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Nació en el barrio limeño de Collique y fue formado en la Escuela de Fútbol Héctor Chumpitaz ubicada
en el distrito de Comas, donde entrenó desde el año 2004 hasta 2008.
Poco a poco fue ganando terreno y gracias a esto fue transferido al Villarreal C.F de España en el
2012. Ya para el 2014 se hizo oficial el traspaso de Flores al Universitario de Perú.
Logró participar en la Copa Libertadores del 2014 a pesar que su equipo haya quedado eliminado. Sin
embargo en el 2016 obtuvo el título del Torneo Apertura junto otros compañeros ante el Sporting
Cristal.
En el mismo año logró ser transferido a su actual equipo Aalborg B.K de Dinamarca, realizó su debut
el 15 de agosto saliendo victorioso
En el 2016 el entrenador de su selección Ricardo Gareca los llamó para participar en la Copa América
Centenario donde obtuvieron varias victorias, a pesar de haber sido derrotados en los cuartos de
finales.
Fue trasladado a la Selección Peruana. Con la 'Blanquirroja' anotó cinco goles en la finalizada
Eliminatoria, fue vital para conseguir el boleto a Rusia 2018 y ahora se alista para cumplir el sueño de
todo futbolista: representar a su país en un Mundial.