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BASES DE BIOQUÍMICA

“Confía en ti mismo para conseguir tus


objetivos. La espera puede hacerse larga, pero
todo esfuerzo tiene su recompensa”
Objetivo del curso
• Aprender los conceptos básicos que
constituyen la bioquímica.

• Entender las diferentes biomoléculas así como


los procesos que utilizan
¿Qué es la Bioquímica
• “Disciplina científica que trata de explicar la vida a
nivel molecular” Pratt Charlotte 2012

• “La Bioquímica es una ciencia que estudia la


composición química de los seres vivos, especialmente
las proteínas, carbohidratos, lípidos y ácidos nucleicos,
además de otras pequeñas moléculas presentes en las
células y las reacciones químicas que sufren estos
compuestos (metabolismo) que les permiten obtener
energía (catabolismo) y generar biomoléculas propias
(anabolismo)” Anónimo
• “Ciencia reduccionista que intenta explicar el
todo separándolo en partes más pequeñas y
examinando cada parte por separado”
• ¿Química Orgánica?

Enzyme

Organic chemistry Biochemistry


• ¿De qué están hechos los seres vivos?

• Como adquieren y usan la energía los


organismos?

• ¿De qué manera un organismo mantiene su


identidad con el paso de las generaciones?
Moléculas biológicas
Biomoléculas

Carbohydrates Lipids

Proteins Nucleic acids


Grupos funcionales en
Bioquímica
CONCEPTO DE ENLACE

Los enlaces químicos son las fuerzas que


mantienen unidos a los átomos en las
moléculas de los elementos (O2 y Cl2); de
compuestos (CO2 y H2O) y de metales.
Los átomos se combinan con el fin de
alcanzar una configuración electrónica más
estable.
La estabilidad máxima se produce cuando
un átomo es isoelectrónico con un gas
noble.
Solo los electrones externos de un átomo
pueden ser atraídos por otro átomo
cercano.
En la formación de enlaces químicos solo
intervienen los electrones de valencia.
Símbolos de Lewis

Los símbolos de puntos o de electrón punto, llamados


símbolos de Lewis son una forma útil de mostrar los
electrones de valencia de los átomos y de seguirles la
pista durante la formación de enlaces.
ENLACE IÓNICO

Atomos de elementos metálicos se encuentran


con átomos no metálicos.
ENLACE COVALENTE
• Fuerzas que mantienen unidos
entre sí los átomos no
metálicos.
• Estos átomos tienen muchos
electrones en su nivel más
externo (electrones de
valencia) y tienen tendencia a
ganar electrones más que a
cederlos.
COVALENTE POLAR
• Los enlaces covalentes polares se llaman
polares porque al compartir desigualmente los
electrones se generan dos polos a través del
enlace
COVALENTE NO POLAR
• Se presenta entre átomos del mismo
elemento o entre átomos con muy poca
diferencia de electronegatividad.
COVALENTE COORDINADO

• En lugar de aportar un electrón cada átomo


del enlace, los dos electrones son aportados
por el mismo átomo.
PUENTES DE HIDRÓGENO
• se produce a partir de la atracción existente
en un átomo de hidrógeno y un átomo de
oxígeno, flúor o nitrógeno con carga negativa.
FUERZAS DE VAN DER
WAALS
• Son fuerzas de
estabilización molecular
(dan estabilidad a la unión
entre varias moléculas),
también conocidas como
atracciones
intermoleculares o de largo
alcance y son las fuerzas
entre moléculas (fuerzas
entre molecula-molecula).
TIPOS DE FUERZAS DE VAN
DE WAALS
Dipolo- dipolo
• Se forma entre un dipolo
positivo de una molécula
polar con el dipolo negativo
de otra polar.
Interacciones ionicas o dipolo-
dipolo inducido
• En ciertas ocasiones, una
molécula polar (dipolo), al estar
próxima a otra no polar, induce
en ésta un dipolo transitorio,
produciendo una fuerza de
atracción intermolecular
Fuerzas de london o dispersión
• En las moléculas no polares puede
producirse transitoriamente un
desplazamiento relativo de los electrones,
originando un polo positivo y otro negativo
(dipolo transitorio) que determinan una
atracción entre dichas moléculas
INTERACCIÓN HIDROFÓBICA
Química del Agua

• Polar
• 70 %
aproximado de
la masa de
muchos
organismos.
• Alto punto de ebullición
• Solvente universal
• Molécula dipolar
• Carga neta 0
• Tensión superficial: debido a la interacción dipolo
• Densidad del hielo menor que la del agua líquida
• El hielo tiene propiedades aislantes
• Estructura
del hielo.
Enlaces de Hidrógeno
• El Oxígeno del agua posee una hibridación sp3
dando una unión H-O-H de 104.5° (menor a la
de un tetraedro por repulsión de e- del O), y
no de 90° (si los H estarían unidos a los
orbitales 2py y 2pz).
• El oxígeno es más electronegativo que el H y
por tanto el enlace O-H es polar.
• 4Kcal/mol
• 1.8 A vs 1.0 A
• N-H, O-H, S-H
Enlaces de Hidrógeno en
Sistemas Biológicos
• Se forma cuando un átomo de H (unido de
modo covalente a un O o N) se encuentra
entre 0.27 y 0.30nm de un átomo de O o N.
• Un enlace S-H puede formar enlaces débiles
de hidrógeno.
• Pueden ser intramoleculares (dentro de una
molécula) o intermoleculares (entre
moléculas).
• ventaja energética
Efectos hidrofóbicos
• Ventajas en sistemas biológicos
SOLUCIONES
• Se define como el número de moles de soluto
en un litro de solución. Se representa con la
letra M y sus unidades son mol l-1
NORMALIDAD
Es el número de Equivalentes Químicos (eq) de soluto, disueltos en un
litro de solución. Se representa con la letra N y sus unidades son eq l-1
OSMOLARIDAD
• El número de Osmoles de soluto por litro de
solución. Se representa son el símbolo Os y
tiene unidades de Osmol l-1.
• Porcentaje en Peso

• Porcentaje en volumen

• Porcentaje en peso a volumen


Fracción Molar
Osmosis y Difusión.
Gradiente de concentración
Ósimosis
Difusión
Química de ácidos y bases
• Agua = reactividad química
• Agua puede ionizarse
• No existen protones aislados, más bien se
vinculan.

• Salto de protones
[H+][OH-] relación inversa
• Según la ley de acción de masas, la ionización
del agua puede describirse por medio de una
constante de disociación
• Kw= constante de ionización del agua.

• [H+] y [OH-] = 107


• Una solución donde [H+][OH-] equivalen a 107
se dice que es neutra.
• [H+] > ácida
• [OH-] < Básico
• pH= -log [H+]

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pH = log10 [H+]
¿Qué pasa entre el H2O y el HCL y el NH3?

pH=-log [H+]
pH=7
pOH=7
Se dispone de ácido nítrico 0.01 M. Calcular el
pH. (HNO3)
Calcular el pH de 1L de agua a la cual se añaden
a) 10 mL de HCl 5.0 M
b) 10 mL de NaOH 5.0 M

C1V1= C2V2
• Calcular el pH de una disolución 0.05 M de
ácido acético sabiendo que su Ka a 25°C es
1.79X10-5
• A 25°C, el pH de una solución es de 4.5.
Calcular la concentración de iones hidronio y
de iones hidroxilo.
¿Cómo funciona un
Buffer?

VIDEO
• Cuando un ácido fuerte como HCl se coloca en
agua = Descenso del pH
• Cuando HCL se agrega a solución con ácido
débil, pH no cambia mucho.
• Cuando una Base NaOH se agrega a su base
conjugada, pH no cambia.
• The weak acid/conjugate base system (HA/A2)
acts as a buffer against the added acid or base
by preventing the dramatic changes in pH
• A buffer solution is typically prepared from a
weak acid and the salt of its conjugate base.

• biochemist must consider other factors,


including the compound’s solubility, stability,
toxicity to cells, reactivity with other
molecules, and cost.
Se requiere preparar 100 ml de una solución
amortiguadora, para un pH= 5 pero el laboratorio sólo
cuenta con ácido acético (Reactivo líquido, MM=60.05
g/mol, densidad= 1.064 g/mol, pureza= 98%) e Hidróxido
de Sodio (Reactivo sólido que se comporta como
electrolito fuerte, MM= 40 g/mol, pureza= 99%)
a) Indicar el volumen en mililitros, de ácido acético y los
gramos de hidróxido de sodio que deben mezclarse para
preparar la solución, si se requiere que la concentración
total del buffer sea igual a 0.5 M
• Principio de Le Chatelier
• Principio de Le Chatelier:
– Un cambio en la concentración de un reactivo
desplazará las concentraciones de los otros
reactivos a fin de reestablecer el equilibrio.

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