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Bioquímica:

Conceptos y Conexiones

Dean R. Appling
Spencer J.
Anthony-Cahill
Christopher K.
Mathews

Capítulo 5 - Introducción a la proteínas: el primer


nivel de estructura de proteínas
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Visión general de
la biosíntesis de
proteínas

▪ ADN se transcribe para formar


ARNm en el núcleo

▪ ARNm se exporta al
citoplasma
▪ ARNm se traduce en una
secuencia lineal de aminoácidos
que se pliega en una estructura
tridimensional

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la estructura del ácido α-amino

▪ Amino grupo unido a la α carbono en el


ácido carboxílico
▪ R - grupos son las cadenas laterales que
distinguen a los 20 aminoácidos comunes

▪ Cuando R no es un átomo de
hidrógeno, la α-carbono es un centro
asimétrico
▪ A pH neutro (~ 7) se protona el nitrógeno de
aminoácido y el ácido carboxílico se
desprotona para dar el zwitterion

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α-amino estereoquímica ácido

▪ Los bola y el palo muestra el modelo de la


disposición 3D de los átomos en un ácido
α-amino
▪ Cuando 4 grupos diferentes están unidos a
un átomo de carbono, se dice que átomo
al ser quirales, o un estereocentro, o un
carbono asimétrico

▪ La proyección de Fischer (panel


inferior izquierdo) representa la

estereoquímica, que se muestra de 3


3

forma explícita en el panel inferior


derecho C C

CR CR

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α-amino estereoquímica ácido

▪ Todos los a-aminoácidos, excepto la


glicina, contienen un α-carbono
asimétrico
▪ L-alanina es la imagen especular de
D-alanina
▪ L-alanina y D-alanina son enantiómeros

▪ Tenga en cuenta el Fischer

representaciones también son imágenes


especulares

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aminoácidos comunes y su clasificación

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aminoácidos comunes y su clasificación

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espectros de absorción UV de la tirosina y
fenilalanina

▪ Las proteínas se pueden


cuantificar mediante el
examen de la absorbancia
UV a 280 nm, que es

dominado por Tyr y Trp

▪ Recordemos que los ácidos


nucleicos absorben más
fuertemente a 260 nm (cap 4)

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curva de titulación de la histidina

▪ La carga de histidina
varía de 2 en -1,
dependiendo del pH

▪ La naranja puntea
corresponden a la p K un
valores para el rojo

átomos de hidrógeno

▪ El punto corresponde
verdes al pI (carga
neta de la molécula es
cero)

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Aminoácidos pueden ser modificadas
después de la traducción

▪ Las modificaciones
post-traduccionales pueden
funcionar en las vías de
señalización, la unión del calcio, la
estabilización de estructuras tales
como colágeno, o jugar papeles en
la expresión génica o la supresión

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El enlace peptídico une amino ácidos

▪ La condensación de dos amino


ácidos forma un enlace
peptídico agua y libera

▪ Esta reacción no es
termodinámicamente
favorable y está acoplado a
la hidrólisis de ATP durante
la biosíntesis de proteínas

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La deslocalización de los electrones crea una
planar y enlace peptídico estable

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escisión del enlace peptídico

▪ Delta G' para la hidrólisis del enlace peptídico ~ -10 kJ / mol

▪ Los péptidos son estables a menos ácido fuerte o un catalizador está presente

▪ 6N HCl a alta temperatura se degradará proteínas para liberar aminoácidos

▪ Proteasas: las enzimas que escinden enlaces peptídicos específicos


▪ bromuro de cianógeno (CNBr) escinde proteínas específicamente en los residuos
metionil
▪ Previamente, la proteína de las secuencias de aminoácidos se determinaron mediante la escisión
selectiva seguido de análisis de la separación y la secuencia de las proteínas individuales. Cada
péptido podría tener su secuencia de aminoácidos determinada por la liberación por etapas de
aminoácidos en la degradación de Edman

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tetrapéptido EGAK

oligopéptidos son cadenas de péptidos que consta de sólo unos pocos residuos,
mientras polipéptidos contener más de 15-20 residuos.

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regiones del péptido a la nota

carboxi (C-)
amino (N-) terminal término

cadena principal

cadenas laterales

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N- y C-terminales puede haber
modificado en péptidos

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el p K un de un lado de la cadena está influenciada por
su entorno

▪ Imperturbable, el pKa del ácido


glutámico es 4,2
▪ En las proximidades de una
carga negativa, la p K un de se
eleva el ácido glutámico

▪ En las proximidades de una


carga positiva, la p K un de ácido
glutámico se baja

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Los péptidos y proteínas como polianfolitos

A medida que el pH aumenta la carga total en un péptido se convertirá más negativa.

A medida que el pH disminuye la carga total en un péptido se convertirá más positivo.

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Las secuencias de
aminoácidos de humano
y ballena
mioglobina
▪ mutaciones conservativas conservan la
propiedad química (por ejemplo, carga) y / o
el tamaño del aminoácido, mientras que las
mutaciones no conservativas implican
mayores diferencias en polaridad / tamaño

▪ Las relaciones evolutivas se infieren de


proteína amino secuencias de ácido

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análisis de la secuencia de la proteína puede
complicarse por múltiples cadenas

▪ La insulina tiene dos cadenas unidas por enlaces disulfuro

▪ Protein amino análisis de la secuencia de ácido mediante secuenciación de ADN del


gen es rápido y barato, pero no identifica las modificaciones post-traduccionales, por lo
que debe ser utilizado una combinación de enfoques

▪ La biosíntesis de la insulina implica una variedad de modificaciones


postraduccionales

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El código genético

▪ El código estándar shows


genéticos los codones, o tripletes
de bases, que corresponden a
cada residuo de aminoácido

▪ El codón de inicio AUG coloca una


Met en el comienzo de proteínas
eucariotas, sin embargo, se
elimina a menudo por proteasas

▪ Tres codones, UAA, UGA y UAG,


son codones de terminación, que
señal de terminación de la traducción

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Transcripción y traducción Resumen

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procesamiento de la insulina

▪ La insulina se sintetiza como un


precursor inactivo,

preproinsulina, que sufre


escisión enzimática de la
proinsulina, seguido por plegado
y enlace disulfuro formación,
seguido de proteolisis enzimática
adicional

▪ Esto permite que la insulina, como


otras hormonas de péptidos o
proteínas, que se sintetiza y se
almacena como un precursor
inactivo, disponible para una rápida
movilización bajo demanda.

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