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Harper Bioquímica ilustrada, 31e

Capítulo 1: Bioquímica y medicina

Victor W. Rodwell; Robert K. Murray

OBJETIVOS

OBJETIVOS

Después de estudiar este capítulo, usted deberá ser capaz de:

Entender la importancia de la capacidad de los extractos de levadura libres de células para fermentar los azúcares, una observación que
permitió el descubrimiento de los metabolitos intermediarios de la fermentación, la glucólisis y otras vías metabólicas.

Apreciar el alcance de la bioquímica y su función central en las ciencias de la vida, y que la bioquímica y la medicina son disciplinas íntimamente
relacionadas.

Apreciar que la bioquímica integra el conocimiento de los procesos químicos en las células vivas con estrategias para mantener la salud,
entender la enfermedad, identificar las terapias potenciales y mejorar nuestro entendimiento de los orígenes de la vida en la Tierra.

Describir cómo los enfoques genéticos han sido críticos para dilucidar muchas áreas de la bioquímica y cómo el Proyecto del Genoma Humano
ha promovido avances en numerosos aspectos de la biología y la medicina.

IMPORTANCIA BIOMÉDICA
La bioquímica y la medicina disfrutan de una relación mutuamente cooperativa. Los estudios bioquímicos han iluminado muchos aspectos de la salud
y la enfermedad, y el estudio de dichos aspectos ha abierto nuevas áreas de la bioquímica. En este libro se enfatiza en la importancia médica de la
bioquímica tanto en situaciones normales como anormales. La bioquímica efectúa contribuciones significativas al campo de la biología celular, la
fisiología, la inmunología, la microbiología, la farmacología, la toxicología y la epidemiología, así como al campo de la inflamación, el daño celular y el
cáncer. Estas estrechas relaciones subrayan que la vida, como sabemos, depende de las reacciones y procesos bioquímicos.

DESCUBRIMIENTO DE QUE UN EXTRACTO DE LEVADURA LIBRE DE CÉLULAS PUEDE


FERMENTAR EL AZÚCAR
Aunque la capacidad de la levadura de “fermentar” varios azúcares hasta conseguir alcohol etílico se ha conocido durante milenios, de manera
comparativa, sólo recientemente este proceso inició la ciencia de la bioquímica. El gran microbiólogo francés Louis Pasteur sustentó que la
fermentación sólo podría ocurrir en las células intactas. Sin embargo, en 1899, los hermanos Büchner descubrieron que la fermentación podría
ocurrir en ausencia de células intactas, cuando almacenaron un extracto de la levadura en un cántaro con una solución de azúcar concentrada,
agregada como preservante. Durante la noche, el contenido fermentado del cántaro se derramó por toda la mesa del laboratorio y el suelo, lo cual fue
demostración fehaciente de que la fermentación puede seguir en ausencia de una célula intacta. Este descubrimiento desencadenó un torrente de
investigaciones que inició la ciencia de la bioquímica. Las investigaciones revelaron las funciones vitales del fosfato inorgánico, ADP, ATP y NAD(H), y
por último identificaron los azúcares fosforilados y las reacciones químicas y enzimas que convierten la glucosa a piruvato (glucólisis) o a etanol y CO2
(fermentación). El comienzo de la investigación en los años 1930 identificó los metabolitos intermediarios del ciclo del ácido cítrico y de la biosíntesis
de la urea, y reveló las funciones esenciales de ciertos cofactores derivados de las vitaminas o las “coenzimas” como el pirofosfato de tiamina, la
riboflavina, y por último la coenzima A, la coenzima Q y la coenzima cobamida. En los años 1950 se conoció cómo los hidratos de carbono complejos
son sintetizados y fragmentados hasta azúcares simples y las vías para la biosíntesis de las pentosas y el catabolismo de los aminoácidos y los ácidos
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Capítulo 1: Bioquímica y medicina, Victor W. Rodwell; Robert K. Murray
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Los investigadores emplearon modelos animales, órganos intactos perfundidos, partes de tejidos, células homogéneas y sus subfracciones, y
posteriormente enzimas purificadas. Los avances fueron mejorados por el desarrollo de la ultracentrifugación analítica, la cromatografía en papel y
investigaciones que inició la ciencia de la bioquímica. Las investigaciones revelaron las funciones vitales del fosfato inorgánico, ADP, ATP y NAD(H), y
por último identificaron los azúcares fosforilados y las reacciones químicas y enzimas que convierten la glucosa a piruvato (glucólisis)Universidad CES
o a etanol y CO2
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(fermentación). El comienzo de la investigación en los años 1930 identificó los metabolitos intermediarios del ciclo del ácido cítrico y de la biosíntesis
de la urea, y reveló las funciones esenciales de ciertos cofactores derivados de las vitaminas o las “coenzimas” como el pirofosfato de tiamina, la
riboflavina, y por último la coenzima A, la coenzima Q y la coenzima cobamida. En los años 1950 se conoció cómo los hidratos de carbono complejos
son sintetizados y fragmentados hasta azúcares simples y las vías para la biosíntesis de las pentosas y el catabolismo de los aminoácidos y los ácidos
grasos.

Los investigadores emplearon modelos animales, órganos intactos perfundidos, partes de tejidos, células homogéneas y sus subfracciones, y
posteriormente enzimas purificadas. Los avances fueron mejorados por el desarrollo de la ultracentrifugación analítica, la cromatografía en papel y
otras formas de cromatografía y la disponibilidad de radioisótopos después de la Segunda Guerra Mundial, principalmente 14C, 3H y 32P, como
“marcadores” para identificar los metabolitos intermediarios en las vías complejas como la biosíntesis del colesterol. La cristalografía de rayos X era
usada entonces para solucionar las estructuras tridimensionales de numerosas proteínas, polinucleótidos, enzimas y virus. Los avances genéticos que
siguieron a la comprensión de que el DNA era una doble hélice incluyen la reacción en cadena de la polimerasa, y los animales transgénicos o aquellos
con bloqueo de genes. Los métodos empleados para preparar, analizar, purificar e identificar los metabolitos y las actividades de las enzimas
naturales y recombinantes, y sus estructuras tridimensionales se discuten en los capítulos siguientes.

LA BIOQUÍMICA Y LA MEDICINA HAN PROPORCIONADO AVANCES MUTUOS


Las dos preocupaciones principales de los trabajadores de las ciencias de la salud —y en particular los médicos— son el entendimiento y
mantenimiento de la salud y el tratamiento eficaz de la enfermedad. La bioquímica afecta a ambas preocupaciones fundamentales, y la interrelación
de la bioquímica y la medicina es una calle amplia, de doble sentido. Los estudios bioquímicos han iluminado muchos aspectos de la salud y la
enfermedad, y a la inversa, el estudio de varios aspectos de salud y enfermedad ha abierto nuevas áreas de la bioquímica (véase figura 1–1). Un
ejemplo temprano acerca de la investigación de la estructura y función de la proteína reveló la diferencia única en la secuencia de aminoácidos entre la
hemoglobina normal y la hemoglobina de células falciformes. El análisis subsecuente de numerosas variantes de células falciformes y otras
hemoglobinas ha contribuido considerablemente a nuestro entendimiento de la estructura y función tanto de la hemoglobina como de otras
proteínas. Durante principios de los años 1900 el médico inglés Archibald Garrod estudió a pacientes con trastornos relativamente raros de
alcaptonuria, albinismo, cistinuria y pentosuria, y estableció que estas condiciones fueron genéticamente determinadas. Garrod designó estas
condiciones como errores innatos del metabolismo. Su percepción estableció una base para el desarrollo del campo de la genética bioquímica
humana. Un ejemplo más reciente fue la investigación de la base genética y molecular de la hipercolesterolemia familiar, una enfermedad que causa el
inicio temprano de la aterosclerosis. Además, el esclarecimiento de las diferentes mutaciones genéticas responsables de esta enfermedad
proporcionó un entendimiento más profundo de los receptores de la célula y mecanismos de la captación, no sólo del colesterol, sino también de la
manera en que otras moléculas cruzan las membranas de las células. Los estudios de los oncogenes y los genes supresores tumorales en las
células cancerosas han dirigido la atención a los mecanismos moleculares implicados en el control del crecimiento celular normal. Estos ejemplos
ilustran cómo el estudio de la enfermedad puede abrir áreas de la investigación bioquímica básica. La ciencia provee a los médicos y otros
profesionales en asistencia médica y biológica con un fundamento que impacta la práctica, estimula la curiosidad y promueve la adopción de
enfoques científicos para el aprendizaje continuo.

FIGURA 1–1

Una calle de doble sentido conecta la bioquímica y la medicina. El conocimiento de los temas bioquímicos dispuestos encima de la línea
verde del diagrama ha aclarado nuestro entendimiento de las enfermedades que aparecen debajo de dicha línea. A la inversa, el estudio de las
enfermedades ha arrojado luz sobre muchas áreas de la bioquímica. Nótese que la anemia de células falciformes es una enfermedad genética, y que
tanto la aterosclerosis como la diabetes mellitus tienen componentes genéticos.

LOS PROCESOS BIOQUÍMICOS SON LA BASE DE LA SALUD HUMANA


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La Organización Mundial de la Salud (WHO, World Health Organization) define la salud como un estado “de bienestar físico, mental, y social completo
y no simplemente la ausencia de enfermedad y debilidad”. Desde el punto de vista de la bioquímica, la salud se puede considerar como esa situación
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LOS PROCESOS BIOQUÍMICOS SON LA BASE DE LA SALUD HUMANA


La investigación bioquímica repercute en la nutrición y la medicina preventiva

La Organización Mundial de la Salud (WHO, World Health Organization) define la salud como un estado “de bienestar físico, mental, y social completo
y no simplemente la ausencia de enfermedad y debilidad”. Desde el punto de vista de la bioquímica, la salud se puede considerar como esa situación
en la cual las miles de reacciones intra y extracelulares que ocurren en el cuerpo, siguen un ritmo proporcionado con la supervivencia del organismo
bajo la presión tanto de los desafíos internos como de los externos. El mantenimiento de la salud requiere de un consumo dietético óptimo de
vitaminas, ciertos aminoácidos y ácidos grasos, varios minerales y agua. Comprender la nutrición depende en alto grado del conocimiento de la
bioquímica; las ciencias de la bioquímica y la nutrición comparten el interés sobre estos elementos. El progresivo énfasis reciente sobre el intento
sistemático de asegurar la salud y prevenir la enfermedad, o medicina preventiva, incluye enfoques alimenticios para la prevención de
enfermedades como la aterosclerosis y el cáncer.

La mayoría de las enfermedades tiene una base bioquímica

Aparte de los organismos infecciosos y contaminadores ambientales, muchas enfermedades son manifestaciones de anomalías en los genes, las
proteínas, las reacciones químicas o los procesos bioquímicos, cada uno de los cuales puede afectar adversamente una o varias funciones
bioquímicas importantes. Los ejemplos de las alteraciones en la bioquímica humana responsables de enfermedades u otras condiciones debilitantes
incluyen el desequilibrio de electrólitos, los defectos en la ingestión o absorción de nutrientes, los desequilibrios hormonales, los agentes tóxicos
químicos o biológicos y los trastornos genéticos basados en el DNA. Para dirigir estos desafíos, la investigación bioquímica sigue estando entrelazada
con estudios en disciplinas como la genética, la biología celular, la inmunología, la nutrición, la patología y la farmacología. Además, muchos
bioquímicos están sumamente interesados en la contribución a soluciones de cuestiones clave como la supervivencia fundamental de la humanidad y
la educación del público para apoyar el uso del método científico en la solución de los principales problemas ambientales y otros que confronta
nuestra civilización.

Impacto del Proyecto del Genoma Humano en la bioquímica, la biología y la medicina

El rápido e inesperado progreso en la secuenciación del genoma humano a finales de la década de 1990 condujo, a mediados de los años 2000, al
anuncio de que más de 90% del genoma había sido secuenciado. Este esfuerzo fue encabezado por el Consorcio Internacional para la Secuencia del
Genoma Humano y por Celera Genomics. Con excepción de algunos intervalos, la secuencia del genoma humano completo se consiguió en 2003, sólo
50 años después de la descripción de la naturaleza doble helicoidal del DNA por Watson y Crick. Las implicaciones para la bioquímica, la medicina, y de
hecho, para toda la biología, son virtualmente ilimitadas. Por ejemplo, la capacidad de aislar y secuenciar un gen e investigar su estructura y función
por secuencia y experimentos de “bloqueo génico” ha revelado previamente genes desconocidos y sus productos, y se han ganado nuevos
conocimientos con respecto a la evolución humana y los procedimientos para identificar genes relacionados con las enfermedades.

Los principales avances en la bioquímica y el entendimiento de la salud humana y la enfermedad continúan siendo hechos por la mutación de los
genomas de organismos de modelos como la levadura, la mosca de la fruta Drosophila melanogaster, el nemátodo Caenorhabditis elegans y el pez
cebra, todos los organismos que pueden ser genéticamente manipulados para proporcionar una percepción de las funciones de los genes
individuales. Estos adelantos tienen el potencial de brindar pistas en la curación de trastornos humanos como la enfermedad de Alzheimer y el cáncer.
En la figura 1–2 se destacan las áreas que se han desarrollado o se han acelerado como resultado directo del progreso hecho en el Proyecto del
Genoma Humano (HGP, Human Genome Project). Las nuevas áreas “ómicas” se concentran en el estudio completo de las estructuras y las funciones
de las moléculas por las cuales cada uno se interesa. Los productos de genes (moléculas de RNA y proteínas) están siendo estudiados con el uso de las
técnicas transcriptómicas y proteómicas. Un ejemplo espectacular de la velocidad del progreso en la transcriptómica es la explosión de
conocimiento sobre pequeñas moléculas del RNA como reguladoras de la actividad de los genes. Otros campos ómicos incluyen, la glicómica, la
lipidómica, la metabolómica, la nutrigenómica y la farmacogenómica. Para seguir el ritmo de la información generada, la bioinformática ha
recibido mucha atención. Otros campos relacionados a los cuales se ha transmitido el ímpetu del HGP son la biotecnología, la bioingeniería, la
biofísica y la bioética. Las definiciones de estas áreas ómicas y otros términos aparecen en el “Glosario” de este capítulo. La nanotecnología es un
área activa, que puede proporcionar, por ejemplo, métodos nuevos de diagnóstico y tratamiento para el cáncer y otros trastornos. La biología de la
célula madre está en el centro de numerosas investigaciones en curso. La terapia génica aún tiene que lograr la promesa que parece ofrecer, pero
todo indica que finalmente ocurrirá. Se han desarrollado muchas nuevas pruebas diagnósticas moleculares en áreas tales como la genética, la
microbiología, y las pruebas inmunológicas y diagnóstico. También florece la biología de sistemas. Los resultados de la investigación en varias
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áreas mencionadas con anterioridad impactarán extraordinariamente el futuro de la biología, la medicina y las ciencias de la salud. La biología
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sintética ofrece el potencial para crear organismos vivos, al principio pequeñas bacterias, del material genético in vitro, que podrían realizar tareas
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específicas como limpiadoras de los vertimientos de petróleo. Todo lo anterior hace del siglo XXI un tiempo estimulante para involucrarse
directamente en la biología y la medicina.
recibido mucha atención. Otros campos relacionados a los cuales se ha transmitido el ímpetu del HGP son la biotecnología, la bioingeniería, la
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biofísica y la bioética. Las definiciones de estas áreas ómicas y otros términos aparecen en el “Glosario” de este capítulo. La nanotecnología es un
área activa, que puede proporcionar, por ejemplo, métodos nuevos de diagnóstico y tratamiento para el cáncer y otros trastornos. LaAccess Provided by:
biología de la
célula madre está en el centro de numerosas investigaciones en curso. La terapia génica aún tiene que lograr la promesa que parece ofrecer, pero
todo indica que finalmente ocurrirá. Se han desarrollado muchas nuevas pruebas diagnósticas moleculares en áreas tales como la genética, la
microbiología, y las pruebas inmunológicas y diagnóstico. También florece la biología de sistemas. Los resultados de la investigación en varias
áreas mencionadas con anterioridad impactarán extraordinariamente el futuro de la biología, la medicina y las ciencias de la salud. La biología
sintética ofrece el potencial para crear organismos vivos, al principio pequeñas bacterias, del material genético in vitro, que podrían realizar tareas
específicas como limpiadoras de los vertimientos de petróleo. Todo lo anterior hace del siglo XXI un tiempo estimulante para involucrarse
directamente en la biología y la medicina.

FIGURA 1–2

El Proyecto del Genoma Humano (HGP) ha influido en muchas disciplinas y áreas de la investigación. La bioquímica no está en la lista ya
que precede al inicio del HGP, pero disciplinas como la bioinformática, la genómica, la glicómica, la lipidómica, la metabolómica, los diagnósticos
moleculares, la proteómica y la transcriptómica son, no obstante, áreas activas de la investigación bioquímica.

RESUMEN
La bioquímica es la ciencia relacionada con las moléculas presentes en los organismos vivos, las reacciones químicas individuales y sus enzimas
catalíticas, y la expresión y regulación de cada proceso metabólico. La bioquímica se ha convertido en el lenguaje básico de todas las ciencias
biológicas.

A pesar del enfoque sobre la bioquímica humana en este texto, la bioquímica concierne a todo el espectro de formas de vida, desde los virus,
bacterias y plantas hasta el complejo eucariota como los seres humanos.

La bioquímica, la medicina y otras disciplinas de la asistencia médica están íntimamente relacionadas. La salud en todas las especies depende del
equilibrio armonioso de las reacciones bioquímicas que ocurren en el cuerpo, mientras que la enfermedad refleja las anormalidades en las
biomoléculas, las reacciones bioquímicas o los procesos bioquímicos.

Los avances en el conocimiento bioquímico han iluminado muchas áreas de la medicina, y el estudio de enfermedades a menudo ha revelado
aspectos previamente insospechados de la bioquímica.

Los enfoques bioquímicos a menudo son fundamentales para elucidar las causas de enfermedades y en el diseño de la terapia apropiada. Las
pruebas de laboratorio bioquímicas también representan un componente integral del diagnóstico y la monitorización del tratamiento.

El conocimiento sólido de la bioquímica y de otras disciplinas básicas relacionadas, es esencial para la práctica racional de la medicina y las
ciencias de la salud.

Los resultados del HGP y de la investigación en áreas relacionadas tendrán una influencia profunda en el futuro de la biología, la medicina y otras
ciencias de la salud.

La investigación de la genómica en organismos modelos como la levadura, la mosca de la fruta D. melanogaster, el nemátodo C. elegans, y el pez
cebra proporciona la percepción del entendimiento de las enfermedades humanas.
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GLOSARIO
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Bioética: Área de la ética que está relacionada con la aplicación de principios morales y éticos a la biología y la medicina.
ciencias de la salud.
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Los resultados del HGP y de la investigación en áreas relacionadas tendrán una influencia profunda en el futuro de la biología, la medicina y otras
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ciencias de la salud.

La investigación de la genómica en organismos modelos como la levadura, la mosca de la fruta D. melanogaster, el nemátodo C. elegans, y el pez
cebra proporciona la percepción del entendimiento de las enfermedades humanas.

GLOSARIO

Bioética: Área de la ética que está relacionada con la aplicación de principios morales y éticos a la biología y la medicina.

Biofísica: Aplicación de la física y sus técnicas a la biología y la medicina.

Bioinformática: Disciplina interesada por la colección, almacenamiento y análisis de los datos biológicos, por ejemplo, el DNA, el RNA y las
secuencias de proteínas.

Bioingeniería: Aplicación de la ingeniería en la biología y la medicina.

Biología de la célula madre: Las células madre son células no diferenciadas que tienen el potencial para autorregenerarse y diferenciarse en
cualquiera de las células adultas de un organismo. Este concepto concierne a la biología de las células madre propiamente dichas y a su potencial para
tratar varias enfermedades.

Biología de sistemas: Campo interesado en los sistemas biológicos complejos estudiados como entidades integradas.

Biología sintética: Campo que combina técnicas biomoleculares con enfoques de ingeniería para construir nuevas funciones biológicas y sistemas.

Biotecnología: Campo en el cual se combinan la bioquímica, la ingeniería, y otros enfoques para desarrollar productos biológicos de uso en la
medicina y la industria.

Diagnóstico molecular: Se refiere al uso de enfoques moleculares como sondas del DNA para asistir en el diagnóstico de varias enfermedades
bioquímicas, genéticas, inmunológicas, microbiológicas y otras.

Farmacogenómica: Uso de información genómica y tecnologías para optimizar el descubrimiento y el desarrollo de nuevos fármacos y objetivos
farmacológicos.

Genómica: El genoma es el grupo completo de genes de un organismo, y la genómica es el estudio a profundidad de las estructuras y las funciones
de los genomas.

Glicómica: El glicoma es el complemento total de los hidratos de carbono simples y complejos en un organismo. La glicómica es el estudio
sistemático de las estructuras y las funciones de los glicomas, como el glicoma humano.

Lipidómica: El lipidoma es el complemento completo de lípidos encontrados en un organismo. La lipidómica es el estudio profundo de las
estructuras y las funciones de todos los miembros del lipidoma y de sus interacciones, tanto en la salud como en la enfermedad.

Metabolómica: El metaboloma es el complemento completo de los metabolitos (pequeñas moléculas implicadas en el metabolismo) presente en un
organismo. La metabolómica es el estudio a profundidad de las estructuras, funciones y cambios de varios estados metabólicos.

Nanotecnología: Desarrollo y aplicación a la medicina y otras áreas de dispositivos como las nanocápsulas, que tienen el tamaño de sólo unos
nanómetros (10−9 m = 1 nm).

Nutrigenómica: Estudio sistemático de los efectos de los nutrientes en la expresión genética y de los efectos de variaciones genéticas en el
metabolismo de los nutrientes.

Proteómica: El proteoma es el complemento completo de proteínas de un organismo. La proteómica es el estudio sistemático de las estructuras y las
funciones de los proteomas y sus variaciones en la salud y la enfermedad.

Terapia génica: Se aplica al uso de genes genéticamente diseñados para tratar varias enfermedades.
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Transcriptómica: Estudio completo del transcriptoma, el grupo completo de transcripciones del RNA producido por el genoma durante un periodo
fijo.
metabolismo de los nutrientes.
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Proteómica: El proteoma es el complemento completo de proteínas de un organismo. La proteómica es el estudio sistemático de las estructuras y las
funciones de los proteomas y sus variaciones en la salud y la enfermedad.

Terapia génica: Se aplica al uso de genes genéticamente diseñados para tratar varias enfermedades.

Transcriptómica: Estudio completo del transcriptoma, el grupo completo de transcripciones del RNA producido por el genoma durante un periodo
fijo.

APÉNDICE
Se muestran ejemplos seleccionados de bases de datos que reúnen, anotan y analizan información de importancia biomédica.

ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements): Enciclopedia de elementos del DNA. Una colaboración de esfuerzos que combina enfoques de
laboratorio y computacionales para identificar cada elemento funcional en el genoma humano.

GenBank: La base de datos de la secuencia de proteína de los Institutos Nacionales de la Salud (NIH, National Institutes of Health) almacena todas las
secuencias de nucleótidos biológicos conocidas y sus traducciones en una forma investigable.

HapMap (Haplotype M a p) : Mapa de haplotipo, un esfuerzo internacional para identificar los polimorfismos de nucleótidos simples (SNP, single
nucleotide polymorphisms) asociados con enfermedades humanas comunes y respuestas diferentes a los productos farmacéuticos.

ISDB (International Sequence DataBase) : Base de Datos de Secuencia Internacional, que incorpora bases de datos del DNA de Japón y del
Laboratorio de Biología Molecular Europeo (EMBL, European Molecular Biology Laboratory).

PDB (Protein DataBase) : Base de Datos de la Proteína. Estructuras tridimensionales de las proteínas, los polinucleótidos y otras macromoléculas,
incluyendo las proteínas ligadas a los sustratos, los inhibidores u otras proteínas.

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