TAXONOMÍA MICROBIANA

La taxonomía comprende tres disciplinas distintas: la clasificación, la nomenclatura y la

identificación. El idioma común que proporciona la taxonomía minimiza la confusión sobre
los nombres y permite centrar la atención en problemas y fenómenos científicos de
relevancia. En el diagnóstico microbiológico estas disciplinas desempeñan un papel central,
ya que proporcionan un diagnóstico exacto y oportuno de las enfermedades infecciosas.

La clasificación es la organización de microorganismos que comparten características

morfológicas, fisiológicas y genéticas similares en grupos específicos o taxones. El sistema
de clasificación es jerárquico y consiste en los siguientes taxones:

1. Especie
2. Género (compuesto por especies similares)
3. Familia (compuesta por géneros similares)
4. Orden (compuesto por familias similares)
5. Clase (compuesta por órdenes similares)
6. División (compuesta por clases similares)
7. Reino (compuesto por divisiones similares)

Especie

La especie es el grupo taxonómico más elemental y se define como una colección de cepas
bacterianas que comparten muchas características fisiológicas y genéticas, y como grupo
difieren de otras especies bacterianas. Existen subgrupos taxonómicos dentro de una
especie, denominados subespecies. Los grupos ubicados por debajo de la subespecie, que
comparten características específicas pueden designarse como biotipo, serotipo o genotipo;
pero su valor en el diagnóstico microbiológico es limitado.

Género

El género es el siguiente taxón más alto y comprende especies que comparten varias
características pero son lo suficientemente diferentes como para seguir manteniendo su
estatus como especies individuales. Todas las especies bacterianas pertenecen a un
género y el pasar de una especie a un género particular se basa en varias características
genéticas y fenotípicas compartidas entre las especies. Las designaciones de taxones más
altos (división, clase, orden, familia) no suelen ser útiles para clasificar las bacterias.

Nomenclatura

La nomenclatura es la denominación de los microorganismos según reglas y normas

establecidas. Estas proporcionan los nombres aceptados por los que los microorganismos
son reconocidos en todo el mundo. Dado que el género y la especie son los grupos de
mayor interés la nomenclatura microbiana se limitará a estos. En la nomenclatura binomial
(“dos nombres”), a cada microorganismo se le asigna un nombre de género y especie
derivado del latín o del griego. Es decir, que cada microorganismo tiene un “nombre”
científico que consiste en dos partes: la designación del género, que siempre se escribe en
mayúscula, y la designación de la especie, que se escribe en minúscula.
Ambos componentes se usan siempre de manera simultánea y se escriben en itálica en la
escritura impresa o subrayados en la escritura manual. También puede abreviarse utilizando
la primera letra mayúscula de la designación del género seguida por un punto (.) y el
nombre completo de la especie (ej: S. pneumoniae).

También puede utilizarse una designación informal (ej: estafilococos, estreptococos) para
denominar a un grupo de microorganismos. Cuanto se obtiene más información respecto a
la clasificación y la identificación de una especie puede trasladarse a un género diferente o
se le puede asignar el nombre de un género nuevo. En el laboratorio de diagnóstico los
cambios de nomenclatura se introducen de manera gradual para que los médicos y los
laboratoristas puedan reconocer que a un patógeno se le asignó un nombre nuevo. Para
esto se utiliza la designación del género nuevo pero se continúa empleando la designación
anterior entre paréntesis, ej: Stenotrophomonas (Xanthomonas).

Identificación

La identificación microbiana es el proceso por el cual se definen las características

importantes de un microorganismo, luego se compara el perfil de este con el de otros
caracterizados antes para que el microorganismo pueda clasificarse dentro del taxón más
apropiado (clasificación) y se le pueda asignar un nombre de género y especie apropiado
(nomenclatura).

Métodos de clasificación

Estos métodos se separan en dos categorías generales: características genotípicas y

características fenotípicas. Las características genotípicas se relacionan con la composición
genética del microorganismo, lo que incluye la naturaleza de sus genes y los ácidos
nucleicos que lo constituyen. Mientras que las características fenotípicas se basan en
rasgos que exceden el nivel genético e incluyen los que se observan con facilidad y otros
cuya detección requiere procedimientos analíticos extensos.

En el cuadro se muestran los criterios de identificación y características para la clasificación

microbiana, que en muchos casos también se utilizan para la identificación y la
caracterización de los microorganismos encontrados en el contexto clínico.