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Tema 6, 7 Genética Médica
Tema 6, 7 Genética Médica
Anomalías numéricas
Euploidías
Es una verdadera poliploidía. La poliploidía es la presencia de varios grupos completos de cromosomas. Está
causada por una polispermia (2 espermatozoides que fecundan un óvulo), por una no disyunción en la primera
división meiótica (un óvulo 2n que es fecundado por un espermatozoide) o por fusión de un ovocito y un
corpúsculo de polar (un ovocito 2n que genera tras la fecundación con un espermatozoide). Todos estos
ejemplos formarían un cigoto 3n. Afecta a aproximadamente al 2% de las concepciones.
Todas estas posibilidades de alteración nunca serán viables, son las causas de los abortos en las primeras
semanas. Elevadísima tasa de mortalidad intraeuterina.
Aneuploidía
Es la pérdida o ganancia de cromosomas individuales. Son cromosomas monosómicos (con una copia) o
trisómicos (3 copias). Es lo más frecuente, son un 5% de las concepciones.
De los abortos un 50% corresponden con las aneuploidías. Los abortos en el primer trimestre corresponden a
individuos triploides o individuos con aneuploidías. Pero hay ciertas alteraciones de la aneuploidía que sí
tienen un porcentaje de viabilidad: las trisomías en los cromosomas 13, 18 y 21; las trisomías en el cromosoma
X tiene permisibilidad de que si tienes más de un par de X gracias a la inactivación siempre se inactivan todos
menos uno SIEMPRE (si tienes tres, se desactivan dos; si tienes cuatro, tres). Ningún cromosoma más tiene el
permiso de ser viable.
Es más frecuente la heterodisomía porque son más normales los fallos en la primera división meiótica. ¿Por
qué? Porque la frecuencia de encontrar una disyunción es de un 20% de los ovocitos (tienden a tener más
fallos en la segregación de los cromosomas debido al envejecimiento de la célula), mientras que solo hay un
2% en los espermatozoides (los ciclos de vida de los espermatozoides se van regenerando a lo largo de la vida
del varón).
El fallo de la segregación está relacionado con la formación de quiasmas. La primera división es un proceso
largo donde se produce el emparejamiento, la recombinación y la separación. Si hay un fallo en la separación
es dónde hay el problema.
Las causas moleculares de la no disyunción están relacionada con la forma y la posición de los quiasmas cerca
de centrómeros y telómeros durante la recombinación. Así, este fallo conllevaría a la desregulación de algunos
Marco Pinto Gamboa Grado Biología Uex Genética Médica (2018)
procesos de recombinación, de cohesión (mal funcionamiento de las cohesinas que harán que la cromatina
esté suelta) y de separación de las cromátidas.
Esto también explica que con la edad, las células pierdan su eficacia y así las células de la línea germinal
funcionen de peor manera. Si hay un problema, es normal que sea a los 50, no a los 15, ya que es debido a los
fallos enzimáticos.
Aneuploidía autosómica
Los nacidos vivos por aneuploidías tienen síndromes debido a monosomías (no se conocen) y a trisomías (sólo
de los cromosomas 13, 18 y 21).
Trisomía 13: síndrome de Patau (47, XX, +13). Frecuencia: 1/10.000 nacidos. Fenotipo: múltiples anomalías,
no alcanzan el mes de vida. Bajo peso, retraso mental, sordera, defectos cardiacos, microcefalia, labio
leporino.
Trisomía 18: síndrome de Edwards (47, XY, +18). Frecuencia: 1/6.000 nacidos. Fenotipo: múltiples anomalías,
no alcanzan el mes de vida. Bajo peso, retraso mental, características faciales propias, problemas infecciosos,
defectos cardiacos y respiratorios.
- Síndrome de Down tienen una relación directa con la edad de la madre. Los embarazos de madres con
más edad tienden a favorecer a la aparición de este síndrome.
- El 94% de los casos son debidos a una no disyunción durante la primera división en los gametos que
provienen de la madre
- El 2% son debido a mosaicismo. A causa de una fecundación en la cual había tres copias del cromosoma
21 pero en divisiones sucesivas una copia se pierde y hay células con un genotipo normal. Por tanto, estos
individuos son mosaicos para el cromosoma 21.
- El 4% es debido a una translocación del cromosoma 21 al 14. Tiene 46 cromosomas, pero el problema es
que tiene dos copias del 21 y además tiene una copia extra translocada al 14. 46, XX der(14;21)(q10;q10).
Esta causa es la que tiene más probabilidad de aparecer más veces en los embarazos, ya que uno de los
gametos parentales tiene una constitución genética alterada.
Es muy importante determinar la causa en cada caso porque el consejo genético será diferente.
Hay una serie de observaciones que relaciona directamente el SD con el Alzheimer. Una de ellas es que el gen
que codifica la prot APP está en el cromosoma 21, ésta es la precursosa de la beta-amiloide. Otra de ellas es
que el SD tiene mucha probabilidad (6 veces mayor) de desarrollar Alzheimer, pero aparece siendo prematuro,
y con ello un envejecimiento más temprano. Y por último, es que el 15% de las neuronas de los individuos con
Alzheimer tienen 3 ch21, serían trisómicos para el SD, de modo que la trisomía estaría relacionada con el
deterioro mental del Alzheimer.
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Es debido a un mecanismo que se descubrió allá por los años 2013-2015. Su conexión es la proteína nexina 27
(SNX27, 1q21.3). Cuando esta proteína está en bajos niveles hay una mala transmisión entre neuronas y
además, regula la formación de beta-amiloide.
El SD tiene un microRNA (regulador epigenético) en alto nivel, regula negativamente a otro regulador, regula
positivamente a la nexina 27. De modo que si hay microRNA alto, hay nexina27 baja. Esto conlleva una alta
cantidad de gama-secretasa, más placas de beta-amiloide y entonces la aparición de Alzheimer.
Es importante conocer los mecanismos para poder conducir el desarrollo de terapias. Aquí, por ejemplo, las
farmacéuticas están buscando fármacos que tengan el microRNA o la nexina27 como diana terapéutica.
Otra relación con el SD está el cáncer, ya que los individuos con SD no suelen tener desarrollo de ningún tipo
de cáncer. Sería como que el ch21 “protegiese” al individuo. Los experimentos fueron realizados en ratones,
no en humanos. Se descubrió que una proteína inhibe una vía de señalización que afecta al SNC. Sería que la
presencia de una copia extra de uno de los genes localizados en el ch21, denominado Dscr1, es suficiente para
ralentizar el crecimiento del cáncer en un modelo de ratón. Este gen parece funciounar en combinación con
otro cromosoma del gen 21, el Dyrk1a, que es una proteín-kinasa implicada en la proliferación celular y el
desarrollo celular.
La última relación que explicaremos, es la del Alzheimer y el cáncer. Se analizaron 1700 personas que tenían
alguna enfermedad neurodegenerativa. Se hizo un estudio del transcriptoma (estudio de la transcripción de
determinados genes) de tres tipos de cáncer (colon, pulmón y próstata) y encontraron que había una serie de
genes que cuando un individuo tenía una enfermedad neurodegenerativa veían que tenían unos genes
sobreexpresados y otras al contrario muy poco expresados, es decir, habría una desregulación.
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También se ha descubierto que el genoma de las personas nacidas con SD compensa los efectos de tener un
ch21 extra. Cuando pensamos en individuos con SD tenemos que tener claro que estas personas trisómicas
vivas serían solo un 15% ya que el otro 85% son abortos. Esto hizo plantearse el por qué, así se ha podido
analizar que ese 15% de las personas trisómicas suelen tener mejor calidad de genes. Es decir, a parte del ch21
que causa el síndrome, los demás genes son mejores. Hay menor cantidad de genes letales. Esto sería gracias
a la SN.
¿Cómo es posible que la distinta dosis de los genes en el chX no provoque problemas en algunos de los sexos?
Es debido a la inactivación de cromosomas X (X-1), remodelación de la cromatina que provoque un
silenciamiento.
…pero, ¿por qué una mujer X0 no es normal? Porque la inactivación del chX no es completa, sino que el 15%
de los genes no se inactiva, y los ch X e Y conservan regiones de homología (PAR1 y PAR2). Estas regiones son
pseudoautosómicas.
Los genes implicados son muchos, de los mil y pico que hay en el chX, 70 son los responsables.
Uno de ellos, es el shox, (Xp22, Yp11) que codifica un factor de transcripción, cuya monodosis provoca la talla
reducida (short stature homeobox). En general, todos los genes ubicados en las regiones que escapan a la
inactivación del X están presentes 2 copias activas de los mismos tanto en varones como en mujeres.
El fenotipo Klinefelter son varones con gran estatura, los caracteres masculinos poco desarrollados,
disminución del coeficiente intelectual.
Al nacer, el niño presenta una apariencia normal, pero el defecto usualmente comienza a notarse cuando éste
llega a la pubertad y las características sexuales secundarias no se desarrollan o lo hacen de manera tardía, y
se presentan cambios en los testículos que producen esterilidad en la mayoría de los afectados. Tienen varios
síntomas, pero la severidad de ellos puede variar.
Son chicas que tienen las características femeninas muy desarrolladas, pero estériles.
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Sería el fenotipo contrario al anterior, dónde son hombres que tienen características masculinas muy
desarrolladas.
Determinación sexual
Las alteraciones no solo tienen que ver con la dotación genética, también podemos tener fenotipos distintos
de lo que tendría que aparecer. Hay distintos grados de sexo:
Anomalías estructurales
En principio podemos hacer dos grandes grupos: reordenaciones equilibradas y reordenaciones
desequilibradas.
Reordenaciones equilibradas: no hay pérdida ni ganancia, pueden ser: translocaciones (cambio de lugar del
ch, que son recíprocas o robertsoniana) e inversiones (cambio de orientación, que son pericéntricas o
paracéntricas).
Momento en el que se produce una rotura y una reunión. El motivo de porqué se da una rotura puede ser por
errores de reparación, hay puntos calientes donde las enzimas son reclutadas para cortar y reparar. Puede
ocurrir que al cortar y reunir provoque una deleción, una recombinación no correcta, puede darse la vuelta,
saltar o recombinación recíproca en el que se cambia de lugar.
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Translocación recíproca entre ch diferentes: el portador suele ser normal, SUELE. El problema lo puede
tener su descendencia, porque a la hora de la meiosis los ch afectados se van a aparear siendo homólogos y
en vez de formar una pareja, forma una tétrada. Cuando esto quiera segregarse, lo va a hacer de cualquier
forma. La producción de gametos de este individuo puede ser normal, con la translocación, con duplicaciones
o con deleciones. ¿Cuándo se produce todo esto? Cuando se une con un gameto normal.
Siempre la segregación se va a dar a partir de los centrómeros, si el cromosoma tiene parte azul y parte de
amarillo, la tétrada se formará de manera que todo esté apareando su secuencia correspondiente. Podemos
encontrar que la formación de los gametos tenga problema. Podemos tener la formación de 1 con 4, dará un
individuo normal, si este tenemos 1 con 4, el otro será 3 con 2, también será equilibrado. También podemos
tener 2 con 4 y 1 con 3, en el que tendremos una duplicación de una zona y deleción de otra zona. Los
individuos suelen ser normales, pero al formar los gametos no.
Translocación robertsoniana en ch 13, 14, 15, 21 y 22: este podría ser la razón del SD. Son la unión de
cromosomas con un brazo corto, muy corto. Estos individuos son normales porque no hay pérdida ni ganancia,
tienen 45 ch XY, pero en vez de tener dos ch 21 sueltos, tiene uno que se ha ido al 14. Lo que pasa es que en
la meiosis de estos individuos se forma un trivalente. Puede formar gametos normales o con translocación.
El único problema que podría tener, es que cuando hay un cambio de localización, caiga en el lugar de otro
gen, o esté controlado mediante otro mecanismo. Al insertarse en los brazos cortos, en estas regiones no suele
haber información esencial, sino que es información repetida.
Su descendencia: tiene 45 cromosomas, en vez de formarse una tétrada se forma una triada.
Tenemos un individuo con esta situación, en la meiosis tiene que aparear con el 1 y con el 21, por lo que al
segregarse cada uno tira para un lado. Los gametos pueden ser normales (podemos tener el 14 y el 21 junto
con el 14 derivado y no ocurre nada). El problema aparece cuando el derivado se une al 21, donde tenemos
una trisomía por translocación, si este es el gameto que entra en funcionamiento, al unirse a un gameto
normal formará un individuo con 23 cromosomas 21. Este es el síndrome de Down familiar.
El portador suele ser normal, lo normal es que las translocaciones vayan a un lugar donde no hay información.
Ejemplo: translocación 13 y 14, podemos observar que tiene 45 cromosomas, con un 13 más largo y un solo
14. Nosotros realmente somos una translocación del chimpancé. Nuestro cromosoma 2 es la unión de los 2 y
3 del chimpancé.
Las inversiones, en las que el cromosoma solo cambia de dirección, por ello es importante si incluye el
centrómero (pericéntricas) o si no incluye al centrómero.
Si hay una inversión pericéntrica, podemos detectarlo porque la longitud de los brazos varía. El individuo
principalmente no tiene problemas, siempre que al cambiar la posición no esté cambiando la regulación de un
gen. El problema se da cuando comienza la meiosis, los cromosomas al aparear las zonas homólogas, el
cromosoma tendría que girar 180 grados. Si hay un punto de recombinación en el bucle, tendríamos una
duplicación y una deleción de determinadas zonas.
El problema es que el gen ABL del cromosoma 9 es un protooncogen que se transloca al gen 22 en el gen BCR.
Al final tenemos un cromosoma 9 más largo de lo normal (un cromosoma 9 derivado) y un cromosoma 22 muy
pequeñito. No es el tamaño lo que importa, lo que importa es que ambos genes se encuentran juntos, ello lo
que hace es que aumente la actividad de la enzima, los procesos que se dan a continuación relacionados con
el ciclo celular y la inestabilidad cromosómica.
El cromosoma 22 se denomina cromosoma Philadelfia, en principio se creía que era causado por una deleción
del cromosoma 22. Pero es simplemente un cambio de lugar, ello es debido a que un gen se ha puesto en
fusión con otro cambiando su actividad y expresión génica.
Una de las terapias que se ha desarrollado es activar la expresión de este microRNA para revertir el fenotipo
alterado de estas células.
Como consecuencia de esta translocación se produce una fusión del gen situado en el locus 15q22 (gen PML -
iniciales de ProMyelocytic Leukaemia-) con el gen para el receptor ácido retinoico (RARa) localizado en 17q12-
21.
La expresión del gen PML-RARa produce una proteína que contiene los dominios de dimerización y de unión
al DNA del gen PML nativo, y los dominios de unión al DNA y a otros ligandos del receptor al RARa.
La expresión del gen PLZF-RARa por una translocación 11 y 17, t(11;17)(q22;q11.2-q12) produce una proteína
que contiene un lugar de unión para un complejo de represión adicional
Linfoma de Burkitt
Translocación recíproca entre los brazos largos de los cromosomas 8 y 14, t(8;14)(q24;q32). Desplazamiento
del protooncogen MYC del 8 al gen de genes de inmunoglobulinas (IG). Es el tumor infantil de mandíbula más
frecuente en niños africanos
Activa este gen que normalmente está silenciado. Las translocaciones son relativamente poco frecuentes,
pero hay muchos casos de leucemia o cáncer en los que se da porque activa a genes que deberían estar
silenciados o porque desregula la actividad de determinadas proteínas.
Marco Pinto Gamboa Grado Biología Uex Genética Médica (2018)
Reordenaciones desequilibradas
Las causas moleculares tanto de deleciones o duplicaciones es debido a rotura-unión o bien por recombinación
desigual. Las deleciones pueden ser:
- Microscópicas: detectables a microscopía óptica: bastante grandes. Podemos detectar pérdida de muchas
megabases.
El fenotipo característico es un tono de llanto especial muy agudo, el problema fundamental es retraso mental,
falta de coordinación motora, microcefalia… puede llegar a edad adulta, pero su vida no es normal.
Síndrome de Wolf-Hirschhorn
Características faciales propias, microcefalia, cardiopatía, fallos renales… son síndromes muy complejos que
afectan a muchos órganos. Son por los problemas por los que acaban muriendo.
- Cualquier microdeleción en cualquiera de las zonas, según a que parte de material afecte, tendrá unas
consecuencias u otras. Hay múltiples síndromes que se dan como consecuencia de microdeleciones.
Microdeleciones: para observarla se usan otras técnicas como el bandeo de alta resolución o FISH.
Normalmente son inferiores a 5 megas. Mediante un FISH, si tenemos la región podríamos observar un solo
punto, en lugar de dos. También se puede realizar hibridación comparativa de genoma en la que se puede
detectar deleciones muy pequeñas.
Síndrome de Prader-Willi/Angelman
Dependiendo de si se encuentra en el cromosoma de la madre o del padre. Causado por una microdeleción
en el cromosoma 15.
Síndrome de Williams
Deleción en el cromosoma 7, provoca normalmente tumor infantil. Se han detectado muchas microdeleciones
en los cromosomas Y, es muy importante ya que hay una serie de secuencias importantes en la formación de
espermatozoides, se han detectado muchas microdeleciones que causa más de la mitad de azoospermia (no
producción de espermatozoides e infertilidad).
Dentro de estas deleciones hay dos fenómenos que se producen que tienen algo especial: morfológicamente
se detecta de forma evidente:
- Duplicaciones, en las que hay casos descritos pero generalmente se dan múltiples síntomas porque
tienen un fenómeno de inestabilidad genómica, es lo que causa la mayor parte de las alteraciones
estructurales que hemos visto. Todas ellas implican una rotura.
Inestabilidad cromosómica
Estos síndromes normalmente asociados a tener inestabilidad cromosómica. Por una parte tenemos las
consecuencias de duplicaciones, translocaciones, deleciones… Hay enfermedades causadas por una alteración
en las enzimas implicadas en los sistemas de replicación y reparación.
¿Por qué se produce los cortes? Muchas causas, pero muchas son derivadas de la propia replicación. La DNA
polimerasa tiene dos actividades, la que degrada por delante y la que repara por detrás. Mutaciones en esta
proteína confiere mayor probabilidad de formar rotura.
El síndrome de Bloom: mutación en un gen que codifica para una helicasa. La helicasa separa la hebra de ADN,
si no es funcional no puede abrirse bien la hebra, por lo que la replicación va mucho más lenta, una horquilla
parada es corte del DNA casi seguro. En este caso es una inestabilidad cromosómica, la horquilla parada casi
siempre se corta.
Anemia de Falconi: FAN (A-G) se encuentran en diferentes cromosomas de la A hasta la G. Pero forman un
complejo relacionado con el complejo de reparación, apoptosis y el desarrollo del ciclo celular. No todos los
individuos con esta enfermedad tienen las mismas mutaciones, se han detectado hasta 100 diferentes en 8
genes diferentes.
La replicación de un dímero de timina implica que la replicación se pare y se da una rotura. Normalmente
todos estos síndromes están asociados a tipos de cánceres como melanoma, colon…
El número de cromosomas se indica por un número que se coloca en primer lugar, seguidos de una XX
(mujeres) o XY (varones).
Por ejemplo: 46, XX representa el cariotipo de una mujer normal 46. XY el de un hombre normal
Por ejemplo [47, XX+21] es el carotipo que indica que el cromosoma 21 está duplicado en un varón (síndrome
de Down) [45, X0] es el carotipo que indica la ausencia de un cromosoma X en una mujer (síndrome de Turner).
Algunos ejemplos
46,XX,r(7)(p22q36): mujer con 46 cromosomas de los cuales el cromosoma 7 es en anillo, el que la banda 22
del brazo corto se ha fusionado con la banda 36 del brazo largo
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46,XY,t(15;17)(q22;q11.2-q12): varón con 46 cromosomas en los que se producido una translocación entre
los cromosomas 15 y 17 afectando a las bandas q22 del primero y las bandas q11.2-12 del segundo.
46,XX,del(14)(q23): mujer con 46 cromosomas en los que se ha producido una deleción de la banda 23 del
brazo largo del cromosoma 14
Marco Pinto Gamboa Grado Biología Uex Genética Médica (2018)
Mutación y polimorfismo
Entre mutación y polimorfismo hay una delgada línea. El polimorfismo se refiere a las variaciones genéticas
que tenemos entre los individuos, variaciones fenotípicas que conviven en una población y no tiene nada que
ver con tener una enfermedad. Esta variabilidad tiene dos componentes: causas ambientales y causas
genéticas. Por ejemplo, en la altura sí influirán las condiciones ambientales mientras que hay otras
características en las que no influye, como por ejemplo en el color de los ojos.
La mutación es asociada a un cambio en los nucleótidos que genera algo deletéreo o algo poco eficiente, lo
asociamos a algo que no funciona bien. Mientras que polimorfismo, el concepto se asocia a secuencias que
conviven unas con otras en la población. Aunque desde el punto de vista genético es prácticamente lo mismo.
El concepto de polimorfismo es algo que ha ido cambiando mucho a lo largo de estas últimas décadas, pero
las herramientas que tenemos, hace que el estudio de estas variantes haya cambiado mucho. Estas
herramientas han sido puestas al servicio de varias comunidades como la Comunidad de Islandia, la
particularidad de ella es que es una Isla que tiene un número de habitantes igual que una ciudad. Lo
característico es que toda la población procede de una comunidad de 1000 vikingos. Es una comunidad en la
que se ha podido determinar el nivel de polimorfismo, y la variación de un individuo a otro en esa comunidad.
Ello es extrapolable al resto de la comunidad humana.
En marzo de 2016 ha habido un estudio de una población en la que se analizaban el exoma. En este tipo de
estudio se vio que hay una serie de genes inactivados (740-750 genes) que podemos tener cada uno de
nosotros, por lo que tenemos variantes que no funcionan. Este número es muy elevado, ya que de 20.000
genes conocidos, 750 no funcionan.
La frecuencia de las mutaciones que afectan a los cromosomas son mucho más frecuentes que en los errores
de segregación.
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Desde nivel de nucleótidos, nivel donde se genera por errores en la replicación. Si un individuo se genera a
partir de una sola célula, puede tener 10^15 divisiones, podríamos a tener muchas mutaciones. Primero si son
células germinales, la variación va a ser transmitida a nuestra futura generación pero a nosotros no nos afecta.
Si se da en células somáticas, nos afectará a nosotros.
Antes era muy sencillo, se asumía que el DNA no codificante no servía para nada, pero ahora toda esa parte
de DNA no codificante, se está viendo que realmente no es que no sirva para nada, sino que hay una
proporción que sí sirve en procesos de regulación de la expresión génica. Por lo que hablamos de DNA
funcional no codificante, ya que sí tiene una función.
Afortunadamente lo tenemos, por ello somos únicos y diferentes a otra persona. Si analizamos capacidad de
generar mutaciones o variaciones en la secuencia como consecuencia deletérea o no.
Durante el proceso de la espermatogénesis, se pueden generar muchos errores 1 por cada replicación. Más o
menos hay 30 mitosis desde que un individuo nace hasta la pubertad, después tiene 23 ciclos de divisiones
por año, después tiene 5 divisiones en las que termina de madurar de espermatogonias a espermatozoide.
En una sola eyaculación un varón puede generar de 10^10 mutaciones. Hablamos de un proceso muy simple,
solo por errores de la replicación, sin añadir nada más. En la mujer, por esa vía generará menos mutaciones
ya que tiene lugar menos divisiones.
Si hacemos cálculos en término de genes, ¿cuántos genes se mutan de una generación a la siguiente?
Depende del tamaño, los genes más pequeños como la somatostandina hasta el gen de la distrofia muscular
Deuchenne 2x106 pb, uno de los más grandes. También influye la presencia de puntos calientes, como las islas
GC, la citosina metilada (las islas GC se metilan) puede pasar a timina, en esas zonas podemos tener más
mutaciones. Esto en la replicación genera un deslizamiento en la DNA polimerasa y genera deleciones. Al igual
que la probabilidad de error de la DNA polimerasa es muy baja, a este nivel de genes aproximadamente el 2%
de los genomas de la población, tendrían un gen con una mutación.
Estos números cambian, los análisis de la isla de Islandia habla de que el 8% tiene inactivo un gen importante,
si se encuentra inactivo tiene mayor probabilidad de generar mutación.
La variación es muy grande, pero la mayor parte de las mutaciones no son deletéreas, sino que generan
variaciones estables en la población. La secuencia de nuestro genoma, solo el 1,5% es una secuencia de DNA
codificante, ello significa que codifica una proteína que son las que hacen funcionar a la célula.
El 45% es genoma único no repetido, incluido la zona de los intrones no codificante. 45% de moderadamente
repetitivo y un 8,5% de ADN altamente repetitivo. Si tenemos 3x109 de bases, un 30% son genes o secuencias
relacionadas, el 70% es extragénico. Del 30% solo el 5% es codifican para genes.
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Puede estar repetido de 100 a 100.000 copias. Los que tienen mayor exponente son los LINE: secuencias
repetidas de 6 a 8 Kb y que están repetidas, son secuencias que se retrotranscriben y se replican a sí mismas
mediante una retrotranscriptasa y codifican para una proteína que se une RNA. Muchas copias pero solo hay
90 copias activas.
Los SINES, secuencias cortas, de ellas la secuencia más repetida y la que no se sabe su origen, son las
secuencias Alu. Ellas contienen un punto de corte para la enzima de restricción en las que corta, un 10% de
nuestro genoma son secuencias Alu.
LINE y SINES se encuentran porque se autoreplican y porque generan repeticiones solas. Se quedan allí ya que
no genera efecto deletéreo. Alu participa en el plegamiento de la cromatina, puede acercar un promotor a
una región. Puede haber enfermedades generadas en este tipo de secuencias.
Hay un 8% de nuestro genoma que son retrovirus, mientras que no hagan daño allí se quedan. Normalmente,
son copias parciales se retrotranscriben y se insertan en lugares donde no ocurre nada, pero si se transloca y
se coloca en un sitio que puede inactivar un gen o separar una zona reguladora, entonces hay problema.
Los transposones tienen una enzima en la que genera una enzima que cuando se traduce corta y se inserta en
otro sitio, si cae en un sitio en el que no pasa nada, se queda.
DNA altamente repetitivo es el realmente importante. Tienen millones de copias, son secuencias
repetidas muy pequeñas:
- Los microsatélites: repeticiones de secuencias más pequeñas, repetidas también en tándem STR. Son
regiones muy variables. Los buenos polimorfismos son los que tienen muchos alelos y mucha variación de una
sola secuencia.
Locus polimórfico: locus con múltiples alelos. Aquel que se encuentra en heterocigosis al menos en el 2% de
la población.
Medida del grado de polimorfismo. Estas frecuencias son necesarias para diferenciar una variante rara de
un polimorfismo.
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Heterocigosis:
- Proporción de genes heterocigóticos en un individuo.
- Proporción de individuos heterocigóticos para un gen.
- Variación media del DNA genómico humano aproximadamente 0,7%.
Hay 10 millones de pares de bases que tenemos diferentes en nuestro genoma. Pero de una persona a la que
tenemos al lado, nos diferenciamos en 3 millones pares de bases. Ello es lo que constituye el polimorfismo,
por eso somos únicos en secuencias.
Detección y medida del polimorfismo a nivel de proteína se sigue utilizando, ya que es lo que importa
desde el punto de vista práctico. Cuando hay una variación, lo que cambia es la movilidad electroforética,
diferente tamaño... la principal técnica para detectar la variación polimórfica es la electroforesis de proteínas.
También geles bidimensionales, en los que primero se corre en una dirección y después en otra, en lugar de
bandas veremos puntos.
A la hora de transfusiones, el A será posible donador del A y AB, ello es debido a que si no tiene ningún
anticuerpo, será el receptor universal mientras que si el donador no tiene ningún antígeno será el donador
universal.
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Sistema Rh (1p36.2-p34)
Es un sistema de antígenos localizado en el cromosoma 1. Se han identificado más de 45 antígenos, pero de
todos ellos cinco son frecuentes: D, C, E, c, e. A su vez, el más importante, y el que identifica + o –, es el D. El
RhD cofidica a una proteína transportadora de antígeno D. El D es un alelo dominante, de forma que si
tenemos el alelo dominante seremos Rh+ y si dos recesivos seremos Rh-.
Detección y medida del polimorfismo a nivel de ADN. Con el boom de la secuenciación, la detección de
polimorfismos es mucho más fina. Los polimorfismos de un solo nucleótido, se han detectado en personas
normales unos 10 millones. Este nivel no existe a nivel de proteína, para detectar una variación a nivel de
proteína tiene que cambiarla y muchas veces no se da. Si una persona se diferencia de otra en 1/1000, 3
millones de pb nos diferenciamos unos de otros.
- Polimorfismo de longitud de los fragmentos de DNA: RFLP. Primeros detectados, una persona con un punto
de corte de una enzima y otra persona no, de forma que da fragmentos diferentes. Es la secuencia de ADN
que implica una modificación en la que corte o no una enzima de transcripción. Normalmente detectado por
el Southern Blot. Es bialélico, puede que corte o puede que no, pero realmente estamos perdiendo detección
de variación. Es un marcador o polimorfismo bialélico.
- Polimorfismo del número de repeticiones de secuencias en tándem: VNTR. Son pequeñas secuencias que se
repiten una a continuación de otra. Hay enfermedades que, en cuanto pasa de un número de repeticiones hay
problema. Hay variaciones normales del número de copias, lo que ofrece una variabilidad ente uno y otro.
Los VNTR y STR tienen la característica de que son repeticiones en tándem. Son muy polimórficos. Un alelo
(aunque no está constituyendo genes) puede tener muchas variantes de esa secuencia, hay una frecuencia
mucho más alta. Normalmente usamos este tipo de polimorfismo, ya que necesitamos tipos que tengan
muchas variantes, muy polimórficos. Normalmente se usa para detectarlo el PCR.
- Polimorfismo de un solo nucleótido: SNP. Variaciones en la secuencia de un solo nucleótido. Un RFLP puede
que sea un SNP. Aunque no todos los SNP son RFLP, podemos tener variaciones de un solo nucleótido que no
varíe el punto de corte de una enzima de restricción. Se detectan con biochips.
Southern blot
Normalmente se detecta los RFLP por Southern. Es una técnica que nos permite la detección de fragmentos
definidos dentro de un genoma. Tiene un protocolo bien definido, si queremos detectar un RFLP:
Aislamos el ADN, se corta con una enzima de restricción, se separa los fragmentos en una electroforesis, se
pasan los fragmentos a una membrana y, finalmente, la membrana se hibrida con la sonda marcada
(radiactividad, luminiscencia, fluorescencia...) diferentes lavados. La sonda se va a unir a las secuencias que va
Marco Pinto Gamboa Grado Biología Uex Genética Médica (2018)
a generar el polimorfismo, después de los lavados y revelado solo vamos a ver los fragmentos de ADN que han
hibridado con la sonda.
De una electroforesis de agarosa donde vemos todo el ADN, después de todo el proceso vemos bandas
definidas por la unión de la sonda a la secuencia.
Podemos tener dos alelos polimórficos diferentes, donde uno tiene el punto de corte y otro no lo tiene, por lo
que sea. Aislamos el ADN, cortamos con la enzima y tenemos que diseñar una sonda para que podamos
interpretar el RFLP, esta tiene que hibridar con todo el fragmento que va a generar la enzima de restricción.
Si el individuo es homocigótico para el alelo, saldrá dos fragmentos, la sonda hibrida con ambos fragmentos.
Si el individuo es homocigótico para el alelo 2, saldrá un solo fragmento de mayor tamaño. Si tenemos un
individuo heterocigótico, tendremos un fragmento grande sin corte, y dos fragmentos.
PCR
Para la detección de las variaciones en tándem lo normal es que se haga por PCR. Normalmente el PCR
desbanca al Southern.
El PCR es la reacción de la polimerasa en cadena, dos cebadores flanquean la zona que queremos amplificar.
Los cebadores son el punto fundamental. Una repetición de desnaturalización, reasociación (con cebadores)
y polimerización. Encontraremos una amplicación de fragmento definido.
Tenemos un locus polimórfico con diferentes secuencias. Definimos el cebador por fuera de la secuencia.
Posteriormente al realizar una electroforesis podemos detectar el número de repeticiones.
‘Biochips’ o ‘Arrays’
Detectar SNP, a menos que modifique un punto de corte, lo normal para detectarlo son los Biochip o RNAchip.
Es una plataforma en la que fijamos un material biológico, posteriormente vamos a hibridar con el ADN del
individuo, son muy sensibles como para que si hay una variación de un solo nucleótido se detecte.
De esta forma se ha descubierto que en el DNA codificante hay una variación de 60.000. Por media, 2SNP/gen.
Si los SNP se encuentran en la parte codificante y modifica regulación o actividad de una enzima, tenemos un
problema que genera enfermedad.
En cada pocillo podemos poner: secuencias de diferentes genes, diferentes alelos de un gen, diferentes
mutaciones (si hablamos de enfermedades). Hibridamos con el ADN del individuo, si coincide podremos
observarlo ya que cada ADN está marcado de un color (verde+rojo=amarillo).
- El metabolismo de fármacos (citocromo P450). No a todo el mundo le sienta bien, ello es debido a los
polimorfismos, tenemos una serie de variantes, alguno caerán en genes que son enzimas metabólicas de
fármacos.
Aplicaciones polimorfismos
Polimorfismo: variaciones entre personas que no tiene por qué corresponder a alelos de un gen. Los mejores
polimorfismos para el uso son ellos que tienen muchas repeticiones, ya que son los más variables.
- Diagnóstico de enfermedad. Siempre que la enfermedad esté causada por una alteración en la secuencia.
Podemos establecer la presencia de una mutación a través de los polimorfismos. O bien porque el
polimorfismo esté asociado a la enfermedad o bien porque esté muy cerquita de él.
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La identificación de personas con la huella de DNA definida por marcadores genéticos que el individuo heredó
de sus padres. Hay regiones muy variables en el genoma; dentro del grupo de polimorfismos tenemos los RFLP
(poco polimórficos), STR (decenas), VNTR (miles) y SNPs (millones).
El otro sistema de aplicación de los polimorfismos es la identificación de los individuos. Se usa este análisis
para la huella de DNA. El fundamente está basado en el polimorfismo. Se analizan las electroforesis, las bandas
son fragmentos de DNA. La longitud variable de esas bandas y la gran cantidad de ellas son porque se está
realizando un número extenso de polimorfismos para identificar un individuo.
Se analizan diferentes VNTR o STR (repeticiones de pocos nt, polimorfismos de pocas tandas de bases), lo que
da un perfil de bandas para cada individuo. Cada alelo tiene una frecuencia. La frecuencia del perfil será el
producto de dichas frecuencias. Si hay coincidencia de perfiles eso indicaría al perfil de la persona
determinada. Esto es usado en casos de crímenes para buscar a un sospechoso.
Todos los laboratorios forenses o criminalísticos que usan el sistema CODIS pueden contribuir a una base de
datos nacional. Los analistas de DNA pueden también buscar coincidencias entre el perfil de DNA de pruebas
obtenidas en la escena de un crimen y los perfiles de DNA ya disponibles en la base de datos.
Este perfil creado identifica a un individuo y demuestra que es único en todo el planeta. No hay dos individuos
que tengan el mismo perfil de ADN (perfil de 13 loci STR); a excepción de los gemelos univitelinos. Para cada
loci hay alelos diferentes. La prob de encontrar un individuo con esas características genéticas, sería el
resultado de multiplicar las frecuencias de cada uno de los polimorfismos. Combinando toda esa info la
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probabilidad de encontrar ese perfil sería uno por cada 7700 billones. Cuando se hace un perfil con los 13 loci,
estamos afirmando que es único para esa persona, por eso están tan objetivamente establecidas estas
pruebas en la medicina forense.
Normalmente, se establecen en los laboratorios unas pruebas estándar que determinan los polimorfismos.
Cálculo de PCA
Cálculos de frecuencia en los perfiles de DNA. En una base de datos de referencia establecida a partir de 200
estadounidenses caucásicos, la frecuencia de los alelos 15 y 18 era de 0.2825 (p) y 0.1450 (q) respectivamente.
La frecuencia del genotipo (15, 18) es, por tanto: 2pq. Hablamos siempre de población, a no ser que le
pongamos un cerco. P = 2 (0.2825) (0.1450), u 8,2%.
Marco Pinto Gamboa Grado Biología Uex Genética Médica (2018)