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Estructura de Proteínas I
Estructura de Proteínas I
(derivado feniltiohidantoína)
Determinación del nº de cadenas
Evolución molecular
Taxonomía
investigación
Homología: consiste en una similitud
significativa en la secuencia de nucleótidos o
aminoácidos
La homología se detecta mediante el
análisis estadístico del alineamiento de
secuencias.
Se pueden comparar secuencias de
nucleótidos o de aminoácidos. Las de
aminoácidos suelen dar más información
estructural y funcional (comparaciones de 20
elementos vs 4).
La semejanza de secuencia sugiere la
existencia de un mismo origen evolutivo y en
muchas ocasiones semejanzas en la estructura
tridimensional de la proteína.
Parálogos: Homólogos presentes en la misma especie, generalmente con
diferencias en su función.
Ortólogos: Homólogos presentes en especies diferentes, generalmente con
funciones muy similares.
Comparación de secuencias: Alineamientos
El análisis de homología se realiza
yuxtaponiendo las secuencias de todas las
maneras posibles. Esto se puede lograr
simplemente por desplazamiento de una
sobre otra.
En ocasiones la inserción de huecos
(que reflejarían inserciones o deleciones
de nucleótidos) en una secuencia permite
aumentar la homología. Esto aumenta la
complejidad del análisis pero la
informática ha ayudado a resolver estos
problemas.
Árbol evolutivo de las globinas
La hemoglobina tiene 141 aminoácidos y la mioglobina 153. La comparación se
realiza por comparación de todas las yuxtaposiciones posibles.
La mioglobina fue la primera proteína de la que se obtuvo su estructura tridimensional
Por difracción de rayos X en 1950 ( John Kendrew)
ALINEAMIENTO CON LA INSERCIÓN DE UN HUECO
Calificación: 38X10-1X25=355
SIGNIFICADO DE LOS ANÁLISIS DE LOS
ESTUDIOS DE ALINEAMIENTO
Para valorar la probabilidad de que
las coincidencias se den por azar, las
secuencias se reordenan de todas las
formas posibles y se vuelven a
alinear. Cuando se representa la
calificación de cada una de estas
secuencias con el nº de
alineamientos se aprecia el
significado del alineamiento.
(barajado)
En rojo aa cargados
En verde aa polares
En azul grandes e hidrofóbicos
En negro el resto
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