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Procesamiento de Señales Biomédicas con Red

Neuronal Adaline
Processing of Biomedical Signal with Neural Network
Adaline
A. Medina-Santiago, L. E. Gómez-Aguilera, A. G. B. Nango-Solis, N. A. Morales-Navarro, J.M.
Cisneros-Gomez, E. M. Melgar-Paniagua Villegas-Izaguirre, N. R. García-Chong, J. I.
Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación Bermudez-Rodriguez
Tecnológica, Universidad de Ciencia y Tecnología
Instituto Tecnológico de Tuxtla Gutiérrez / Universidad
Descartes / Instituto de Investigaciones Nucleares
Autómata de Baja California / Universidad Autónoma de
Tuxtla Gutiérrez, Chiapas, México. Ciudad de México. Chiapas, Facultad de Medicina Humana
cidit@universidaddescartes.edu.mx, luigoaga@gmail.com, Tuxtla Gutiérrez, Chiapas / Tijuana, Baja California,
acisneros@universidaddescartes.edu.mx, México / Tuxtla Gutiérrez, Chiapas. México
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villegas_josemanuel@uabc.edu.mx, negarcia@crae.gob.mx,
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Resumen — En este artículo se presenta el desarrollo de un las Redes Neuronales serán expresadas de acuerdo a las
sistema de apoyo al medico en el diagnóstico de enfermedades propuestas por Hagan [1], que son mas generalizadas e
mentales; el sistema se basa en una red neuronal Adaline para el inclusive el software Matlab [5, 10-12] tiene los ejemplos de
procesamiento de las señales biomédicas a partir de 4 tipos de sus ejercicios.
movimientos oculares, a fin de extraer su información e
interpretar el potencial de acción de cada uno de los movimientos El procesamiento de señales biomédicas se realiza para
oculares en estudio. extraer información del funcionamiento de los distintos
sistemas del organismo. Las medidas más usuales agrupadas
Palabras Clave – Señales Electro-oculográficas (EOG); Red por sistemas correspondientes a los sistemas cardiovascular,
Neuronal Adeline, Diagnostico. respiratorio, nervioso y muscular, destacando el tipo de
información que proporcionan y el método de medida
Abstract — This article presents the development of a support
utilizado.
system for the physician in the diagnosis of mental illness; the
system is based on an Adaline neural network for the processing Es así como La definición de "Señal Biomédica" incluye
of biomedical signals from 4 types of ocular movements in order todas la señales usadas en el diagnostico o investigación
to extract their information and interpret the action potential of medica que se originan de alguna manera en el cuerpo, este
each eye movement under study. campo ha sido impulsado principalmente en las últimas dos
Keywords - Electro-oculograficas (EOG) signals; Adaline décadas gracias al desarrollo en el procesamiento de señales.
neural network, Diagnostics.
Cuando el propósito de la señal es el procesamiento, no es
I. INTRODUCCIÓN muy relevante cual es la fuente de la señal o qué tipo de señal
Las redes neuronales son el nuevo estándar de notación biomédica es, lo que es primordial es el tipo de la señal.
matemática y representación de arquitecturas para aquellas que
no se han establecido firmemente aún. Además, artículos y El artículo esta compuesto por la sección II que expresa un
libros sobre redes neuronales han salido de diversos campos, marco teórico y la definición de la red neuronal Adaline
incluyendo ingeniería, física, psicología y matemáticas, y definida, la sección III muestra los resultados experimentales
muchos autores tienden a usar un vocabulario peculiar a su del procesamiento de las señales biomédicas con la red
especialidad. Muchos libros y artículos son difíciles de leer y neuronal Adaline desarrollada e implementada en un sistema
los conceptos parecen ser mucho más complejos que lo que embebido de alto desempeño, la sección IV muestra las
realmente son, debido a que no hay un estándar establecido pruebas reales del sistema y sus resultados al tomar muestras
para las RNA [1-3], en este trabajo nos guiamos de las en pacientes bajo estudio y por ultimo se presentan las
notaciones de Hagan para redes neuronales [1], aunque también conclusiones del artículo.
hay otros autores como Yeung, Dayan, Russell de los que
rescatamos información para esta sección, las ecuaciones para

978-989-98434-7-9/17/$31.00 2017
c AISTI 2256
II. MARCO TEÓRICO salida deseada y la salida lineal obtenida antes de aplicarle la
función de activación [1].
A. Introducción
En cuanto a la estructura de la red Adaline, se considera
El presente trabajo tiene como objetivo principal analizar, formada por un elemento denominada combinador adaptativo
diseñar e implementar el procesamiento de señales biomédicas lineal (ALC) como se muestra en la figura 1, que obtiene una
basados en redes neuronales artificial Adaline a través de la salida lineal (s) que puede ser aplicada a otro elemento de
adquisición de datos con la conexión de los electrodos hacia el conmutación bipolar, de forma que:
cerebro del paciente de manera no invasiva para que la
•Si la salida del ALC es positiva, la salida de la red
información pase por una tarjeta de adquisición de datos y
ADALINE es +1
estos a su vez capturados en una computadora personal;
acondicionando la señal de los electrodos a voltajes para •Si la salida del ALC es negativa, la salida de la red
permitir la entrada en la tarjeta de adquisición de datos. ADALINE es -1
Este sistema pretende apoyar al médico en su diagnóstico
en las enfermedades mentales; considerando que un grupo de
científicos del Reino Unido demostró que el movimiento ocular
puede servir para detectar enfermedades mentales como la
esquizofrenia; mas sin embargo detectar un movimiento ocular
alterado requiere no sólo de la pericia del oftalmólogo, sino
también de la tecnología que pueda diferenciar patrones
normales de posible indicios patológicos.
Con los datos obtenidos a partir de la red neuronal Adaline,
se genera una base de datos para sus posterior procesamiento. Figure 1. Estructura de la red ADALINE, compuesta por un combinador
Se implementó a la red Adaline con la finalidad de identificar adaptativo lineal y una función escalón (de dos estados)
los patrones de las ondas cerebrales; para lo cual se entrenó la
red para que realizara la clasificación de patrones de señales C. Electroculagrafia (EOG)
ópticas. Dicha red aprendió a diferenciar entre 4 tipos de Es un método que puede detectar los movimiento oculares,
señales que se nombraron como: clase 1, clase 2 clase 3 y clase consiste en medir el dipolo característico que aparece en el
4, las cuales corresponden a la salidas del sistemas, por lo que globo ocular ya que la retina es electronegativa con respecto a
se renombraron como neuronas de salida. la córnea. La medición de este dipolo se hace detectando
El estudio efectuado para la obtención de los datos partió de pequeñas diferencias de potencial con unos electrodos
dirigir el puntero del mouse con la vista del usuario, realizando adheridos a la piel alrededor de los ojos . Este método no es lo
la clasificación de acuerdo a los movimiento básicos del globo suficientemente sensible como para medir pequeños
ocular de la siguiente manera: Clase tipo 1, con la función movimiento de los ojos y no puede ser utilizado para medir
fisiológica de vista hacia arriba; Clase tipo 2, con la función movimientos verticales puesto que los músculos de los
fisiológica de vista hacia abajo; Clase tipo 3, con la función parpados introducen corrientes eléctricas. En horizontal puede
fisiológica de vista hacia izquierda; y Clase tipo 4, con la medir un amplio rango dinámico de (+-) 70º. No necesita de
función fisiológica de vista hacia derecha [5-9]. calibración cada vez que se colocan los electrodos y deben
estar perfectamente adheridos ya que cualquier movimiento de
Por ultimo se implemento el sistema para el procesamiento los mismo introducen errores de cálculo. Se dice que el sistema
de las señales con unas red neuronal Adaline a nivel hardware es intruso ya que el usuario necesita llevar electrodos y cables
para observar el comportamiento del sistemas integral y definir para registrar las señales, lo que puede resultar molesto, ya que
los avances obtenidos con la investigación. si el paciente se mueve o parpadea mucho puede introducirse
ruido (externo) que afectaría el nivel de medición de las señales
así como si existen aparatos electrónicos o movimientos de los
B. Red Neuronal tipo Adaline pies de las personas involucradas. [5-9]
Son estructura que usan neuronas con funciones de III. DESARROLLO EXPERIMENTAL
transferencia escalón. Esta red está limitada a una única
neurona de salida. Como su nombre lo dice es un sistema que El equipo utilizado para la adquisición de las señales
puede presentar a la entrada de la red un elemento el cual cerebrales fue un sistema de adquisición de datos BiTalino
puede ser adaptable al aprendizaje de la misma red linealmente, junto con un software que realiza el registro de datos (Matlab)
a su vez esta regido por un algoritmo de aprendizaje muy y posterior al análisis de la señal con el uso d la red neuronal
sencillo que más adelante se utilizara en el desarrollo de la red Adaline implementada en PCDuino [2] como se muestra en la
y sus respectivas pruebas que es el LMS(least Mean Square) Figura 2.
por sus siglas en ingles o reglas del mínimo error cuadrado
medio. Con este trabajo se propone un sistema adaptativo que
puede aprender del formas más precisa y rápida, basándose en
la búsqueda del mínimo de una expresión de error entre la

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verticales se tiene otro tipo de familias es decir arriba abajo,
pero habrá que tomar en cuenta que es lo que pasa cuando se
mira en diagonales, esto podría producir una combinación de
señales tanto horizontales como verticales generando así de
esta forma una nueva familia la cual puede ser caracterizada
para obtener otro tipo de señal mas concreta. A continuación se
muestra la Tabla 1 con las relaciones entre los movimientos
oculares, la señal de EOG detectada y su salida [6. 13-16].

TABLE I. RELACIÓN ENTRE LOS MOVIMIENTOS


OCULARES, LA SEÑAL DETECTADA Y SU SALIDA .
Figure 2. Equipo de Adquisición de Datos y Software.

A. Mediciones oculares
Se realizaron una serie de mediciones de las señales
oculográficas de un voluntario y se evaluaron problemas
relacionados con el ruido electrónico, biopotenciales parásitos,
fatigas y movimientos involuntarios. A pesar de que las señales
electrooculagráficas están fuertemente afectadas por otros
potenciales bioelectrónicos, se implementó un software que
minimiza estos efectos no deseados. Se muestra como se
conecta a las persona con los electrones y el equipo: Se
utilizan electrodos activos a nivel cornea y de referencia en los
cantos externos, con el electrodo neutro sobre la frente. En la
figura 3. se muestra el posicionamiento de los electrodos sobre
un voluntario, en una sesión de medición de señales
electrooculográficas (EOG) [4, 13-16].

Adicionalmente el cambio que puede presentarse en las


señales a estar delimitado por un factor llamado umbral, el cual
es una frontera en la que el globo ocular manda señales hacia el
cerebro a fin de saber que dentro de ese umbral del sistema
“ocular” presenta cierta estabilidad, pero fuera de este las
Figure 3. Posiciones de los Electrodos sobre el Voluntario para la señales son diferentes ya que generan otro tipo de formas de
adquisición de los datos (señales oculográficas). onda las cuales ya traen consigo quizás un poco de distorsión.

Nota: Cada uno de los electrodos colocados en el facial del Se observa que hay una forma de onda (cerebral) definida
voluntario son estratégicamente colocados en sus distintos para cada uno de los ocho movimientos oculares que a su vez
puntos sobre la superficie del rostro, ya que cada uno de ellos se delimitan con el factor umbral para su estudio.
representan los cambios que puedan existir en la señal cuando B. Tecnicas de registro
el paciente mueve los ojos a distintas direcciones.
La técnica consintió en tener al voluntario conectado al
Estos puntos que se establecen para el posicionamiento de equipo tal como se muestra en la Figura 4. Después de ello se
cada uno de los electrodos, son estratégicamente colocados en realizaron todas las técnicas de aislamiento posible para que no
esos sectores faciales, con base al desarrollado de múltiples fuera a introducir ruido dentro del proceso de adquisición de
investigaciones las cuales se han dedicado al estudio y datos cerebrales. Para ellos se pidió al paciente estar sentado
comportamiento de las señales oculares tratando de precisar
cómodamente en un cuarto donde solo estuviera la persona a
qué tipo de onda cerebral (señal) da lugar a un movimiento
determinando de los globo oculares. Esto es, que para cada tomar las mediciones y el paciente (alumno-voluntario).
movimiento que el globo ocular realiza la relación de Adicionalmente se le pidió que tratara de no moverse y estar
potenciales retina – cornea genera en el cerebro distintas relajado y sin estrés minutos previos a la adquisición.
formas de onda, es decir, por ejemplo para movimientos
horizontales se tienen una familia de señales muy parecida ya
que horizontalmente se tienen muchos movimientos ente ellos
el de izquierda a derecha, a hora bien para los movimientos

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vertical. Un electrodo de referencia se coloca en el lóbulo del
oído. Ver Figura 6.

Figure 4. Representación del modelo experimental desarrollado.

El método consistió en establecer sobre un plano cuádruple-


direccional una serie de indicaciones al cual tenía el paciente
que fijarse como elemento para su prueba tratando de no
parpadear ni hacer movimiento de su cabeza. Básicamente
tenia que seguir las instrucciones que se le pedían, se tomaron
2 tipo de pruebas:
1. Con movimiento ocular horizontales (izquierda-
centro-derecha)
2. Con movimiento ocular verticales (arriba-centro-
abajo)
Donde el centro es un punto de referencia con el fin de
establecer la diferencia de cambio en la señal entre los
movimientos realizados [5]. Este plano se muestra en la Figura
5.

Figure 6. Adquisición de Datos Cerebrales-Oculares.

Nota: se trata de una aplicación típica de reconocimiento de


patrones, siendo en este caso las imágenes sensoriales del
globo ocular captadas del mundo exterior, los patrones que hay
que reconocer. Se puede utilizar una red Adaline para aprender
las diferentes formas de los caracteres que se presentaran como
Figure 5. Representación del movimento ocular. imágenes compuestas.

C. Electrodos IV. RESULTADOS


Algunos electrodos comúnmente usado para el registro del Para esta parte se desarrollo una interfaz gráfica con
EOG [21-22] consisten en una pequeña hojuela de cloruro de herramientas muy ponderosas como la implementación de una
plata montada en cubierta plástica que mantiene al electrodo etapa de comunicación serial con los datos analógicos para ser
alejando de la piel. El espacio entre el electrodo y la piel se procesado digitalmente por una computadora a través de un
llena de electrolito (crema flotante). Los electrodos fueron sistema empotrado como PCDuino [24, 25, 27].
seleccionados en base a su tiempo de respuesta que es de 3ms,
son relativamente económicos y contiene un gel especial el A. Protocolo asíncrono de comunicación serial
cual reduce las bacterias.
Los electrodos pueden colocarse en los lados externos de En el protocolo estándar se transfiere 10 bit, un bit de
los ojos (cerca de la sien) y un tercer electrodo de referencia en inicio, 8 bits de datos y bit de stop , formando así una palabra
el lóbulo de la nariz, con el fin de obtener registros separados de 10 bits.
del movimiento horizontal de cada ojo [7].
Si los electrodos se colocaban ligeramente alejados de las Para saber si hubo errores en la trasmisión se usa un bit de
sienes se reducen los artefactos causados por la actividad paridad el cual indica el error. Por ejemplo en el byte
muscular. Cuando se desea registrar movimiento verticales y 00111100 se tiene 4 unos porque el bit de paridad se le asigna
horizontales como es nuestro caso, de uno o ambos ojos, deben un 0 y se dice que tiene paridad par en el byte 10111100 se
ser considerados los posibles errores producidos por el tiene 5 unos por lo que l bit de paridad se le asigna un 1 y se
acoplamiento entre los ejes. tiene paridad impar.
En el registro de configuración de hardware se tiene:
En la adquisición las derivaciones del EOG [17-20] pueden
obtenerse colocando dos electrones en la parte exterior de los TXSTA. Registro de configuración de la transmisión serial
ojos para la derivación horizontal y el mismo para la derivación PCSPA. Registro de configuración de la recepción serial

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SPBRC. Contador programable digitales que configura la C. visualización de la comunicación en Simulink
velocidad de transmisión.
Para esta parte hacemos uso de una simulación sencilla
Por otra parte en el protocolo asíncrono RS-232-C, la implementada en Matlab-Simulink por medio del uso de un
frecuencia de baudios (bit por segundo) a la que se realiza la osciloscopio para apreciar la señal de la Figura 7. Mostrada
transferencia se debe efectuar a un valor normalizado: 330, anteriormente.
660, 1200, 2400, 4800, 9600, 19200, 38400, etc. Para generar
esta frecuencia, el USUART dispone de un generador de Cabe mencionar que el bloque Simulink realiza la
frecuencia en baudios, BRG, cuyo valor es controlado por el comunicación y procesamiento de datos. A continuación se
contenido grabado en el registro SPBGR, además del valor muestra en la Figura 8 como se lleva a cabo la recepción de la
“x” cargado en el registro SPBRG, la frecuencia en baudios señal.
del generador depende del bit BRGH del registro TXSTA<2>.
En el caso de BRGH=0 se trabaja en baja velocidad y si
BRGH=1 se trabaja en alta velocidad, según este bit se obtiene
el valor de una constante K necesaria en la determinación de la
frecuencia de funcionamiento [10-12].

B. Programación y resultado
En esta parte del trabajo se expone la manera en como se
implementaron los ambientes de visualización y
procesamiento de los datos.

En la Figura 7. Se muestra el diagrama del sistema


empotrado que permite realizar la conversión de la señal de
entrada analógica así como también la parte de la
comunicación serial asíncrona. Figure 8. Despligue en Pantalla de Lectura Empleado Simulink-Matlab.

V. CONCLUSIONES
En este trabajo se desarrollo un sistema de soporte medico
que podría aplicarse en el diagnóstico de enfermedades
mentales, con base a una red neuronal, partiendo de 4 tipos de
combinación lógica para interpretar el potencial de acción de
cada uno de los movimiento oculares. Después de las pruebas
realizadas en laboratorio era necesario extraer las señales
oculográficas proveniente del cerebro para un tipo de acción
determinando y con ello poder extraer cada una de las
características de las señales para estudiarlas y saber a qué tipo
de clasificación pertenecen (esto lo hace la red neuronal) [25,
26].
De los resultados de estas primeras experiencias se pueden
Figure 7. Comunicacion Serial por Medio del Bloque por S-Function. obtener las siguientes aseveraciones:
•Las señales de EOG presentan una componente
Para llevar a cabo este proyecto se hizo uso de continua muy importante porque no solo presenta
programación C++. Se muestra el programa que implementa variaciones en el corto plazo sino también en un
en el sistema empotrado para la conversión A/D y transmisión día a otro, y evidentemente de un paciente o
serial. voluntario a otro.
A grandes rasgo este programa se describe mediante dos
etapas: •Las señales bioléctricas del ser humano suele tener
• La primera etapa constan de la conversión A/D amplitudes inferiores al ruido de 50Hz. Aun
mediante la cual se habilita al PIC para que reciba cuando se utiliza amplificadores o adquisidores
en la entrada una señal de voltaje análoga (0 a 5V) específicamente diseñados para minimizar este
ruido. Afortunadamente este ruido puede ser
y posteriormente se convierte este dato a digital.
filtrado siempre y cuando no interese medir una
potencial bioeléctrico justo a esa frecuencia.
• La segunda etapa consta de trasmisión serial en la
cual se recibe el dato convertido para posterior •Las señales rápida del parpadeo (ya sea voluntaria o
trasmitirlo a través del puerto serie. involuntarias) se muestran como cambios de
potencial muy rápidos perfectamente

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discriminables de la línea de base de la señal [15] A.Domingues. “Smartphone Based Monitoring System for Long-
filtrada TermSleep Assessment.” In Mobile Health Technologies Methods in
Molecular Biology, Vol 1256, Springer, 2015, pp 391-403.
Como trabajo futuro se pretende realizar o caracterizar este [16] P. Travis. “ An Assessment of Single-Channel EMG Sesing for Gestural
tipo de señales mediante una red neuronal ya descrita para que Input”, Dartnouth College, Computer Science Departemant, Tech. Rep.
posteriormente esta cumpla con los patrones ya preestablecidos TR2015-767, 2015.
dependiendo del tipo de enfermedad mental validado por un [17] A. Verhulst, T. yamaguchi and p: Richard. “Physiological-based
dynamic difficulty adaptation in a theragame for children with cerebral
medico. Dado que las pruebas de detección ocular por el palsy”, In Proc. Of the int´I Conf. on Physiological Computing Systems
momento se realizaron con voluntarios sanos. (PhyCS), pp. 164-171, 2015.
Por ello se ha entregado en línea y fuera de línea, esto es [18] A. Chaé. D. Olezak, T Fernandes and h. Ferreira. “Physiological
computing gaming: Use of electrocardiogram as an input for video
que si algún paciente tiene una señal ocular distinta a las ya gaming.” In proc. Of the Int Conf. on Physicological Computing
aprendidas previamente por la red, pueda discernir a cual es la Systems (PhyCS), pp. 157.163, 2015.
que mas se le parece o en su defecto crea un nuevo tipo de [19] H. Silva, Fred and R Martins “Biosignals For Everyone “, IEEE
señal para su posterior análisis. Pervasive Computing, 13(4):64-71,2014.
[20] B. Gamecho, J. Guerreiro, P. Alves and A. Lourenco. “Evaluation of a
Con esto se pretende que la red este entrenada para context-awaare application for mobile robot control mediated by
reconocer cualquier tipi de anomalía en señales oculares y physiological data: The ToBITas Case study”. In Proc. Of the Int´I conf.
pueda dar un diagnostico final y precio acerca de los estados on Ubiquitous Computing &Ambient Intelligene& International Work-
que presentan las señales oculares de algún paciente con alguna Conference on ambient Assited Living(UCAmI&IWAAl), 2014.
enfermedad mental. [21] A. Bernando, y.Rybarezk and J. Barata. “versatily of human body
control through low-cost electromyographic interface”, In Proc. Of the
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