TEMA 25: MICROBIOLOGIA DE LAS AGUAS CONTINENTALES Y MARINAS

El agua como hábitat microbiano

 Contenido de O2 disuelto variable.

 pH del agua tamponado. (equilibrio ácido carbónico/bicarbonato/carbonato)

 Radiación solar. Luz  zona fótica Temperatura  estratificación termal

 Disponibilidad de nutrientes.

Agua dulce: Los ambientes de agua dulce presentan recursos y condiciones para el crecimiento microbiano variables.
El balance entre fotosíntesis y respiración controla los ciclos del oxígeno y del carbono. Fitoplancton: fotótrofos
oxigénicos libres en el agua, incluye algas y cianobacterias. Las especies bentónicas son las que están ancladas al fondo
o los lados de un lago o de una corriente.

La actividad de los microbios heterótrofos en sistemas acuáticos es altamente dependiente de los productores
primarios; los fotótrofos oxigénicos producen material orgánica y oxígeno. EL oxígeno tiene baja solubilidad en agua;
las capas profundas de los lagos pueden volverse anóxicas una vez el oxígeno es consumido Las concentraciones de
oxígeno en sistema acuáticos dependen de la cantidad de materia orgánica y la mezcla fisca que haya en el sistema.

En muchos lagos templados, la columna de agua se estratifica durante el verano. El epilimnion es la capa más caliente,
menos densa de la superficie del agua. El hipolimnion es la capa más fría, más densa del fondo del lago. Ambas están
separadas por la termoclina. Estas capas varían mucho en temperatura, disponibilidad de oxígeno y composición
química. En otoño, la superficie se enfría y se invierte el lago produciéndose mezcla de nutrientes.

Distribución de microorganismos en un lago:

- Plancton: organismos flotadores.

- Neuston: organismos en la interfase aire-agua.
- Pleuston: vegetación macroscópica flotante y organismos que viven sobre el agua

Muestreo filogenético: Se han realizado estudios genéticos en lagos. La secuencia

rRNA16S se utiliza como un método independiente de cultivo. Una alta diversidad refleja
el carácter dinámico de un lago

Lagos oligotróficos y eutróficos

- Oligotrófico
- Eutrófico: enfriamiento en otoño. Perdida de la termoclina, ascenso de
subproductos anaerobios. Muerte de peces.
Diversidad de bacterias y arqueas en un lago de agua dulce

Eutrofización de un río: Demanda bioquímica de oxígeno (DBO o BOD): Mide la capacidad de los microorganismos de una
masa de agua de consumir oxígeno. El aumento de la entrada de materia orgánica aumenta la DBO, luego disminuye con el
tiempo y corriente abajo.
Ríos, arroyos y manantiales
Pueden estar bien mezclados debido a una rápida corriente. El flujo continuo de agua evita que se formen
comunidades planctónicas. Habitan microorganismos quimiorganótrofos y autótrofos. Pueden sufrir deficiencias de
oxígeno por la entrada de: materia orgánica del alcantarillado, contaminación agrícola e industrial y si se añade
excesiva MO, la tasa de respiración excede a la de fotosíntesis, y el sistema se vuelve eutrófico.

Glaciares: La vida depende de la actividad fotosintética de los microorganismos psicrófilos. En los lagos que se
encuentran por debajo de glaciares, las comunidades microbianas se mantienen mediante la quimiosíntesis.

Mares y océanos: Comparado con la mayoría de ambientes de agua dulce, el océano abierto es: salino, pobre en
nutrientes, especialmente N, P y Fe y más frio. Debido al tamaño del océano, la actividad microbiana que tiene lugar
en él es uno de los principales factores en el equilibrio del carbono en la Tierra. Las zonas costeras contienen mayor
número de microbios que el océano abierto.

Salinidad intermedia:
 Estuarios: masas de agua semi-encerradas (desembocaduras de ríos, bahías) de salinidad intermedia y
dependiente de las mareas.
A veces una sola especie microbiana crece a expensas de los otros organismos: dándose floraciones de algas
tóxicas (HAB, harmful algal bloom) y aparición de zonas muertas.
 Marismas: amplias extensiones de tierras bajas que sufren frecuentes inundaciones del agua del mar.
 Deltas: desembocaduras de ríos en las que se van depositando los sedimentos arrastrados por la corriente.
Son una forma de estuario y en ellos abundan las marismas.

Productividad

Estuarios: Entrada de agua dulce que aporta nutrientes. Gran variabilidad de factores ambientales. Movimiento de
corriente + mareas. Microorganismos halotolerantes. Productividad alta.

Marismas: asociadas a estuarios de ríos, extensiones planas y movimiento de corriente + mareas.

Océano abierto: Ambiente oligotrófico. Zona eufótica y zona afótica. La intensidad de luz depende de la turbidez y la
profundidad. Del orden de 106 procariotas/ml en mar abierto. El virioplancton es más abundante aún. Toda la
producción primaria procede de bacterias y algas microscópicas.

Bacterias del medio marino:

- Hálofilos moderados.
- Psicrófilas o psicrotróficas: El 90-95% del medio marino tiene temperaturas inferiores a 5ºC.
- Barófilos o barotolerantes, sobre todo en las fosas oceánicas (altas presiones hidrostáticas).
- La mayoría Gram-, móviles.
- Aerobias o anaerobias facultativas (columna de agua).
- Anaerobios estrictos (sedimentos): sulfato reductoras y metanógenas

Cianobacterias: Producción primaria. Fijación de N2 atmosférico. Ej: Anabaena Oscillatoria Nostoc.

Pueden alcanzar densidades de 104-105 cel/ml en la zona eufótica profunda. Proclorofitas: filogenéticamente
relacionadas con cianobacterias, tienen clorofila pero carecen de ficobilinas, tamaño muy pequeño (1 µm,
picoplancton algal). Prochlorococcus, principal productora primaria en los océanos, presenta distintos ecotipos
fisiológica y genéticamente distintos adaptados a distintas intensidades de luz.

Relaciones de los fotótrofos y el oxígeno. Vertido de petróleo Deepwater horizon (o vertido del Golfo de Mexico,
2010), fue el mayor vertido de la historia. El petróleo se sumergió a grandes profundidades (1,5 Km). Hubo un
crecimiento temprano de Gammaproteobacteria, Colwellia, and Cycloclasticus, degradadoras de hidrocarburos. Esto
redujo el impacto ambiental.

Zonas de mínimo oxígeno (OMZs). Regiones pobres en oxigeno a profundidades intermedias. Alta demanda de
oxígeno. Riqueza de nutrientes, altos niveles de desnitrificación y anammox. OMZs están en expansión.
Zonas pelágicas y profundidades marinas (bentos)

- Luz: poca por debajo de los 25 m

- Temperatura: baja mucho a partir de los 50 m (1-5ºC). pH ≈ 8
- Concentración O2: desciende hasta entre 100 y 1000 m (ZMO, zonas de mínimos
de O2). Pero sube otra vez hasta los 4000 m, a partir de ahí la concentración de
O2 es similar a la del agua superficial, ya que se produce el hundimiento de masas
de agua fría ricas en O2 en los polos hacia las profundidades del océano.
- Cada 10 m de profundidad la presión aumenta 1 atmósfera

Bacterias, Arqueas y Virus pelágicos:

Los procariotas planctónicos heterótrofos (105–106 células/ml) son abundantes en aguas marinos pelágicas. Pero
disminuyen con la profundidad. La superficie contiene ~106 células/ml; pero caen hasta 103–105/ml por debajo de los
1000 m de profundidad. Las especies bacterianas tienden a dominar la superficie. Bacterias y Arqueas son igual de
abundantes en capas más profundas.
Diversidad filogenética marina: Abundan Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, cyanobacteria, y
Bacteroidetes, y en menor cantidad de Betaproteobacteria y Actinobacteria (aún menos de Firmicutes)

Los virus son los microorganismos más abundantes en los océanos. La concentración viral se cree tan alta como 108
partículas virales/ml. Los virus afectan a las poblaciones bacterianas y son muy diversos.

Productividad en la zona pelágica:

Faltan nutrientes en la parte superior. Y falta luz en la parte inferior (productividad muy baja, reciclado de nutrientes
muy lento  miles de años)

Zona pelágica: procariotas heterótrofos planctónicos.

- Pelagibacter es la bacteria más abundante, y es oligotrófico
- Son de pequeño tamaño 0,2-0,5 µm diámetro. Pequeño genoma 1,3 Mbp.
- Alto número de transportadores ABC.
- Contiene proteorodopsina (proteína fotoactiva distinta de la bacteriorodopsina de las Arqueas) que convierte la
energía luminosa en ATP.

Diversidad de bacterias y arqueas en el océano.

El océano profundo: >75 % de todo el océano es océano profundo, principalmente entre 1000 y 6000 m. Los
organismos que habitan el océano profundo deben adaptarse a: Baja temperatura, alta presión y bajos niveles de
nutrientes.
Los microbios del océano profundo son:
- Barotolerantes, barofílicos y barofilos extremos.
- Psicrofilicos y psicrotolerantes.
- Termofílicos o termotolerantes.
Las adaptaciones para el crecimiento bajo altas presiones ocurren gracias a cambios en unas pocas moléculas
adaptadas al frío: cadenas de ácidos grasos más cortas en las membranas y aumento en la cantidad de hélices alfa en
proteínas.

El océano profundo: Adaptaciones a la alta presión. Los barófilos poseen mecanismos para detectar la presión que
regulan la expresión de genes para su adaptación. Los barófilos Gram- regulan la expresión de porinas según la presión.
El cultivo de barófilos requiere el uso de cámaras presurizadas.

Sedimentos marinos profundos:

Diversidad filogenética de procariotas en los sedimentos marinos: Predominan Proteobacteria, están bien
representados Bacteroidetes, poca cantidad de cianobacterias.

Fumarolas hidrotermales submarinos: Aguas ricas en compuestos reducidos de azufre. La productividad depende de
bacterias quimiolitotrofas que oxidan azufre (Beggiatoa, Thiomicrospira) y consumen CO2 (Methanoccocus).
Poliquetos tubícolas gigantes establecen simbiosis con bacterias quimiolitotróficas.

Prósperas comunidades microbianas están asociadas a las fumarolas hidrotermales. Las bacterias quimiolitotróficas
son predominantes. Termófilos e hipertermófilos están presentes. Los procariotas quimiolitotróficos utilizan el
material inorgánico de las fumarolas.
Diversidad filogenética en las fumarolas hidrotermales: Dominan Proteobacteria (Epsilonproteobacteria,
Alphaproteobacteria, Deltaproteobacteria, and Gammaproteobacteria) y pocas Archaea.

Bioluminiscencia microbiana:
Bioluminiscencia: emisión de luz. Géneros importantes: Vibrio, Aliivibrio, y Photobacterium.
Mayormente marinas; algunas colonizan los órganos de luz de algunos peces y calamares, produciendo luz como
señalización, o paras evadir predadores, o atraer presas. Son Gram -.
Mecanismo y ecología de la bioluminiscencia:
Se da solo cuando hay O2. Requiere los genes luxCDABE y es catalizada por la enzima luciferasa, que utiliza O2, un
aldehído alifático de cadena larga y Flavin mononucleótido reducido (FMNH2).
En muchas bacterias, solo ocurre a altas densidades de población, exhibiendo autoinducción/quorum sensing con el
control del regulador LuxR y acil homoserina lactona (AHL). Una alta densidad poblacional resulta en acumulación de
AHL. A alta concentración, AHL se une a LuxR, activando la transcripción de luxCDABE produciéndose luz. Esto asegura
la producción de bioluminiscencia solo a altas densidades de población para atraer la atención de animales marinos y
colonizar su tracto intestinal o para establecer relaciones simbióticas.