, suelen unirse a distintos apoenzimas. Las uniones son con enlaces dbiles.
Coenzima A: Es un ejemplo de
coenzima de transferencia. El
CoA tranporta grupos acetil
(-CO-CH3)
NAD+ y NADH
FAD+
Si en 1 y 5 se unen H
tendremos el FADH2
El NADH2 y el FADH2 y sus formas oxidadas NAD+ y FAD+
son coenzimas de oxido-reduccin. (transportan H+ y e-)
Clase 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreduccin, es decir, transferencia de hidrgeno
(H) o electrones (e-) de un sustrato a otro. Segn el sustrato sobre el que actan
o los coenzimas utilizados se diferencian 97 subclases diferentes. De ellas las dos
ms importantes son:
Oxidasas: transfieren slo
electrones
e-
e-
reducido
oxidado
CH3
CH COOH
OH
e-
oxidado
Deshidrogenasas: transfieren H
utilizando coenzimas.
e-
reducido
CH3
NAD+
c. lctico
COOH
c. pirvico
NADH+H+
Clase 2: Transferasas
Catalizan la transferencia de un grupo
qumico, distinto del hidrgeno, de un
sustrato a otro. Hay 9 subclases.
Glucosa
Pi
Pi
Glucoquinasa
Glucosa 6 fosfato
Pi
Pi
ATP
Pi
ADP
Clase 3: Hidrolasas
Rompen enlaces con la adicin de una
molcula de agua. El enzima tambin
rompe la molcula de agua, introduciendo
el OH en un lado del enlace y el H al otro
lado. Hay 13 subclases.
Maltasa
H2O
OH + H
H2O
Clase 4: Liasas
Rompen enlaces sin la adicin de una molcula de agua.
Hay 99 subclases. Generalmente:
crean dobles enlace
Acetacetato
descarboxilasa
+
cido acetoactico
Acetona
CO2
Clase 5: Isomerasas
Catalizan el cambio de posicin de un grupo qumico de
una parte a otra del sustrato. Hay 99 Subclases.
Fosfoglicerato mutasa
cido 3 fosfoglicrico
cido 2 fosfoglicrico
+
ATP
ADP + Pi
ATP
ADP + Pi
+
Pptido sintetasa
Glicina
c. Glutmico
Dipptido
Especificidad absoluta
El enzima slo reconoce a un sustrato.
Fumarato hidrolasa
Especfica para el ismero
trans- del fumrico y da el
producto en su forma
isomerica L-
Especificidad de grupo
Actan sobre el mismo grupo qumico de molculas.
Por ejemplo, la -glucosidasa reconoce cualquier glcido pero
no a los .
fructosa
fructosa
glucosa
glucosa
Especificidad de clase
Actan sobre el mismo tipo de enlace.
carboxilesterasas
Ester
cido
Alcohol
Mecanismo de accin I
Segn la teora de las colisiones para que una reaccin qumica se produzca, debe
ocurrir simultneamente:
No hay reaccin
Choque
Eficaz y energa de
activacin adecuada
Hay reaccin
Mecanismo de accin II
Por qu los enzimas aceleran las reacciones qumicas?
Los catalizadores cambian la energa de activacin de una determinada
reaccin, y por tanto incrementan la velocidad de reaccin.
Complejo
activado
Reaccin no catalizada
Reaccin catalizada
Energa
de activacin
E.A
Reactivos
Reaccin endotrmica
Complejo
activado
Reaccin exotrmica
Energa
de activacin
E.A
Productos
H>0
H<0
Productos
Transcurso de la reaccin
Reactivos
Transcurso de la reaccin
Cintica enzimtica
Estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas.
[ ]
d[ ]
v=
dt
Si representamos la
aparicin de producto, o la
desaparicin del sustrato, en
funcin del tiempo se
obtiene la llamada curva de
velocidad de la reaccin, o
simplemente, la cintica de
la reaccin.
s
t
Modelo de Michaelis-Menten
En 1913 Leonor Michaelis y Maude Menten postulatron la teora
general de la accin enzimtica, basada en la formacin del
complejo SE.
1.-Deducciones de M-M
Michaelis y Menten propusieron que las reacciones catalizadas enzimticamente ocurren
en dos etapas: En la primera etapa se forma el complejo enzima-sustrato y en la
segunda, el complejo enzima-sustrato da lugar a la formacin del producto, liberando el
enzima libre
S+E
K1
K2
SE
K3
E+P
En este esquema, k1, k2 y k3 son las constantes cinticas individuales de cada proceso
y tambin reciben el nombre de constantes microscpicas de velocidad. Segn esto,
podemos afirmar que:
v1 = k1 [S][E]
v2 = k2 [SE]
v3 = k3 [SE]
O lo que es lo mismo
2.-Deducciones de M-M
De la reaccin:
S + E
K1
SE
K2
K3
E + P
[Et][S]
(k2+k3)/k1 + [S]
[SE] =
[Et][S]
Km + [S]
3.-Deducciones de M-M
De la reaccin:
S + E
K1
SE
K2
K3
E + P
v = v3 = k3 [SE]
[Et][S]
Km + [S]
Vmax[S]
Km + [S]
Grfica de Michaelis-Menten
La representacin grfica de la
ecuacin de Michaelis-Menten,
velocidad frente a [S], es una
hiprbola
vmax
Vmax[S]
Km + [S]
Simplificando
1/2 =
vmax
2
[S]
Km + [S]
Es decir
[S] + km = 2 [S]
?
[S] =Km
[s]
despejando
Km = [S]
Significado de Km
Km es la concentracin de sustrato para la cual la velocidad de reaccin es la
mitad de la velocidad mxima.
El valor de Km da idea de la afinidad del enzima por el sustrato.
A menor Km, mayor afinidad del enzima por el sustrato. Este hecho tiene fcil
explicacin si tenemos en cuenta que Km se define como (k2+k3/k1), donde las
reacciones 2 y 3 destruyen el complejo ES, mientras que la reaccin 1 lo forma.
As, si Km es grande, el complejo ES es inestable pues predomina la tendencia a
destruirlo (poca afinidad hacia el sustrato), y si Km es pequea, el complejo ES
es estable, ya que predomina la tendencia a formarlo (gran afinidad hacia el
sustrato).
La Km del sustrato natural es menor que la de los sustratos anlogos.
Si dos sustratos del mismo enzima tienen distinta Km, el que presente mayor Km
tiene menor afinidad por el enzima, y la reaccin transcurre siempre a menor
velocidad que con el sustrato de menor Km, salvo a concentraciones saturantes de
sustrato, donde la V = Vmax.
Los valores de Km de muchos enzimas son prximos a los de la concentracin
fisiolgica de sus sustratos, de forma que pequeas variaciones en la [S]
pueden suponer grandes cambios en la velocidad de toda una ruta metablica.
Clculo de Km y de Vmax
1/V
de Lineweaver-Burk.
Pendiente= KM / Vmax
1/Vmax
-1/Km
1/[S]
Si -2=-1/Km
Km=1/2
Si 3=1/vmax
Vmax=1/3
pH
Los enzimas, en las cadenas laterales de sus aminocidos, poseen grupos qumicos
ionizables (carboxilos -COOH; amino -NH2; tiol -SH; imidazol, etc.). Segn el pH del
medio estos grupos se ionizan de forma distinta, pueden tener carga elctrica positiva,
negativa o neutra. Como la forma espacial de las protenas depende, en parte, de las
cargas elctricas de sus restos, habr un pH en el cual la conformacin ser la ms
adecuada para la actividad cataltica. Este es el llamado pH ptimo.
V
Enzima
pH
ptimo
Pepsina
1,5
Ureasa
6,8
Catalasa
7,6
Tripsina
7,7
Fumarasa
7,8
Arginasa
9,7
Si cambia el pH del
medio, cambia la
forma espacial del
enzima y esto cambia
la velocidad de la
reaccin.
100%
50%
10
11 12
pH
Ts de desnaturalizacin.
50%
-10
10
20
30
40
50
(T optima).
T C
Inhibicin competitiva
Ocurre cuando el inhibidor
se une al centro activo,
compitiendo con el sustrato.
1/V
Con inhibidor
Sin inhibidor
vmax
Sin inhibidor
Pendiente= KM / Vmax
Con inhibidor
1/Vmax
Aumenta Km
No cambia Vmax
-1/Km
1/[S]
Km-I
Km+I
[s]
Inhibicin no competitiva
Ocurre cuando el inhibidor se une
a un sitio del enzima distinto del
centro activo: no compite con el
sustrato. Pero modifica la
configuracin del enzima
retrasando la unin con el sustrato.
1/V
Con inhibidor
Sin inhibidor
vmax
Sin inhibidor
Pendiente= KM / Vmax
1/Vmax
Con inhibidor
No cambia Km
Disminuye Vmax
-1/Km
1/[S]
Km-I
Km+I
[s]
Inhibicin acompetitiva
Complejo sustrato-enzima
1/V
Con inhibidor
Sin inhibidor
vmax
Sin inhibidor
Pendiente= KM / Vmax
1/Vmax
Con inhibidor
Disminuye Km
Disminuye Vmax
-1/Km
1/[S]
Km-I
Km+I
[s]
Modulacin alostrica I
El trmino alostrico significa otro sitio y tambin otra forma.
Los enzimas alostricos son aquellos, que presentan dos sitios y dos formas.
Los sitios son lugares donde se pueden unir sustancias. Uno es el centro activo, al
que puede unirse el sustrato y otra el centro regulador, al que puede unirse, de
forma reversible, otra sustancia llamada ligando.
Las formas son dos conformaciones espaciales, que estn en equilibrio qumico. Una
es la tensa, en la que sustrato no se puede unir, forma inactiva y la otra es la
relajada, en la que el sustrato se puede unir.
Forma tensa
Forma relajada
Centro activo con
afinidad al sustrato
Centro regulador
Centro regulador
Modulacin alostrica II
El equilibrio puede romperse cuando se une el ligando al centro regulador, dando estabilidad a la
forma a la que se una.
Si la unin siempre estabiliza la forma relajada al ligando se le denomina efector alostrico.
Si la unin siempre estabiliza la forma tensa al ligando se le denomina inhibidor alostrico.
Forma tensa estabilizada
Forma tensa
Forma relajada
Inhibidor alostrico
Efector alostrico
E1
E2
E3
Inhibidor alostrico
Producto final
E1
Efector alostrico
E2
E3
Producto final
Sustrato
Ligando
Variacin V
V/2
KM
Variacin S
[S]
Fosfatasa
Pi
O-Pi
Forma
activa
Tripsingeno:
inactivo
Extremo ms corto
Tripsina:
activa
Modulacin isoenzimas
Se llaman isozimas o isoenzimas a los enzimas que catalizan la misma reaccin
pero que pueden distinguirse por alguna caracterstica fsica, estructural,
inmunolgica, etc. Su origen es gentico.
Las diferencias que presentan, se traducen en ligeros cambios en sus propiedades,
de forma que cada isozima se adapta perfectamente a la funcin que debe
realizar.
Se diferencian isoenzimas en funcin de:
- el tipo de tejido: Por ejemplo, la Hexokinasa, presenta, al menos, cuatro formas
distintas:
- Heptica
- Cerebral
- Muscular
- Eritrocitaria
- el compartimento celular donde acta: Por ejemplo, la malato deshidrogenasa
del citoplasma es distinta de la de la mitocondria.
- el momento concreto del desarrollo del individuo: Por ejemplo, algunos enzimas
de la glicolisis del feto son diferentes de los mismos enzimas en el adulto.