Lic. TM.

Juan Erick Castillo Polo

 Virtualmente todas las reacciones
del cuerpo son mediados por
enzimas, que son proteínas
catalíticas que incrementa la
velocidad de las reacciones sin
cambios en el proceso global.

 Las enzimas dirigen todos los

eventos metabólicos
 Nombre recomendado: El nombre de las enzimas más comúnmente
usadas tiene el sufijo “asa” unido al substrato de una reacción (por
ejemplo, glucosidasa, ureasa, sucrasa) o a una descripción de una acción
realizada (por ejemplo, lactato deshidrogenasa y adenil ciclasa).

 Algunas enzimas retienen su nombre de origen, cual no dan indicios de la

reacción enzimática asociada.

 Nombre sistemático: La Unión Internacional de Bioquímica y Biología

molecular a desarrollado un sistema de nomenclatura en el cual las
enzimas son divididad en 6 clases.
A. Sitio Activo

B. Eficiencia catalítica

C. Especificidad

D. Cofactores

E. Regulación

F. Localización dentro de la célula

A. Sitio Activo
A. Sitio Activo
A. Sitio Activo
A. Sitio Activo
B. Eficiencia catalítica: La mayoría de las reacciones
catalizadas por enzimas son altamente eficientes, producen
entre 103 a 108 veces más rápido que reacciones no
catalizadas por enzimas. Típicamente cada enzima es capaz
de transformar entre 100 a 1000 moléculas de substrato en
producto cada segundo.
C. Especificidad: Las enzimas son altamente específicas,
interaccionan con uno o algunos substratos y cataliza sólo un tipo
de reacción química.

D. Cofactores: Algunas enzimas están asociadas con un cofactor no

proteico necesario para la actividad enzimática. Comúnmente los
cofactores encontrados incluyen iones metálicos con Zn2+ o Fe2+
y moléculas orgánicas, conocidas como co-enzimas que son a
menudo derivados de las vitaminas.
D. Cofactores:
D. Cofactores:
D. Cofactores:

Sustrato
oxidado
D. Cofactores:
E. Regulación: La actividad enzimática puede ser regulada, es decir puede
ser activada o inhibida, por lo tanto la velocidad de formación del
producto responde a las necesidades de la célula.

F. Localización dentro de la célula: Muchas de las enzimas son

localizadas en organelas específicas dentro de la célula. La
compartimentalización sirve para aislar la reacción. Esto procee un
medio favorable para la reacción y la organización de cientos de
enzimas presentes en la célula dentro de una vía determinada.
 MITOCONDRIA
Ciclo del ATC, CITOSOL
oxidación de ácidos grasos, Glicolisis
dexcarboxilación de piruvato
Síntesis de ácidos
grasos

NUCLEO,
Síntesis de DNA y RNA
 El mecanismo de la acción enzimática puede ser vista de dos

diferentes perspectivas. El primero trata la catálisis en términos de

cambio de energía que ocurren durante la reacción. La segunda

perspectiva describe como el sitio activo facilita químicamente la

catálisis.
A. Cambios de Energía que

ocurren durante la reacción:

1. Energía libre de activación:

2. Velocidad de reacción

3. Vía de reacción alternativa

B. Química de los sitios activos
1. Estabilización del estado de transición

2. Otros mecanismos

3. Visualización del estado de transición

S E
E
E
Enzyme may
be used
Enzyme- again
substrate P
complex
P
Reaction coordinate
A. Concentración del substrato
1. Velocidad máxima

2. Curva hiperbólica de la cinética enzimática

B. Temperatura
1. Incremento de la velocidad con temperatura

2. Disminución de la velocidad con altas temperaturas

Q10 Denaturation
Enzyme
activity

0 10 20 30 40 50
Temperature / °C
C. pH
1. Efecto del pH en la ionización del sitio activo

2. Efecto del pH en la denaturación de la enzima

3. El pH óptimo varía para cada enzima

Optimum pH values

Enzyme
activity Trypsin

Pepsin
1 3 5 7 9 11
pH
A. Modelo de reacción
k1 k2
E+S k-1
ES E+P

Michaelis-Menten kinetics

B. Ecuación de Michaelis-Menten

[S] >> [E]

[ES] ~ constant

V0 = K2 [ES]
C. Conclusiones importantes sobre la Cinética de M - M

Effect of substrate concentration on the initial velocity

of an enzyme-catalyzed reaction

Vmax [S] k 2 +k -1
V0  Km 
K m [S] k1

Michaelis constant

 Vmax
Velocidad de la reacción (v)

Vmax/2

Km Concentración de Sustrato [S]

La Km es la concentración de sustrato donde se obtiene la mitad de la Vmax

 Vmax
Velocidad de la reacción (v)

Vmax/2

Km Concentración de Sustrato [S]

• A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato

• A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
 D. Diagrama de Lineweaver-Burk

Vmax [S]
V0 
K m  [S]

 1 Km 1
 
V0 Vmax [S] Vmax

Lineweaver-Burk equation
Inhibidor:
• Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos (alostéricos).
• Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la enzima a
través de desnaturalización de la molécula enzimática
• De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:
• Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo
• Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula, causando un
cambio conformacional con repercusión negativa en la actividad enzimática.
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:

1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima

libre, con el complejo enzima-substrato o con ambos:

E+I EI

ES + I ESI

2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:

E+I E’
Inhibición reversible

a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la

fijación del substrato: Inhibición Competitiva
b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga
o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación del
substrato a la enzima, pero sí impide la acción catalítica: Inhibición
No Competitiva
c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato una
vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se conoce
como Inhibición Anticompetitiva
Inhibición Competitiva

 Compiten con el sustrato por el sitio

activo de la enzima

 Se une solo a la enzima libre

 V máx no se altera y K M cambia

Al aumentar la cantidad de
SUSTRATO el inhibidor competitivo
es desplazado y se forma producto
 Inhibición Competitiva
 Inhibición Competitiva
Inhibición No Competitiva

 Se une a un lugar diferente del

sitio activo la enzima

 Se une a la enzima libre y también

al complejo enzima-sustrato

 Por acción del inhibidor disminuye

la Vm pero el valor de Km no se
altera
Inhibición No Competitiva
Inhibición Anticompetitiva o Incompetitiva

• En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo

después de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, inhibidor y sustrato no
compiten. De esta manera, aunque todo el sustrato esté saturando la enzima
y toda la enzima esté como complejo ES, el inhibidor puede enlazarse
produciendo un complejo inactivo ESI.

• Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por tanto, incrementa

la unión del sustrato a la enzima, disminuyendo Km . Sin embargo, el
complejo ESI no conduce a productos y Vm disminuye.
Inhibición Anticompetitiva o Incompetitiva

 Se une a un lugar diferente del sitio activo de la enzima

 Se une sólo al complejo enzima-sustrato

 Los efectos que tiene: disminuye el valor de Km y

también el de Vmáx

S
E ES E+P
I
Inhibición
Anticompetitiva

ESI
El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES;
el complejo ESI no es productivo
Inhibición Irreversible

• Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico de la

enzima, modificándola covalentemente
• Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki, sino por
una constante de velocidad ki:

E+I E’
• A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los inhibidores
irreversibles depende del tiempo de actuación del inhibidor.
• Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente tóxicos.
Inhibición Irreversible

 Producen inactivación permanente de la actividad enzimática

 Se interfiere con el normal desarrollo de una reacción o vía metabólica

 Ejemplos: p-cloromercuribenzoato, yodoacetato, diisopropilfluorfosfato

 Son enzimas cuya estructura proteica está formada de varias
subunidades

 No se rigen por la cinética de M - M

 Además del sitio o centro activo tienen sitios alostéricos o de regulación

 Sitio activo/sustratos;

 Sitio alostérico/moduladores o reguladores

 La relación entre la velocidad de reacción y la concentración de sustrato

sigue cinética sigmoídea
 Las enzimas alostéricas presentan
estructura cuaternaria.
 Tienen diferentes sitios activos,
unen mas de una molécula de
sustrato
 La unión del sustrato es
cooperativa
 la curva de velocidad presenta una
forma sigmoidal