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4.1.2.

Formula de tres puntos


Supongamos que solo tenemos tres datos decir, con igualmente espaciados,es . Aplicando la frmula

anterior con tres puntos, para respectivamente, obtenemos las tres siguientes frmulas (llamadas de "tres puntos")

Planteamiento inverso En primer lugar es necesario demostrar la existencia de ligamiento entre los tres loci analizados. Suponiendo que se trata de un cruzamiento prueba entre un tri eterocigoto (Aa!b"c) # un omocigoto recesivo (aabbcc) los pasos que es necesario realizar para demostrar la existencia de ligamiento son los siguientes$ a) "omprobar mediante un c% que el locus A,a segrega correctamente$ & A & a. b) "omprobar mediante un c% que el locus !,b segrega correctamente$ & ! & b. c) "omprobar mediante un c% que el locus ",c segrega correctamente$ & " & c. d) "omprobar mediante un c% que la segregacin combinada de los loci A,a # !,b no se a'usta a la esperada en caso de independencia (( A!, ( Ab, ( a!, ( ab). e) "omprobar mediante un c% que la segregacin combinada de los loci A,a # ",c no se a'usta a la esperada en caso de independencia (( A", ( Ac, ( a", ( ac). f) "omprobar mediante un c% que la segregacin combinada de los loci !,b # ",c no se a'usta a la esperada en caso de independencia (( !", ( !c, ( b", ( bc). g) "omprobar que la segregacin combinada de los tres loci A,a ) !,b # ",c no se a'usta a la esperada en caso de independencia (*+, A!", *+, A!c, *+, Ab", *+, a!", *+, Abc, *+, a!c, *+, ab" # *+, abc).

-na vez demostrada la existencia de ligamiento entre los tres loci, el ob'etivo del problema de los tres puntos es deducir a partir de los datos de una descendencia$ *. El orden relativo de los tres loci, es decir, determinar el locus que ocupa la posicin central. %. "alcular los valores de la fraccin de recombinacin (r* # r%) entre el locus central # cada uno de los extremos, # entre los dos loci extremos (r). .. "alcular el valor del coeficiente de coincidencia (c) # de la interferencia (/) entre los tres loci. 0ara ello, vamos a suponer que estamos analizando la descendencia de un cruzamiento prueba entre un individuo tri eterocigoto (Aa!b"c) en fase de acoplamiento (A!"+abc) # un omocigoto recesivo (aabbcc). 1uestro primer ob'etivo ser2 averiguar el orden de estos tres loci sobre el mismo cromosoma, es decir, determinar cual es el locus que ocupa la posicin central. Esta cuestin puede ser resuelta de dos formas distintas$

*. En un cruzamiento prueba como el indicado (Aa!b"c x aabbcc), suponiendo

3ue los tres loci est2n en fase de acoplamiento (A!"+abc) # que el locus central es el !,b) se esperan oc o clases de descendientes. 4as dos clases m2s frecuentes ser2n las procedentes de gametos parentales formados cuando no se da

sobrecruzamiento entre los loci analizados$ A!" # abc. 4as dos clases menos frecuentes ser2n las dobles recombinantes, procedentes de gametos originados cuando se da sobrecruzamiento entre el locus A,a # el locus !,b # tambi5n entre el locus !,b # el locus ",c$ Ab" # a!c. Aquel locus cu#o intercambio de alelos en las clases dobles recombinantes reconstitu#e las clases parentales ser2 el central. En el caso que nos ocupa, el 6nico locus que cumple esta condicin es el !,b.

b) 4a otra forma de determinar el locus central consiste en calcular las distancias gen5ticas entre los tres loci considerados. 4a distancia gen5tica es el valor de la fraccin de recombinacin en tanto por cien. 4a distancia ma#or corresponder2 a los dos loci extremos. En este caso, la ma#or distancia gen5tica corresponder7a a la encontrada entre los loci A,a # ",c. 0or tanto, el locus central ser7a el !,b. Es importante destacar que para determinar el locus central # calcular las fracciones de recombinacin # distancias gen5ticas es necesario analizar los tres loci en los mismos descendientes. 0odr7a darse el caso (normalmente bastante frecuente) de que no se a#a podido determinar el fenotipo de algunos individuos

para alguno de los tres loci estudiados. 0or e'emplo, en un individuo A!8 se abr7a determinado su fenotipo A para el locus A,a, su fenotipo ! para el locus !,b # no se abr7a podido averiguar su constitucin gen5tica en el locus ",c. En otro individuo de la descendencia puede ser otro locus diferente el que no se a#a podido analizar. 0ara determinar el orden es necesario emplear descendientes en los que a#a sido posible determinar el fenotipo en los tres loci estudiados. 0osteriormente, calculamos los valores de la fraccin de recombinacin. 9raccin de recombinacin entre A,a # !,b) r*$

9raccin de recombinacin entre !,b # ",c) r%$

9raccin de recombinacin entre A,a # ",c) r$

:eniendo en cuenta que el locus central es el !,b, el ma#or valor de la fraccin de recombinacin corresponder2 a r. 0or 6ltimo, calculamos el coeficiente de coincidencia (c) que se define como la frecuencia de los dobles sobrecruzamientos observados frente a los dobles sobrecruzamientos esperados.

El coeficiente de coincidencia (c) nos permite saber si se da interferencia cromosmica (/), es decir, si el ec o de que se de un sobrecruzamiento en una determinada regin (por e'emplo entre el locus A,a # el !,b) favorece o impide el que se den m2s sobrecruzamientos en una regin prxima a la anterior (por e'emplo entre el locus !,b # el ",c). 4a interferencia (/) se define como / ; * 8 c, pudiendo ser positiva cuando c es menor que uno # negativa cuando c es ma#or que *. "uando c es igual a * (igual cantidad de dobles sobrecruzamientos observados # esperados) se dice que no a# interferencia.

Planteamiento directo
En el planteamiento directo sabemos que tres loci est2n ligados, conocemos las frecuencias de recombinacin # (r*, r% # r), el valor del coeficiente de coincidencia (c) # la interferencia (/). A partir de estos datos, lo que se pretende es calcular las frecuencias de los gametos que produce un tri eterocigoto (Aa!b"c) #, por consiguiente, las frecuencias de los , fenotipos distintos de la descendencia obtenida en un cruzamiento prueba (Aa!b"c x aabbcc). En el siguiente esquema se indican los oc o tipos de gametos que produce un tri eterocigoto en fase de acoplamiento (A!"+abc), as7 como las frecuencias de los oc o tipos de individuos de la descendencia (oc o fenotipos).

En el esquema anterior emos visto los , tipos de gametos que produce el parental tri eterocigoto en fase de acoplamiento, emos clasificado los gametos en base a si se da sobrecruzamiento slo en la regin / (entre A,a # !,b), slo en la regin // (entre !,b # ",c), en ambas zonas / # // (uno entre A,a # !,b # el otro entre !,b # ",c) # cuando no se da ning6n sobrecruzamiento. 4a suma de las frecuencias de los , tipos de gametos debe ser la unidad$ %# < %z < %t < %x ; * (total gametos). El valor del coeficiente de coincidencia (c) es$

El valor de la fraccin de recombinacin en la regin / se calcular7a como$

El valor de la fraccin de recombinacin en la regin // se obtendr7a de la siguiente forma$

:eniendo en cuenta que conocemos el valor del coeficiente de coincidencia (c)) el valor de la fraccin de recombinacin en la regin / (r*), # el valor de la fraccin de recombinacin en la regin // (r%). 4o me'or es despe'ar el valor de la frecuencia =t> (gameto doble recombinante) en la frmula del coeficiente de coincidencia$

-na vez conocido el valor de "t", podemos averiguar el valor de la frecuencia "#" despe'ando en la siguiente frmula$

9inalmente, slo necesitamos conocer el valor de la frecuencia =x>, frecuencia que tendr7amos despe'ando en la siguiente ecuacin$

:eniendo en cuenta que se trata de un cruzamiento prueba # que, por tanto, los fenotipos de la descendencia coinciden con los gametos producidos por el individuo tri eterocigoto, las frecuencias de los diferentes tipos de gametos indicados coincidir7an con las de los , fenotipos distintos obtenidos en el cruzamiento.

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