ACIDOS NUCLEICOS

Transcripción Traduccción
DNA RNA Proteínas
Replicación

La secuencia de aa de todas las proteínas depende de una secuencia

específica de RNA, determinada por una secuencia específica de DNA.

Una célula tiene miles de genes, por lo tanto, la molécula del DNA es muy
grande: Genoma

Cada segmento de DNA contiene la información requerida para la síntesis de

un producto biológico (polipéptido): gen

Cada segmento de RNA que se transcribe del DNA: transcrito (RNAm)

La información contenida en el DNA se expresa mediante el código genético

1. DNA Genoma

2. RNA

1. Mensajero (mRNA)
2. Ribosomal (rRNA)
3. De transferencia (tRNA) Transcriptoma
Otros RNA:
snRNA, small nuclear RNA
miRNA, micro RNA
siRNA, RNA de interferencia
 NUCLEÓTIDOS

RIBONUCLEÓTIDO DESOXIRIBONUCLEOTIDO
 BASES

PIRIMIDINA PURINA
 PURINAS

 Donador de hidrógenos PIRIMIDINAS

 Aceptor de hidrógenos
 AZÚCARES

-RIBOFURANÓSIDO -2’-DESOXIRIBOFURANÓSIDO
 NH2
NH2
N
N O O O
-O N N
-P-O-P-O- P-O-CH2
O
-O - P-O-CH N N O O O
2
O -
OH OH

OH OH
Adenina (A)
Adenosina-5’-monofosfato (AMP)
Base
Adenosina
Nucleósido Adenosina-5’-difosfato (ADP)

Adenosina-5’-monofosfato o Adenilato
Adenosina-5’trifosfato (ATP)
Nucleótido
 DESOXIRIBONUCLEÓTIDOS

Nucleótido: Deoxiadenosina Deoxiguanosina Deoxitimidina Deoxicitidina

5’-monofosfato 5’-monofosfato 5’-monofosfato 5’-monofosfato

Símbolos: A, dA, dAMP G, dG, dGMP T, dT, dTMP C, dC, dCMP

Nucleósido: Deoxiadenosina Deoxiguanosina Deoxitimidina Deoxicitidina

Base: Adenina Guanina Timina Citosina

 RIBONUCLEÓTIDOS

Nucleótido: Adenosina Guanosina Uridina Citidina

5’-monofosfato 5’-monofosfato 5’-monofosfato 5’-monofosfato

Símbolos: A, AMP G, GMP U, UMP C, CMP

Nucleósido: Adenosina Guanosina Uridina Citidina

Base: Adenina Guanina Uracilo Citosina

 ÁCIDOS
NUCLEICOS
Complementariedad de bases en el DNA
Las bases pueden rotar en el enlace -glicosídico dando dos
diferentes conformaciones:

N N N

N N N
CH2-OH CH2-OH

OH OH OH OH

1. Conformación anti: la base está hacia fuera del nucleósido.

2. Conformación syn: la base está hacia adentro de los
nucleósidos.

En los ÁCIDOS NUCLEICOS la conformación comúnmente

encontrada es la anti.
 ESTRUCTURA DEL DNA
En 1940’s Erwin Chargaff y col., de la Universidad de Columbia encontraron
que:

EN DNA’S OBTENIDOS DE DIFERENTES ESPECIES, LAS 4 BASES ESTAN

PRESENTES EN DIFERENTE PROPORCIÓN (A, C, T, G).

1. El DNA aislado de diferentes tejidos de la misma especie contiene la

misma composición de bases.

2. La composición de bases del DNA varía de una especie a otra.

3. La composición de bases del DNA en una misma especie no varía con la

edad.

4. El número de Adeninas (A) es igual al número de Timinas (T) y el número

de Guaninas (G) es igual al número de Citosinas (C):
A+G=T+C
 ESTRUCTURA DEL DNA
Watson y Crick de la Universidad de Cambridge
(1953), postulan el modelo tridimensional de la
estructura del DNA.

1. Dos cadenas helicoidales enrolladas alrededor Surco

menor
de un eje formando una doble hélice a la
derecha.
2. Las cadenas son antiparalelas y complementarias
3. Los nucleótidos están unidos por enlaces
fosfodiester 5’,3’. Surco
4. Los esqueletos hidrofílicos deben estar mayor
colocados hacia fuera de la doble hélice.
5. Los esqueletos hidrofóbicos deben estar
colocados dentro de la doble hélice unidos
entre sí en forma plana y perpendiculares al eje
de la doble hélice.
6. La relación de esqueletos hidrofílicos e
hidrofóbicos hace que se forme un surco mayor
y uno menor.
7. Las bases permitidas son purinas-pirimidinas.
8. Periodicidad- 0.34 nm entre nucleótidos, 3.6 nm
por vuelta de la doble hélice.
 Forma A Forma B Forma Z
Hélice: a la derecha a la derecha a la izquierda
Diámetro:  26 Å  20 Å  18 Å
Pares de bases/ vuelta: 11 10.5 12
Distancia entre
par de bases: 2.8 Å 3.4 Å 3.7 Å
Conformación
del enlace Anti Anti Anti para pirimidinas
glicosídico:
 FACTORES QUE AFECTAN
LA ESTABILIDAD DE LAS CADENAS
DEL DNA
Factores que determinan la conformación polinucleotídica

1. Los polinucleótidos tienden a formar hélices, lo que les

permite conciliar las fuerzas de interacción moleculares
distribuyéndolas a intervalos regulares.

2. Las interacciones hidrófobas entre los anillos de las bases y

fuerzas de VanDerWalls producen una conformación apilada.

3. Las repulsiones entre los grupos fosfato cargados

negativamente producen cierta rigidez en la estructura que se ven
estabilizadas por la cantidad de iones Mg++ en solución.

4. La formación de puentes de hidrógeno cooperativos altamente

direccionales asegura una estabilidad relativa y un estado dinámico.
 Agentes que dañan el DNA

I. Especies reactivas del oxígeno producidas a partir de subproductos

metabólicos normales (por mutaciones espontáneas).

II. Agentes externos:

1.Radiación ultravioleta del sol [UV 200-300nm] u otras frecuencias
de radiación, incluyendo los rayos X y los rayos gamma.
2. Radiación ionizante (extrayendo los electrones ligados).
3. Hidrólisis o ruptura térmica.
4. Algunas toxinas vegetales.
5. Mutágenos artificiales, especialmente compuestos aromáticos que
actúan como agentes intercalantes del ADN.
6. Quimioterapia y radioterapia como tratamiento contra el cáncer.
7. Virus que se integran en el genoma.
 Tipos de daño

Debido a procesos celulares endógenos:

1. Oxidación de las bases (por ejemplo, 8-oxo-7 0.8-dihidroguanina (8-

oxoG) y generación de interrupciones de la cadena de ADN
por parte de especies reactivas del oxígeno.
2. Alquilación de bases (normalmente metilación), como la formación de
7-metilguanina, 1-metiladenina, O6-metilguanina
3. Hidrólisis de bases, como desaminación, depurinación y
depirimidinación.
4. Malfuncionamiento de bases, debido a errores en la replicación del
ADN, en que se inserta una base de ADN errónea en una
cadena de ADN en formación, se inserta una base que no es
necesaria insertar, o no se inserta una necesaria.
Debido a agentes exógenos:

1. La luz UV-B debido a entrecruzamientos con bases adyacentes de citosina y

timina, crean dímeros de timidina. Esto recibe el nombre de daño directo al
ADN.

2. La luz UV-A provoca la formación de «radicales libres», especialmente si

hay crema solar que ha penetrado en la piel. Esto recibe el nombre de daño
indirecto al ADN.

3. La radiación ionizante, como la que causa la desintegración radioactiva o la

de los rayos cósmicos, provoca rupturas en las cadenas de ADN.

4. La ruptura térmica a temperaturas elevadas aumenta la velocidad de

la despurinización (pérdida de bases de purina del «tronco» del ADN) y las
roturas de cadenas sencillas.
Por ejemplo, se observa despurinización hidrolítica en los bacteria termófilas, que
viven en aguas termales a 85 a 250 ° C. En estas especies, la velocidad de
despurinización (300 residuos de purina/ genoma/ generación) es demasiado alta
como para que se repare mediante los mecanismos habituales de reparación, de
manera que no se puede descartar la posibilidad de una respuesta adaptativa.
5. Productos químicos industriales, como el cloruro de vinilo o
el agua oxigenada, hidrocarburos policíclicos que se encuentran
en el humo, el hollín y el alquitrán, provocan una gran diversidad
de aductos-etenobases de ADN, bases oxidadas, fosfotriésteres
alquilados y entrecruzamiento del ADN, entre otros.

6. Los daños por radiación UV, la alquilación/metilación, los

daños por rayos X y los daños oxidativos son ejemplos de daños
inducidos.

Los daños espontáneos incluyen la pérdida de una base, la

desaminación, plegamientos de los anillos de azúcar, y los
desplazamientos de tautómeros.
Desnaturalización y renaturalización reversible del DNA

desnaturalización
G° (—) para la
Calor

Enfriar
suavemente

DNA Nativo DNA Tm

Temperatura
Desnaturalizado

Efecto hipercrómico del DNA

Desnaturalizado

Nativo
Nativo Desnaturalizado

Tm
Longitud de onda (nm) Temperatura
Tamaño de algunas moléculas de DNA

(Viruela aviar)
Funciones del ADN

1. Replicación del DNA

2. TRANSCRIPCIÓN
Watson y Crick (1953):
La replicación del DNA durante la
división celular empezaría por la
separación de las dos cadenas,
cada de éstas siendo templado y
así especificando la secuencia de
bases de una nueva cadena
complementaria; además
postularon que cada doble hélice
pasaría intacta a la célula hija.

Semiconservativa
Bidireccional
En dirección 5' -------- 3‘
Semidiscontinua
Bajo control enzimático
Cadena Cadenas Cadena
parental hijas parental
 CARACTERÍSTICAS DE LA REPLICACIÓN DEL
DNA
1. Semi-conservativa ya que al final de la duplicación, cada molécula de
DNA presenta una hebra original y una hebra nueva.

2. Es bidireccional, ya que a partir de un punto dado, la duplicación

progresa en dos direcciones.

3. La replicación avanza adicionando mono nucleótidos en dirección 5' →

3'.
4. Semidiscontinua, ya que en una de las hebras (hebra conductora) se
sintetizan filamentos bastante grandes y de forma continua, mientras que en
la otra (hebra retardada) la síntesis es discontinua, ya que se van
sintetizando fragmentos pequeños que se disponen de manera separada.

5. Proceso controlado enzimáticamente, asegurando así una alta fidelidad

en la información que contiene la copia.
 Enzimas que participan en la replicación:

DNA girasas: que desenrollan la doble hélice haciendo cortes que

permiten la entrada del complejo enzimático para que éste encuentre
el origen de la replicación.
Helicasas: separan las dos hebras del DNA para que cada una actúe
como molde.
DNA polimerasas: participan en la replicación y reparación del DNA.
Nucleasas: rompen una de las hélices, dando lugar a un origen de
replicación; reparan lesiones del DNA.
Ligasas: unen fragmentos de DNA adyacentes a través de enlaces
fosfodiéster.

Otras:
SSB, proteínas de unión a la cadena que no permiten que el DNA se
vuelva a renaturalizar o forme estructuras secundarias.
Topoisomerasas, que evitan que se retuerzan y formen super
enrollamientos cortando una o ambas hebras del DNA.
Otras estructuras del DNA
 Posiciones de Hoogsteen

CG + Citidina
TA + Timidina
En cadenas con polipurinas
o polipirimidinas con imagen
en espejo.

DNA H
2. TRANSCRIPCION
 1. RNA mensajero
• 1. Molde para la síntesis de proteínas o traducción.
En consecuencia, el mRNA es una clase
heterogénea de moléculas. La longitud media del
mRNA es alrededor de 1.2 kilobases.
RNAm
DNA RNAm: Transcripción

La longitud de un RNAm depende de la longitud del

polipéptido que codifica.
Así, un polipéptido de 100 aa requiere una secuencia
de RNA de al menos 300 nucleótidos.

RNA: Intermediario que transmite la información

codificada en el DNA para especificar la secuencia de
aminoácidos de una proteína.
1. Iniciación: Descondensación de la cromatina. Unión de acetilasas a la lisina en las histonas a traves del Bromodominio.
Se forma un complejo de pre-iniciación: RNA polimerasa II y factores de transcripción. Unión de la RNA polimerasa al sitio
Promotor. La helicasa abre el complejo y comienza la transcripción. Se forma un fragmento de 8-10 nucleótidos de RNA.

2. Elongación. El CTD debe seguir fosforilado. La ARN polimerasa II cataliza la formación de los enlaces fosfodiéster entre
nucléotidos. Intervienen otros factores, conocidos como factores de elongación que disminuyen las pausas de la
ARN polimerasa II, desorganizan los nucleosomas y favorecen los procesos de corrección de errores. También intervienen
factores de transcripción involucrados en la iniciación. En la elongación se fosforila otra posición del CTD.
El CTD fosforilado es reconocido también por proteínas encargadas del procesamiento y maduración del pre-ARNm,
de modo que la maduración del pre-ARNm se produce de forma simultánea a la transcripción.

3. Terminación: El CTD es defosforilado por una fosfatasa. La ARN polimerasa II continúa transcribiendo hasta llegar a
una secuencia específica que determina el sitio de poliadenilación. Esta secuencia es reconocida por una endonucleasa.
Esta enzima corta el ARNm unos nucleótidos más allá de la secuencia que reconoce, liberándolo.
Posteriormente esta secuencia específica es reconocida por una enzima encargada de añadir la cola de poli-A al transcrito.
 2. RNA de transferencia
• Transporta los aminoácidos al
ribosoma para la formación de
enlaces peptídicos, en una
secuencia dictada por el mRNA
molde.
RNAt: moléculas adaptadoras que actúan
durante la síntesis de proteínas:

TRADUCCION

RNAm Proteínas

Está unido covalentemente a un aa en un extremo y

se aparean con el RNAm de tal forma que van
alargando la secuencia correcta del polipéptido
Hay al menos un tipo de tRNA para cada uno de los 20
aminoácidos. El RNA de transferencia consta de
alrededor de 75 nucleótidos con una masa de 25 kDa.
RNA de transferencia (tRNA)
 3. RNA Ribosomal
• El RNA ribosómico (rRNA) es el componente principal de
los ribosomas. En el ribosoma está presente una
molécula de cada una de estas especies de RNA.
Ribosomal RNA
Componente de los ribosomas con amplia variedad de
funciones específicas que incluye actividades enzimáticas
como las ribozimas.
RNA de ribosomal
(rRNA)
 4. RNA nuclear pequeño
• El RNA nuclear pequeño (snRNA, small nuclear RNA) constituye el
empalme de los exones del RNA.
• Exón: contiene la información para producir la proteína codificada en
el gen. Su conjunto define la región codificante del gen.

• snRNA: coadyuva
a dirigir las proteínas recién
sintetizadas hacia los
compartimientos intracelulares
y extracelulares
 5. Micro RNA
• Los microRNA (miRNA) tienen alrededor de 21
nucleótidos no codificantes que se unen a las
moléculas de mRNA complementarias e inhiben
su traducción
 Micro RNAs (miRNAs): RNAs involucrados en la
regulación génica.

• Están constituidos por RNA no codificante de 22 nucleótidos

• Son complementarios a regiones particulares de mRNA

• Regulan la función del mRNA rompiéndolo o suprimiendo su

traducción.

• Se encuentran en eucariotas multicelulares

• El 1% del genoma humano codifica miRNAs

• El miRNAs reconoce hasta un tercio del mRNA humano.

Los transcritos primarios para miRNAs (pri-miRNAs) varían
mucho en tamaño
 6. RNA pequeños de
interferencia
• Los RNA pequeños de interferencia
(siRNA) se unen al mRNA y facilitan su
degradación.

Los miRNA y los siRNA son unos potentes instrumentos

experimentales para inhibir la expresión de determinados
genes en las células.
Otras ribozimas: Rnasa P de E. coli
• Compuesta de RNA (377 nucleótidos) y proteína
(Mr 17,500). Sidney Altman y Norman Pace:

• El RNA puede romper los precursores del tRNA en

posiciones específicas.

• La proteína estabiliza el RNA o facilita su función in vivo.

• Reconoce la estructura tridimensional de su sustrato
pre-tRNA a lo largo de la secuencia CCA y así puede
romper los extremos líderes 5´ de diversos tRNAs.
 OTROS NUCLEOTIDOS

1. Acarreadores de energía: ATP, UTP, GTP,

CTP, por la adición de tres fosfatos

2. Componentes de cofactores enzimáticos

3. Mensajeros químicos
 2. Nucleótidos que actúan como coenzimas

Coenzima que
transfiere grupos acilo:
Coenzima que transfiere
grupos hidruro
Coenzima
que transfiere
electrones
3. Nucleótidos que actúan como moléculas
regulatorias

Son segundos mensajeros en el interior de la célula.

1. AMP cíclico: cAMP, formado de ATP en una reacción

catalizada por adenilato ciclasa, ubicada en la cara interna
de la membrana plasmática. Está presente en casi todas
las plantas.
Nucleótidos que actúan como segundos mensajeros

2. Guanosina 3,5- monofosfato

cíclico (cGMP), está presente
en muchas células y también
tiene funciones regulatorias.

3. ppGpp: producido en
bacterias. Inhibe la síntesis de
rRNA y tRNA necesarios para la
síntesis de proteínas evitando la
producción innecesaria de
ácidos nucleicos.