Departamento Académico de Ingeniería.

Molecular Biology for Engineers 2020-2

Instrucciones para el informe de la Práctica Dirigida Nro. 03

Siguiendo las recomendaciones de la última práctica, resuelve el siguiente ejercicio con la
información solicitada. Asegúrate de leer cuidadosamente el enunciado información precisa en
tus respuesta.
Los informes son de carácter individual y se entregarán vía EVA en la tarea “Informe 3”. La
fecha límite de entrega es el día viernes 25 de setiembre de 2020 hasta las 22:00 hrs. No se
aceptarán entregas extemporáneas.

Problema: Inflammatory clues

Gracias a la prueba molecular que diseñaste la semana anterior se está haciendo un buen triaje
en los casos positivos para T-virus: ¡La administración dirigida de fármacos está mejorando
significativamente la prognosis!
No obstante, con la información que se acumula de los triajes se ha identificado un nuevo tipo
de pacientes: Existe un grupo de personas que son qPCR positivas pero que no tienen
compromisos clínicos importantes. Identificar a estos pacientes asintomáticos es importante para
conocer mejor la etiología del virus en el cuerpo y diseñar nuevas estrategias.
Si bien anticipar qué paciente desarrollará una
fase clínica es complicado, la información más
relevante estaría en la respuesta inflamatoria: Se
ha observado en frotis sanguíneos que pacientes
en fase clínica tienen una gran cantidad de células
inflamatorias en el plasma, por lo que explorar
cómo se comporta la inflamación en respuesta a
la carga viral podría permitir predecir la
necesidad de atención clínica.
Existen 2 grandes vecindarios en la ciudad con
casos confirmados para T-virus y se necesita
anticipar qué pacientes requerirían cuidados
clínicos para acondicionar adecuadamente los
hospitales de campaña, de lo contrario el ya
debilitado sistema de salud podría terminar de colapsar.

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Lunes 21 de setiembre de 2020
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En el laboratorio te sobraron sondas de qPCR de un proyecto anterior. Estas sondas están

dirigidas al gen gapdh y al gen tnfα, así que en los próximos triajes se logró implementar la
evaluación de estos genes para recolectar más información en una muestra de pacientes. Los
resultados fueron los siguientes:

Carga
Cq T-virus (réplicas) Nro. Media simple de Cq
viral Vencindarios
Paciente
T-virus gapdh tnfα
1000000 20.8 20.77
P1 33.23 21.33 30.78
100000 23.81 23.75 Pacientes non-
clinical (1er P2 32.24 22.33 30.55
triaje)
10000 27.33 27.31
P3 36.21 21.44 31.22
1000 30.87 30.67
P4 21.02 22.33 25.83
100 33.64 33.54
P5 27.21 21.55 28.34
10 37.23 37.84
P6 26.41 20.34 26.24
Raccon Hills
P7 22.01 21.34 25.4

P8 22.84 21.34 25.63

P9 22.23 21.76 25.69

P10 27.34 20.11 27.28

P11 22.84 21.22 25.4

P12 23.71 20.34 26.4

Talls Oaks
P13 24.31 19.89 25.5

P14 24.89 21.34 28.34

P15 23.98 20.78 25.78

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Lunes 21 de setiembre de 2020
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Objetivo:
Analiza los datos proporcionados y calcula/responde lo siguiente:
 ¿El método de qPCR dirigido a detectar T-virus es apropiado? Detalla que criterios has
analizado para fundamentar tu respuesta.
 ¿Cuál es la carga viral de los pacientes evaluados?
 ¿Qué nivel de expresión tiene tnfα en los pacientes evaluados?
 En base a los datos proporcionados ¿Qué pacientes podrían necesitar atención clínica?
 ¿Hay alguna asociación entre la carga viral y la respuesta inflamatoria? ¿Qué se podría
postular?
 ¿Qué vecindario necesitará más apoyo para repotenciar su hospital de campaña?
Asumiendo que la muestra observada es representativa, ¿Cuál sería la prevalencia de
casos que requerirán cuidados clínicos?
 Si el hospital de campaña del vecindario con mayor prevalencia tiene dos camas
disponibles, ¿En qué porcentaje como mínimo deberá incrementar su oferta de camas
hospitalarias para cubrir la demanda?
 En base a la nueva información sobre la etiología, propón un nuevo tratamiento para
evitar que los pacientes (positivos a T-virus) requieran hospitalización. Fundamenta
mínimamente el mecanismo de tu estrategia.

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Lunes 21 de setiembre de 2020