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BIOENERGTICA
BIOENERGTICA
Las leyes de la Fsica y la Qumica incluyen los principios de la termodinmica que tambin se cumplen en el mundo biolgico.
Qu es Energa?: La definicin clsica seala que es la capacidad para realizar trabajo. En biologa, por lo tanto, esta se aplica a la capacidad de realizar trabajo biolgico.
Qu tipos de trabajo biolgico existen? Los principales tipos son: Trabajo qumico (sntesis de biomolculas)
Trabajo de concentracin y transporte de minerales y biomolculas en las clulas Trabajo mecnico (contraccin filamentos contrctiles) de msculos y
Respiracin: Flujo desde las estructuras qumicas orgnicas a formas de energa utilizables en trabajo biolgico
Radiacin Solar: 4H 4He + 2e- + h h = 2,5 jouls/mol He Fotosntesis: 6CO2 + 6H2O + h Respiracin: C6H12O6 + 6O2 C6H12O6 + 6O2 G= + 686Kcal/mol 6CO2 + 6H2O + Energa (ATP) G= - 686Kcal/mol Trabajo Biolgico:
ATP
Oxidacin de la Glucosa
T. Qumico (Biosntesis)
T.Mecnico y otros
ADP+Pi
LA TERMODINMICA EN BIOLOGA
El anlisis de los distintos cambios de energa asociados a una reaccin qumica permite definir cuando una reaccin ocurrir en forma espontnea; pero no informa acerca de la velocidad con que ocurre esa reaccin, ni si ser completa o si alcanzar el equilibrio.
H (+) indica que el sistema gan calor de su entorno : Proceso Endotrmico H (-) indica que el sistema Exotrmico liber calor al entorno: Proceso
Entorno
Sistema
Calor
Sistema H ( + )
H ( - )
Exotrmico
Endotrmico
El signo del H no basta para indicar si una reaccin se llevar a cabo. La espontaneidad de los procesos se asocia con un aumento en el desorden del sistema que se expresa como un aumento de Entropa (S). Al igual que la entalpa, la entropa es una funcin de estado y se puede establecer el cambio de ella entre los estados inicial y final (S). S (+) indica un aumento del desorden del sistema (ej. un aumento en el movimiento de las partculas o bin un aumento en el nmero de partculas) C6H12O6 (s) 6 CO2 (g) + 6 H2O (g) Sf > Si S ( + ) S (-) indica una disminucin del desorden del sistema. El sistema aparece ms ordenado a costa del trabajo efectuado
inicial
Si > Sf S ( - )
final
La funcin de estado propuesta por Gibbs conocida como Energa Libre (G) considera las funciones entalpa y entropa de una reaccin qumica que ocurre a presin y temperatura constantes. Se expresa como : G = H - T S
G es una medida del trabajo til que puede realizar un sistema en un proceso espontneo.
La Energa libre se relaciona con la espontaneidad de una reaccin: Si G es (-) la reaccin es espontnea en el sentido directo y se denomina Reaccin exergnica. Si G es (+) la reaccin no es espontnea en sentido directo, es una reaccin endergnica. Se debe aportar energa desde el entorno para que ocurra. La reaccin inversa ser espontnea. Si G = 0 la reaccin est en estado de equilibrio. posibilidad de realizar trabajo. No hay
Las reacciones con G (+) pueden ser impulsadas por reacciones espontneas que se acoplan a ellas. G y Equilibrio Qumico: En reacciones en donde existe transformacin de un sustrato en producto el G tambin depende de la relacin de las concentraciones de los reactantes y productos. Q = B/A A B G = G + RTlnQ
G = G condiciones estandar (25C; 1M) R = 1,987 cal/molxgrado (constante de los gases) Q = cuociente de reaccin
En equilibrio
G = 0
y Q = Keq
G = G + RTlnKeq = 0
Si :
G (-) ;
Keq > 1
Si se conoce la Constante de Equilibrio de una reaccin se podr estimar si ella es espontnea o termodinmicamente posible, sin considerar la velocidad a que se realiza.
a 25C
Si en el equilibrio:
R P
G ( - )
G ( + )
Ejemplo.Glucosa1P T = 25C
( Fosfoglucomutasa ) Glucosa 6P
pH = 7,0
Concentracin inicial G-1- P = 0,020 M Concentracin final G-1- P = 0,001 M Concentracin G-6- P = 0,019 M Keq = 0,019/0,001 = 19
G y reacciones de xido-reduccin :
En reacciones en donde se transfieren electrones desde un compuesto reductor hacia un compuesto oxidante el G se relaciona con la diferencia de potencial de reduccin (E) que se genera entre ambos. (e-)
H2
HCl Pt
AgCl Ag
G = - nF E n = N de electrones transferidos F = Cte de Faraday (23062 cal 96500 Coulomb) E0 = V entre oxidante (aceptor) y reductor (dador de e- )
La obtencin de energa til en los organismos vivos est relacionada con procesos de oxido-reduccin asociados a la transformacin de energas de diferente tipo. Por ejemplo la transformacin de la energa luminosa en energa de enlaces qumicos. Estas reacciones se encuentran asociadas a la fotosntesis en los cloroplastos y a la respiracin en las mitocondrias de los organismos vivos. As, tanto en el transporte de electrones en los cloroplastos como en el transporte en la cadena respiratoria en las mitocondrias, existen molculas con distintos potenciales de reduccin capaces de generar flujos de electrones en funcin de los gradientes de potencial que se generen.
E0 (V)
- 0,58 - 0,42 - 0,32 - 0,324 - 0,12 - 0,197 - 0,166 - 0,05 + 0,03 + 0,1 + 0,23 + 0,29 + 0,82
El potencial de reduccin indica la capacidad del componente para ceder o captar electrones. A potencial ms negativo mayor capacidad reductora del componente.
Cunta energa se asocia al movimiento de 2 e- desde el NADH.H+ hasta el O2 ? G0 = - 2 x 23062 (0,82 - (- 0,32) ) = - 52.700 cal Parte de esta energa liberada queda ATP.
atrapada
en
forma
de
Qu tipo de reaccin es esta ? - Identifique el origen de los electrones que llegan a la cadena respiratoria. - Trate de cuantificar la cantidad de ATP mxima que se podra lograr con esta energa.
C H2 O H
O + 6 O2
6 CO2
H 2O
- Si el sustrato inicial o combustible fuera la Glucosa trate de estimar el rendimiento energtico de esta molcula al degradarse totalmente a nivel celular (revise el captulo Metabolismo de Hidratos de Carbono). - Calcule la energa que se necesita para traspasar 2 electrones desde el H20 al NADP+ en los cloroplastos.
Ley de Hess.- En una serie de reacciones concatenadas por un intermediario comn, el cambio de energa libre total ser igual a la sumatoria de los cambios de energa libre parciales Reacciones metablicas con G (+) : A + B D + C G1 = (+) 5 Kcal
D A + B
2 E C
G2 = (-) 9 Kcal + 2E
GTotal = G1 + G2 = (-) 4 Kcal El mecanismo de acoplar reacciones es relativamente frecuente en vas metablicas para impulsar reacciones no espontneas o para favorecer un sentido de reaccin en algunas que son fcilmente reversibles.
produce un G = - 7,3 Kcal/mol, cantidad apreciable de energa debido a que la Keq de su hidrlisis es muy elevada.
NH2 N O O O N N CH N
Adenina
- O P O P O P O H2 C OOOHO
O
D-Ribosa
OH
Forma ionizada del ATP a pH 7. Estructura de alto Adenosina contenido energtico debido a electrosttica y Adenosina Monofosfato (AMP) repulsin estabilizacin por resonancia. Adenosina Difosfato (ADP) Adenosina Trifosfato (ATP) PM=472
La gran tendencia a la hidrlisis de este compuesto se debe en parte a la acumulacin de cargas negativas en la porcin de los anhdridos fosfricos que se repelen entre s; esta repulsin es mayor ATP que en ADP. Adems los productos de la hidrlisis (ADP-3 y HPO4-2) son aniones con menor carga negativa que el ATP y se estabilizan como hbridos de resonancia. El ATP fosforila a otras biomolculas y a su vez se recupera por fosforilacin del ADP, si las condiciones energticas lo permiten. El G de hidrlisis de los compuestos fosforilados tambin se expresa como Potencial de transferencia de fosfato.
G de hidrlisis kcal/mol
- 14,8 - 11,8 - 10,3 - 7,3 - 5,0 - 3,8 - 3,3 - 2,2
Potencial de transferencia
14,8 11,8 10,3 7,3 5,0 3,8 3,3 2,2
Los compuestos con mayor potencial de transferencia de fosfato pueden fosforilar a otros que tienen potencial menor.
ADP
ADP
S1 S2 S3
Intermediarios
ATP
1)
Cofactores Reducidos
P eO2 2)
3)
Cofactores
ATP
ATP
Cofactores. Oxidados..
ADP
Componentes Celulares propios CO2 + H2O
Calor
Productos finales de desecho : Materia y Energa - Por qu se dice que este es un sistema termodinmico abierto? - Identifique los procesos bioqumicos representados en los sectores 1), 2) y 3) - Qu papel desempea el ATP?
ENTROPA CELULAR:
Macromolculas
Sistema ordenado
CALOR
Unidades Estructurales
ATP
Productos de Degradacin E cintica y desorden Membrana Celular
Macromolculas Propias
E. entorno
Cintica
del
En el conjunto clula y su entorno se cumple Segundo principio de la Termodinmica. - Identifique el trabajo qumico desarrollado - Identifique y compare las macromolculas iniciales o de entrada al organismo vivo con las macromolculas sintetizadas. - Cmo relaciona esta produccin de calor celular con los procesos de eliminacin de calor desde el organismo.
Productos Orgnicos
O2
Organismos Fotosintticos Auttrofos Organismos Hetertrofos
CO2
H2O NH3 y otros
ORGANISMOS HETERTROFOS
PROCESOS DEGRADATIVOS OXIDATIVOS (Prdida de H+ + e- ) ENERGA (*) ENERGA (*) PRODUCTOS FINALES : CO2 + H2O + NH3 + otros
CALOR (prdida)
ATP (ganancia)
Analice la transferencia de energa en la naturaleza Identifique las molculas orgnicas energticas Seale otros nombres para los procesos bioqumicos aqu sealados.
CO2; NO3
AAc.
Sntesis de Componentes Estructurales y Funcionales Retculo Endoplsmico; Protenas Sntesis Compuestos Nitrogenados Especializados : Bases nitrogenadas, DNA, porfirinas, pigmentos, hormonas vegetales etc. Obtencin de Energa : Intermediarios del Ciclo de Krebs Gluconeognesis
ATP Glucosa
Identifique los usos ms relevantes de cada tipo de sustrato. Al avanzar en su conocimiento bioqumico se recomienda que elabore sus propios esquemas que le permitirn comprender los procesos metablicos celulares y sus interrelaciones. Para cada componente aportado por la fotosntesis, identifique estructuras qumicas generales, vas catablicas que permiten generar ATP y mecanismos generales de fosforilacin. Compare el uso de sustratos en organismos vegetales y animales. Establezca las similitudes y diferencias.
G-6-P
Acil CoA
AAc.
Sntesis Cptes. Estructurales Celulares Biosntesis Cptes. Estructurales y Funcionales Retculo Endopl. : Protenas Biosntesis Cptos. Nitrogenados Especializados : Bases Nitrogenadas, hormonas, porfirinas, etc.
Obtencin de Energa :
ATP
Glucosa
o Identifique los usos ms relevantes de cada tipo de sustrato. o Al avanzar en su conocimiento bioqumico se recomienda que elabore sus propios esquemas que le permitirn comprender los procesos metablicos celulares y sus interrelaciones. o Para cada componente aportado por la sangre, identifique estructuras qumicas generales, vas catablicas que permiten generar ATP y mecanismos generales de fosforilacin
ACETIL CoA
ACETIL CoA
SI LOS PROCESOS ANTERIORES NO SON SUFICIENTES SE RECURRE A LOS AMINOCIDOS : AMINOCIDOS Componentes del Ciclo
de Krebs
ACETIL CoA Y DERIVADOS DE AMINOCIDOS SE INCORPORAN AL CICLO DE KREBS ASOCIADO A LA CADENA RESPIRATORIA :
ATP
ENERGA CELULAR
Para cada tipo de sustrato, identifique los procesos catablicos que ocurren antes de incorporarse al Ciclo de Krebs. Es el ciclo de Krebs generador de ATP directamente? Cmo se asocia el Ciclo de Krebs con la cadena respiratoria? Determine cmo cambia esta situacin bajo condiciones de ayuno o de trabajo intenso como ejercicio, crecimiento, etc.
CONDUCCIN NERVIOSA
BIOSNTESIS DE BIOMOLCULAS
TRANPORTE DE SUSTRATOS
(*)
Qu entiende por Potencial de transferencia de fosfato? Refirase al G de hidrlisis de los compuestos fosforilados. Asocie lo anterior con procesos de produccin o de gasto de ATP.
Las molculas energticas ATP / ADP / AMP tambin son efectores o reguladores alostricos en vas relacionadas con la produccin de ATP, por ejemplo desde la Glucosa. La Glucosa que se cataboliza, en los vegetales puede provenir directamente de la Fotosntesis o de la degradacin de hidratos de carbono de reserva (Almidn). En los animales puede provenir de la Glucosa sangunea o de la degradacin del Glicgeno (Glicognolisis). Las vas catablicas de la Glucosa son la Glicolisis y el Ciclo de Krebs MOLCULAS ENERGTICAS (ATP, REGULADORES ALOSTRICOS EN RELACIONADAS CON LA GLUCOSA. ADP, VAS AMP) COMO METABOLICAS
Si:
ADP AMP
; ATP
Glicgenolisis
Si:
ATP
ADP AMP
Glicgenolisis Gliclisis
Fosforilasa (-) ; Gliclisis F6P-Quinasa (-) ; F1-6bisP-fosfatasa(-) ; neognesis DH-Pirvica (+) ; Gluco-
P-enol-Pir-Quinasa (-) ;
Gliclisis
Se activa C. de K. Se frena C. de K.
Signos (+) o (-) indican si el efecto del regulador es de activacin o de inhibicin de la accin de la enzima mencionada.
ANTE UNA DISMINUCUN DE ATP INTRACELULAR SE ACTIVAN LOS PROCESOS DE DEGRADACIN o CATABLICOS. POR EL CONTRARIO EN UNA SITUACIN DE AUMENTO DE ATP DISMINUYEN LOS PROCESOS DE DEGRADACIN o PRODUCTORES DE ENERGA CELULAR.
Bibliografa o Brown,T.L. ; LeMay, H.E. ; Bursten, B.E. 1998. Qumica: La Ciencia Central, 7ed., Prentice Hall Hispanoamericana, Mxico DF, Mxico 991p o Levine, I.N. 1991, Espaa, 1077p Fisicoqumica, McGraw-Hill/Interamericana,
o Lehninger, A. 1975 . Bioenergtica, Fondo Educ. Interam. S.A. 225p. o Nelson,D.L. ; Cox M.M. 2000. Lehninger: Principles of Biochemistry, 3 ed, Worth Publishers, New York, USA, 1152p o Sybesma Ch 1989.- Biophysics, Kluwer Acad. Pub. London 311p. o Stryer, L. 1995, Bioqumica, 4 ed. Espaa, 1010p Revert, S. A., Barcelona,