Universidad Tcnica de Manab Facultad de Ciencias de la Salud Carrera de Medicina Deber de informtica Tema: Sistemas informticos en el campo de la salud

Tercer Nivel B Autores

Ivn Andrs Jaramillo Chvez Zahira Rosas Cervantes Gulnara Lorena Fernndez Basurto Gema Liliana Alcvar Palma Colombo Efran Arteaga Delgado Verni Danilo Cedeo Alvarado Ricardo Guerrero Saltos Juan Jos Hidrovo Ocaa Gorki Hidrovo Ocaa Vctor Emilio Holgun arce Josu Herrera Cedeo Sofa Alejandra Idrovo dueas

Sep. 2011- Febre2012

Sistemas informticos en el campo de la medicina

CalImag fue desarrollado para ejecutarse sobre Matlab versin 7 o superior, por lo que es necesario instalar previamente este sistema. No importa el sistema operativo que posea la computadora. Se opt por el MatLab por sus tollbox, en ellas se encuentran implementadas muchas herramientas que ahorran tiempo de programacin y de puesta a punto. Tambin se utilizan herramientas para generar una interfaz de usuario amistosa. El software est conformado por 6 mdulos. De ellos los ms importantes son: el de mediciones de calidad y el de mapas, pues en estos se calculan los descriptores de calidad de las imgenes, o del equipo a travs de las mismas. Estos descriptores son: la relacin seal ruido, la relacin contraste ruido y la no uniformidad integral de las imgenes; adems es posible calcular el espesor del plano, la estabilidad del campo magntico B0 y del ancho de banda del filtro del detector. Con el mdulo se pueden calcular los mapas de recepcin, excitacin y homogeneidad del campo magntico B0. El sistema tiene una ayuda que permite conocer los pasos para realizar cualquier accin en el sistema. Los requerimientos mnimos de hardware son: Microcomputadora IBM compatible Pentium o superior, 32 Mbytes de memoria RAM, disco duro de 1 Gbytes como mnimo, lector de CD, monitor grfico a color y tarjeta de vdeo compatible SVGA, mouse (ratn). Para la instalacin solo se requiere 3 Mbytes de memoria libre en disco; aunque debe haber un mayor espacio, para permitir el almacenamiento de los resultados de las pruebas en los ficheros de datos y para la manipulacin de las imgenes. Para desinstalar slo es necesario borrar, el subdirectorio CalImag.

1. RESULTADOS Y DISCUSIN
La interfaz del sistema est constituida por dos partes fundamentales, el men y la zona grfica (Fig. 1). En el men se presentan las acciones que se realizan en este sistema, desde cargar las imgenes hasta la visualizacin de la ayuda, pasando por el pre-procesamiento, las mediciones geomtricas, las mediciones de calidad y el clculo de mapas. En la zona grfica se presentan las imgenes y sus caractersticas.

Men

Zona grfica

Fig. 1: Partes fundamentales del Sistema CalImag.

La zona grfica se divide en 4 cuadrculas, en cada una de las cuales se visualiza una imagen o serie de imgenes (Fig. 1). Cada cuadrcula tiene herramientas que facilitan la manipulacin de la imagen (Fig. 2). El mdulo de Cargar Imgenes carga varios tipos de imgenes de distinto formato: DICOM, fichero .mat (fichero de workspace de matlab), fichero .img (fichero nativo de imgenes de los equipos Giroimag), fichero datas 01 (fichero nativo raw data del equipo Giroimag 01), fichero datas 02 (fichero nativo raw data del equipo Giroimag 02) y los ficheros estndar BMP, JPG, TIF, PCX, PNG, HDF, XWD. Este mdulo se presenta como se muestra en la Fig. 3. En el caso particular de las imgenes DICOM se dise de forma tal que se puedan cargar imgenes independientes, una serie o un estudio completo.
Botn de seleccin de la imagen Seleccin del plano Total de planos Botn de visualizacin de Datos

Scroll de desplazamiento por plano

# de pxeles de la imagen

Fig. 2: Herramientas de la cuadrcula de imagen. Estas permiten moverse dentro de la serie cargada, visualizar los datos con que se registr la serie y activar el estudio.

A B

Fig. 3: Opcin Cargar Imgenes. A la Izquierda el Men. A la derecha la ventana.

Se proporcionan adems una serie de filtros para realizar preprocesamiento a las imgenes. Estn activos 5 tipos de filtros como se muestra en la Fig. 3.

Fig. 4: Men preprocesamiento. Donde se observan los filtros disponibles.

El primero es el filtro zipper, el cual reduce de manera semi-automtica los artefactos de efecto zipper. El resto de los filtros de este mdulo: el filtro gaussiano, el filtro de la media y un filtro wavelet; se aplican automticamente despus de haber hecho la eleccin de la imagen y del filtro a aplicar; terminado el filtrado la imagen original es remplazada por la filtrada resultante. Este sistema brinda la posibilidad de realizar mediciones geomtricas. En la Fig. 5 se muestran las diferentes opciones disponibles.

Fig. 5: Men de mediciones geomtricas.

CalImag realiza pruebas de calidad con procedimientos diseados principalmente para caracterizar imgenes de resonancia magntica y a travs de stas a los equipos. No obstante con los sub-mdulos de mediciones generales y de relacin contraste ruido es posible caracterizar cualquier imagen, sobre todo si se utilizan en la comparacin de resultados de algn procesamiento realizado a estas. Las tres opciones o sub-mdulos restantes estn diseados slo para imgenes de resonancia magntica donde es posible caracterizar ya no las imgenes sino el equipo y/o las series implementadas en l (Fig. 6).

Fig. 6: Mdulo de Mediciones de calidad, donde estn las pruebas de Relacin Seal Ruido y No Uniformidad para una o varias imgenes.

Las mediciones generales se dividen en dos mdulos, el primero realiza los clculos con una sola serie y el segundo utiliza al menos 2 series de imgenes. En ambos mdulos se calcula la media de una regin de inters (ROI) de la zona de seal de la imagen (ecuacin 1), la desviacin estndar de la misma, la media de una ROI del fondo de la misma imagen y la desviacin estndar de esta ROI. Con estos datos se obtiene la relacin seal ruido (RSR) y la no uniformidad de la imagen (NUI) de la forma descrita en [7]. Los resultados se muestran en una tabla (Fig. 7B). El sistema brinda la posibilidad de guardar los resultados en un fichero texto para ser utilizados mas tarde para los estudios temporales, predictivos y retrospectivos. Opcionalmente se pueden graficar los resultados segn el plano para visualizar el estado de funcionamiento del equipo.

Guardar Guardar

Graficar Graficar

Fig. 7: Mediciones generales de una sola imagen. A. Marcaje de las ROIs. B. Tabla de resultados donde estn las opciones de Guardar y Graficar.

Para el clculo de la relacin contraste ruido se selecciona una serie de imgenes. Este procedimiento es por plano. Se realiza automticamente para todos los planos si se selecciona esa opcin. CalImag permite calcular los mapas de recepcin (B+1R(x,y)), de excitacin que es proporcional a (ij(x,y)) [6] y de inhomogeneidades de Bo (Bo(x,y)), ver Fig. 8. Los datos para estos clculos tienen que ser los descritos en la Metodologa para la medicin de los parmetros cuantitativos [8], de lo contrario los resultados no son vlidos.

Fig. 8: Mdulo de Clculo de Mapas. Solo disponible para IRM adquiridas con el protocolo [8].

El mapa de excitacin (ver Fig. 9) se calcula con la determinacin de los ngulos de giro del sistema de espines del sistema. Para esto se obtienen dos imgenes de un phantom homogneo, una con un ngulo de giro de 45 o menor, y otra con un ngulo igual al doble del primero (por ejemplo 30 y 60).

B
Fig. 9: Medicin de los ngulos (mapa de excitacin). A- Seleccin de la zona del phantom. B- Resultado final del mapa de excitacin.

En la medicin del mapa de recepcin se usa una imagen de un phantom homogneo y una vez escogida esta opcin del men, se visualiza la imagen, se marca la ROI en la zona de seal de la imagen (Fig. 10A) y se obtiene el mapa (Fig. 10B).

Fig. 10: Clculo del mapa de recepcin (no uniformidad). A. Marcaje de la ROI. B. Mapa de recepcin en la que se observan sus 8 barras conductoras.

En la Fig. 11 se muestran los mapas de Bo, en ppm, obtenidos en un equipo de 1.5 T usando un phantom diseado especialmente para calcular este descriptor. La flexibilidad del software permite realizar el CAC a cualquier equipo facilitando la estandarizacin y su uso en estudios multicntricos. Se introduce exitosamente una funcin que permite la realizacin de estudios por plano. Con los datos adquiridos y salvados en las tablas (ver Fig. 7B) se realizan los anlisis temporales y la comparacin entre equipos. Adems se realizan los informes de pruebas de aceptacin y los controles peridicos de calidad. En las figuras 12 y 13 se muestran resultados finales del procesamiento de la informacin obtenida por el sistema realizados y analizados por el experto.

Fig. 11: Mapas de una ROI de 25x25 cm obtenidos en equipo de 1.5 T. A) Inhomogeneidad de B0, B) Distorsin introducida por gradiente X. C) Distorsin introducida por el gradiente Y.

A
180 160 140 120 100 80 60

Mapa de Phantom Hom. SE. Yaracuy 1.4

Mapa de no-uniformidad del plano 11 97.7887% 180 160

120

2.5

140

Mapa de no-uniformidad del plano 10 78.7191% 1.8 1.6 1.4

1.2

140
1

2
100

120
0.8

1.2

100 80

1.5

80

1 0.8 0.6

0.6

60

1 60
0.4
40

40 20 0.2

40 20

0.4

0.5

20

0.2 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200

20

40

60

80

100

120

140

160

180

20

40

60

80

100

120

140

160

180

200

220

Fig. 12: Mapas de recepcin de RF obtenidos con CalImag correspondientes a la bobina receptora de crneo del equipo de 0.23T. (A) corte axial plano 11, (B) corte sagital plano 11. (C) corte coronal plano 11.

R S R t e m p o ra l y re t ro s p e c t ivo 55 50 45 40

N U I t e m p o r a l y r e t r o s p e c t i vo 20

18 16 14

IR M IR M IR M IR M IR M

1 2 2 + 1 A O 3 3 1 MES

35 30 25 20 15 10 5 IR M IR M IR M IR M IR M 5 10 15 # d e p la n o 20 25 1 2 2 + 1 A O 3 3 +1 MES 30

NUI (% )

12 10 8 6 4 2

RSR

10

15 # d e p la n o

20

25

30

Fig. 13: Se muestra una de las salidas del Sistema, el valor de la RSR y NUI de tres equipos de RM a 0.35T. (A) Anlisis temporal de la RSR. Se observa las desviaciones temporales intraequipo y las diferencias entre equipos. (B) Anlisis de la NUI. La mejor NUI est en los planos del 20-25, desplazada hacia la parte posterior. Esta diferencia est dada por la configuracin de las bobinas.

Para finalizar con los descriptores y supliendo la falta de uno que realice un anlisis temporal se introduce el descriptor CVt(x,y). Este se define como la razn entre la desviacin estndar de una serie temporal de imgenes y su madia expresada en por ciento [7]. Cvt se divide en tres zonas: la del fondo, correspondiente al ruido; la que corresponde a los bordes del objeto y que depende de B0; y la del centro a la excitacin. Segn la zona que vare ser el subsistema que presente la inestabilidad temporal en una ventana de tiempo en el orden de minutos u horas. La figura 14 muestra un ejemplo de inestabilidad temporal en el sistema de excitacin en un equipo de 1.5 T.

Fig. 14: Mapa de Cvt(x,y) de un equipo de 1.5T con inestabilidad temporal, en 15 min, en el sistema de excitacin. Se observan variaciones de hasta un 6%.

La reproducibilidad, precisin de los mtodos y de los programas se comprob con la realizacin de 15 mediciones por parmetro sobre la misma imagen, obtenindose errores relativos por debajo del 2%. Adems se someti a control y verificacin por la Oficina Nacional de Metrologa y recibi el certificado de apto. La estandarizacin conseguida con el sistema facilita la realizacin remota de las pruebas y permite que las tablas (Fig. 7B) viajen a un centro nico para realizar los anlisis comparativos entre equipos e intraequipos. No obstante el estado actual de las redes en Cuba y la no existencia de una red nacional de imgenes eficiente limita el uso remoto pleno del sistema. Los anlisis retrospectivos de las tablas permiten determinar que valor o valores de los descriptores se alejaron de lo usual y cual parte del equipo fall. Por tanto, cuando estas variaciones se produzcan es posible predecir que subsistema fallar. Con esto es posible tomar las medidas correctivas necesarias para evitar la salida del equipo por mucho tiempo. Otra bondad del CalImag es puede utilizarse como paquete o como programas independientes que son

usados a criterio del experto en la realizacin de las pruebas. Dentro de las aplicaciones que ha tenido el Sistema estn la caracterizacin de varios equipos de RM en Cuba y Venezuela. El costo de desarrollo del sistema es bajo, solo se necesitan los phantoms y una PC de procesamiento. El precio de estos servicios es elevado, por ejemplo la MagNET adjunta a la Unin Europea, cobra por el CAC a IRM alrededor de 50 000 USD. La marca CalImag (Resolucin: No. 938/2002) y la metodologa estn registradas (Registro: 010450-10450). El trabajo tambin recibi un diploma de la Organizacin Mundial de la Propiedad Intelectual.

Nombre del producto: Pletismgrafo Digital para el diagnstico de enfermedades vasculares perifricas. Marca comercial: ANGIODIN Fabricante: Biofsica Mdica. EL ANGIODIN PD 3000 es un equipo mdico porttil, perteneciente al grupo de pletismgrafos digitales, diseado para el diagnstico precoz y no invasivo de las ms frecuentes enfermedades arteriales perifricas, que son tratadas en los Laboratorios de Hemodinmica Vascular y otras reas hospitalarias, como Cardiologa, Endocrinologa y Anestesiologa. Entre las enfermedades diagnosticables se encuentran la insuficiencia arterial perifrica, la angiopata diabtica, el pie diabtico, los sndromes oclusivos en miembros superiores e inferiores, la hipersensibilidad al fro y el sndrome de Raynaud. Otras de sus aplicaciones son la determinacin del nivel ptimo de amputacin, la presin arterial sistlica (PAS) y el estudio de la disfuncin sexual erctil. El sistema basa su funcionamiento en el registro de la onda de pulso arterial mediante el empleo del mtodo fotopletismogrfico. Este equipo porttil posee gran autonoma y simplicidad en el diseo, aspectos que permiten extender su aplicacin a la evaluacin del sistema vascular en otras reas de salud.

Incluye un software auxiliar que permite recibir las pruebas hemodinmicas desde el ANGIODIN a una computadora personal, generndose los respectivos reportes para ser visualizados, impresos, analizados, legalizados y adjuntados a la Historia Clnica. Principales prestaciones: Registro de la onda de pulso mediante sensor infrarrojo. egistro Estudios de insuficiencia arterial perifrica, angiopatas y sndromes oclusivos. Determinacin del nivel ptimo de amputacin y estudio de la disfuncin sexual erctil. Posibilidad de generar e imprimir reportes, desde una computadora personal, a partir de pruebas hemodinmicas con el ANGIODIN. Visualizacin de mens, curvas, parmetros y tablas en pantalla de Cristal Lquido, con posibilidad de luz para locales de poca o ninguna iluminacin.

SILENCIAMIENTO DE GENES
2. INTRODUCCIN
El silenciamiento de genes mediante los RNA pequeos de interferencia (siRNA) se perfila como una poderosa herramienta teraputica en el futuro. Hace aproximadamente 8 aos en estudios de otra ndole [1], se descubri la existencia de genes que permitiran el silenciamiento de otros genes, es decir, que seran capaces de inhibir su accin en el organismo. Este mecanismo de silenciamiento de genes fue descubierto en el C. Elegans y ahora se sabe que est conservado en casi todos los organismos, por lo que puede ser utilizado como una forma de terapia gnica: si cierta enfermedad es el efecto del aumento en la expresin de un gen especifico y se conoce su identidad, se podra apagar su expresin por medio de inyecciones de RNA pequeos de doble cadena y curar as la enfermedad [2]. En estudios ms profundos se dedujo, que la creacin de forma artificial de un gen como el siRNA, sera una de las principales herramientas experimentales para combatir y buscar soluciones a problemas de enfermedades en animales, plantas y el genoma humano [2]. En general, la informacin gentica es el programa que gua la sntesis de protenas especficas, responsables de las caractersticas estructurales y funcionales de un organismo. La molcula principal portadora de esta informacin es el ADN. En el ADN existen secciones llamadas genes que son la unidad de informacin hereditaria y que en muchos casos son responsables por una protena especfica. Mecanismos bioqumicos en el ncleo celular seleccionan y transcriben parte de la informacin en un gen formando una copia de su mensaje en molculas de RNA mensajero (transcripcin); en clulas eucariotas la informacin de un solo gen puede transcribirse en ms de una polimerasa. Las molculas de RNA son utilizadas entonces para la sntesis de la protena correspondiente en los ribozomas (traduccin). El esquema del flujo de informacin gentica se muestra en el diagrama siguiente:

Fig. 1: Dogma general de la biologa molecular. Por tanto, el mensaje gentico se realiza en dos sucesivas, en las que el RNA es un intermediario imprescindible.

etapas

TIPOS: RNA mensajero RNA ribosmico RNA transferente Es necesario notar que existen mecanismos de regulacin en todas las etapas de este proceso. Algunos de ellos se encuentran embebidos como marcadores que promueven o inhiben la transcripcin del gen. Otros, una vez formado el mRNA deciden si se sintetiza una protena o no (mecanismos posttranscripcionales). Cuando no se sintetiza puede deberse, entre otras causas a la accin de RNA de interferencia o microRNA (miRNA). Los miRNA son transcritos a partir del ADN, pero que no son traducidos a protenas. La funcin de los miRNA est relacionada con la regulacin gnica. Un miRNA es complementario a una parte del mRNA. El apareamieto del miRNA con el mRNA inhibe su traduccin a protena, y facilita la rotura del mRNA. Este proceso de degradacin del mRNA ocurre de forma natural en los organismos y el causante principal es el miRNA. En contrapartida, el proceso artificial de silenciamiento de genes se realiza a travs de RNA pequeo de interferencia (siRNA); creado en los laboratorios una vez que se han encontrado los genes a silenciar. Para poder construir los siRNA es necesario encontrar sitios candidatos para la accin del mecanismo de interferencia en el RNA mensajero. Estos son los llamados sitios blancos. Este proceso de bsqueda es

necesario realizarlo con una aplicacin informtica, dada la gran cantidad de informacin que es necesario procesar.

3. METODOLOGA
Para la implementacin del sistema se desarrolla una herramienta Cliente Servidor con interfaz web, debido a su fcil acceso, adems siempre estar disponible para los especialistas que la necesiten en sus estudios. Para realizar un buen desarrollo del sistema fue imprescindible primero entender el proceso que ocurre para el silenciamiento (parte biolgica) y luego hacer el trabajo informtico. En este ltimo se concibi trabajar con bases de datos, ficheros y por ende hacer bsqueda de informacin en ambos adems del anlisis correspondiente con dicha informacin para encontrar los sitios blancos, presentamos el proceso de forma general en el siguiente esquema:

Fig. 2: Muestra en la parte superior el proceso de silenciamiento biolgicamente: trascripcin, traduccin, degradacin provocada por el siRNA. En la parte inferior el proceso que se lleva a cabo en la aplicacin para encontrar los sitios blancos para los que se disea el siRNA.

Una de los aspectos novedosos de biosiRNA-Design es que permite al especialista formar la secuencia de mRNA a partir de la base de datos y la informacin de los cromosomas del genoma humano con los cuales se cuenta, introduciendo solamente un criterio de bsqueda (id del gen, nombre del gen o id del transcrito). La implementacin se realiz completamente con herramientas de software libre, lo que garantiza una completa independencia tecnolgica y podra si se decide ser comercializado sin restricciones.

4. FUNCIONALIDADES DEL SOFTWARE

1: Mostrar gen.

1.1: Especificar criterio de bsqueda. 1.2: Buscar transcritos asociados al gen. 1.3: Mostrar numero del cromosoma, id y smbolo del gen. 1.4: Mostrar transcritos asociados al gen. 1.5 Mostrar cantidad de transcritos asociados. 2: Mostrar transcrito. 2.1: Seleccionar transcrito. 2.2: Buscar transcrito especificado. 2.3: Mostrar grfica con el nombre, posicion inicial y posicin final del transcrito e id del gen al que pertenece. 2.4: Mostrar exones, diferenciando zona codificante de zona no traducida. 2.5: Mostrar SNPs. 2.6: Mostrar secuencia de nucletidos. 3: Realizar anlisis de las secuencias mRNA. 3.1: Seleccionar reglas. 3.2: Seleccionar opcin de incluir o no SNPs para el anlisis. 3.3: Buscar sitios blancos en la secuencia mRNA. 3.4: Mostrar grfica de la secuencia de mRNA resaltando sitios blancos. 3.5: Mostrar subcadena de los sitios blancos, con posicion inicial y final. 3.6: Mostrar en caso de axistencia de los polimorfismos de nucletido simple (SNP), la subsecuencia mRNA con los SNP. 3.7: Mostrar resultados ordenados por reglas cumplidas. 4: Mostrar miRNA 4.1: Mostrar id, score y pvalue del miRNA. 4.2: Mostrar el sitio del gen donde el miRNA acta. 4.3: Seleccionar nivel de significancia que el usuario desee.

5. IMPACTO Y BENEFICIOS DE BIOSIRNA-DESIGN

La herramienta desarrollada puede aportar mucho a lo que se conoce se est haciendo en el mundo con la tcnica de silenciamiento de genes. Silenciar determinados genes puede abrir unas vas teraputicas magnficas para tratar enfermedades como cncer, problemas autoinmunes, infecciones vricas entre otras. A continuacin se muestran algunos ejemplos de sus aplicaciones: Se ha llegado a fabricar tomates transgnicos que llevan un gen artificial, productor de un ARN antisentido para bloquear la expresin de otro, implicado en la sntesis de etileno, la hormona vegetal que provoca maduracin (reducen su expresin un 90%). As, estos tomates se conservan mucho ms. Desde el punto de vista mdico, ya se ha logrado frenar la replicacin del VIH, del poliovirus y del virus de la hepatitis C, exponiendo cultivos celulares humanos a siRNA. Quedan muchos obstculos todava hasta llegar a los pacientes. Como, p.ej., lograr administrar el posible frmaco, ya que los ARNip tienen un tamao muy superior al medicamento tpico, o que el ARN se digiere y degrada en el sistema digestivo. Para orillar las dificultades se ha pensado en adenovirus como taxis genticos, pero todava hay muchos interrogantes, especialmente en el terreno de la seguridad para el paciente. Tumour invasion and metastasis initiated by microRNA-10b in breast cancer.Ma L, Teruya-Feldstein J, Weinberg RANature 2007 Oct 11 449(7163):682-8 En el artculo anterior se demuestra que el gen RHOC acelera la metstasis en el cncer de mama y la intensidad de su expresin es regulada por el miR-10b, que es un miRNA, uno de los mismos que se muetran en BiosiRNA-Design de determinado gen. En la pgina que responde al URL: www.nature.com/focus/microrna-cancer, se pueden encontrar ms de diez artculos que relacionan a los miRNA con el desarrollo y regulacin del cncer. El producto se desarrolla para el Centro de Ingeniera Gentica y Biotecnologa(CIGB), brinda independencia en los experimentos y pruebas que realizan los especialistas de la institucin que llevan un alto

valor cientfico y confidencialidad, se estn haciendo estudios de las enfermedades que ms afectan hoy a la humanidad (cncer, VIH) con esta tcnica. Nuestro pas est enfrascado en estas tareas siguiendo las polticas de seguridad que ello requiere lo cual no es posible sin un sistema completamente independiente. Adems el diseo de los siRNA con la aplicacin implementada posibilita rapidez y eficiencia en los resultados deseados, tales caractersticas son esenciales para el proceso de investigacin. El sistema administra la seguridad requerida en cuanto a la informacin que se maneja, se cuenta con una base de datos donde la informacin no est expuesta a alteraciones y cambios. El algoritmo que realiza la bsqueda de los posibles sitios blancos para los cuales los investigadores disean RNA pequeos de interferencia fue implementado por el equipo en conjunto que trabaja en el proyecto, lo que posibilita que se sepa cmo y qu se tiene en cuenta a la hora de obtener los resultados. Los investigadores no solo pueden ver la secuencia de nucletidos que se busca sino que tambin tiene una representacin grfica de la posicin de dicha secuencia dentro de la cadena de mRNA, puede ver igual de forma grfica los datos de los genes, transcritos, exones y los puntos que cambian en el genoma en individuos distintos (llamados SNP). De los SNP puede verse el nucletido que puede cambiar dentro de la secuencia y permite excluir esos puntos del diseo de los siRNA, lo que beneficia a los especialistas a la hora de realizar un determinado frmaco, pues si incluimos un SNP en un medicamento pudiera ser que para unos organismos fuera efectivo y para otros no, por la caracterstica de que este es un punto que puede variar en el genoma. En consecuencia, se le muestra tambin los RNA de interferencia que el organismo humano tiene por naturaleza, lo que tiene como ventaja que si uno de estos es el regulador de cierta enfermedad no hay necesidad de hacer un nuevo diseo de un RNA pequeo de interferencia, pues solo sera reproducir ese que ya se tiene. El sistema cuenta con funcionalidades que cubren todos los requerimientos planteados, adems de secciones informativas de vnculos a sitios de internet donde se brinda informacin relacionada con el tema.

6. CONCLUSIONES
El sistema biosiRNA-Design en su primera versin est diseado de forma tal que el usuario haga uso de la misma sin dificultad alguna, ajustndose a los estndares establecidos para el desarrollo de un buen diseo. Podr ser usado por cualquier persona que posea conocimientos bsicos en el manejo de la computadora, solo se necesita contar con conocimientos especializados en biologa para entender los resultados dados por la aplicacin. Al estar concebida para un ambiente cliente/servidor se garantiza la rapidez de respuesta del sistema ante las solicitudes de los usuarios, al igual que la velocidad de procesamiento de la informacin para lo cual se realiza la validacin de los datos y la manipulacin de eventos en el cliente, y en el servidor aquellas que por cuestiones de seguridad o de acceso a los datos lo requieran, logrndose as un tiempo de respuesta ms rpido, una mayor velocidad de procesamiento, y un mayor aprovechamiento de los recursos. Es multiplataforma. Se debe disponer de Linux en cualquiera de sus distribuciones, Windows 95 o versiones superiores para la instalacin de la aplicacin. La Base de Datos es independiente de la aplicacin. Para el desarrollo y puesta en prctica del proyecto se requiere al menos procesador Pentium 3, 256 MB de RAM y 2 GB de espacio disponible en disco duro para los servidores y para las pc clientes Pentium 2 de procesador y 128 MB de RAM. El buen uso de esta aplicacin, puede convertirla en una poderosa herramienta para el avance cientfico de los especialistas que realicen investigaciones en el marco de trabajo de los diseos de los ARN pequeos de interferencia.

SISTEMA AIDA (Advanted Image and Data Archiving System)

Sistema asistido por ordenador para la documentacin y archivo de imgenes de vdeo de una cmara vdeoendoscpica y de datos del paciente que pueden registrarse durante una intervencin quirrgica. INTEGRACION EN EL QUIROFANO - Los datos de imgenes, as como su tratamiento, se asignan al paciente seleccionado en cada caso. - El cirujano puede usar configuraciones personalizadas y estandarizadas con slo introducir su nombre y seleccionar el tipo de intervencin. Se entrega al paciente informe de alta con las fotografas de su intervencin. Se ha integrado el sistema Ada con el ordenador central del Quirfano OR1.

ORDENADOR CENTRAL
En el caso concreto de la UCMA Santa Cristina: (S.C.B: Storz Comunication Bus) - Se encuentra dentro del quirfano. - Es un monitor que permite indicar todos los parmetros de los aparatos conectados al S.C.B - Cada uno de los mdulos de la torre de endoscopia tiene la representacin comprimida de sus funciones, as como la representacin visual en esta pantalla de ordenador. - El control se realiza por medio de una pantalla tctil que se manipula desde el campo estril mediante una funda de plstico estril. FUNCIONES BASICAS DEL ORDENADOR CENTRAL SCB. - Mando a distancia de todas las funciones de los aparatos (p.ej. insuflacin, irrigacin, coagulacin, potencia lumnica, etc). - Indicacin de todos los parmetros de los aparatos (cada uno de los valores de los aparatos configurados previamente, tales como flujo, presin, valores de corte, coagulacin, etc.). - Programacin de las configuraciones de cada mdico (cada mdico introduce los parmetros de individualizada en relacin al proceso quirrgico concreto). forma

- Permite la grabacin de la intervencin (por medio de la interconexin con el Rack). - Hace posible enviar imgenes a otras partes del mundo, as como establecer videoconferencia en directo durante la intervencin.

DESFIBRILADOR MONITOR
Equipo electromdico porttil, de soporte de vida, para la descarga elctrica sincrnica o asincrnica, con el fin de revertir alteraciones del ritmo y de la conduccin, as como para la vigilancia de la actividad elctrica del corazn. Para desfibrilacin, cardioversin y monitoreo continuo integrado. Con pantalla LCD, TRC, FED alta resolucin o electroluminiscente. Con despliegue digital y de onda de los siguientes parmetros: frecuencia cardiaca, despliegue de un trazo de ECG como mnimo a seleccionar entre 6 derivaciones: (DI, DII, DIII, aVR, aVL y aVF). Energa para descarga externa, dentro del rango de 0 a 360 o ms joules. Alarmas visibles y audibles, ajustables por el usuario, para alteraciones en la: frecuencia cardiaca, conexin del paciente y carga de la batera. Paletas convertibles para adulto y para nio, para excitacin externa que dete ten actividad electrocardiogrfica, reusables. Con selector de modo: sincrnico (o cardioversin), asincrnico (o desfibrilacin). Con descarga: desde las paletas y desde el panel de control. Capacidad de autodescarga cuando no se utilice en un plazo mximo de 60 segundos. Con sistema para probar descarga. Tiempo de carga mximo de 8 segundos para carga de 0 a 360 joules. Con batera recargable integrada que permita dar 30 desfibrilaciones a 360 joules o 2 horas de monitoreo continuo como mnimo. Tiempo de carga mximo de la batera de 4 horas. Sistema de impresin trmica integrado, con un canal como mnimo. Con soporte para la tabla para compresiones cardiacas externas. Con soporte ajustable y resistente para tanque de oxgeno. Soporte de altura ajustable para soluciones.

ECOCARDIGRAFO COLOR AVANZADO.

BIDIMENSIONAL

DOPPLER

Equipo de alta resolucin que se utiliza con fines diagnsticos para exploracin ultrasonogrfica invasiva y no invasiva, en tiempo real con doppler color para estudios cardiacos en pacientes adultos y peditricos. Monitor a color de alta resolucin de 14 pulgadas o mayor. Sistema digital de 512 canales independientes de procesamiento digital, Modo B, doppler continuo y pulsado, doppler color y sistema de mapeo a color (angio, power doppler), Modo de imgenes armnicas en modo B y angio. Modo doppler color de tejido, Trazo automtico del espectro doppler y clculos de: frecuencia cardiaca, ndice de pulsatilidad, ndice de resistencia, velocidad mxima y mnima, aceleracin mxima y tiempo de aceleracin, gasto cardiaco. Rango dinmico de 150 dB o mayor con adquisicin de mnimo 300 cuadros por segundo. Con 256 escalas de grises y 256 tono de

color como mnimo. Memoria de cineloop o cuadro por cuadro de mnimo 400 cuadros en color y en blanco y negro y 100 segundos en modo M o doppler espectral. Programa completo de mediciones en modo doppler, M y 2D (modo B) con clculos cardiacos y vasculares: dimensiones, volmenes de ventrculo izquierdo y derecho, medicin de fraccin de expulsin, medicin de reas, medicin de masas de ventrculo izquierdo y derecho, medicin de velocidades, pendientes y aceleracin, mtodo Simpson y mtodo Bullet. Zoom. Superposicin del ECG.

ELECTROENCEFALGRAFO DE 16 CANALES.

Electroencefalgrafo de 16 canales, para valorar la actividad elctrica cerebral. Equipo que consta de generador (estimulador) de pulsos cuadrangulares, audimetro (audioestimulador) y fotoestimulador. Integrado en un gabinete rodable, de 16 canales. Cuenta con cabezal, caja de conexin de electrodos, aguja, pajillas, cable toma corriente, cables para paciente, electrodos ajustables a la cabeza del paciente y papel adecuado para el registro

MONITOR DE SIGNOS TRASLADO DEL PACIENTE

VITALES

PARA

EL

Equipo porttil no invasivo que registra en pantalla las constantes vitales del paciente, con fines diagnsticos y teraputicos. Con las siguientes caractersticas, seleccionables de acuerdo a las necesidades de las unidades mdicas: monitor. Con asa para transporte y sistema para sujecin a rieles laterales de camilla. Controlado por microprocesador. Para presentacin simultnea de curvas fisiolgicas e informacin numrica para los siguientes parmetros, de acuerdo a las necesidades de las unidades mdicas: Oximetra de pulso, electrocardiograma, respiracin por impedancia. Despliegue numrico simultneo de: frecuencia cardiaca, presin arterial no invasiva, programacin de la toma de presin a diferentes intervalos de tiempo: sistlica, diastlica, temperatura en al menos un canal, frecuencia respiratoria con presentacin de su curva, oximetra 45

CATLOGO /ELECTRNICA MDICA de pulso y frecuencia del pulso. Almacenamiento de tendencias grficas y numricas. Uso adulto y peditrico. Batera interna recargable. Cargador. Indicador luminoso o en pantalla de baja batera. Alarmas audibles y visibles con funcin que permita revisar y modificar los lmites de alarma de los siguientes parmetros: saturacin de oxgeno, frecuencia cardiaca, presin arterial no invasiva, temperatura, frecuencia respiratoria y alarma de apnea. Con silenciador de alarmas. Manual y mensajes en espaol. Teclado del equipo en espaol y con simbologa aceptada internacionalmente. Peso incluyendo la batera y el cargador.

MONITOR DE SIGNOS VITALES

Equipo invasivo y no invasivo que registra en pantalla las constantes vitales del paciente, con fines diagnsticos y teraputicos. Con las siguientes caractersticas, seleccionables de acuerdo a las necesidades de las unidades

mdicas: monitor configurado o modular con pantalla. Con capacidad para conectarse a red de monitoreo. Pantalla para presentacin de curvas fisiolgicas simultneas e informacin numrica para los siguientes parmetros: Electrocardiograma en derivaciones seleccionables por el usuario. Presentacin de un canal de ECG mnimo en pantalla. Oximetra de pulso. Frecuencia respiratoria con despliegue de su curva. Despliegue numrico de: frecuencia cardiaca, presin arterial no invasiva, sistlica y diastlica. Modos para la toma de presin: Manual y automtica a diferentes intervalos de tiempo. Temperatura en al menos un canal. Frecuencia de pulso. Opcin de monitoreo de capnografa a futuro. Canales de presin invasiva, cada uno debe medir y mostrar simultneamente en pantalla: presin sistlica, diastlica y media. Debe contar con funcin de etiquetado para cada canal de presin invasiva: presin arterial, presin venosa central, arteria pulmonar, como mnimo. Con ajuste automtico de escala y alarmas. Tendencias grficas y numricas de todos los parmetros, seleccionables por el usuario. Uso para adulto y peditrico. Con batera interna recargable, con cargador integrado e indicador de bajo nivel en pantalla. Alarmas audibles y visibles con funcin que permita revisar y modificar los lmites superior e inferior de los siguientes parmetros: saturacin de oxgeno, frecuencia cardiaca, presin arterial no invasiva, sistlica y diastlica, temperatura, frecuencia respiratoria y alarma de apnea, presin invasiva sistlica, diastlica y media. Que identifique niveles de prioridad en las alteraciones fisiolgicas. Con silenciador de alarmas. Todas las funciones deben ser accesadas mediante teclas de membrana, sensibles al tacto o perilla selectora en el gabinete del monitor. Teclado, mens y mensajes en pantalla en espaol. Registrador. Diseo que permita ser usado como monitor de transporte y monitor de cabecera.

POLGRAFO DEL TRACTO DIGESTIVO

Equipo para medir motilidad del tracto digestivo, presiones esofgicas y anorrectales, electromiografa y retroalimentacin biolgica. Aparato medidor (unidad base) de 1 hasta 16 canales de grabacin, configurables para medir presin, electromiografa, electrogastrografa, pH, respiracin y trago. Con display de LEDS luminosos, para verificacin rpida de funcionamiento. Con resolucin de 12 bits. Comunicacin serial ptico RS 232. Compatible para ser usado con catteres para medir presiones, con sensores electrnicos (catter de estado slido) y en base al sistema de perfusin (catter multiusos). Peso aproximado de 1000 g y dimensiones aproximadas, en cm: 28 x 5 x 15. Incluye catter de estado slido (de 4 canales). Computadora Pentium 200 MHz, 32 MB en RAM, un slot de expansin yCD-ROM. Impresora a color, de inyeccin de tinta. Programa para leer y analizar los datos contenidos en el equipo, manejado bajo ambiente Windows 3.1, 95 o 98. Para analizar estudios esofgicos incluyendo evaluaciones del esfnter esofgico inferior, del esfnter esofgico superior, relajacin, reposos, coordinacin y peristalsis esofgica; as como para anlisis de estudios anorrectales incluyendo presiones radiales, balones rectales, volmenes vectoriales, etc.

POLISOMNGRAFO
Equipo para el estudio de alta especialidad en pacientes con desrdenes del sueo. Aparato de polisomnografa computarizado, con 28 canales de registro simultneo y anlisis de ocho entradas auxiliares para equipo externo, ocho canales de registro de EEG, diez horas de registro por sesin, con cambio manual o ajuste automtico de ganancias, medicin de impedancia, cambio de la base de tiempo y revisin de datos anteriores. Anlisis automtico de nivel de sueo, estadios de sueo, apneas, hipopneas, respiracin peridica, apneas por nivel de CPAP, oximetra de pulso, electrocardiografa, frecuencia cardiaca, intervalo R-R prolongado, movimientos peridicos de extremidades, eventos de pH, ronquido, posicin corporal, esfuerzo torcico, esfuerzo abdominal, movimientos, tendencia de ETCO2, edicin de nivel o estados de sueo, edicin de eventos de apnea-hipopnea. Mediciones en pantalla de su frecuencia, amplitud y duracin, valoracin y frecuencia de repeticin, generacin automtica de respuestas. Incluye computadora pentium de 133 MHz, 32 Mb de memoria RAM, disco duro 1 Gb, disco flexible de 1.44 Mb, dispositivo sealador (mouse), monitor de color de alta resolucin SVGA, unidad de registro de alta densidad disco ptico o CD ROM, mdem de 24 buts para recepcin de estudios remotos.

SISTEMA DE AUDIODIAGNSTICO MULTIFUNCIONAL

Equipo computarizado que integra varias funciones para realizar exmenes audiolgicos precisos y eficientes. Aparato integrado en consola de mando que incluye computadora y programacin que permite secuencia de pruebas en forma automtica, realizacin de pruebas independientes o simultneas, informacin de pacientes y resultados mediante base de datos. Consta de intercomunicacin y control a travs de bocinas, audfonos, micrfonos, amplificadores y monitor que permite al operador la estimacin visual de las seales de voz. Impresora de alta resolucin y alta calidad. Analizador de odo medio y auxiliar auditivo digital que permite programar realizar e imprimir los siguientes estudios: audiometra, tonos puros, umbral de recepcin y deteccin, discriminacin fontica, Bekesy, decaimiento de tonos y mediciones de odo real.

UNIDAD PARA MEDIR METABOLISMO

Equipo porttil microprocesado de monitoreo metablico, para pacientes con ventilacin mecnica y respiracin espontnea. Informacin metablica en pantalla monocromtica o a color de alta resolucin. Despliegue de los siguientes parmetros como mnimo: consumo de oxgeno (O2), produccin de CO2 (VCO2), gasto energtico (EE), fraccin inspirada de oxgeno (FiO2). Presentacin en pantalla de las tendencias configurables por el usuario. Estimacin del metabolismo basal mediante la ecuacin de Harris-Benedict como mnimo. El equipo deber reportar la hora y el tiempo de medicin. Rangos de medicin: de 5 a 2000 ml/min para consumo de oxgeno, de 5 a 2000 ml/min para produccin de CO2, sensor de CO2 infrarrojo con rango de 0 a 10%. Medicin directa de la produccin de CO2 usando generador de flujo constante, sensor de oxgeno diferencial paramagntico (libre de mantenimiento). Concentraciones de oxgeno inspirado: FIO2 21 a 85% (ventilador), FIO2 21 a 50 % (canopia o escafandra). Flujo de muestreo: en el rango de 80 a 150 ml/min (con ventilador), en el rango de 0 a 50 ml/min (con uso de escafandra) Capacidad de realizar calibracin de gases de manera manual y automtica. Para uso en pacientes neonatos, peditricos y adultos. Computadora personal o microprocesador integrado. Con capacidad de realizar evaluacin nutricional.