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Facultad de Ingeniería

UNIVERSIDAD DE MENDOZA
Pasaje Descote750
5500 Mendoza
República Argentina
Teléfono 061-201872

CURSO

“EXPERIMENTACIÓN CON BASES DE DATOS


DE SEÑALES CARDIOLÓGICAS. RECURSOS DE
PHYSIONET. ”
DICTADO POR:
DR. ING. JESÚS RUBÉN AZOR MONTOYA
2011
Matrices

MATLAB trabaja esencialmente con un solo tipo de objetos – una


matriz numérica rectangular con elementos que pueden ser
complejos- todas las variables representan matrices. Las
matrices 1-por-1 son interpretadas como escalares y las
matrices con sólo una fila o columna son interpretadas como
vectores.
Las matrices pueden ser incorporadas a MATLAB en diversas
formas:

•Ingresadas por una lista explícita de elementos.


•Generadas por sentencias o funciones incorporadas (built-in).
•Creadas en un archivo M.
•Cargadas desde archivos de datos externos.
Ingresadas por una lista explícita de elementos.

Por ejemplo, una u otra de las sentencias

A = [1 2 3; 4 5 6; 7 8 9]
Y

A=[
123
456
789]

crean la matriz 3-por-3 y la asigna a la variable A. Inténtelo. Los


elementos dentro de una fila de una matriz pueden estar
separados por comas así también como por un espacio.
Generadas por sentencias o funciones incorporadas (built-in).

Funciones incorporadas (built-in) como rand o magic, por citar


algunas, proveen una forma fácil de crear matrices con las cuales
experimentar.
El comando rand(n) creará una matriz n-por-n con elementos
generados aleatoriamente con distribución uniforme entre 0 y 1,
mientras que rand(m,n) creará una matriz m-por-n
Como segundo ejemplo, magic(n) creará una matriz de enteros la
cual es un cuadrado mágico (filas y columnas tienen la misma
suma)
Creadas en un archivo M.
MATLAB puede ejecutar una secuencia de sentencias almacenadas sobre
archivos de disco. Tales archivos son llamados “M-files” porque deben tener
extensión “.m”.
Hay dos clases de archivos M: script y function.
Los archivos script son frecuentemente usados para ingresar datos en una
gran matriz, en un archivo de este tipo los errores pueden ser fácilmente
editados. Si, por ejemplo, se ingresa en un archivo de disco data.m a través
de un simple editor como Notepad (Block de notas) con la siguiente
estructura

A=[1234;5678]

Se obtiene
Cargadas desde archivos de datos externos

En ocasiones, los datos pueden estar presentes en archivos externos


con distintas extensiones pero en formato ascii.
Para recuperarlos desde Matlab en forma de matriz se utiliza función
load.
A modo de ejemplo, cree desde el Bloc de Notas un archivo con la
siguiente estructura y denomínelo data.txt:

Recupere los datos en la matriz datos con la instrucción


Carga de una matriz a un archivos de datos externo

Esta es la operación inversa a la anterior. Aquí los datos están


presentes en una variable interna en forma de matriz y se
pretende guardarla en un archivo externo con alguna
extensión, pero en formato ascii.
Para lograr esto desde Matlab, se utiliza función save.
A modo de ejemplo, cree la siguiente matriz de datos:

Abriendo ahora el archivo creado (matriz.txt) con el Block de


notas, se puede visualizar el contenido de la matriz
Archivos binarios (.mat)

Para guardar todo el contenido del espacio de trabajo (workspace) se


utiliza el comando save.
Por ejemplo,

save c:\datos\sesion

guarda todo el contenido del espacio de trabajo en el archivo


sesion.mat (MATLAB añade automáticamente la extensión mat, de ahí
que los archivos así generados se conozcan como archivos MAT).
Es posible guardar sólo variables concretas especificando el nombre de
las mismas después del nombre del archivo.
Por ejemplo, save c:\datos\sesion x y z sólo guarda las variables x, y y z
en el archivo sesion.mat.
Por defecto los datos se almacenan en formato binario (no legible por
nosotros), pero es posible hacerlo en formato ASCII (legible, como ya
se ha visto) añadiendo el modificador -ascii al final de la instrucción.
Archivos binarios (Ejemplos)
Se define una matriz numérica asignada a una variable M:
Seccionamiento de una matriz
Dada una matriz numérica asignada a una variable M, de m filas y n
columnas, se pueden definir submatrices tales como:
Creación de vectores

Los vectores son casos particulares de matrices (una sola


columna o una sola fila).
Ejemplo:
>> i=1:3; % Se define un rango de valores para el índice i

v(i)=i.^2 % Se crea el vector fila v cuyos elementos son i2.


v =

1 4 9

El punto posterior a la i indica que cada elemento del “vector” i


se debe elevar al cuadrado.
De otro modo (de no tener el punto) intentaría elevar dicho
“vector” al cuadrado, lo que no sería posible ya que las
dimensiones del mismo son 1 x 3.
Funciones de graficación en MATLAB

Se hará mención a dos herramientas que permitirán trabajar


más eficientemente con Matlab.
La primera es la alternativa de dejar una "traza" documental
mediante el software Word de las operaciones realizadas con
Matlab.
Para ello se ejecuta el comando
notebook
Una vez ejecutado el mismo, se abre una hoja de Word que
permite actuar interactivamente con Matlab. Esto es, se escribe
en el Procesador de Texto (Word) una sentencia válida de
Matlab y accionando las teclas ctrl+enter se ejecuta la
sentencia apareciendo el resultado en Word.
De este modo se puede componer un documento "vivo" desde
el procesador que “trace” todas las acciones realizadas.
Funciones de graficación en MATLAB

La segunda alternativa es la creación de una función, para usarla


posteriormente por su nombre. Hay dos opciones, pudiéndose
elegir cualquiera de ellas sin mengua en su acción.
Una de ellas, como la sentencia que se muestra debajo, crea una
función llamada sqr que encuentra el cuadrado de un número.
Cuando se llama esa función, MATLAB asigna el valor que se pasa
en la variable x, y luego usa x en la ecuación x.^2:

>> sqr = @(x) x.^2;

Para ejecutar la función sqr escriba, por ejemplo


>> a = sqr(5)
a =
25
Funciones de graficación en MATLAB
Ezplot
Función graficadora de fácil uso.
ezplot(fun) grafica la expresión fun(x) sobre el dominio
default -2p < x < 2p.

>> ezplot('sin(x)’)
Funciones de graficación en MATLAB
>> ezplot('x^2',[-2,2])

>> ezplot('(x^2)/4+(y^2)/9-1',[-3,3],[-3,3])
Funciones de graficación en MATLAB
PLOT(X,Y) grafica el vector Y versus el vector X. si X o Y es una matriz,
entonces el vector es graficado versus las filas o columnas de la matriz, lo
que se alinea.

>> x=[1 2 3 4];y=[2 4 8 16;1 2 3 4];


>> plot(x,y)
Funciones de graficación en MATLAB

Se pueden obtener varios tipos de líneas, símbolos y colores con


PLOT(X,Y,S) donde S es una cadena de caracteres hecha desde un
elemento desde las siguientes 3 columnas:
b blue . point - solid
g green o circle : dotted
r red x x-mark -. dashdot
c cyan + plus -- dashed
m magenta * star (none) no line
y yellow s square
k black d diamond
w white v triangle (down)
^ triangle (up)
< triangle (left)
> triangle (right)
p pentagram
h hexagram
Funciones de graficación en MATLAB

X=[1 2 3 4];Y=[2 4 8 16];


plot(X,Y,'b+:')

Grafica una línea de puntos (:) azul (b) con un signo más (+) en
cada punto dato
Funciones de graficación en MATLAB

Existen además otras funciones orientadas a añadir títulos al gráfico, a cada


uno de los ejes, a dibujar una cuadrícula auxiliar, a introducir texto, etc. Estas
funciones son las siguientes:

•title('título') añade un título al dibujo


•xlabel('tal') añade una etiqueta al eje de abscisas. Con xlabel off desaparece
•ylabel('cual') añade una etiqueta al eje de ordenadas. Con ylabel off
desaparece
•text(x,y,'texto') introduce 'texto' en el lugar especificado por las coordenadas
x e y. Si x e y son vectores, el texto se repite por cada par de elementos. Si
texto es también un vector de cadenas de texto de la misma dimensión, cada
elemento se escribe en las coordenadas correspondientes
•gtext('texto') introduce texto con ayuda del ratón: el cursor cambia de forma
y se espera un clic para introducir el texto en esa posición
•legend() define rótulos para las distintas líneas o ejes utilizados en la figura.
Para más detalle, consultar el Help
•grid activa la inclusión de una cuadrícula en el dibujo. Con grid off desaparece
la cuadrícula
COMANDO SUBPLOT
Una ventana gráfica se puede dividir en m particiones horizontales y
n verticales, con el objeto de representar múltiples gráficos en ella.
Cada una de estas subventanas tiene sus propios ejes, aunque otras
propiedades son comunes a toda la figura. La forma general de este
comando es:

subplot(m,n,i)

donde m y n son el número de subdivisiones en filas y columnas, e i es


la subdivisión que se convierte en activa. Las subdivisiones se numeran
consecutivamente empezando por las de la primera fila, siguiendo por
las de la segunda, etc.
COMANDO SUBPLOT
Sean las siguientes en Matlab
>> x=0:0.01:pi;
>> y=sin(x); z=cos(x); w=exp(-x*.1).*y; v=y.*z;
subplot(2,2,1), plot(x,y)
subplot(2,2,2), plot(x,z)
subplot(2,2,3), plot(x,w)
subplot(2,2,4), plot(x,v)
Otras funciones gráficas

bar() crea diagramas de barras


barh() diagramas de barras horizontales
bar3() diagramas de barras con aspecto 3-D
bar3h() diagramas de barras horizontales con aspecto 3-D
pie() gráficos con forma de “tarta”
pie3() gráficos con forma de “tarta” y aspecto 3-D
area() similar plot(), pero rellenando en ordenadas de 0 a y
stairs() función análoga a bar() sin líneas internas
errorbar() representa sobre una gráfica –mediante barras–
valores de errores
hist() dibuja histogramas de un vector
rose() histograma de ángulos (en radianes)
Graficación desde un archivo ascii
El archivo que contiene los datos está en el disco rígido C en la
carpeta llamada “datos”, con el nombre “dat10.txt” y ha sido
obtenido desde el recurso ubicado en www.physionet.org.

>> load c:\datos\dat10.txt

En la variable dat10 quedan almacenados los valores contenidos


en el archivo.
Para conocer la dimensión del arreglo, se tipea:

>> size(dat10)
ans =
17101 3

Lo que implica que dat10 tiene 17101 filas y 3 columnas. La


primera columna indica el instante en que se toma la muestra y
las otras dos, las tensiones de dos derivaciones del ECG.
Graficación desde un archivo ascii
A partir de estos datos, se puede graficar la salida de la primera graficación
(contra el tiempo) de la siguiente manera:

>> x=dat10(:,1); % lee la columna 1 (en seg) y la guarda en x


>> y=dat10(:,2); % lee la columna 2 (en mV) y la guarda en y
>> plot(x(1:1000),y(1:1000))
Transformada de Fourier de una señal
La Transformada de Fourier de una señal permite analizar sus composición
frecuencial. Considerando la señal anterior (y), se ejecutan las siguientes
instrucciones:

>> H=abs(fft(y-mean(y))); % Trans. De Fourier en valor absoluto


>> plot(H(1:5000))
Transformada de Fourier de una señal
Como se puede observar en el gráfico anterior, en el eje de abscisas se
representan los índices de cada muestra. Para que quede en frecuencia (Hz) es
necesario conocer con qué tasa de muestreo ha sido adquirida la señal.
Esto es posible hacerlo desde la primera columna observando el tiempo entre
muestra y muestra.
>> Fs=1/(x(3601)-x(1))*3600 % análisis de 3600 muestras
Fs =
360

Dado que la expresión de la Transformada Discreta de Fourier está dada por:

Donde N es la longitud de la señal y Fs la frecuencia de muestreo (la recíproca del


tiempo de muestreo T).
Transformada de Fourier de una señal
En base a lo expuesto, modificando la escala horizontal del gráfico se logra que
las abscisas se expresen en Hz.
>> i=1:5000;plot(i*Fs/length(y),H(i))

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