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Curso: BIOQUÍMICA
TEMA: PROTEOMICA
TERCERA estrategias
La primera estrategias LA SECUNDA ESTRATEGIA Pretende minimizar la
Etiqueta de secuencia para la intervención del especialista
Para la identificación de en la identificación de las
identificación de proteínas. Ella
proteínas en las bases de proteínas en las bases de datos
plantea que para lograr la
datos se basa en que la de secuencias.
identificación solo es necesario Esta estrategia se conoce como
digestión proteolítica de una extraer una pequeña secuencia huella de masas del espectro y
proteína con una proteasa parcial (3 a 4 aminoácidos) del se basa en que cada péptido
altamente específica, origina espectro de un péptido. que se fragmenta mediante un
de manera reproducible un Este método revolucionó la proceso de disociación inducida
conjunto de péptidos identificación de las proteínas a por colisiones produce un
que es característico para partir de la secuencia deducida espectro de iones fragmentos
cada una de las proteínas. que es muy característico de su
de los espectros de masas por
secuencia y que lo diferencia
cuanto se requería una
del resto de los péptidos
interpretación exhaustiva del almacenados en las bases de
espectro. datos.
APLICACIONES DE LA PROTEÓMICA
.
1. Caracterización del
2. Proteómica
proteoma de un 3. Interacción de
organismo. Comparativa Proteínas.
El propósito de este estudio Consiste en evaluar los la importancia de
es la identificación del cambios en identificar las
mayor número de proteínas la expresión de proteínas interacciones entre
expresadas por un de un organismo sometido proteínas y de proteínas
organismo en una condición a dos o varias condiciones con otras moléculas. En
biológica particular. En el biológicas diferentes, varias publicaciones se
caso de organismos generalmente una de ellas han reportado los
unicelulares o de células en es una condición control resultados de aislamiento
cultivo, muchos trabajos se que se utiliza como de complejos de
han propuesto la referencia de la expresión proteínas y la posterior
separación y la de proteínas en identificación de las
identificación de proteínas. condiciones “normales”. proteínas componentes
¿ QUE SON LAS PROTEÍNAS?
son macromoléculas formadas por cadenas
lineales de aminoácidos.
Por sus propiedades fisicoquímicas, las
proteínas se pueden clasificar en proteínas
simples (holoproteidos), formadas solo
por aminoácidos o sus derivados; proteínas
conjugadas (heteroproteidos), formadas por
aminoácidos acompañados de sustancias
diversas, y proteínas derivadas, sustancias
formadas por desnaturalización
desdoblamiento de las anteriores. Las proteínas
son necesarias para la vida, sobre todo por su
función plástica (constituyen el 80 %
del protoplasma deshidratado de toda célula),
pero también por sus
funciones biorreguladoras (forman parte de
las enzimas) y de defensa (los anticuerpos son
proteínas).
De acuerdo al tipo de grupo prostético, las proteínas conjugados pueden
clasificarse a su vez en:
– nucleoproteínas. Una nucleoproteína es una proteína que está
estructuralmente asociada con un ácido nucleico (que puede
ser ARN o ADN).
Proteínas conjugadas
_Fosfoproteína. Una fosfoproteína es una proteína unida covalentemente a
Formadas por aminoácidos
y por un compuesto no una sustancia que contiene ácido fosfórico, a través del mismo. Un ejemplo
peptídico. En estas de tal grupo es un grupo fosfato. El aminoácido que es fosforilados suele
proteínas, la porción poli
ser serina, treonina, tirosina, aspartato o histidina.
peptídica se denomina
apoproteina y la parte no – glicoproteínas. Las glicoproteínas son moléculas compuestas por
proteica se denomina una proteína unida a uno o varios glúcidos, simples o compuestos.
grupo prostético.
– flavoproteinas. Las flavoproteínas actúan como enzimas. Estas proteínas se
caracterizan por poseer un nucleótido derivado de la vitamina B2.
– hemoproteinas. Las hemoproteínas, son metaloproteínas que poseen un
grupo prostético hemo, el cual está unido permanentemente con enlaces
covalentes y no covalente a las cadenas de la proteína y están presentes en
una gran cantidad de organismos.
La albúmina. La albúmina es una proteína que se
encuentra en gran proporción en el plasma
Proteína Simples sanguíneo, siendo la principal proteína de la sangre,
Formadas solamente por
y una de las más abundantes en el ser humano. Se
aminoácidos que forman
cadenas peptídicas. sintetiza en el hígado.
La Globulina. Las globulinas son un grupo de
proteínas solubles en agua, solubles en disoluciones
salinas, que se encuentran en todos los animales y
vegetales. Entre las globulinas más importantes
destacan las seroglobulinas (de la sangre), las
lactoglobulinas (de la leche), las ovoglobulinas (del
huevo), la legúmina, el fibrinógeno,
las inmunoglobulinas (anticuerpo) y numerosas
proteínas de las semillas.
De acuerdo a su valor nutricional, las proteínas
pueden clasificarse en:
1. Proteínas fibrosas. Son aquellas que están formadas por cadenas polipeptídicas,
formando estructuras compactas llamadas fibras. Por ejemplo:
• La fibroína. Es producida por insectos, sobre todo por las arañas y el gusano de seda.
• El colágeno. Constituye el componente proteico principal del tejido conectivo.
• La queratina. Puedes encontrarla en las uñas, garras, pico, pezuñas, cuernos, pelo,
lana, y en capa externa de tu piel.
• La elastina. Le proporciona elasticidad a tu piel y a los vasos sanguíneos.
• Proteínas globulares. Están formadas por cadenas polipeptídicas que adoptan una
forma esférica. Por ejemplo: enzimas, anticuerpos, hormonas. La mayoría de las
proteínas que conoces, pertenecen a esta clase. Desempeñan funciones
estructurales y mecánicas, actuando como:
2. FUNCIONAN COMO ENZIMAS