Micro Suelo 1

Microbiologa
del suelo
Mara Cecilia Arango Jaramillo
El suelo:
Un biotopo,
prcticamente
ignorado

EL SUELO
Es el principal medio en el que
crecen las plantas.
Es el soporte fsico que
continuamente les proporciona:
Los nutrientes inorgnicos
El agua
El entorno gaseoso adecuado
para los sistemas radicales.
Los nutrientes inorgnicos
que utilizan las plantas
provienen de la atmsfera y
de la meteorizacin de las
rocas de la corteza terrestre.

Meteorizacin de la corteza terrestre
Los minerales son compuestos

inorgnicos que normalmente estn
formados por dos o ms elementos en
proporciones de peso determinadas
Ejemplo:
El cuarzo( SiO2 )
La calcita (CaCO3).
Las rocas se dividen en tres grupos
segn su origen y formacin:
gneas
Granito, basalto, cuarzo, feldespato
Sedimentarias
esquistos, areniscas, piedra caliza
Metamrficas
Areniscascuarcita,
Esquisto pizarra
Piedra caliza mrmol
Procesos de meteorizacin

desintegracin fsica y descomposicin
qumica de los minerales y las rocas
superficiales

producen los materiales inorgnicos que
formarn los suelos

Los suelos tienen
diferente origen y
composicin
Por lo tanto la
microfauna
asociada a ellos
tambin

La meteorizacin implica procesos:
Mecnicos
congelamiento y descongelacin
calentamiento y enfriamiento,
Qumicos
El agua se introduce entre las
partculas, y los materiales solubles
se disuelven en ella.
Biolgicos
CO2 de la respiracin y otras
sustanciasMara
descomponen
Cecilia Arango Jaramillo las rocas
Meteorizacin mecnica
El agua y el viento transportan fragmentos

de roca a grandes distancias desgaste que
las fracciona enMara
partculas
Cecilia Arangoms pequeas
Jaramillo
Meteorizacin qumia (corrosin)
H2O + SO2 Disuelven

cidos materiales
H2O + NO2 (NO3) menos solubles
Meteorizacin orgnica-biolgica
Los cidos producidos por

plantas y las bacterias pueden
afectar las rocas.

La formacin del suelo puede ocurrir en:
El mismo sitio donde la roca es
meteorizada
Pueden ser transportados a otros sitios
por :
La gravedad
El viento
El agua
Los glaciares.
Materia orgnica del suelo
Origen de la materia orgnica del suelo:

Bacterias, hongos, algas, lquenes,
musgos y plantas que crecen sobre o
entre los minerales y las rocas
erosionadas
Plantas y animales muertos

Los microbios en el suelo
Contribuyen a la Controlan la
formacin de materia disponibilidad de
orgnica muchos
nutrientes
la convierten en cido importantes para
carbnico o cidos las plantas
orgnicos

disuelven rocas.
La actividad La actividad
microbiana es microbiana es clave
limitada por el agua en la productividad
(sequa,humedad ) y de los suelos.
estado de los
nutrientes

Los microbios pueden existir varios
cientos de metros por debajo de la
superficie de la Tierra
Los mecanismos de sobrevivencia

an no se conocen

Seccin vertical del suelo:
Variaciones en el color
Cantidad de materia orgnica viva o
muerta (incluye microorganismos)
Porosidad
Estructura
Grado de meteorizacin.
Horizontes del suelo
Horizonte A
Horizonte B
Horizonte C

Horizonte A: Contiene la mayor
parte del material
orgnico del suelo,
Capa superior del vivo o muerto:
suelo Grandes cantidades
La regin ms de partes de plantas
superficial y de y hojas muertas
mayor actividad Insectos y otros
fsica qumica y artrpodos pequeos
biolgica. Lombrices de tierra
Organismos
descomponedores
Nemtodos
O2, N2, CO2
Inorgnicos
Desechos Lluvia O2, NH3, granulados
orgnicos CH4, H2S
Residuos
orgnicos, humus
Suelo: Horizonte A Agua (inundado,
Rocas, silicatos mojado)
Gases (disueltos y
difusos)
Sistemas
Capa de agua biolgicos (races,
insectos,
microobios)
En un gramo de suelo del horizante A
pueden haber:
2500 millones de bacterias
+
medio milln de hongos
+
50 000 algas
+
30 000 protozoos
Horizonte B:
Regin de
acumulacin

El horizonte B: Algunos materiales
Contiene mucho del horizonte A,
menos material llegan al B por
orgnico y est filtracin del agua a
menos travs del suelo:
meteorizado que el xido de hierro
horizonte superior. Partculas arcillosas
Pequeas cantidades
Hay pocos
de material orgnico
microorganismos
Horizonte C:
Compuesto por rocas y

minerales fragmentados y
meteorizados de los cuales se ha
formado el suelo verdadero de
los horizontes superiores.
Los microorganismos son
escasos.

Composicin del suelo
Los suelos estn Poro Pelcula de Agua
formados de
materia slida y Materia orgnica
espacio poroso O2 Arena
CO2,
El espacio poroso H2S,
CH4
es ocupado por
Arcilla
diferentes
proporciones de
aire y agua,
dependiendo de Hifa
Bacterias
las condiciones de
humedad.
Los fragmentos de roca y minerales en el
suelo varan en tamao:
Partcula Dimetro
en micrmetros
Arena gruesa >200 - 2000
Arena fina >20 - 200
Limo 2 - 20
Arcilla <2

Los suelos estn divididos segn su
textura:
Arenoso arcillosos: 35% o ms de

arcilla y 45% o ms de arena
Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40%
o ms de limo
Margosos o francos: contienen igual
proporcin de arena, limo y arcilla.
Ideales para la agricultura.

La textura del
suelo influye en las
comunidades de
microorganismos
porque de ella
depende la
aireacin y la
disponibilidad de
agua
Intercambio de catinico
Los nutrientes
inorgnicos para Cl Cl
microorganismos HCO3 --
-
-
+ K
+ NO
y plantas estn Na Na + 3
SO4-2 -
presentes en la OH
Ca+ + Arcilla - Na+
solucin del
OH -
suelo como -2
SO4 Na+ Ca+ +
iones. K+ H+
HCO3- OH-
NO3- HCO3-
Intercambio catinico:
Los cationes apresados por
las partculas de arcilla
pueden: Partculas de
Ser reemplazados por arcilla:
otros cationes componentes
esenciales de
Ser liberados a la
los suelos
solucin del suelo para
productivos.
ser tomados por plantas
y microorganismos.
El fosfato, no puede
Los aniones (NO3-, ser arrastrado, ya
SO4-2, HCO3-, y OH-) que:
son lixiviados del Forma precipitados
suelo ms insolubles
rpidamente que
Es absorbido o
los cationes ya que adsorbidoen la
no pueden fijarse a superficie de
las partculas de compuestos que
arcilla. contienen hierro,
aluminio y calcio.
La acidez o Los suelos varan
basicidad del mucho en su pH,
suelo est y muchos
relacionada con la microorganismos
disponibilidad de tienen un
nutrientes estrecho margen
inorgnicos para el de tolerancia.
crecimiento de
plantas y
microbios.
La gente
desconoce que
cuando tiene un
gramo de tierra en
el hueco de la
mano, tiene entre
un milln y mil
millones de seres
vivos en esa mano.
Una muestra de
suelo contiene:
Insectos pteros
Arcnidos
Sobretodo
filamentos de
hongos y de
bacterias.

La cuenta de La riqueza de
grmenes por especies y la
suspensin- complejidad de la
dilucin muestra delgada capa
ms de un milln cultivable
de grmenes por condicionan la
gramo de tierra vida sobre la tierra,
arable del mismo modo
que la fotosntesis.
Ciclo de la materia orgnica
CO2
Restos vegetales
Fotosntesis desaparecen bajo
la accin de la
microfauna y la
Cada de ramas, microflora del
hojas, frutos..
suelo
Microfauna del suelo

Microorganismos del suelo
Mineralizacin Humificacin
CO2 Amontonamiento de
Fotosntesis
acculas de varios
centmetros.
Cada de ramas,
hojas, frutos..
Acidez frena actividad
microbiana
Acumulacin Microfauna del suelo

Descomponedores casi ausentes:
hongos y bacterias
Mineralizacin Humificacin
Papel de la microfauna del suelo:
Disgregacin de la materia orgnica

Diseminacin de la microflora

http://www.aecientificos.es/ElSuelo.html
Diseminacin activa
Reincorporacin de microorganismos al suelo

ELECCIN
con las heces de la Reutilizacin
TRFICA:
microflora por otros
Disgregacin de la materia orgnica Rgimen
alimentario intestinal organimos
microfauna
Multiplicacin
Seleccionan de la
los alimentos microflora
para los de las heces
microbios
Heces
Aumentar
las Diseminacin
superficies pasiva Transporte Invasin por
de ataque accidental en la los microbios
para los superficie del del suelo
microbios.
cuerpo
Plantas y Los residuos
microflora: orgnicos no
organismos consumidos van a
complementarios, ser degradados por
en la la microflora. Son los
mineralizacin de hongos, en primer
la materia lugar, los que van a
orgnica atacar a la materia
orgnica fresca, y en
el siguiente orden
Mineralizacin de la materia orgnica
Descomposicin de hojas (Sucesin)
Tiempo (las fases pueden ser simultneas)
Hongos: Hongos Hongos

glucfilos celulolticos: lignolticos :
utilizacin de metabolismo degradacin
las de la celulosa de la lignina
sustancias
hidrosolubles
Bacterias: transforman residuos fngicos y

productos noMara
consumidos por las hifas.
Cecilia Arango Jaramillo
Plantas y microorganismos
son complementarios:
unos fabrica materias
carbonadas, otros libera
minerales

CAPA VEGETAL DEL SUELO
Materia inorgnica
Materia orgnica
Microorganismos
Material mineral
CO2
no utilizado por los
microorganismos
H 2O
Hojas de las
plantas
Races de las
plantas
Fotosntesis
Proteccin de los microorganismos ante
desequilibrios ambientales
Cuando se aade materia orgnica a

los suelos agrcolas, las bacterias
consumen todo el carbono
disponible.
Consecuencia: rarefaccin, e
incluso desaparicin, de los
microorganismos.
Para estos casos, la naturaleza ha
creado sistemas de proteccin para
que los microorganismos
Mara Cecilia Arango Jaramillo sobrevivan
Estructuras de proteccin de los hongos
Clamidospora: clula latente, con

pared gruesa y cuyo contenido es rico
en reservas
Esclerote: esfera cuyo envoltorio
externo est constituido de hifas
muertas de pared gruesa, y el centro
de filamentos vivos ricos en reservas,
en estado latente.

Estructuras de proteccin delas bacterias
Las (Gram+) Las Gram- estn

forman desprovistas de
endosporas. mecanismos de resistencia
Susceptibles Forman agregados
de sobrevivir biolgicos cuando las
muchos aos condiciones son
en condiciones desfavorables
desfavorables. La actividad celular y las
divisiones, se hacen ms
lentas.
Numerosos
Se forman cuando
procariotas para
las condiciones
protegerse exudan
ambientales llegan a
en su superficie
ser desfavorables
polisacridos que se
adhieren a lminas
de arcilla. Desaparecen cuando
Son estructuras las condiciones
que permiten la pedolgicas vuelven
supervivencia de las a ser adecuadas
bacterias
Estas formaciones
tienen un dimetro
que vara de 10 a
1000 mm y pueden
contener varios
miles de grmenes.

Los polisacridos tienen varias funciones:
La superficie de bacterias y arcillas tienen

cargas elctricas negativas, mientras que los
azcares son neutros, tienen por tanto un
papel aislante.
Los azcares tienen tendencia a retener
agua, evitan evaporacin en perodos
secos.
Constituyen reservas. En ausencia de
alimentos, las bacterias toman el carbono
necesario para el mantenimiento de las
funciones vitales esenciales.
Para los microorganismos del
suelo vivir en el espacio
interagregado (poros) y el
agregado mismo (granos)
tiene implicaciones
importantes

Este es el
microhabitat
colonizado por las
En el espacio bacterias Gram+,
interagregado las que poseen la
condiciones son facultad de
drsticas: producir
La humedad y la endosporas.
aireacin varan Las esporas de los
muy rpidamente. hongos y las de los
actinomicetos, son
muy resistentes a
la desecacin.
Por el Aparecern rpidamente
contrario, el condiciones de
agregado anaerobiosis.
mismo es En este medio tan
recorrido slo estable viven o
por finos sobreviven las bacterias
capilares de Gram-.
alrededor 2 Aunque sensibles a las
mm de modificaciones
dimetro, que ambientales, permanecen
slo permiten vivas en suelos secos
una circulacin durante ms de un ao
lenta de aire y gracias a la proteccin de
de agua. los agregados
La composicin qumica y fsica de los
agregados es variable.
El suelo es un medio muy

heterogneo
Est constituido de un
mosaico de microhabitats
cuya composicin biolgica
vara cualitativa y
cuantitativamente en funcin
del tiempo, y de la fuente
trfica disponible.
Unos agregados Los microorganismos
pueden formarse que colonizan estos
alrededor de citina, microhabitats
desarrrollndose en
difieren igualmente
su seno los llamados
citinolticos.
tanto por su
morfologa, como por
Otros encerrarn
sus requerimientos
residuos de lignina
permitiendo el ecologicos.
crecimiento de los
ligninolticos. Mara Cecilia Arango Jaramillo
Influencia del ambiente
del suelo en las
poblaciones de
microorganismos

Nunca se dan
condiciones
Aunque los ambientales idnticas:
microorganismos Las que favorecen la
son ubicuos, en reproduccin de un
pocas situaciones microorganismo, o
existen poblaciones permiten la
iguales. sobrevivencia de otro,
pueden ser
desfavorables para la
existencia continuada
de un tercero.
El suelo de un pinar
suele ser muy cido y
Los suelos su contenido en
cultivados y de principios nutritivos es
jardn tienen bajo
abundancia de Los terrenos
oxgeno y agua y pantanosos estn
son ricos en inundados, tienen
nutrientes poco oxgeno y
aportados por contienen abundante
las fertilizaciones materia orgnica en
descomposicin.
Estas diferencias se
Mara reflejan
Cecilia en la microflora
Arango Jaramillo
Para comprender la influencia de
los factores que afectan la
microflora del suelo es necesario:
Conocer las condiciones
normales de crecimiento de los
microorganismos
Los efectos que las condiciones
extremas ejercen sobre los
distintos grupos.
Factores que afectan en mayor grado a las
poblaciones de microorganismos
pH DEL SUELO
Acidez- TEMPERATURA
Alcalinidad
POBLACIONES DE MICROORGANISMOS
DISPONIBILIDAD DE
OXGENO, AGUA Y
TCNICAS DE
SUSTANCIAS MANEJO DEL
NUTRITIVAS SUELO
Consideremos estos
factores
separadamente,
pero deberemos tener
en cuenta que de
ordinario son
interdependientes.

Temperatura (Psicrfilos, Mesfilos y Termfilos).
TEMPERATURA DE CRECIMIENTO DE LOS
MICROORGANISMOS
Tipo de Temperatura Temperatura Ejemplo de
micro- ptima s lmite microorganismo
organismo
Psicrfilas Alrededor 5a30o C Achromobacter
20o C
Mesfilas 25 a 37o C 5 a 45o C Staphylococcus ,

Mayora de los
hongos.
Termfilas Superior a 40 a 80o C Desulfovibrio,

45o C Thermoactinomyce
s, Algunas algas
Mara Cecilia Arango Jaramillo verdes azules
Fermentacin del estircol:
La temperatura puede elevarse
hasta 65 o C, destruyendo todos
los microorganismos, excepto a
los termfilos, como el Bacillus
calfactor , Thermoactinomyces
spp y los hongos termfilos.

En suelos del piso trmico tropical y
premontano son ms frecuentes:
Fusarium, Aspergillus y Rhizopus
Penicillium crece mejor en suelos ms

fros.

REQUERIMIENTOS
NUTRITIVOS
Utilizacin de energa lumnica

Oxidacin quimioautotrfica de
materias inorgnicas
Respiracin hetertrofa de materia
orgnica
Fermentacin de materia orgnica

Existe competencia entre
los microorganismos por
utilizacin de los
nutrientes orgnicos e
inorgnicos.

En el suelo la
materia orgnica
fcilmente
utilizable por los
microorganismos
es ordinariamente
reducida, lo que
limita su
velocidad de
multiplicacin.

Al aadir al suelo materiales
frescos, estircol o desechos
vegetales

el nmero de microorganismos aumenta
rpidamente

los nutrientes se agotan

poblacin de microorganismos vuelva
nivel anterior.
Como un microorganismo
determinado no puede
utilizar igualmente todos los
substratos

su incidencia y proporcin
varan de acuerdo con las
situaciones

Opionibacterium
acta como En el rumen utiliza
barrendero de cido lctico y
medios nutritivos glucosa producidos
parcialmente por las bacterias
degradados por celulticas y las del
microorganismos. cido lctico.

Lactobacillus
compite eficazmente
cuando existen
carbohidratos Crece bien en la
simples pero es leche y en el rumen
incapaz de pero no en el suelo.
metabolizar
sustancias como
lignina.
Otros
microorganismos
degradan lignina y
celulosa Pero no en leche,
donde compiten con

microorganismos
sobrevivien en el suelo como Bacillus y
y en el manto en Lactobacillus
descomposicin de
los bosques
En una poblacin mixta solo unos
pocos microorganismos son
capaces de metabolizar una
sustancia determinada, como
insecticidas y herbicidas, estos
microbios se ven libres de
competencia.

Los auttrofos no
Desarrollo de
compiten por
Nitrosomonas y
nutrientes
Nitrosobacter es
orgnicos con otros
limitado por
microorganismos.
compuestos
Slo compiten por nitrogenados
luz. apropiados.

OXGENO
Los requerimientos de oxgeno de los
microorganismos varan:
Aerobios
Anaerobios
Microanaerobios
Anaerobios
facultativos

El oxgeno
determina el
desarrollo de
poblaciones de
microorganismos
en detrimento de
otras.

En el ensilado, los forrajes son
comprimidos y recubiertos para:
Establecer condiciones de
anaerobiosis con el fin de promover
el crecimiento de microorganismos
anaerobios tiles o microaerfilos
como Lactobacillus
Mientras se impide el desarrollo de
los que tienden a descomponer el
forraje (pudricin).
En suelos poco aireados
hay competencia por el
El oxgeno es uso del oxgeno
esencial para disponible y ello puede
muchos llevar a un descenso en la
microorganismos proporcin de
fijadores de microorganismos aerobios
nitrgeno. En consecuencia
disminuye la fijacin de
nitrgeno y tambin de la
velocidad de degradacin
de la materia orgnica.
El nivel de aporte de oxgeno
tambin determina la forma de
metabolizacin de los nutrientes.
Los anaerobios facultativos metabolizan los

polisacridos aerobicamente en presencia
de oxgeno, descomponiendolos hasta
dixido de carbono y agua con alta
liberacin de energa.
Cuando no hay oxgeno lo hacen
anaerobicamente, mediante el proceso de
fermentacin, en el cual la degradacin slo
es parcial y con poca liberacin de energa.
pH
Con pocas
El pH ptimo para la
mayora de las excepciones estos
bacterias, algas y microorganismos no
protozoos est crecen por debajo
alrededor de 7. de un pH de 4 o por
encima de un pH 9.

Los Thiobacillus,
actinomicetos Acetobacter y la
y las algas son bacteria fijadora de
sensibles a los nitrgeno
cidos y su pH Beijerinckia, son
ptimo est capaces de crecer y
entre 7.5 y 8. multiplicarse a pH
entre 2.5 y 3.5.

El pH ptimo para os hongos son
las levaduras y los resistentes a los
hongos vara entre cidos
3.1 y 6.0, mientras Algunas especies
sus pH extremos de hongos crecen a
de crecimiento son pH entre 1.6 y 2.0
1.6 y 9.5.

En suelos con pH
mayores a 7
predominan las
bacterias, en
especial los
actinomicetos, y en
menor proporcin
los hongos.
micorrizas.
El efecto del pH afecta el desarrollo de
los microorganismos:
Cuando el pH baja:
Declina el nmero de bacterias
Mientras sube el de levaduras, hongos y
bacterias resistentes a la acidez.
A pH extremadamente bajos la
proporcin de bacterias puede disminuir
hasta el 60%.

En suelos cidos suele
La acidez del
envolverse la semilla en
suelo
una capa de cal, que
influencia las
neutraliza la acidez
bacterias de
circundante, promueve la
los ndulos
multiplicacin de
de la raz de
Rhizobium y permite
las
buena nodulacin de la
leguminosas
leguminosa husped.

AGUA
Todos los
microorganismos
necesitan agua,
aunque sus
requerimientos
varan.

Las formas Las endosporas
vegetativas de las termoestables
bacterias son producidas por las
menos resistentes a bacterias, como
la desecacin que Bacillus y
los hongos o los Clostridium, son
actinomicetos. resistentes a la
desecacin.

Las bacterias
esporuladas, los
actinomicetos y
los hongos son los
contaminantes ms
frecuentes del aire
porque son
resistentes a la
desecacin.
En los materiales de Los suelos
potencial osmtico salinizados suelen
alto el agua es poco tener presiones
asequible a los osmticas altas que
microorganismos. inhiben el
crecimiento de la
mayora de los
microorganismos y
races, exceptuando
los halfilos.
El exceso de agua en el suelo
suele causar encharcamiento y
prdida de oxgeno en los
capilares del suelo lo cual hace
que disminuyan los
microorganismos aerobios y
aumenten los anaerobios.

Tcnicas de manejo del suelo
Las poblaciones de microorganismos del

suelo, se pueden:
Disminuir o erradicar por perturbaciones
importantes del suelo
Favorecer con prcticas adecuadas.

FACTORES LIMITANTES DE LA
MICROBIOTA DEL SUELO
Erosin y baja disponibilidad de nutrientes

Fertilizacin mineral y correctivos
Presencia de antagonistas, parsitos y
depredadores
Temperatura y pH extremos
Extremos en los contenidos de aire y
humedad

Textura del suelo y concentraciones
txicas de metales pesados
Uso de plaguicidas, especialmente los
de amplio espectro. Desinfeccin,
fumigacin y esterilizacin del suelo
Inundaciones y malos drenajes

Aradas profundas, volteo del suelo y
solarizacin.
Sistemas de produccin y explotacin
del suelo (monocultivo, cultivos
intesivos sin manejo adecuado, minera
a cielo abierto).

PRCTICAS QUE FAVORECEN LA
DENSIDAD Y LA ACTIVIDAD DE LOS
MICROORGANISMOS
Mantenimiento de la biodiversidad
dentro de los cultivos y en las
fincas.
Coberturas vegetales, abonos
verdes y alcolchados
Inoculacin de suelos y semillas
con microorganismos y eliminacin
de competidores.
Incorporacin de compost,
fracciones lquidas y slidas de
biodigestores, humos, excretas,
restos de cosechas y otros
residuos vegetales
Agentes naturales de control:
control biolgico, plaguicidas
botnicos, control cultural.

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Los minerales son compuestos

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El agua y el viento transportan fragmentos

H2O + SO2 Disuelven

Los cidos producidos por

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Origen de la materia orgnica del suelo:

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Los mecanismos de sobrevivencia

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Compuesto por rocas y

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Arenoso arcillosos: 35% o ms de

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Microfauna del suelo

Acumulacin Microfauna del suelo

Disgregacin de la materia orgnica

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Reincorporacin de microorganismos al suelo

Hongos: Hongos Hongos

Bacterias: transforman residuos fngicos y

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Cuando se aade materia orgnica a

Clamidospora: clula latente, con

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Las (Gram+) Las Gram- estn

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La superficie de bacterias y arcillas tienen

Mara Cecilia Arango Jaramillo

El suelo es un medio muy

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Mesfilas 25 a 37o C 5 a 45o C Staphylococcus ,

Termfilas Superior a 40 a 80o C Desulfovibrio,

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Penicillium crece mejor en suelos ms

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Utilizacin de energa lumnica

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Los anaerobios facultativos metabolizan los

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