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Grupos Bsicos
Durante la catlisis, el nitrgeno bsico de la histidina es capaz de captar un protn de la serina, tironina y cistena por eso forma parte del centro cataltico de determinadas enzimas.
Lisina y Arginina son aa muy bsicos, sus cadenas laterales estn cargadas positivamente dentro de la clula (hidrfilos), se encuentran en contacto con el agua en la superficie de las protenas.
Histidina puede estar sin carga o cargada positivamente a pH fisiolgico, as que con frecuencia desempea un papel activo en reacciones enzimticas que implican intercambio de iones hidrgeno (catlisis enzimtica)
Anillos Aromticos
Fenilalanina y Triptfano son aa no polares con cadenas laterales que contienen anillos aromticos muy hidrfobos Tirosina con cadena lateral sin carga pero polar porque tiene un grupo hidroxilo
Iminocidos
Un iminocido es cualquier molcula que contenga tanto un grupo funcional imino (>C=NH) como un carboxilo (-C(=O)-OH).
Las enzimas del tipo aminocido oxidasa son capaces de convertir aminocidos en iminocidos. Adems, el precursor biosinttico del aminocido prolina es el iminocido (S)-1pyrrolina-5-carboxylato (P5C).