Se llama estructura terciaria a la disposicin tridimensional de
todos los tomos que componen las protena, concepto
equiparable al de conformacin absoluta en otras molculas. La estructura terciaria de una protena es la responsable directa de su propiedades biolgicas, ya que la disposicin espacial de los distintos grupos funcionales determina su interaccin con los diversos ligandos. Se forma sobre la disposicin de la estructura secundaria de un polipeptido al plegarse sobre si misma originando una conformacin globular.
Puede haber estructuras terciarias de tipo globulares donde no
hay forma y son solubles; las hormonas y enzimas suelen tener esta forma, y fibrosas, son estructuras insolubles, son alfa queratina, beta, queratinas y colgenos .
la estructura terciaria de una protena esta generalmente
conformada por varios tramos con estructuras secundarias distintas; en cuantos a los niveles de la estructuras de las pretinas, en la estructura terciaria generalmente los aminocidos apolares se sitan hacia el interior de la protena y los polares hacia el exterior, de manera que puedan interactuar con el agua circundante. En el caso de protenas integrales de membrana, los aminocidos hidrolgicos quedan expuestos en el interior de la bicapa lipidica. Por tanto este tipo de estructura es la que les da a las protenas sus particularidades fisicoqumicas, como la polaridad o opolaridad de la molcula. La fuerza que estabilizan la estructura terciaria de una protena se establecen entre las distintas cadenas laterales de los AA que la componen. Los enlaces propios de la estructura terciaria pueden ser de dos tipos: covalentes y no covalentes. Existen regiones diferenciadas dentro de la estructura terciaria de las protenas que actan comunidades autnomas de plegamiento y desnaturalizacin de las protenas. Estas regiones constituyen un nivel estructural intermedio entre las estructuras secundarias y terciarias reciben el nombre dominio. Los dominios se pliegan por separado a medida que se sintetiza la cadena polipeptdica. La figura corresponde a la protena piruvato quinasa, que consta de cuatro dominios, cada uno representado de un color. La perdida total o parcial de los niveles de estructuracin superiores al primero recibe el nombre de desnaturalizacin, que puede ser reversible o irreversible.