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TRADUCCIÓN Y SÍNTESIS PROTEÍCA.

EL CÓDIGO GENÉTICO.
RNA DE TRANSFERENCIA:
 RAMAS DEL RNAT.
 ESTRUCTURA TRIDIMENCIONAL DEL RNAT.
 INTERACCIÓN CODÓN-ANTICODÓN.
 HIPÓTESIS DEL BALANCEO.
 UNIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS AL RNAT (FORMACIÓN DE
AMINOACIL-RNAT)
RNA RIBOSÓMICO O RNAR.
SÍNTESIS DE LAS PROTEÍNAS EN EL RIBOSOMA O
TRADUCCIÓN:
 INICIACIÓN DE LA TRADUCCIÓN.
 ELONGACIÓN
 TERMINACIÓN.
POLIRRIBOSOMAS.
MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES DE LAS
PROTEÍNAS.
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CÓDIGO GENÉTICO.
El código específico por el cual los ácidos nucleicos especifican los
aminoácidos que forman las proteínas se conoció hasta 1965.

El DNA tiene un alfabeto de cuatro “letras” dado por las bases púricas
y pirimídicas (A, T, C y G) y como estas cuatro letras codifican 20
aminoácidos, el código genético debe contener “palabras” formadas
por tres letras .Las palabras de tres letras permiten un vocabulario
posibles de 64 palabras, mas que suficiente para especificar los 20
aminoácidos.

El código genético esta formado por palabras de tres letras que NO


se superpone y que se llaman CODONES

Por convención, todas las secuencias de codones se escriben y


traducen de 5’ – 3’, es decir empezando en el extremo 5’del mensaje
Así UAC especifica tirosina y CAU especifica histidina.

El término CODÓN se refiere a tripletes de nucleótidos en el RNAm,


pero también se aplica a tripletes de nucleótidos en el DNA.

CÓDIGO GENÉTICO ESTÁNDAR.


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Todos los aminoácidos, con excepción de metionina y triftófano, son


codificados por más de un codón.

Existen tres codones que no codifican para aminoácido alguno y se


denominan CODONES SIN SENTIDO y constituyen la señal que
indica la terminación de la polimerización de aminoácidos una vez que
la proteína está totalmente formada.

Estos codones son: UAA (ocre), UAG (ámbar), UGA.

También existen codones de inicio.

Los aminoácidos con estructura química semejante poseen codones


similares; por ejemplo, la sustitución de una base convierte cualquiera
de los codones para serina en codón para treonina
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NÚMERO DE CODONES PARA CADA AMINOÁCIDO


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CARACTERÍSTICAS DEL CÓDIGO GENÉTICO.

1.- ES INEQUÍVOCO.- cada codón corresponde sólo a un aminoácido.

2.- ES DEGENERADO.- ya que hay varios codones para la mayor


parte de los aminoácidos. Codones diferentes que especifican los
mismos aminoácidos se conocen como CODONES SINÓNIMOS.

3.- Los DOS primeros nucleótidos de un codón con frecuencia son


suficientes para especificar un aminoácido dado. Por ejemplo, los
cuatro codones para la glicina empiezan con GG : GGU, GGC, GGA,
GGG.

4.- Los codones, con secuencias similares especifican aminoácidos


similares químicamente. Por ejemplo, los codones para la treonina
difieren de cuatros de los codones para la serina en solo un
nucleótido sencillo en la posición 5’

5.- 61 de 64 codones especifican aminoácidos. Tres son codones de


terminación (UAA, UGA, AUG).También existen codones de iniciación
como el AUG de la metionina que especifica el sitio de iniciación de la
proteína.
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RNA DE TRANSFERENCIA (RNAt).

Son pequeñas moléculas formadas por 73 a 93 moléculas con un peso


moléculas de 24,000 a 31,000 daltons.

Sirven como interpretes del código genético, ya que son un enlace


crucial entre la secuencia de las bases de los nucleótidos del RNAm y
las secuencia de los aminoácidos de un polipéptido.

Por cada aminoácido existe cuando menos un RNAt. Por ello cada
célula debe contener al menos veinte tipos de RNAt (uno por cada
aminoácido), y cada una de estos RNAt deben poder reconocer al
menos un codón de RNAm.

Tiene forma de TREBOL de cuatro hojas:


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RAMAS DEL RNAt

RAMA O TALLO ACEPTOR O DEL AMINOÁCIDO.


Es el sitio de unión de los aminoácidos. El extremo 5´y la región
cercana al extremo 3´ tiene las bases apareadas mediante enlaces de
hidrógeno.
El extremo 3´tienen siempre la secuencia de nucleótidos C C A. En
este punto el grupo carboxilo del aminoácido se enlaza con el grupo
OH del carbono 2 ´o 3´de la ribosa del nucleótido AMP.
El extremo 5´está siempre fosforilado.

RAMA ANTICODÓN.
Está colocada en el lado opuesto del tallo aceptor. Es el sitio de unión
del RNAt con el RNAm. Contiene el ANTICODÓN, que es la
secuencia de tres bases que se fijan a un codón complementario del
RNAm.

RAMA T ψ C.
Contiene Timidina (T), Pseudouridina (ψ y Citidina (C).

RAMA D.
Contienen Dihidrouridina.

RAMA VARIABLE.
Entre la rama ANTICODÓN y la RAMA T ψ C.
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ESTRUCTURA TRIDIMENCIONAL DEL RNAt.

En tres dimensiones el RNAt está doblado en forma de L.


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INTERACCIONES CODÓN – ANTICODÓN. HIPÓTESIS DEL


BALANCEO.

Durante el proceso de la síntesis de proteínas, los RNAt portadores de


los distintos aminoácidos deben reconocer específicamente los
codones presentes en el RNAm .Dicho reconocimiento se produce
mediante el apareamiento por complementariedad de bases entre
codón y anticodón (A con U y G con C).

Sin embargo, hay evidencias que indican que existen apareamientos


adicionales a los que se producen normalmente (A-U, G-C)

Para explicar esto Crick desarrolló la hipótesis del BALANCEO en


1966. Esta señala que el apareamiento entre el codón y anticodón en
las dos primeras bases siempre sigue las reglas usuales, mientras en
la tercera base existen apareamientos alternativos. La base de la
posición 5´ del anticodón del RNAt se llama POSICIÓN DE
BAMBOLEO O BALANCEO

Los apareamientos permitidos según la hipótesis del Balanceo son los


indicados en la siguiente tabla:

BASES EN LA BASES EN LA
POSICIÓN 5 POSICIÓN 3´DEL
´(BALANCEO) DEL CODÓN
ANTICODÓN
G UoC
C G
A U
U AoG
I A,U,oC

La POSICIÓN DE BALANCEO O BAMBOLEO ES LA POSICIÓN 5


´DEL ANTICODÓN
El balanceo permite que una molécula de RNAt reconozca más de un
codón.
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En muchas moléculas de RNAt la guanina en la posición 5´del


anticodón está desaminada en C-2, formando INOSINA que puede
unirse por enlaces de hidrógeno a Adenina, Uracilo y citocina.
Se llaman RNAt isoaceptoras las que tienen diferentes anticodones
que se fijan al mismo aminoácido.
APAREAMIENTO DE BASES EN POSICIÓN DE BALANCEO

El anticodón 3´CGI 5´, se puede fijar a cualquiera de los tres codones


que especifican la alanina (GCU, GCC, GCA), debido a que la Inosina
puede aparearse con U, C, A .Nótese que la interacción codón-
anticodón comprende cadenas antiparalelas de RNA.

3´ 5´ 3´ 5´posición de balanceo
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HIPÓTESIS DEL BALANCEO.


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UNIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS A LA MOLÉCULA DE


RNAt.

Cada molécula de RNAt fija a un aminoácido en su extremo 3´,


mediante un enlace covalente.

La unión aminoácido/RNAt recibe el nombre de AMINOACIL-RNAt.

La enzima que cataliza esta reacción se llama AMINOACIL-RNAt


SINTETASA.

ETAPAS DE LA SÍNTESIS DE AMINOACIL-RNAt.


1ª. ETAPA:
El aminoácido (su grupo carboxilo) se une a una molécula de ATP a
nivel del fósforo α, con liberación de pirofosfato inorgánico (PPi) y
produciendo AMINOACIL-AMP. Esta reacción es catalizada por la
Aminoacil-RNAt sintetasa.

2ª .ETAPA:
La enzima Aminoacil-RNAt sintetasa transfiere al aminoácido de la
molécula de AMINOACIL-AMP al RNAt.

El aminoácido queda unido al RNAt mediante la formación de un


enlace ÉSTER entre el grupo carboxilo del aminoácido y cualquiera de
los OH en posición 2´o 3´ de la adenina terminal del RNAt.

Se sabe que existen 20 enzimas distintas (aminoacil-RNAt sintetasa)


una por cada aminoácido.
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SÍNTESIS DE MOLÉCULAS DE AMINOACIL-RNAt.

ATP

AMINOACIL-AMP.
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ACTIVACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS POR ACCIÓN DE LA


AMINOACIL-RNAt SINTETASA Y TRANSFERENCIA AL
CORRESPONDIENTE RNAt.
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R.N.A. RIBOSÓMICO o RNAr.

El RNAr se forma en el NUCLEOLO.

Está constituido en un 60% de RNA y el resto de proteínas


estructurales y enzimas.

Es el organelo donde se sintetizan las proteínas .Siempre funciona


junto con el RNAt y el RNAm.

El RNAt transporta aminoácidos al ribosoma para incorporarlos a la


molécula proteica que se está formando. El RNAm proporciona la
información necesaria para establecer la secuencia de aminoácidos en
el orden apropiado para que se sintetice la proteína.

SUB-UNIDAD PEQUEÑA 30s, 40s.

Tiene dos sub-unidades (70s) (80)


(E.coli y humano)

SUB-UNIDAD GRANDE 50s, 60s.

El RNAr parece que es el núcleo catalítico del ribosoma, mientras que


las proteínas sirven para estabilizar la estructura y permitir que las
moléculas de RNAt interaccionen con el RNAm.

Lo esencial de la síntesis proteica es la formación de enlaces


peptídicos, pero la formación de estos enlaces debe empezar y
terminar con los aminoácidos adecuados para que se originen
proteínas biológicamente activas.
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Las reacciones de TRADUCCIÓN en que están implicados los


ribosomas se dividen en tres etapas:

INICIACIÓN.
ELONGACIÓN DE LA CADENA
TERMINACIÓN.
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COMPARACIÓN ESQUEMÁTICA DE LOS RIBOSOMAS


EUCARIÓTICOS Y LOS PROCARIÓTICOS.

S = coeficiente de sedimentación.
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UNIDAD 70s COMPLETA

A: sitio aminoacilo.

B: sitio peptidilo.

E: sitio de salida.

COMPONENTES MOLECULARES DE LOS RIBOSOMAS.

Monosomas Subunidades RNAt Proteínas

Procariotas 70s 30s 16s 21


50s 23s + 5s 33

Eucariotas 80s 40s 18s 34


60s 28s + 5s + 5.8s 49
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INICIACIÓN DE LA TRADUCCIÓN.

La iniciación de la síntesis de proteínas requiere del ensamblaje de un


complejo llamado COMPLEJO DE INICIACIÓN, formado por:

 Las sub-unidades ribosómicas


 Los Factores de Iniciación (iF1,iF2,iF3)
 El RNAm.
 El RNAt iniciador.

1.- Al principio, la sub-unidad 30s del ribosoma se encuentra disociada


debido a la presencia de dos factores de iniciación iF1 e iF3, que se
encuentran unidos a la sub-unidad 30s.

2.-Formación del complejo iF2:GTP que se une al RNAt iniciador.


El iF2 se une a la GTP para formar un complejo iF2:GTP. Este
complejo selecciona de entre todos los aminoacil-RNAt el RNAt
-INICIADOR, que es una molécula de Formilmetionil-RNAtmet (RNAt
con metionina formilada) o la Metionil-RNAtmet. (metionil-RNAtmet.) en
las células eucariotas .Por ello, el primer aminoácido incorporado en
casi todas las proteínas es la formilmetionina o la metionina.
Este RNAt INICIADOR unido al complejo iF2:GTP es colocado en el
sitio P o Peptidilo del ribosoma.

3.-Unión del RNAm al ribosoma.


El RNAm se fija a la sub-unidad 30s en un sitio llamado SITIO DE
UNIÓN AL RIBOSOMA que está cerca de donde se encuentre el
codón de iniciación AUG, que es el codón para la metionina. El
RNAm se fija a la región terminal 3´del RNAr (16s) unos 7 a 10
nucleótidos previos al condón de iniciación.
El sitio del RNAm que se fija al ribosoma contiene una secuencia de
purinas AGGAG que se conoce con el nombre de Secuencia de
Shine-Dalgarno. Debido a que esta secuencia se encuentra
inmediatamente antes del codón de iniciación, asegura que el
anticodón RNAt de INICIACIÓN se ensamble solo con el codón de
iniciación para la metionina y no en los codones internos de metionina.
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4.-Unión codón-anticodón.
El codón de iniciación AUG del RNAm se une al anticodón de
iniciación del metionil-RNAtmet.

5.-Formación del ribosoma completo o 70s.


Formado el complejo de iniciación se libera el iF3 y el iF1, lo que
permite el ensamblaje de la sub-unidad 50s. El ensamblaje de ambas
sub-unidades forman el complejo 70 s que delimita el lugar o sitio P
o peptidilo, donde se coloca el PÉPTIDO y el lugar o sitio A o
aminoácilo, donde se encuentra el aminoácido.

El RNAt INICIADOR colocado en el sitio P se une al codón AUG,


formando el primer apareamiento codón-anticodón.

El complejo iF1-GTP (colocado en el sitio A) se desprende del


complejo 70s al hidrolizarse el GTP en GDP y Pi por acción de la GTP
asa.
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APAREAMIENTO CODÓN-ANTICODÓN

REGIÓN DEL RNAm QUE SE UNE AL RIBOSOMA (RNAt 16S).


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TRANSCRIPCIÓN Y TRADUCCIÓN.
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INICIACIÓN DE LA BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS EN LOS


PROCARIOTES.
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ELONGACIÓN

La elongación o alargamiento de la cadena polipeptídica se realiza a


partir del momento en que llega el siguiente aminoacil-RNAt al sitio A
del ribosoma, ya que el sitio P está ocupado por RNAt INICIADOR.

El sitio P del ribosoma mantiene la cadena polipeptídica en formación.


El RNAt unido a un aminoácido se llama Aminoacil RNAt.
El RNAt unido a la cadena polipeptídica se llama Peptidil RNAt.

La ELONGACIÓN tiene las siguientes etapas:

1.- Colocación del Aminoacil-RNAt correcto en el sitio A.


Una proteína llamada factor de elongación Tu o “EF-Tu”, la cual
está unida a una molécula de GTP. La molécula EF-Tu:GTP se une al
aminoacil-RNAt formando un COMPLEJO TERNARIO que lleva al
RNAt al sitio A del ribosoma.
El complejo EF-Tu:GTP nunca se une al RNAt de iniciación o fMet-
RNAtmetf.. Al unirse el anticodón del RNAt con el codón correspondiente
del RNAm se produce la hidrólisis del GTP en GDP y Pi por lo que el
complejo EF-Tu:GDP se separa del aminoacil-RNAt.y se desprende
del ribosoma.
La velocidad de alargamiento de la cadena es de 18 aminoácidos por
segundo.

2.-Reactivación del EF-Tu por acción del EF-Ts.


El EF-Tu no se puede unir a otro aminoacil-RNAt mientras no se
disocie del GDP. Por ello es necesario que actúe el Factor de
elongación Ts o “EF-Ts” que elimina el GDP y une una molécula de
GTP al EF-Tu para que pueda volverse a unir a un aminoacil-RNAt y
llevarlo al sitio A del ribosoma.
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3.- Formación del enlace peptídico por acción de la Peptidil-


transferasa.
Cuando el aminoacil-RNAt está colocado en el sitio A, su aminoácido
establece un enlace peptídico con el aminoácido de la cadena
polipeptídica colocada en el sitio P, reacción catalizada por actividad
de la PEPTIDIL-TRANSFERASA. Esta enzima a su vez rompe el
enlace de la cadena polipeptídica con el peptidil-RNAt del sitio P,
quedando entonces un RNAt sin aminoácido que posteriormente es
expulsado del ribosoma.
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4.- Translocación
El ribosoma se mueve un codón en dirección 3´del RNAm por lo que el
RNAt sin aminoácido (desaminacilado) sale del ribosoma y el peptidil-
RNAt del sitio A recién formado pasa a ocupar el sitio P quedando libre
el sitio A que recibirá un nuevo aminoacil-RNAt. Este movimiento se
llama TRANSLOCACIÓN.
Este proceso se produce por la acción el Factor de elongación G o
“EF-G”, que unido a GTP (EF-G:GTP) libera al RNAt desaminacilado
del sitio P y transloca el peptidil-RNAt del sitio A al P.
Este ciclo de repite a medida que se traduce cada nuevo codón del
RNAm. Dando por resultado una cadena polipeptídica.
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ELONGACIÓN DE LA CADENA EN LA TRADUCCIÓN


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TERMINACIÓN.

La terminación se produce en el momento en que el ribosoma se


desplaza y coloca en el sitio A alguno de los tres codones de
terminación del RNAm: UGA, UAG, UAA.
Los codones de terminación NO son reconocidos por ningún RNAt y
en cambio si los reconocen el FACTOR DE LIBERACIÓN
(dependiente de GTP) en los eucariotes.
Una vez unido el factor de liberación al codón de terminación del
RNAm en el sitio A la peptidil transferasa causa hidrólisis del ester del
peptidil RNAt situado en el lugar P.
Al liberarse el polipéptido recién formado se separa el factor de
liberación del ribosoma, se disocian las sub-unidades 50s y 30s,
uniéndose a esta última los factores de iniciación (iF-1 e iF-3).

FACTORES PROTEICOS QUE INTERVIENEN EN LA TRADUCCIÓN


DE LOS PROCARIOTES
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POLIRRIBOSOMAS.

La misma molécula de RNAm puede ser traducida por muchos


ribosomas de manera simultánea.

Debido a su gran tamaño varios ribosomas pueden adherirse al mismo


RNAm siempre y cuando exista una separación de 80 nucleótidos por
lo menos entre ellos.

La fijación de numerosos ribosomas en la misma molécula de RNAm


forman un Poliribosoma.

Cada ribosoma es capaz de sintetizar aproximadamente 100 enlaces


peptídicos por minuto.
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MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES DE LAS


PROTEÍNAS.

1.- Todos los polipéptidos se inician con N.formilmetionina


(procariotas) y metionina (eucariotas).Estos residuos se eliminan por
medio de enzimas específicas de manera que no aparezcan en la
proteína final.

2.- Muchas proteínas se pliegan (estructura secundaria) hasta tener su


conformación nativa, por lo que necesitan formar puentes disulfuro
contre dos residuos de cisteina.

3.- Las cadenas laterales de los aminoácidos son modificadas


específicamente de diferentes maneras. Una de ellas es la
fosforilación de los aminoácidos que tienen grupos hidroxilo como la
serina , treonina y tirosina , por ejemplo la caseina de la leche tiene
muchas moléculas de serina que le sirven para unir calcio ,fosfatos y
aminoácidos, proporcionando nutrientes esenciales para los lactantes.
En cambio la fosforilación de la tirosina se observa cuando células
normales se transforman en neoplásicas.
4.- Algunos aminoácidos en la cadena polipeptídica pueden
HIDROXILARSE como ocurre con la prolina y lisina de la colágena.
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5.- Enlaces covalentes, entre carbohidratos y aminoácidos como la


asparagina, serina, treonina formando glucoproteinas.

6.- Algunas proteínas son sintetizadas con un número mayor de


aminoácidos a los que tienen las proteínas biológicamente activas, por
lo que se eliminan los residuos sobrantes mediante peptidasas
específicas como es el caso de la pro-insulina que se transforma en
insulina.

7.- La adición de grupo prostético para actividad biológica de ciertas


proteínas con actividad enzimática.

8.- Metilación de algunos residuos de lisina (proteínas del músculo y


citocromo C).

DESTINO DE LAS PROTEÍNAS SINTETIZADAS.

Las proteínas sintetizadas son llevadas al:


 Citosol
 Diferentes organelos celulares.
 Se secretan al exterior (hormonas polipeptídicas, anticuerpos,
mucoproteínas, proteínas plasmáticas etc.
 Forman parte de las membranas.
 Sirven como proteínas de transporte.
 Enzimas.

LIDERES:

Son de15 a 30 aminoácidos que forman parte de la proteína y que


funcionan como señal para dirigir la nueva proteína a su destino
correcto, especialmente en proteínas de secreción.
Estos líderes se localizan en el extremo amino terminal y presentan
grupos hidrofóbicos específicos que le permiten llegar al receptor
específico en la superficie externa del retículo endoplásmico y penetrar
su membrana hasta la cisterna del mismo.
El polipéptido líder es eliminado por acción de una peptidasa
específica en la cisterna.
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La proteína una vez completa y sin polipéptido líder, llega al aparato


de Golgi, se encapsula en una vesícula secretora y finalmente se
secreta al exterior.

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