CAPITULO 1

Introducción a
la Microbiología

1.1 Microbiología

1.2 Los microorganismos

como células

1.3 Los virus, entes

microscópicos no
celulares

1.4 Células eucariotas y

procariotas

1.5 Posición de los

Louis Pasteur (1822 – 1895)
Químico y Biólogo Francés que
fundó la ciencia de la
Microbiología, demostró la teoría
de los gérmenes como causantes
de enfermedades (patógenos),
inventó el proceso que lleva su
nombre y desarrolló vacunas
contra varias enfermedades
incluida la rabia.
microorganismos en la
naturaleza
1.6 Taxonomía y filogenia
1.7 Algunos trabajos claves
en microbiología
1.8 El inicio de la genómica
microbiana y la
post-genómica

1.9 Referencias
bibliográficas

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

1.1 Microbiología

La Microbiología es el estudio de un grupo amplio y diverso de organismos microscópicos

que existen como células aisladas o asociadas. Los microorganismos incluyen bacterias, hongos,
protozoarios y virus que aunque son microscópicos no son celulares. La Microbiología analiza la
diversidad microbiana y su evolución así como el rol de los microorganismos en el mundo en general,
en la sociedad humana, en el cuerpo humano y en animales y plantas.
La Microbiología gira en torno a dos temas fundamentales, uno básico y otro aplicado. Como
ciencia básica, la Microbiología suministra algunas de las herramientas de investigación más versátiles
para determinar la naturaleza de los procesos característicos de la vida. Los sofisticados conocimientos
que poseemos sobre los principios físicos y químicos que gobiernan los procesos vitales han surgido de
estudios con microorganismos. Esto se debe a que los microorganismos comparten con las células de
los organismos pluricelulares muchas propiedades bioquímicas. Además, las células microbianas
pueden alcanzar elevadas densidades de población en cultivo y son fácilmente manipulables para
estudios genéticos. Ejemplo el conocimiento del ADN surgió de un estudio de transferencia genética en
bacterias.
Como ciencia biológica aplicada, la Microbiología se ocupa del rol de los microorganismos en
diferentes sectores como la industria de alimentos. Los productos agrícolas o los animales en
explotaciones ganaderas deben llegar a los consumidores con calidad sanitaria. Los microorganismos
tienen gran importancia en la industria alimentaria porque pueden ocasionar el deterioro de los
alimentos y ocasionar pérdidas económicas inmensas. Las industrias de enlatado, congelado, desecado
de alimentos y otras, tienen como finalidad acondicionar los alimentos de tal modo que no sufran
deterioro. Los microorganismos causantes de enfermedades y transmitidos por alimentos también son
dignos de consideración. Los alimentos deben estar adecuadamente preparados y controlados para
evitar la transmisión de enfermedades, ya que el alimento apto para el consumo humano puede servir
también para sustentar el crecimiento de muchos microorganismos.
No todos los microorganismos tienen efectos indeseables sobre los alimentos o sobre los
consumidores. Por ejemplo, los productos lácteos, como queso, yogurt, mantequilla, que se
manufacturan en gran medida por la actividad microbiana, son de gran valor económico. De modo
similar, productos de importancia en la industria alimentaria como encurtidos, bebidas alcohólicas,
ácido cítrico, acético, enzimas y otros son obtenidos por actividad microbiana.

1.2 Los microorganismos como células

Microorganismo es un organismo que no se puede observar a simple vista (microscópico),
constituido por una célula o varias, incluyendo los virus. La célula es la unidad fundamental de toda
materia viva. La célula es una entidad aislada de otras células por una membrana celular y en algunos
casos por una pared celular. Contiene una variedad de estructuras (núcleo o nucleoide, citoplasma) y
componentes químicos (proteínas, ácidos nucleicos, lípidos, polisacáridos), que hacen posible su
funcionamiento.
Todos los organismos celulares son estructuras altamente organizadas que muestran alguna
forma de metabolismo. Esto es, las células toman sustancias químicas del medio y las transforman,
conservan parte de la energía liberada, de modo que las células pueden usarla y luego eliminan los
productos de desecho. Todas las células poseen reproducción, es decir, son capaces de dirigir una serie
de reacciones bioquímicas que conducen a su propia síntesis. Como resultado de los procesos
metabólicos, una célula crece y se divide para formas dos células. Muchas células sufren
diferenciación, un proceso por el que se transforman nuevas sustancias o estructuras. A menudo, la

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

diferenciación celular es parte de un ciclo vital en el que las células forman estructuras especiales
relacionadas con la reproducción, la dispersión o la supervivencia.
Las células responden a señales químicas en su medio ambiente, tales como las producidas
por otras células. Por tanto pueden comunicarse e incluso estimar su propio número en el ambiente
circundante por medio de pequeñas moléculas que se difunden y pasan entre células vecinas. Con
frecuencia los organismos vivos tienen movimiento por autopropulsión, y en el mundo microbiano
existen diferentes mecanismos responsables de la movilidad. Finalmente, a diferencia de las estructuras
inertes, las células pueden evolucionar, cambiando permanentemente sus características y
transmitiendo las nuevas propiedades a su descendencia. De alguna forma, la primera célula debió
originarse a partir de una estructura no celular hace más de 3 800 millones de años. Después se
produjeron una serie de sucesos altamente probables, tales como el crecimiento y división,
originándose poblaciones de células a partir de las cuales tuvo lugar la evolución mediante la selección
de nuevas características y mayor diversidad.

1.3 Los virus, entes microscópicos no celulares

Los virus no son células. Carecen de muchos de los atributos de las células y no son sistemas
dinámicos abiertos. Una partícula vírica aislada es una estructura estática muy estable e incapaz de
cambiar o reemplazar sus partes constituyentes. Sólo cuando se asocia con una célula el virus es capaz
de replicarse y adquirir algunos de los atributos de un sistema vivo. Así, a diferencia de las células, los
virus no tienen metabolismo propio. Aunque poseen información genética (ADN o ARN) los virus
carecen de un sistema de traducción y usan la maquinaria de la célula para la síntesis de proteína. Los
virus infectan diversos organismos incluyendo a los microorganismos.

1.4 Células eucariotas y procariotas

Las células eucariotas son por lo general más grandes y estructuralmente más complejas que las
procariotas. Su característica diferencial es la presencia de estructuras limitadas por membranas
denominadas orgánulos que corresponden al núcleo, mitocondrias y cloroplastos. Los microorganismos
eucariotas son las algas, los hongos y los protozoos. Las células procariotas tienen una estructura
interna más simple y carecen de orgánulos o estructuras rodeadas por membranas (Tabla 1.1). Los
procariotas corresponden a las Bacteria y Archaea.
Los genomas presentan una organización diferente en células procariotas y eucariotas. En los
procariotas, el ADN se encuentra como una larga molécula de dos cadenas formando el cromosoma que
se condensa para originar una masa visible llamada nucleoide. En la mayoría de los organismos
procariotas el ADN es circular y en general poseen un cromosoma. Por esta razón la mayoría de los
procariotas contiene una copia de cada gen y son genéticamente haploides. Asimismo la mayoría de los
procariotas contienen ADN extracromosómico dispuesto de manera circular constituyendo los
plásmidos (que confieren propiedades especiales a las células pero no requeridas para la supervivencia).
En los eucariotas, el ADN se presenta dentro del núcleo en moléculas lineales empaquetadas en
un estado muy organizado formando los cromosomas. El número depende del organismo, por ejemplo
Saccharomyces cerevisiae contiene 16 cromosomas (ocho pares). El humano contiene 46 (23 pares).
Los cromosomas eucariotas además de ADN contienen también proteínas que favorecen el plegamiento
y empaquetamiento del ADN, así como otras proteínas necesarias para la expresión génica. Una
diferencia fundamental es que los eucariotas contienen dos copias de cada gen y son, por tanto
genéticamente diploides.

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Un procariota típico como la bacteria Escherichia coli contiene un cromosoma con ADN de
alrededor de 4,6 millones de pares de bases y cerca de 4 300 genes. Una célula eucariota como la de los
humanos contiene mil veces más ADN que E. coli y alrededor de siete veces su número de genes.

Tabla 1.1 Características diferenciales entre Procariotas y Eucariotas

Característica Procariotas Eucariotas
Organización del material genético
Membrana nuclear Ausente Presente
ADN con histonas No Si
Número de cromosomas Uno* Más de uno
Intrones en los genes Raro Común
Nucleolo Ausente Presente
Desarrollo de mitosis No Si
Recombinación genética Parcial transferencia unidireccional Meiosis y fusión gametos
Mitocondrias Ausentes Presentes
Cloroplastos Ausentes Presentes
Membrana plasmática con esteroles No** Si
Flagelos Submicroscópicos, Microscópicos,
una fibra 20 microtúbulos
Retículo endoplasmático Ausente Presente
Peptidoglicano Presente*** Ausente
Ribosomas 70 S 80 S
Lisosomas y peroxisomas Ausentes Presentes
Microtúbulos Ausentes o raros Presentes
Citoesqueleto Ausente Presente
Diferenciaciòn Rudimentaria Tejidos y órganos
*Algunas excepciones
** Excepción micoplasmas y metanótrofos
*** Excepción micopolasmas y arqueobacterias
Fuente: Prescott et al. 1999

1.5 Posición de los microorganismos en la naturaleza

Existen millones de organismos vivos en la naturaleza. El hombre en su afán de ordenarlos creó
la taxonomía ó Ciencia de la clasificación, nomenclatura e identificación.
 Carlos Linneaus, a mediados del siglo XVIII, ordenó a todos los seres vivos en dos reinos bien
definidos (según tipo de nutrición; fotosíntesis, absorción y ingestión).
Reino animalia: Organismos móviles, heterótrofos (absorción, ingestión)
Reino plantae: Organismos inmóviles, autótrofos (fotosíntesis).
 Ernest Haeckel, en 1866 propuso un tercer reino, denominado Protista, conformado por
organismos unicelulares o multicelulares pero carentes de especialización tisular (sin tejidos).
Los Protistas inferiores incluían células procariotas: bacterias, cianobacterias (algas verdes
azules) y los Protistas superiores células eucariotas: algas, hongos y protozoos.
 Chatton, en 1937 dividió a los seres vivos en dos grupos según presentaran o no membrana
(organización celular). Aparecieron los términos:
Eucariota: Organismos cuyas células tienen membrana nuclear: protozoos, algas, hongos.
Procariota: Organismos cuyas células carecen de membrana nuclear: bacterias.

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 Whittaker, en 1969 propuso un sistema de clasificación basado en dos niveles de

organización celular y tres formas de nutrición.
a) Reino Monera: Procariotas, bacterias y algas azul verdosas. Predominantemente absorción,
algunas fotosíntesis.
b) Reino Protista: Eucariotas, unicelulares, microalgas, protozoos, hongos sencillos.
Eucariotas sin tejidos verdaderos. Absorción, ingestión, fotosíntesis.
c) Reino Fungi: Eucariotas osmótrofos, Hongos filamentosos y levaduras. Eucariotas
pluricelulares multinucleados con núcleos dispersos en su micelio con pared y a menudo
tabicado. Absorción.
d) Reino Plantae: Eucariotas fotosintéticos, multicelulares con células eucariotas, pared
celular rígida y nutrición fotoautotrófica.
e) Reino Animalia: Eucariotas fagótrofos, multicelulares con células eucariotas sin pared
celular y nutrición principalmente ingestiva.

1.6 Taxonomía y filogenia

La taxonomía es la ciencia de la clasificación. Se apoya en propiedades físicas observables que
constituyen el fenotipo de una célula e incluyen su apariencia (morfología), la forma en la que
interaccionan con colorantes o tintes y su capacidad de convertir en producto químico determinado en
otro.
Un método diferente y nuevo de clasificación es la filogenia, que detecta diferencias en
microorganismos basadas en características genéticas codificadas en el ADN y en el ARN que está
implicado en la síntesis de proteínas. Particular importancia tienen las secuencias de base par en el
ARN ribosómico (16 Svedberg). En 1987 Carlos Woese a través de la secuenciación del ARNr 16S
determinó que los procariotas están divididos en dos grupos:
Arqueobacterias: Bacterias que producen metano y otros que viven en medios ambientes muy ácidos,
muy calientes o muy salinos (ambientes extremos).
Eubacterias: Bacterias comúnmente aisladas del cuerpo, suelo y agua.
En 1990, Carlos Woese propuso un nuevo Taxon superior al reino que denominó Dominio.
Todos los seres vivos se agruparían en tres dominios: Bacteria, Archaea y Eukarya. De estos dominios
dos son exclusivamente microbianos y están formados por células procariotas del reino Monera. y el
tercero Eukarya incluye a los reinos Protista, Fungi, Plantae y Animalia.

a. Dominio : Bacteria
Reino : Monera
Phylum : Proteobacteria
Clase : Alphaproteobacteria
Orden : Rhodosprillaes
Familia : Acetobacteriaceae
Género : Acetobacter
Especie : Acetobacter aceti

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

b. Dominio : Archaea
Reino : Monera
Phylum : Euryarchaeota
Clase : Methanobacteria
Orden : Methanobacteriales
Familia : Methanobacteriaceae
Género : Methanobacterium
Especie : Methanobacterium thermoautotroplicum

c. Dominio : Eukarya
Reino : Fungi
División : Ascomycota
Clase : Plectomycetes
Orden : Eurotiales
Familia : Tricomaceae
Género : Aspergillus
Especie : Aspergillus niger

La unidad básica taxonómica es la especie. Los grupos de especies con mayores similitudes se
agrupan en conjuntos denominados géneros y a su vez grupos de géneros con similitudes suficientes se
agrupan en familias. Una vez que el organismo ha sido definido, recibe un nombre según el sistema
binomial de nomenclatura establecida por Linneo. El nombre del género se escribe con mayúscula y se
coloca delante de la especie que nunca se escribe con mayúscula. El género y la especie se imprimen
en cursiva. Ejm: Escherichia coli. Una vez mencionado el nombre del género, se puede abreviar
usando sólo la mayúscula pero nunca se abrevia el nombre de la especie ejemplo E. coli.
La filogenia se refiere a organismos según su evolución histórica, mientras que la taxonomía se
refiere a organismos según características observables de las células. Ambos son métodos de
clasificación y suministran diferentes clases de información. Un árbol filogenético (Figura 1.1) muestra
las relaciones evolutivas entre varias especies u otras entidades que se cree tuvieron una descendencia
común. Cada rama representa un descendente del nodo o antecesor. Cada nodo se denomina unidad
taxonómica. Además de las diferencias filogenéticas, algunas características fenotípicas separan
consistentemente tres categorías de organismos vivos: Bacteria, Archaea y Eukarya (Tabla 1.2).

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

Figura 1.1 Arbol de vida filogenético establecido de una secuencia de RNA ribosómico.

Tabla 1.2 Características diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya

Característica Bacteria Archaea Eukarya

Núcleo incluido en membrana Ausente Ausente Presente
Pared de célula (ácido murámico) Presente Ausente Ausente
Membrana plasmática Bicapa Monocapa Bicapa
Enlaces Enlaces Enlaces
éster éter éster
Fotosíntesis basada en clorofila Sí No Sí
Metanogénesis No Sí No
Reducción de S a H2S Sí Sí No
Nitrificación Sí No No
Desnitrificación Sí Sí No
Fijación de nitrógeno Sí Sí No
Síntesis y almacenamiento de poli – β – hidroxi –
alcanoato Sí Sí No
Sensibilidad a cloranfenicol, estreptomicina y
kanamicina Sí No No
Sensibilidad de ribosomas a la toxina de difteria No Sí Sí
Fuente: Rittman y McCarty, 2001

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

1.7 Algunos trabajos claves en Microbiología

 1664: Robert Hooke describió cuerpos fructíferos de mohos creciendo sobre objetos de
cuero.
 1684: Antonie van Leeuwenhoek observó por primera vez a los microorganismos con
detalles (microscopios muy simples).
 1864: Louis Pasteur finalizó la controversia sobre la generación espontánea (hipótesis
de que los organismos vivos pueden originarse a partir de la materia inerte).
 1866: Ferdinand Cohn, estudió la bactería oxidante del azufre Beggiatoa y el bacilo
esporulante Bacillus.
 1876: Roberto Koch enunció la teoría microbiana del origen de las enfermedades
infecciosas.
 1882: Roberto Koch, etiología de la tuberculosis.
 1884: Postulados de Koch, demostraron que un determinado microorganismo causa una
determinada enfermedad (Figura 2).
1. El microorganismo patógeno sospechoso debe estar presente en todos los casos de la
enfermedad y ausente en animales sanos.
2. El microorganismo sospechoso debe ser cultivado en forma pura fuera del cuerpo del
animal (en laboratorio).
3. El microorganismo obtenido por cultivo en el laboratorio el ser inoculado en animales
sano debe causar enfermedad.
4. El microorganismo debe ser reaislado de los animales inoculados experimentalmente
y al ser cultivado en el laboratorio debe tener las mismas características que el
microorganismo original.
 1884: Christian Gram, tinción de Gram.
 1887: Richard Petri, placas de Petri.
 1889: Martinus Beijerinck, concepto de virus.
 1929: Alexander Fleming, penicilina.
 1953: James Watson, Francis Crick y Rosalind Franklin, estructura del ADN.
 1966: Marshall Nirenberg y Gobind Khorana, descubrimiento del código genético.
 1967: Thomas Brock, descubrimiento de bacterias capaces de crecer en fuentes termales
con agua en ebullición.
 1973: Stanley Cohen, Annie Chang, Robert Helling, Herbert Boyer, DNA
recombinante.
 1979: Síntesis de insulina por técnica de ADN recombinante.
 1983: Luis Montagnier, VIH como causa del Sida.
 1988: Kary Mullis, reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
 1995: Craig Venter y Hamilton Smith, secuenciación del genoma de Haemophylus
influenzae.
 1999: The Institute for Genomic Research (TIGR) y otros, más de 100 genomas
secuenciados total o parcialmente.

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

Figura 1.2 Los postulados de Koch (Fuente: Madigan et al., 2004).

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

1.8 El inicio de la genómica microbiana y la postgenómica

En julio de 1995, J. Craig Venter y Hamilton O. Smith, de la compañía Celera Genomics, y
Claire M. Fraser del Institut for Genomic Research (TIRG), publicaron la primera secuencia
completa del cromosoma de un microorganismo: Haemophilus influenzae cepa Rd. Este hecho
marcó un hito en la historia del estudio de los microorganismos. El grupo de Fraser continuó
con la secuencia del genoma de Mycoplasma genitalium, bacteria que tiene el genoma más
pequeño de las especies conocidas. Les interesaba conocer el número y calidad de genes
esenciales de la célula. Posteriormente continuaron con el genoma de Methanococcus
jannaschii, una extraordinaria arqueobacteria aislada de las costas de México a 2 600 metros de
profundidad, a 200 atmósferas de presión, que crece a 85 °C, y es capaz de transformar el
dióxido de carbono0, CO2, a metano y generar la energía para su metabolismo. La secuencia
reveló que alrededor del 50 % de genes no se relacionan con secuencias previas, sugiriendo
que codifican para mecanismos fisiológicos inexplorados. Ese mismo año la secuencia del
genoma de Saccharomyces cerevisiae, el primer eucariota se completó, encontrándose
aproximadamente 6 000 genes y al menos 2 000 de función desconocida.
A raíz de la consolidación del programa genético en los últimos años (genómica o estudio
del genoma), la postgenómica es el punto de partida para las investigaciones en el futuro. Al
estudio del transcriptoma (el repertorio de las moléculas de RNA mensajero que se expresan) y
el proteoma (el análisis de las proteínas y su condición, ya sea normal o patológica), se le ha
llamado comúnmente postgenómica. El conocimiento de los genomas de los microorganismos
facilitará la tarea de su estudio; sin embargo, su conocimiento no reemplaza la necesidad de
conocer las funciones que realizan en la célula. El número de genes importantes sin caracterizar
subraya el hecho de que contar con el genoma de un microorganismo es justo el punto de inicio
para su comprensión y estudio. Por lo tanto, el gran reto para el futuro es definir las funciones
de las proteínas del genoma y descifrar las redes funcionales de regulación.

Los datos aportados actualmente indican que un microorganismo puede contener alrededor
de 1 000 a 5 000 genes, de los cuales 20-70% son consideradas proteínas putativas que son
descritas como de función desconocida. Algunas de la proteínas reguladoras pueden tener una
docena de funciones celulares que pueden variar de una célula microbiana a otra; además, una
proteína puede contener varios dominios funcionales lo cual complica el análisis estructura-
función. Desde luego, la genómica es sólo el primer paso para discernir los procesos
fundamentales que gobiernan la vida. El gran reto en el futuro es definir la función de las
proteínas codificadas por el genoma, incluyendo el gran número de nuevas proteínas de función
desconocida, y descifrar las redes funcionales de los genomas. Integrar los resultados de los
esfuerzos de secuenciación con la información existente y con una base de datos bien
desarrollada producirá un panorama amplio del metabolismo celular y de la función genética.
La tecnología, por sí misma, no proporciona un entendimiento sustantivo del universo
microbiano. Vivimos “la edad de la información”, con excesivos genes, secuencias, reacciones,
y datos, los cuales debemos de integrar para lo cual es necesario desarrollar rápidamente la
bioinformática necesaria para organizarla. La ecología microbiana necesita de proyectos para
cultivar nuevos microorganismos, describir la composición y dinámica de las comunidades
microbianas, hacer la metagenómica a gran escala y sin fines comerciales; estudiar la expresión
de los genes y las interacciones in situ, crear las bases de datos y herramientas informáticas
necesarias para poder interpretar el enorme flujo de datos que se está generando; por lo que será
indispensable incorporar científicos en computación y bioinformática, con amplios

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 Capítulo 1. Introducción a la Microbiología

conocimientos en biología molecular. Este es el reto al que se enfrentan los microbiólogos del
siglo XXI.
1.9 Referencias bibliográficas
Baca, E. (2010). La Microbiología. De sus inicios a la genómica. Recuperado de
http://www.elementos.buap.mx/num49/htm/3.htm
Madigan, M.; Martinko, J. & Parker, J. (2004). Brock. Biología de los Microorganismos
(10ª ed.) Madrid, España: Pearson Educación, S.A.
Rittman, B. & McCarty. P. (2001). Biotecnología del Medioambiente, Principios y
Aplicaciones. España: McGraw Hill Interamericana.
Prescott, L, Harley J., & Klein, D. (1999). Microbiología. España: McGraw Hill
Interamericana.

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