Metabolismo de las Proteínas

METABOLISMO DE
AMINOACIDOS
Los aminoácidos, no se almacenan en el
organismo.
Sus niveles dependen del equilibrio entre
biosíntesis y degradación de proteínas
corporales, es decir el balance entre
anabolismo y catabolismo (balance
nitrogenado).
El N se excreta por orina y heces
 FIJACIÓN BIOLÓGICA DE NITRÓGENO

Existe un mantenimiento estable del N2 atmosférico por microorganismos

que convierten NITRATOS NO3- en NITRITOS (NO2-) y NITRITOS en N2

El 18 % del volumen atmosférico es N2… La Tierra está envuelta por

4000 x 106 toneladas de N2… Cada año las bacterias fijan 30 a 60 x 106
toneladas de N2 atmosférico.

CATABOLISMO DE LOS AMINOÁCIDOS.

Ocurre en gran parte en el hígado, algo de actividad hay en el riñón.

Los grupos aminos en los vertebrados, debe excretarse como:

UREA AMONIACO ACIDO ÚRICO

Organismo Ureotélico Amoniotélico Uricotélico

La separación del grupo α - amino constituye generalmente, la primera etapa en el

catabolismo de los aas. Dos procesos importantes: Transaminación y desaminación
oxidativa.
 CATABOLISMO DE
AMINOACIDOS
La degradación se inicia por procesos que
separan el grupo amino.

Estos procesos pueden ser reacciones de

transferencia (transaminación) o de
separación del grupo amino
(desaminación)
 TRANSAMINACIÓN
Es la transferencia reversible de un grupo
amino a un cetoacido, catalizada por
una aminotransferasa, utilizando
piridoxal fosfato como cofactor
El a.a. se convierte en cetoácido y el
cetoácido en el aminoácido
correspondiente.
Es decir, el grupo amino no se elimina sino
se transfiere a un cetoácido para formar
otro aminoácido.
 TRANSAMINACIÓN
Un ácido alfa-ceto es un tipo de cetoácido que contiene un
grupo funcional cetona adyacente al carbono de un grupo
funcional carboxilo. El ácido alfa-ceto más característico es el
ácido pirúvico, producto de la reacción de la glucólisis. Otro
ejemplo es el α-cetoglutarato, un compuesto del ciclo de Krebs
Todos los a.a. excepto lisina y treonina,
participan en reacciones de
“transaminacion” con piruvato, oxalacetato
o cetoglutarato.

a.a.(1) + cetoácido(2) a.a.(2) + cetoácido (1)

Alanina + acetoglutarato piruvato + glutamato

A su vez, la alanina y el aspartato reaccionan con

cetoglutarato, obteniéndose glutamato como
producto
La Aspartato
aminotransferasa
cataliza en ambos
sentidos la reaccion.
El cetoglutarato es
el aceptor del grupo
amino, cedido por el
aspartato.
(No toxico)
 DESAMINACIÓN
El grupo amino del glutamato, puede ser
separado por desaminacion oxidativa
catalizada por la glutamato
deshidrogenasa, utilizando NAD y NADP
como coenzimas.
Se forma cetoglutarato y NH4
La mayoría del NH4 producido en el
organismo se genera por esta reacción
La glutamato deshidrogenasa se encuentra en
la matriz mitocondrial.

Es una enzima alosterica activada por ADP y

GDP e inhibida por ATP y GTP.
Cuando el nivel de ADP o GDP en la célula es
alto, se activa la enzima y la producción de
cetoglutarato, alimentará el ciclo de Krebs y
se generará ATP
Hay dos aminoácido oxidasas no espeíficas la L-
L-aminoácido
oxidasa y la D-
D-aminoácido oxidasa, estas enzimas catalizan la
oxidación de D y L aminoácidos respectivamente, utilizando FAD
(link a fad) como coenzima redox (en vez de NAD(P)+). El FADH2
resultante es reoxidado por el oxígeno molecular.

Aminoácido + FAD + H20  -ceto ácido + NH3 + FADH2

FADH2 + O2  FAD + H202

La D aminoácido oxidasa ocurre normalmente en el riñón. Su

función es enigmática debido a que los D aminoácidos se
encuentran principalmente en la pared de muchas células
bacterianas.
Seven Amino Acids Are Degraded to Acetyl-CoA
Catabolic pathways for phenylalanine and tyrosine.
Los síntomas suelen ser retraso psicomotor, cuadros psicóticos de tipo autista,
convulsiones, síndrome de West, convulsiones generalizadas y un eczema facial muy
rebelde. Por lo general su desarrollo físico es bueno, tienden a tener el cabello más claro
que sus hermanos, piel clara, y presentan un olor característico a paja mojada.
 ALCAPTONURIA
Se trata de un error metabólico congénito. Es una enfermedad
poco frecuente en la que el ácido homogentísico, un
intermediario de la ruta catabólica de la fenilalanina, no puede
metabolizarse provocando aciduria (orina negra), ocronosis
(pigmentación del tejido conjuntivo) y artrosis.

•Error en la ruta catabólica que provoca la alcaptonuria

El albinismo es un defecto metabólico hereditario, limitado a las células
pigmentarias, los melanocitos. Una deficiencia de tirosinasas origina la
incapacidad de formar melanina.

Las personas con albinismo tienen muy poca o quizás no tengan pigmento
en sus ojos, piel o pelo. Han heredado genes que no hacen las cantidades
correctas de un pigmento llamado melanina.

El albinismo afecta a peces, aves, mamíferos y a personas de todas las razas.

La mayoría de niños con albinismo tienen padres con pelo y ojos normales
típicos de su raza.
 Excresión de los productos nitrogenados
Los organismos vivientes excretan el exceso de nitrógeno que
resulta del metabolismo de aminoácidos en una de tres formas.
Muchos organismos acuáticos simplemente excretan amonio.
Donde el agua es menos abundante, el amonio se transforma
en una molécula menos tóxica, además de que su excreción
necesita de menos agua. Uno de estos productos es la urea, la
cual es excretada por la mayoría de los vertebrados terrestres.
El otro producto posible de excreción es el ácido úrico, que es
excretado por aves y reptiles terrestres.
De acuerdo a lo anterior, los organismos vivientes, se clasifican
en amoniotélicos (excretan amonio), ureotélicos (excretan urea)
y uricotélicos (excretan ácido úrico). Algunos organismos
pueden cambiar su metabolismo de amonotélicos a urotélicos o
uricotélicos, según las restricciones de agua a las que sean
expuestos.
 VÍAS DE ELIMINACION DEL NH3

La vía mas importante de eliminación es la

síntesis de urea en hígado

También se elimina NH3, por la formación

de glutamina
NH4+= amoniaco HCO3= bicarbonato
El ciclo de la urea de una manera sintética se puede decir que es de
la siguiente manera:

2 NH4 + CO2 + 3 ATP → NH2-CO-NH2 + 2 ADP + AMP PPi

Este ciclo se regula gracias por medio de la carbamil fosfato sintetasa,

ya que un aumento en las reacciones de transaminación da lugar a un
aumento en su actividad.
4

hidrólisis
Qué es el ácido úrico?

El ácido úrico es un producto del

metabolismo de las purinas que se produce
de forma natural en nuestro organismo. Las
purinas que lo originan proceden de:
1. Alimentos ingeridos.
2. Formación en el propio organismo.

Cuando el ácido úrico sobrepasa los límites

habituales se habla de hiperuricemia.
Anabolismo de los nucleótidos de purina (Inocina)

Origen de los átomos del anillo de purina

en la biosíntesis del núcleo de purina.
4 átomos de N del anillo derivan de aa
(2 glutamina, 1 aspartato y 1 glicina).

2 C glicina
2C tetrahidrofolato (THF)
1C CO2
Consecuencias de la hiperuricemia mantenida:
1- Gota:
Son manifestaciones clínicas por el depósito de cristales de
urato monosódico fundamentalmente sobre el tejido de las
articulaciones, lo que da lugar a episodios de artritis aguda,
bursitis y tenosinovitis, que suele ser recurrente y más adelante
se convierte en crónico. El sobrepeso contribuye a su aparición.
2- Afectación renal:
Cálculos renales de ácido úrico que pueden producir cólicos
renales, con posible desarrollo de una insuficiencia renal a largo
plazo.
La prevención y el control de estos problemas se consigue
siguiendo una dieta hipouricémica
 Dieta hipouricémica
Alimentos que se deben limitar al máximo:
1. Vísceras animales, ternera, cordero, carne de caza, embutidos,
pescado azul, marisco, garbanzos, lentejas y guisantes.
2. Bebidas alcohólicas.
Alimentos recomendables o de consumo preferente:
1.Verduras y frutas en general, arroz, pastas, pan, patatas, lácteos y
derivados, carnes blancas, pollo o pavo y pescado blanco.
Puntos Clave
Limitar la ingesta de alimentos ricos en proteínas (legumbres,
carnes rojas, marisco, pescado azul, vísceras).
Aumentar el consumo de aguas bicarbonatadas para alcalinizar la
orina.
Limitar el consumo de bebidas alcohólicas.
Mantener el peso ideal.
 Exceso puede
producir Gota
 TRANSCRIPCIÓN
El proceso de síntesis de ARN o TRANSCRIPCIÓN, consiste en hacer una copia
complementaria de un trozo de ADN. El ARN se diferencia estructuralmente del ADN en el
azúcar, que es la ribosa y en una base, el uracilo, que reemplaza a la timina. Además el ARN es
una cadena sencilla.
sencilla.

En una primera etapa, una enzima, la ARN

polimerasa se asocia a una región del ADN
,denominada promotor, la enzima pasa de
una configuración cerrada a abierta , y
desenrolla una vuelta de hélice, permitiendo
la polimerización del ARN a partir de una de
las hebras de ADN que se utiliza como patrón.

La ARN-
ARN-polimerasa, se desplaza por la
hebra patrón, insertando nucleótidos de
ARN, siguiendo la complementariedad
de bases, así p.e.

Secuencia de ADN:
3'...TACGCT...5‘

Secuencia de ARNm :
5'...AUGCGA...3'
Cuando se ha copiado toda la hebra, al final del proceso , la cadena de ARN queda
libre y el ADN se cierra de nuevo, por apareamiento de sus cadenas
complementarias. De esta forma, las instrucciones genéticas copiadas o transcritas
al ARN están listas para salir al citoplasma.

El ADN, por tanto, es la "copia

"copia maestra"
maestra" de la información genética, que permanece
en "reserva" dentro del núcleo.
El ARN, en cambio, es la "copia
"copia de trabajo"
trabajo" de la información genética. Este ARN
que lleva las instrucciones para la síntesis de proteínas se denomina ARN
mensajero.
TERMINO
DE LA
TRANSCRIPCIÓN
 TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIONTES
En ella podemos distinguir las siguientes fases:
a) Iniciación: la ARN polimerasa se une a un cofactor σ que permite su unión a una región del ADN llamada promotor,
la cual posee una secuenciaa TATAAT ó TTGACA.
b ) Elongación: la ARN polimerasa recorre la hebra de ADN hacia su extremo 5´ 5´ sintetizando una hebra de ARNm en
dirección 5´
5´-3´
c) Finalización: presenta dos variantes. En una interviene un cofactor "p" y en otra no interviene dicho cofactor.
El proceso fiinaliza al llegar a una secuencia rica en G y C (zona llamada operador). El ADN vuelve a su forma
normal y el ARNm queda libre.
d) Maduración: si lo que se forma es un ARNm no hay maduración, pero si se trata de un ARNt o ARNr hay procesos
de corte y empalme.
 TRANSCRIPCIÓN EN EUCARIONTES
Hay que tener cuenta dos cosas:

- Existen tres tipos de ARN polimerasa I, II y III.

- Los genes están fragmentados en zonas sin sentido o
intrones y zonas con sentido o exones. Antes ha de
madurar y eliminar los intrones
intrones..
- Desempaquetamiento de las histonas.

En la trascripción de eucariontes se distinguen las

siguientes fases:

a) Iniciación: la ARN polimerasa II se une a una zona del

ADN llamada promotor (posee secuencias CAAT y TATA)

b) Elongación: la síntesis continua en sentido 5´

5´-3´. luego
se añade una caperuza (metil
(metil--guanosín trifosfato
trifosfato)) al
extremo 5´
5´ .

c) Finalización: parece que está relacionado con la secuencia

TTATTT. Ahora interviene un poli-
poli-A polimerasa que añade
una cola de poli-
poli-A al pre-
pre-ARNm (ARNhn
ARNhn). ).

d) Maduración: se produce en el núcleo y la hace un enzima

llamada RNPpn (ribonucleoproteínas nucleares pequeñas
pequeñas)),
que elimina los nuevos intrones (I) formados.

Posteriormente las ARN ligasas empalman los exones (E) y

forman el ARNm
ARNm..
snRNPs: ribonucleoproteínas nucleares pequeñas
 Características de los tRNA

Todos los tRNA tienen un “tallo aceptor” con la

secuencia terminal, en el extremo 3’ OH : CCA

Se representan en la configuración de hoja de “trébol”

Presentan 3 asas diferentes:

a) A la derecha, gran parte de secuencia común en todas
las especies de tRNA y su TψCG.... es universal.
Se le asigna la función común de unión a los
ribosomas.
b) El asa del centro, (hacia abajo), tiene una región
distinta en cada uno de los tRNA: Es el anticodón,
secuencia complementaria al codón del mRNA.
(Interaccionan en el ribosoma)
c) El asa de la izquierda es también con regiones
diferentes, asignándosele la función de unión con la
enzima activante o aminoaciltRNA-sintetasa específica.
• CARACTERÍSTICAS DEL CÓDIGO GENÉTICO
• código está organizado en tripletes o codones:
cada tres nucleótidos (triplete) determinan un aminoácido.
•El código genético es degenerado:
existen más tripletes o codones que aminoácidos, de forma
que un determinado aminoácido puede estar codificado por
más de un triplete.
•El código genético es no solapado o sin superposiciones:
un nucleótido solamente pertenece a un único triplete.
•La lectura es "sin comas":
el cuadro de lectura de los tripletes se realiza de forma continua
•El código genético nuclear es universal:
el mismo triplete en diferentes especies codifica para el mismo
aminoácido. La principal excepción a la universalidad es el
código genético mitocondrial.
*El código tiene triples con sentido y sin sentido:
*Existen 61 tripletes con sentido, que codifican a aas. y tres
tripletes sin sentido que codifican la terminación de la traducción.
 TRADUCCIÓN

La síntesis de proteínas o traducción tiene lugar en los ribosomas del citoplasma.

Los aminoácidos son transportados por el ARN de transferencia, específico para
cada uno de ellos, y son llevados hasta el ARN mensajero, dónde se aparean el
codón de éste y el anticodón del ARN de transferencia, por complementariedad de
bases, y de ésta forma se sitúan en la posición que les corresponde.
Una vez finalizada la síntesis de una proteína, el ARN mensajero queda libre y puede
ser leído de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice una
proteína ya está comenzando otra, con lo cual, una misma molécula de ARN
mensajero, está siendo utilizada por varios ribosomas simultáneamente.

En esta sencilla animación puedes ver el proceso de la "síntesis de proteínas".

Esta información está
codificada en forma de
tripletes, cada tres
bases constituyen un
codón que determina
un aminoácido.
aminoácido. Las
reglas de
correspondencia entre
codones y aminoácidos
constituyen el código
genético..
genético
 [Iniciación de la traducción]

[Sitios de unión a ribosomas libres y ocupados]

Clasificación de los antibióticos…
Según su mecanismo de acción...

Que alteran o inhiben la síntesis de la pared

celular…
Que afectan la función de la membrana
citoplasmática…
Que inhiben la síntesis de proteínas a nivel del
ribosoma…
Que inhiben la síntesis de ácidos nucleicos…
Antibióticos que inhiben la síntesis de proteínas...
Antibióticos que inhiben la síntesis de proteínas...

Que actúan sobre la subunidad 30S del ribosoma:

ribosoma:
Aminoglicósidos: ej. Estreptomicina, Neomicina,
Kanamicina, Gentamicina, Tobramicina, Amikacina
Tetraciclinas:: ej. Doxiciclina, Tetraciclina
Tetraciclinas

Que actúan sobre la unidad 50S del ribosoma:

Cloran
Clora nfenicol
Macrólidos: ej. Eritromicina, Azitromicina, Claritromicina
Lincosamidas: ej. Clindamicina
Antibióticos que inhiben la síntesis de proteínas...
Que actúan sobre subunidad 30S...
Aminoglicósidos: Estructura
Son azúcares complejos unidos por enlaces glicosídicos. Los grupos
NH y OH interactúan con proteínas del ribosoma.

La estreptomicina fue
aislada en 1940 de un
Streptomyces.
Antibióticos que inhiben la síntesis de proteínas...

Que actúan sobre subunidad 30S...

Aminoglicósidos: Mecanismo de Acción
i) Se une a proteína S12 en la subunidad 30S del ribosoma
ii) Bloquea la formación del complejo de iniciación
iii) Produce lectura errónea del mensaje: proteína defectuosa
iv) El resultado final es la muerte de la bacteria, son bactericidas
Antibióticos que inhiben la síntesis de proteínas...
Que actúan sobre subunidad 30S...
Tetraciclinas: Estructura química y Mecanismo de acción

Bloquean la inserción del aminoacil-tRNA…

La unión es transitoria, por lo que su efecto es reversible: son bacteriostáticos.
Antibióticos que inhiben la síntesis de proteínas...
Que actúan sobre subunidad 50S...
Cloranfenicol: Estructura química y Mecanismo de acción
Originalmente producido por un Streptomyces, actualmente se
sintetiza químicamente.

Se une a la enzima peptidil transferasa en la subunidad 50S…

Inhibe la formación del enlace peptídico…
Detiene la síntesis de proteínas. Es un agente bacteriostático
bacteriostático..
Antibióticos que inhiben la síntesis de proteínas...
Que actúan sobre subunidad 50S...

Macrólidos y Lincosamidas: Estructura y Mecanismo de

acción

Inhiben la peptidil transferasa y la translocación…

Se detiene la síntesis de proteínas. Son bacteriostáticos.
Antibióticos que inhiben la síntesis de ácidos nucleicos…
Que inhiben la síntesis de RNA...

Rifampicina: se une a la RNA polimerasa bloqueando la síntesis

del mRNA.
Es un antibiótico de uso limitado, debido a la aparición de
mutantes resistentes.
Es capaz de penetrar a las células, por esto, es útil en el
tratamiento de la Tuberculosis, en combinación con drogas
antituberculosis, como Isoniazida (inhibe la síntesis de lípidos
de Mycobacterium tuberculosis)
tuberculosis) y Etambutol.
También se usa en combinación con esta drogas para el
tratamiento de la Lepra.
Resumen de los sitios blanco de acción para los antimicrobianos…
Antimicrobianos…

Antimicrobiano
“Sustancia capaz de actuar sobre los microorganismos, inhibiendo su
crecimiento o destruyéndolos”

Quimioterapéutico “Sustancia Antibiótico

producida de manera sintética que posee
la propiedad de inhibir el crecimiento o
destruir microorganismos”.
“Sustancia producida por el
metabolismo de organismos vivos,
principalmente hongos microscópicos
y bacterias, que posee la propiedad de
inhibir el crecimiento o destruir
microorganismos”.

Prontosilo
Penicilina
Quimioterapéuticos…

Interferencia con el metabolismo...

Sulfonamidas y Trimetoprim: interfieren con el metabolismo del ácido fólico, que
es un precursor de la síntesis de purinas, pirimidinas y aminoácidos. Se bloquea la
síntesis de ácidos nucleicos y pared celular.

Se usan generalmente combinados, ya que producen un efecto sinérgico, en

infecciones respiratorias, urinarias y gastroenteritis por Shigella y Salmonella.
Quimioterapéuticos que inhiben la síntesis de DNA:
Quinolonas y Nitroimidazoles

1. Quinolonas, ácido nalidíxico: se unen a la DNA girasa,

girasa,
enzima que mantiene el estado de sobreenrrollamiento del
DNA. La unión del antibiótico al complejo DNA-
DNA-girasa inhibe
la replicación del DNA.
Las quinolonas y las nuevas fluoroquinolonas, como
ciprofloxacina, norfloxacina y ofloxacina son antibióticos de
amplio espectro y especialmente utilizados en infecciones
urinarias y en infecciones por Escherichia coli y Salmonella.
2. Nitroimidazoles
Nitroimidazoles:: el grupo Nitro es reducido por una
proteína de bacterias anaeróbicas. La droga reducida
produce ruptura del DNA.
DNA.
Son activas frente a anaerobios y protozoos.
protozoos.