Introducción

En la presente practica se hizo uso de la herramienta Uniprot el cual es un repositorio

central de datos gratuito sobre proteínas. Y es importante porque organiza los datos
de una manera que permita a los usuarios navegar eficazmente por los proteomas
mientras se mantiene fácilmente accesible la información relevante y pertinente. Para
lograr esto, UniProt proporciona proteomas de referencia para ofrecer una selección
de especies que representan una amplia cobertura del árbol de la vida.
También usamos la base de datos STRING la cual tiene como objetivo recopilar,
puntuar e integrar todas las fuentes de información de interacción proteína-proteína
disponibles públicamente, y complementarlas con predicciones computacionales. Su
objetivo es lograr una red global integral y objetiva, que incluya interacciones directas
(físicas) e indirectas (funcionales).
Escherichia coli es una bacteria Gram negativa, facultativa, que es parte del microbiota
residente de humanos. En esta práctica vamos a comparar los proteomas de la E. coli
comensal y la patógena lo cual es importante para encontrar que es lo que las hace
diferentes mediante la comparación de los gráficos desarrollados usando los datos
obtenidos del Uniprot
La red de interacción es importante ya que gracias a esta podemos tener conocimiento
de las proteínas que van a interactuar y así poder investigar que función cumple cada
una de estas.