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Formatos para trabajar visalizacion de moléculas

XYZ

Pdb

Gro

Zint

Ingreso de ssh programa ejecutador ssh

Usuario password

Direccion- ip

Simulación

Preparar el archivo de entrada ---

 topología del campo de fuerza (*.top)


 Coordenadas de las interacciones
 Parámetros de simulación (*.mdp)
Input file---*.tpr

Simulación _____ DM,min geometría de eneregia , dinámica molecular (archivo*.gro-


coodenadas)

Min encontrar el punto critico de menor energía por medio de algún método numérico

Resultados

Se debe tener en cuenta la interaciones enlazantes y no e

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