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Bioq 19
Bioq 19
A G C T
Formas cristalinas:
1. Estructura helicoidal
2. Periodicidad a 3.4 nm
3. Periodicidad a 0.34 nm
4. R.E.Franklin sugiere que el eje
ribosa-fosfato está hacia fuera y
las bases hacia dentro. Igualmente
sugiere que se trata de una doble
hélice, y no triple
3’ 5’
0.34 nm
CH3
O T
H H (a) Adenina (A) sólo puede
A N interaccionar con timina (T)
N N (y viceversa), a través de dos
N H
N puentes de hidrógeno, y
O
N N
(b) Guanina (G) sólo
puede interaccionar con
H citosina (C) (y viceversa),
C
a través de tres puentes
N de hidrógeno
H
G O
N N
N H
N
O
H
N N N
H
Modelo de Watson-Crick, F
7. La base está situada
8. La desoxirribosa en posición anti-
en forma furanósica
5’
1’
4’
2’
3’ 9. El anillo furanósico está
en conformación endo-2’
Surco
estrecho
10. El eje de la doble hélice
no pasa por el centro geométrico
del par de bases. Esto determina
que la hélice presente un surco
Surco ancho y un surco estrecho
ancho
Modelo de Watson-Crick, G
Geometría de la doble hélice (DNA-B)
3.4
Paso de rosca 3.4 nm
0.34
Distancia entre 0.34 nm
planos de bases
Anchura 2.4 nm
Interacciones débiles que mantienen la estructura del DNA
2. Interacciones hidrofóbicas
entre planos de bases contiguos
(int. de apilamiento, stacking)
5’ -
O O H
N
N
O
3’
P O N CH2
- H
O N O
O N O
H O-
N P
H2C N N
O H O O-
N
- O N O
O O
H H CH2
P N
-
O N N O
O H O-
N
N P
H2C H H
N O O O-
O
H N
N O
-
O O N
H CH2
P O
- N N
O H3C H O
O N O-
P
H2C N O H3C O O-
O
O
-
O O H O
H N N CH2
P N
- H
O N O O
O N O-
P
H2C N N
O H O O-
N
-
O O H O
N
O N CH2
P
- H
O N O
O N O
H O-
N P
H2C N N
O H O O-
3’ O 5’
Implicaciones genéticas del modelo, 1
5’-CGTTGCAATTGCGAT-3’ 5’-CGTTGCAATTGCGAT-3’
3’-GCAACGTTAACGCTA-5’ 3’-GCAACGTTAACGCTA-5’
Implicaciones genéticas del modelo, 2
A B Z
% Incremento
Absorbancia a
260 nm
La desnaturalización
térmica del DNA sigue
una curva sigmoide. El
punto medio, Tm, está
relacionado con el conte-
nido en G+C. Así, la muestra
B tiene un mayor contenido
en G+C que A.
T, ºC
Superhélices de DNA
OH
-
O O
P H H
-
N
O
O
N
H2 C
N O
O
-
O O OH
P O
-
O H
Uracilo en lugar de timina
O N
H2 C N O
O
-
O O OH H
H N
P
-
O N
O N
H2 C N N
O
-
-
O
P
O OH
O
H
RNA
O N
O N
H
N
H2 C N N
O H
3’ O OH
1. Reactividad química:
2. Estructura tridimensional
5’
5’
4’ 1’ 1’
4’
3’ 2’ 3’ 2’
O
H C CH3 O NH2
N
CH3
HN
HN N Bases
O N O N
anómalas
O N
O
O N O H
N N
H
N
N
HOCH2 HOCH2
N N Nucleósidos
O O H
anómalos
HO OH HO O
CH3
Participan en el procesado
del RNA transcrito primario
y en la formación de enlace
peptídico en la síntesis de
proteínas.
Ribozima
hammerhead
7. Funciones y tipos de RNA, 1
5’
Lazo T--C
Lazo DHU
Lazo variable
tRNA
Lazo anticodon
-
O O
P O
- H
O N
O N
H
N
H2C N N
O H
OH
-
O O
P H H
-
N
O
O
O
C
extremo 3’ del tRNA O
-
O O OH
H H
P N
-
O
O
C
N
H2C N O
O
-
O O OH H
H N
P
-
O
A
O N
N
H2C N N
O
H O OH
H3 N C C
R O
Estructura tridimensional del tRNA
3’
5’
Extremo
aceptor
Lazo TC
Lazo
variable
Lazo
anticodon
3’ Lazo anticodon
5’
5’
A
U
mRNA
G
I C
C
3’
rRNA 23s