Lectura previa introductoria

• The role of 3D genome organization in development and cell

differentiation (PDF adjunto): https://www.nature.com/articles/s41580-
019-0132-4
 ÁCIDOS NUCLEICOS Y CONDENSACIÓN DEL ADN

• Ácidos nucleicos: estructura, formas y funciones.

• Condensación del ADN.
 Objetivos del tema a ver:

• Conocer la estructura, composición y funciones de los ácidos nucleicos

y contrastar sus diferentes tipos.
• Entender los principios de la condensación del ADN y relacionar la
condensación del ADN y los principios de la expresión genética.
 Ácidos nucleicos

• Son polinucleótidos
esenciales para la
todas las formas de
vida conocidas:

• ADN (ácido
desoxirribonucleico).
• ARN (ácido
ribonucleico).
 Ácidos nucleicos

• Cada nucleótido tiene tres componentes: un azúcar de 5 carbonos, un

grupo fosfato y una base nitrogenada.
• Si el azúcar es desoxirribosa, el polímero es ADN.
• Si el azúcar es ribosa, el polímero es ARN.

Ribosa Desoxirribosa
Ácidos nucleicos

• Función: codificación,
transmisión y
expresión de la
información genética.
• La información
contenida depende de
la secuencia específica
de nucleótidos del
ácido nucleico (ADN o
ARN).

ARN vs ADN
Ácidos nucleicos

Enlace fosfodiéster

Estructura
de un
nucleótido
 Ácidos nucleicos

Cada nucleótido consta de tres componentes: una base de purina o

pirimidina (a veces denominados base nitrogenada o simplemente
base), un azúcar pentosa, y un grupo fosfato. A la subestructura
formada por un azúcar y una base se le denomina nucleósido.
 Ácidos nucleicos
• Composition molecular y tamaño:
• Son generalmente moléculas muy grandes (las moléculas del ADN
son individualmente las más grandes conocidas).
• Hay gran variación en tamaño (Ej. ARN interferente pequeño
contiene 21 nucleótidos, mientras que el cromosoma humano 1
contiene 247 millones de pares de bases).
• En general, el ADN es una molécula de doble cadena y el ARN es de
cadena simple.
• Hay excepciones:
• Algunos virus ARN presentan doble cadena (rotavirus,
gastroenteritis en niños)
• Algunos virus ADN presentan cadena simple (parvovirus,
gastroenteritis canina).
• En algunas circunstancias el ADN puede tener cuatro
cadenas ("cuádruple hélice" del ADN –conocido como G-
quadruplex, en regiones ricas en guanina y parece estar
relacionado con el proceso de replicación del ADN).
Ácidos nucleicos

En general, ADN es
una molécula de
doble cadena y el
ARN es de cadena
simple.
 Ácidos nucleicos

ADN, doble cadena

Cuádruple hélice del ADN

o G-quadruplex

The Structure and Function of DNA G-Quadruplexes: https://www.cell.com/trends/chemistry/fulltext/S2589-5974(19)30174-1

 Ácidos nucleicos

Un bucle de horquilla a
partir de un pre ARN
mensajero (pre-ARNm).
Una cadena de ARN se
pliega sobre sí misma.
bases (verde) y
esqueleto de ribosa-
fosfato (azul).

Estructura química del ARN

 Ácidos nucleicos

Par de bases GC con tres Par de bases AT con dos

puentes de hidrógeno. puentes de hidrógeno.
 Ácidos nucleicos
• Los ácidos nucleicos difieren en el azúcar de sus nucleótidos:
• ADN: 2' desoxirribosa y ARN: ribosa (grupo hidroxilo, HO- en C2´).
• También difieren en una base: la timina es reemplazada por el uracilo en
ARN (las demás bases se comparten).
• La cadena principal se forma por la unión de azúcares y fosfatos a través de
enlaces fosfodiéster.
• Nomenclatura convencional: C al que el grupo fosfato se une es el
extremo 3' (3 prima) y C al que el grupo fosfato se une es el extremo 5' (5
prima). Lo que da a los ácidos nucleicos direccionalidad, y los extremos
de la molécula de ácido nucleico se refieren como extremo 5' y extremo 3'.
• Las bases se unen a los azúcares a través de un enlace N-glicosídico que
conecta un nitrógeno del anillo de la base (N-1 para pirimidinas y N-9 para
las purinas) y el C1 del anillo de azúcar de pentosa.
Ácidos nucleicos
 Diferencia en la estabilidad del ADN y ARN:

Ribosa Desoxirribosa

ARN es más susceptible de

degradarse por el ozono en el
aire, el agua (iones hidronio o
hidroxilo, la deshidratación lo
protege contra la degradación) y
nucleasas.

Sirakov, I. N, 2016, Nucleic Acids-from Basic Aspects to Laboratory Tools, 1, p2

Estabilidad del ADN y ARN:
ADN de doble cadena más estable
(previene el acceso de electrófilos
extraños, no posee un OH en 2’ de
la pentosa, la timina es más
resistente a la fotomutación que el
uracilo).
ARN es más susceptible a
degradación (aunque el ARN de
doble cadena es mas estable)
debido a la presencia de OH en 2’
de la pentosa (enzimas como la
ribonucleasa A que posee histidina
en su sitio activo, utiliza la catálisis
ácido-base para eliminar los
protones de los OH en 2’, los
oxígenos con carga negativa
realizan un ataque nucleofílico a los
Sirakov, I. N, 2016, Nucleic Acids-from Basic
enlaces fosfodiéster de la cadena). Aspects to Laboratory Tools, 1, p2
 Ácidos nucleicos

Direccionalidad de los ácidos

nucleicos: los extremos se
refieren como extremo 5' y 3'.
 Ácidos nucleicos
Direccionalidad de los
ácidos nucleicos: Los
surcos (hendiduras) mayor y
menor están uno frente al
otro, a lo largo del ADN de
doble cadena. Los surcos se
generan a partir de la
disposición antiparalela de
las dos cadenas de ADN. Los
surcos son importantes en la
interacción con las
proteínas como en el caso de
la replicación y trascripción.

Video, DNA major and minor grooves: https://www.mun.ca/biology/scarr/MGA2_02-

https://www.youtube.com/watch?v=QD1TjeszTHQ 07.html
 Ácidos nucleicos

• El C3' y el C5' de las pentosas

(ribosa para ARN y desoxirribosa
para ADN) se unen a través de
grupos fosfato mediante enlaces
fosfodiéster (con una alta carga
negativa).
 Ácidos nucleicos
• Topología:
• ADN y ARN de doble cadena al tener secuencias complementarias, (modelo
de Watson-Crick) se limitan a forman una estructura tridimensional de doble
hélice bastante uniforme.
• Por el contrario, el ARN y ADN de cadena simple no están limitados, y pueden
adoptar estructuras tridimensionales de alta complejidad.
• Por lo general no son ramificados: lineales o circulares.
• Los cromosomas bacterianos, plásmidos, ADN mitocondrial, ADN de
cloroplastos son moléculas de ADN bicatenario, generalmente circulares.
• Los cromosomas de eucariotas son moléculas de ADN de doble cadena
generalmente lineales.
• La mayoría de las moléculas de ARN son moléculas lineales, de cadena
sencilla, pero moléculas circulares y ramificadas pueden resultar a partir
del proceso de empalme (proceso post-transcripcional de maduración del
ARN).
Video, STRUCTURE OF DNA: https://www.youtube.com/watch?v=0E4p34mqJbg
 Ácidos nucleicos

Estructura química
del ADN. Los
puentes de
hidrógeno se
muestran como
líneas de puntos

La estructura de una parte

de una doble hélice de
ADN Video, The Structure of DNA: https://www.youtube.com/watch?v=o_-6JXLYS-k
 Conformaciones naturales del ADN:

El ADN es una molécula muy

flexible que presenta
diferentes conformaciones
dependiendo del ambiente
en que se encuentre. El
ADN de doble hélice de
origen natural se clasifica
en los tipos A, B y Z (las
formas A y B son las formas
con giro a la derecha y Z
con giro a la izquierda).

http://www.bch.cuhk.edu.hk/vr_biomolecules/different-form-of-dna.html
 Conformaciones naturales del ADN:
Forma B: la más común y
existe en condiciones
fisiológicas normales
(descubierta por Watson y
Crick). La estructura es
asimétrica con surcos
mayores y surcos menores
presentes alternativamente.
En una vuelta hay 10 pares
de bases con una longitud de
3.4nm. La distancia entre
desoxirribonucleótidos
adyacentes es de 0,34 nm. El
ancho de la hélice es de 2 https://www.intechopen.com/books/dna-replication-current-
nm. advances/dna-structure-alphabet-soup-for-the-cellular-soul
http://www.bch.cuhk.edu.hk/vr_biomolecules/different-form-of-dna.html
 Conformaciones naturales del ADN:
Forma A: Aparece cuando la
humedad relativa del
ambiente es inferior al 75%,
rara vez presente en
condiciones fisiológicas
normales. La molécula es
asimétrica y en cada vuelta se
pueden observar los surcos
mayores y los surcos
menores. Una vuelta de la
hélice consiste en 11 pares de
bases con una longitud de
2.86nm. El ancho de la hélice
de 2,3 nm. En general, más https://www.intechopen.com/books/dna-replication-current-
ancho que el B-DNA. advances/dna-structure-alphabet-soup-for-the-cellular-soul
http://www.bch.cuhk.edu.hk/vr_biomolecules/different-form-of-dna.html
 Conformaciones naturales del ADN:
Forma Z: apariencia en
zigzag. Ancho hélice es de
1,8 nm. Presenta de ranuras
mayores y menores. Una
vuelta tiene 12 pares de
bases y la longitud es de
4.56nm. La distancia entre
dos desoxirribonucleótidos
adyacentes es de 0,37 nm. Es
difícil de observar porque es
inestable. Puede participar en
procesos de regulación de
expresión genética o en
recombinación genética. Se https://www.intechopen.com/books/dna-replication-current-
puede encontrar en bacterias, advances/dna-structure-alphabet-soup-for-the-cellular-soul
eucariotas y virus. http://www.bch.cuhk.edu.hk/vr_biomolecules/different-form-of-dna.html
Ácidos nucleicos
 Ácidos nucleicos

ARN de transferencia
 Ácidos nucleicos

Las bacterias contienen su cromosoma

como ADN circular. Por lo general, todo el ADN mitocondrial humano con
genoma es un solo círculo, pero a menudo hay los 37 genes en sus respectivas
círculos extras que son llamados plásmidos. cadenas H y L.
 La termodinámica del ADN
• Es el estudio de cómo la temperatura
afecta a la estructura del ADN de
doble cadena.
• La temperatura de fusión (Tm) se
define como la temperatura a la que la
mitad de las cadenas de ADN están
en separadas como cadenas
sencillas.
• Tm depende de la longitud de la
molécula de ADN y su secuencia
específica de nucleótidos (puentes de
hidrógeno).
• ADN desnaturalizado: cuando se han
disocian sus dos cadenas debido a la
alta temperatura.
Oligonucleotide Melting Temperature — Tm of DNA: https://www.sigmaaldrich.com/technical-
documents/articles/biology/oligos-melting-temp.html
 La termodinámica del ADN

Renaturalización del ADN: las

cadenas de ADN separadas por
el aumento de temperatura
vuelven a emparejarse de nuevo
al reducirse la temperatura
(formación de puentes de
hidrogeno entre las bases).

Oligo Calc: Oligonucleotide Properties Calculator:

http://biotools.nubic.northwestern.edu/OligoCalc.html
Melting Temperature (Tm) Calculation:
http://insilico.ehu.es/tm.php?formula=basic
OligoEvaluator™:
http://www.oligoevaluator.com/OligoCalcServlet
 Preguntas

• Diga cómo se conforma un nucleótido.

• Diga cómo se conforma un nucleósido.
• Mencione las diferencias básicas entre ADN y ARN.
• Explique en qué consiste la direccionalidad del ADN.
• Diga cómo se une la pentosa al fosfato y a la base.
• Diferencie las diferentes conformaciones naturales del ADN y por qué se
presentan.
• Explique qué tienen en común un cromosoma bacteriano y el ADN
mitocondrial humano.
• Explique de qué depende la temperatura de fusión del ADN y por qué.
 Enlaces para consultar
• Genetics Review:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/MLACourse/Original8Hour/Genetics/nucleotide.h
tml
• DNA vs. RNA – 5 Key Differences and Comparison:
https://www.technologynetworks.com/genomics/lists/what-are-the-key-differences-
between-dna-and-rna-296719
• DNA and RNA: https://cm.jefferson.edu/learn/dna-and-rna/
• Separating and Segregating the Human Mitochondrial Genome:
https://www.cell.com/trends/biochemical-sciences/fulltext/S0968-0004(18)30158-0
• A Guide for Mitochondrial DNA Analysis in Non-Human Forensic Investigations:
https://www.researchgate.net/publication/230558046_A_Guide_for_Mitochondrial_D
NA_Analysis_in_Non-Human_Forensic_Investigations
• Temperature of Melting:
http://www.austincc.edu/mlt/mdfund/mdfund_unit9assignmentsMeltingTemperature.
html
 Enlaces para consultar
• Spiegel, J., Adhikari, S., & Balasubramanian, S. (2020). The structure and function
of DNA G-quadruplexes. Trends in Chemistry, 2(2), 123-136:
https://www.cell.com/trends/chemistry/fulltext/S2589-5974(19)30174-1
• Ho, P. S., & Carter, M. (2011). DNA structure: alphabet soup for the cellular soul. In
DNA Replication-Current Advances. IntechOpen.
https://www.intechopen.com/books/dna-replication-current-advances/dna-structure-
alphabet-soup-for-the-cellular-soul
• Sirakov, I. N. (2016). Nucleic acid isolation and downstream applications. Nucleic
Acids-from Basic Aspects to Laboratory Tools, 1.
https://www.intechopen.com/books/nucleic-acids-from-basic-aspects-to-laboratory-
tools/nucleic-acid-isolation-and-downstream-applications
Condensación del ADN
Condensación del ADN
 Condensación del ADN
• El proceso de empaquetamiento de las moléculas de ADN in vitro o in
vivo.
• Es esencial para el proceso de regulación de los genes.
• El diámetro del ADN es ∼ 2 nm, y su la longitud estirado puede ser de
varias decenas de centímetros.
• En bacterias (procariotas):
• El ADN bacteriano se embala con la ayuda de poliaminas y
proteínas.
• ADN asociado a proteínas ocupa aproximadamente 1/4 del volumen
intracelular formando una fase viscosa concentrada con
propiedades cristalinas líquidas, llamada nucleoide.
• Un empaquetamiento del ADN similar existe también en los
cloroplastos y mitocondrias.
 Condensación del ADN

Organización topológica del cromosoma bacteriano

 Condensación del ADN
• En bacterias
(Continuación):
• La mayoría de las
bacterias contienen
un solo cromosoma
circular (2-8
megabases) que
debe ser
compactado más de
1.000 veces.
• El mecanismo
principal de
compactación es
mediado por el Superenrollamiento
superenrollamiento Superenrollamiento
negativo (hélice
negativo del ADN. positivo (hélice
infraenrollada).
sobreenrollada).
 Condensación del ADN
• En bacterias (Continuación):
• La homeostasis de superenrollamiento se rige básicamente por
las acciones opuestas de ADN girasa, que introduce
superenrollamiento negativos, y topoisomerasa I (Topo I) que los
relaja.

La girasa (topoisomerasa II ) rompe La topoisomerasa I rompe una cadena

ambas cadenas del ADN produciendo del ADN eliminando
superenrollamiento negativo. superenrollamiento negativo.
 Condensación del ADN
• En bacterias (Continuación):
• La mitad del cromosoma está restringido por abundantes pequeñas
proteínas que se unen de forma específica e inespecífica al ADN
(equivalente bacteriano de las histonas eucariotas). Ej. En E. coli, las
principales proteínas de esta clase son HU, IHF, Fis y H-NS.
 Condensación del ADN
• En bacterias (Continuación):
• El complejo de condensina SMC (proteínas SMC, ScpA, y ScpB)
parece restringir los bucles del ADN formando puentes, trabajando
en conjunto con el superenrollamiento y las pequeñas proteínas
asociadas al ADN.

Mecanismo hipotético para la

condensación de ADN por los
complejos de proteínas SMC.
 Condensación del ADN
• En bacterias (Continuación):
• El nucleóide se organiza en estructuras de orden superior llamadas
macrodominios (de 800 kb - 1 Mb en E. coli), se sugiere que proteínas se unen
a secuencias específicas al ADN que participan en esta organización de orden
superior. Ej. proteína de unión al ADN (MatP) que se une a las secuencias
matS.

El cromosoma de E. coli está organizado Estructura del complejo MatP-matS

en cuatro macrodominios. E. coli (izquierda) y estructura del dímero.
expresando derivados fluorescentes de matP.
 Condensación del ADN eucariotas:
• Típicamente de una longitud de decenas de centímetros se empaca
ordenadamente en el núcleo para su fácil acceso con la ayuda de las
proteínas histonas.
• El nivel básico de la compactación es el nucleosoma:
• El ADN se enrolla alrededor de un octámero de histonas (dos copias
de cada histona: H2A, H2B, H3 y H4).
• La histona enlazadora H1 (H1) se une al ADN entre nucleosomas,
facilitando el embalaje del ADN enrollado alrededor del nucleosoma
(10 nm de cadena nucleosomal) en una fibra más condensada de 30
nm.
 Condensación del ADN eucariotas:

Las histonas son proteínas altamente alcalinas que se encuentran en los núcleos
de las células eucariotas que empaquetan y ordenan el ADN en unidades
estructurales llamado nucleosomas. Estas importantes proteinas de la cromatina
actuan como carretes sobre los que se envuelve el ADN, jugando un papel en la
regulación génetica.
 Condensación del ADN eucariotas:

Nucleosoma: unidad básica de

empaquetamiento del ADN en
eucariotas. Consiste en un segmento
de ADN envuelto (dos veces)
alrededor de ocho histonas.
Condensación del ADN eucariotas:
En general, hay tres niveles de organización
de la cromatina (ADN y proteínas en distintos
grados de condensación):
• ADN se envuelve alrededor de las proteínas
histonas que forman los nucleosomas,
formando una estructura como las "cuentas
de un collar" (eucromatina).
• Múltiples histonas se envuelven en una
fibra 30 nm que consiste en matrices de
nucleosomas en su forma más compacta
(heterocromatina).
• Empaquetamiento de alto nivel de la fibra del
ADN de 30 nm en el cromosoma de metafase
(durante la mitosis y meiosis).
Video, Chromatin packaging in neurons:
https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-01/hhmi-
ntr011020.php
 Condensación del ADN eucariotas:

Entre divisiones celulares, la cromatina es optimiza para permitir el fácil

acceso de los factores de transcripción a los genes activos, formando una
estructura menos compacta llamada eucromatina, y para facilitar el acceso
de proteínas a regiones más apretadas llamados heterocromatina.

Niveles de organización de la cromatina

 Condensación del ADN eucariotas:
• Proteínas de condensación de la cromatina:
• Condensinas: complejos de proteínas que intervienen en son
organización y segregación cromosomal.
• Hay dos tipos:
• Condensina II: involucrada en las etapas iniciales de la
condensación de los cromosomas (profase). Encontradas en
el núcleo celular en interfase.
• Condensina I: gana acceso a los cromosomas después que la
envoltura nuclear se rompe (final de profase). Presente en el
citoplasma en la interfase.
• En prometafase y metafase ambas condensinas
contribuyen a condensar y ensamblar los cromosomas
(donde las dos cromátidas hermanas son resueltas).
• Cohesinas (similares a las condensinas): intervienen en la cohesión
de cromátides hermanas.
Packing a Genome, Step-by-Step: https://www.hhmi.org/news/packing-genome-step-by-step
 Condensación del ADN eucariotas:

Las condensinas (rojo) sólo se asocian con los

cromosomas cuando se condensan (profase a anafase).
 Condensación del ADN eucariotas:

(A) Dimero de condensina o cohesina, (B) Cohesion mediada por

cohesina entre cromátidas hermanas, (C) Bobinado (formación de
vueltas) de ADN por Condensina.
 Condensación del ADN eucariotas:

Niveles de organización de la cromatina

Las condensinas son complejos de proteínas que desempeñan un papel
fundamental en la organización estructural y funcional de los
cromosomas.
 Condensación del ADN eucariotas:
• La cromatina presenta diversos cambios estructurales durante un ciclo celular
• Las histonas son modificadas para alterar el empaquetamiento de la
cromatina (modificaciones post-traduccionales).
• La mayoría de dichas modificaciones se producen en la cola de la
histona, según el amino acido modificado en la histona, la accesibilidad
a la cromatina y su compactación variara.
• Ej.
• La acetilación de histonas resulta en un aflojamiento y aumento de la
accesibilidad a la cromatina para los procesos de replicación y
transcripción.
• Lisina tri-metilación puede ser correlacionada con la actividad
transcripcional (tri-metilación de la histona H3 lisina 4) o represión de
la transcripción y compactación de la cromatina (tri-metilación de la
histona H3 lisina 9 o 27).

Histones: At the Crossroads of Peptide and Protein Chemistry https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4378460/

 Condensación del ADN
eucariotas:
Diferentes modificaciones post-
traduccionales ocurren en el extremo
N de H3: acetilación (bandera verde), la
fosforilación (círculo gris), y la
metilación (hexágono amarillo).
 Condensación del ADN eucariotas:
• Cromatina: complejo de macromoléculas formado por ADN, proteínas y ARN.
• Funciones principales:
• Empaquetar el ADN en un volumen muy pequeño.
• Reforzar el ADN para permitir la mitosis y evitar daños en el ADN.
• Controlar la expresión génica y la replicación del ADN.
• La estructura de la cromatina depende de varios factores:
• La etapa del ciclo celular: en interfase, la cromatina es
estructuralmente suelta para permitir el acceso a las polimerasas de
ARN y ADN para transcribir o replicar el ADN.
• La estructura local de la cromatina en interfase depende de los genes
presentes en el ADN. El ADN que codifica genes que se transcriben
activamente (encendidos) están empaquetados de manera más
flexible y se encuentran asociados con ARN polimerasas (referido
como eucromatina).
• Tipos de cromatina en interfase: la cromatina toma dos formas diferentes,
eucromatina y heterocromatina.
 Condensación del ADN eucariotas:
• Cromatina:
• Tipos de cromatina:
• Eucromatina: una forma ligeramente empacada de cromatina que
presenta ADN activo (genes). Presenta una alta concentración de
genes (a menudo asociada con la transcripción). La parte de la
eucromatina que no se transcribe normalmente se convierte en la
heterocromatina.
• Heterocromatina: forma apretada de la cromatina que generalmente se
relaciona con ADN inactivo, y está implicada en mantener la
integridad de los cromosomas, junto con la regulación genética.
• La heterocromatina se divide en dos tipos: constitutiva y facultativa.
• Heterocromatina constitutiva: contiene regiones de ADN que no
están bien expresados. A menudo se encuentran cerca de las zonas
de los centrómeros y telómeros de los cromosomas.
• Heterocromatina facultativa: es más variable que la constitutiva.
Se ha asociado con procesos tales como la morfogénesis o
diferenciación y puede resultar en el silenciamiento de un
cromosoma entero.
 Condensación del ADN eucariotas:
• Cromatina:
• Tipos de cromatina:
• La heterocromatina facultativa está compuesta de regiones que
pueden ser transcripcionalmente activas en determinadas células
y bajo determinadas circunstancias. Ej. En el caso de el
cromosoma X, uno de los cromosomas del par X es activo y
permanece eucromático mientras que el otro es heterocromático
(inactivo transcripcionalmente), por ello y durante la interfase forma
el corpúsculo de Barr.
Un cuerpo de Barr es un cromosoma X inactivo
en una célula somática de una hembra (en un
proceso llamado lionization). Esto ocurre
temprano en el desarrollo embrionario. El
cromosoma X inactivo es silenciado al ser
empaquetado en forma de heterocromatina.
Video, Barr Body Slide Preparation Practical Experiment:
https://www.youtube.com/watch?v=hLt884HV8bE
 Condensación del ADN eucariotas:
• Cromatina:
• Actividad de la cromatina:
• La heterocromatina: al ser muy compacta tiene poca actividad. Se
localiza en los bordes del núcleo.
• La heterocromatina constitutiva: es repetitiva y forma los
centrómeros y telómeros.
• La heterocromatina facultativa: no es repetitiva y esta formada por
genes que son silenciados. Puede llegar a activarse en algún
momento.
• La eucromatina: es la región activa y tiene una alta densidad de genes,
con ARN y proteínas. Está situada más cerca del centro del núcleo y
por lo general actúa en la producción de proteínas.
 Condensación del ADN eucariotas:
ADN teñido con un colorante. En
células que no se están dividiendo,
los cromosomas se ven como ovillo
desenrollado, mientras que en una
célula en división se parecen más a
barras.

Video, Real Microscopic Mitosis:

https://www.youtube.com/watch?v=L61Gp_d7evo
 Puntos claves:
• Ácidos nucleicos son polinucleótidos esenciales para la vida (ADN y
ARN).
• Cada nucleótido tiene tres componentes: un azúcar de 5 carbonos, un
grupo fosfato y una base nitrogenada. La base purina o pirimidina, un
azúcar pentosa, y un grupo fosfato (un nucleósido está formado por
una azúcar y una base).
• Los ácidos nucleicos difieren en el azúcar (ADN: 2' desoxirribosa y
ARN: ribosa con grupo hidroxilo, HO- en C2'). También difieren en una
base (timina es reemplazada por el uracilo en ARN).
• Cadena principal formada por la unión de azúcares y fosfatos a través
de enlaces fosfodiéster C3’ o C5', el C al que se une al fosfato da la
direccionalidad a los ácidos nucleicos (C de la pentosa se une al O del
grupo fosfato).
 Puntos claves:
• Las bases se unen al C1 del azúcar a través de un enlace N-glicosídico
(une un N del anillo de la base, N-1 para pirimidinas y N-9 para las
purinas).
• Purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (citosina, timina y uracilo).
Parejas que forman son C:G (tres puentes de H) y A:T (dos puentes de
H).
• La temperatura de fusión (Tm): temperatura a la que la mitad de las
cadenas de ADN están en separadas como cadenas sencillas y
depende de la longitud de la molécula de ADN y su secuencia
específica de nucleótidos (# puentes de hidrógeno).
• ADN desnaturalizado se separan sus cadenas (se rompen los puentes
de H).
 Puntos claves:
• La condensación del ADN es el empaquetamiento de las moléculas de ADN, el
cual es esencial para el proceso de regulación de los genes (diámetro ADN es
∼ 2 nm, y su longitud estirado puede ser de varias decenas de centímetros).
• Mayoría bacterias contienen un cromosoma circular (2-8 megabases) que debe
ser compactado más de 1.000 veces, su mecanismo principal de compactación
es mediado por el superenrollamiento negativo del ADN (hélice infraenrollada).
Girasa (topoisomerasa II) rompe ambas cadenas del ADN produciendo
superenrollamiento negativo y la topoisomerasa I rompe una cadena del ADN
eliminando el superenrollamiento negativo.
• En bacterias el cromosoma está restringido por muchas proteínas pequeñas
que se unen de forma específica e inespecífica al ADN (Ej. E. coli tiene HU,
IHF, Fis y H-NS, equivalente bacteriano de las histonas eucariotas).
• En bacterias el nucleóide se organiza en estructuras de orden superior
llamadas macrodominios (de 800 kb - 1 Mb en E. coli), se sugiere que
proteínas se unen a secuencias específicas al ADN.
 Puntos claves:
• En eucariotas el nivel básico de la compactación es el nucleosoma (ADN se
enrolla, aproximadamente dos veces, alrededor de un octámero de histonas
(dos copias de cada histona: H2A, H2B, H3 y H4). La histona enlazadora H1
(H1) se une al ADN entre nucleosomas, facilitando el embalaje del ADN.
• Condensinas son proteínas de condensación de la cromatina: condensina II
(en las etapas iniciales de la condensación de los cromosomas (profase) y
condensina I: gana acceso al final de profase. En prometafase y metafase
ambas condensinas contribuyen a condensar y ensamblar los cromosomas
(donde las dos cromátidas hermanas son resueltas).
• Cohesinas (similares a las condensinas): intervienen en la cohesión de
cromátides hermanas.
• Las histonas son modificadas postraduccionalmente para alterar el
empaquetamiento de la cromatina (mayoría de dichas modificaciones se
producen en la cola de la histona, N- terminal), según el amino acido
modificado, la compactación de la cromatina variara (Ej. Acetilación de
histonas resulta en aflojamiento y aumento de la accesibilidad a la cromatina
para los procesos de replicación y transcripción).
 Puntos claves:
• La cromatina es un complejo de macromoléculas formado por ADN,
proteínas y ARN, la cual sirve para empaquetar el ADN, reforzar lo en
la mitosis (evitar daños en el ADN) y controlar su expresión génica y
replicación.
• la cromatina toma dos formas diferentes, eucromatina y
heterocromatina.
• La eucromatina es una forma ligeramente empacada de cromatina
que presenta ADN activo (genes), a menudo asociada con la
transcripción.
• La heterocromatina es la forma apretada de la cromatina,
generalmente se relaciona con ADN inactivo y está implicada en
mantener la integridad de los cromosomas, junto con la regulación
genética.
 Puntos claves:
• La heterocromatina se divide en dos tipos: constitutiva (regiones de
ADN que no están bien expresadas, cerca de centrómeros y telómeros
de los cromosomas) y facultativa (más variable que la constitutiva,
asociada con procesos como morfogénesis o diferenciación, puede
resultar en el silenciamiento de un cromosoma entero, como el X en
hembras para formar el cuerpo de Barr).
• La heterocromatina constitutiva es repetitiva (forma los centrómeros y
telómeros), la heterocromatina facultativa no es repetitiva y está
formada por genes que son silenciados (puede llegar a activarse en
algún momento) y la eucromatina es la región activa y tiene una alta
densidad de genes, con ARN y proteínas (situada más cerca del centro
del núcleo y por lo general actúa en la producción de proteínas).
 Preguntas
Explique en general que implicaciones tiene la organización tridimensional del
genoma en los diferentes procesos celulares y en general como ocurre.
Diga en general como se realiza el empaquetamiento del ADN en bacterias.
Diga cuál es el nivel básico de empaquetamiento del ADN en eucariotas y como
está conformado.
Diga cuales son las proteínas de la cromatina y en que participan en general.
Diga que modificaciones ocurren en las histonas, donde y que efectos tienen
sobre el empaquetamiento del ADN.
¿Por qué se dice que la estructura de la cromatina varía de acuerdo a la etapa
del ciclo celular?
Mencione cuales son los tipos de heterocromatina, en qué se diferencian
básicamente, de que se componen y donde se encuentra.
¿Qué es un cuerpo de Barr, cuando se forma, de donde, en que células?
Diga cuál es la cromatina más activa y por qué.
 ENLACES PARA CONSULTAR
• DNA Packaging: Nucleosomes and Chromatin:
https://www.nature.com/scitable/topicpage/dna-packaging-nucleosomes-and-chromatin-
310
• How DNA Is Packaged: https://www.hhmi.org/biointeractive/how-dna-packaged
• An Overview of Chromatin-Regulating Proteins in Cells:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4932839/
• Chromosomes: https://www.nature.com/scitable/topicpage/chromosomes-14121320
• How the cell cycle impacts chromatin architecture and influences cell fate:
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2015.00019/full
• Euchromatin and Heterochromatin:
http://medcell.med.yale.edu/histology/cell_lab/euchromatin_and_heterochromatin.php
• Difference Between Heterochromatin and Euchromatin:
https://biodifferences.com/difference-between-heterochromatin-and-euchromatin.html
• Müller, M. M., & Muir, T. W. (2015). Histones: at the crossroads of peptide and protein
chemistry. Chemical reviews, 115(6), 2296-2349.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4378460/
 ENLACES PARA CONSULTAR
• Johan H. Gibcus et al., “A Pathway for Mitotic Chromosome Formation.” Science.
Published online January 18, 2018. doi: 10.1126/science.aao6135.
https://www.hhmi.org/news/packing-genome-step-by-step