Genética Evolutiva

Davinia María García Molina

Tema 5. Equilibrio de Hardy - Weinberg

El principio se cumple siempre y cuando la población de estudio sea grande, donde no se vayan a producir
procesos de deriva genética. Además, la población debe estar en panmixia (apareamiento al azar, es decir, que
los humanos no nos reproducimos en función de nuestras posiciones nucleotídicas). Además, la población
debe estar en ausencia de factores que modifiquen las frecuencias alélicas como la mutación, la migración y la
selección sobre el locus. Este principio es una hipótesis nula, ya que si una población está en equilibrio de
Hardy-Weinberg, no se va a producir evolución, y sabemos que esto no es así.
Se aplica para saber si la calidad del genotipado de secuenciación masiva es buena o mala. Si cumple el
equilibrio de Hardy-Weinberg, la calidad es alta.

Si todos esto sucede, el principio dice que:

- Las frecuencias alélicas no cambian de generación y generación
- Si los cruces son al azar, las frecuencias genotípicas pueden estimarse a partir de las frecuencias
alélicas como una binomial (p+q)2 si el locus es bialélico o una multinomial (p+q+r+...+z)2.

Cuando los genotipos están en las proporciones esperadas de p2, 2pq, y q2, se dice que la población, para
ese locus, se encuentra en equilibrio de Hardy-Weinberg.

Partimos de una sola población inicial con un único locus, el locus A. En el tablero de Punnet fusiona alelos A1
y A2 para ver lo que puede ocurrir en función de los alelos en la población. Los machos en la población
tendrían alelos A1 y A2 al igual que las hembras y suponemos que las frecuencias son igual también en ambas:
p y q.
A partir de las frecuencias alélicas se pueden calcular las frecuencias genotípicas que se van a generar en la
siguiente generación mediante la fórmula pxp, es decir, p2 al cuadrado en el caso de A1A1 y q2 en el caso de
A2A2. Para A1A2 o A2A1 sería pxq+pxq=2pq.

La población la puedo considerar como una caja llena de alelos 1 y alelos 2. Si la población está en panmixia,
los gametos al mezclarse darán individuos:
- A1A1→ con una frecuencia p2
- A1A2→ con una frecuencia 2pq
- A2A2→ con una frecuencia q2

En estas clases genotípicas se tienen en cuenta todos los individuos.

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Así se demuestra que la frecuencia del alelo A1 no ha cambiado.

Esto es un problema ya que para que ocurra la evolución deben cambiar, por ello, debe producirse alguna
excepción a la ley de H-W.

Consiste en ver qué ocurre con las frecuencias genotípicas.

El primer recuadro amarillo nos indica que esa fórmula se emplea por las proporciones mendelianas para este
caso de 1/4,2/4,1/4. El segundo recuadro amarillo muestra cómo se saca factor común de p2. El tercer
recuadro amarillo muestra que las frecuencias genotípicas no han cambiado, pues sigue siendo p al cuadrado
el resultado.

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Características de la población ideal de HW:
1. Organismo diploide→ dos copias. Los cromosomas sexuales tienen un tratamiento especial
2. Reproducción sexual
3. Generaciones no solapantes (todos los individuos sexualmente activos)
4. Panmítica = Apareamientos al azar = Frec. de un apareamiento depende de la frecuencia en la población de
los individuos implicados:

5. Población infinita (grande >500) → ausencia de Deriva genética

6. Ausencia de migración
7. Ausencia de mutación
8. Ausencia de selección
9. Ausencia de Epistasis, ligamiento, ..... → no influya el fondo genético

Conclusiones del Equilibrio H-W

1.- Frecuencias genotípicas de una generación dependen de las alélicas de la generación anterior. Sólo necesito
conocer p y q para calcularlas.

En esta gráfica se representa en el eje x las frecuencias de alelo A2, es decir, q. Las líneas representan las
frecuencias genotípicas, como van variando en función del alelo A2. A medida que el alelo A2A2 va a
aumentando en frecuencia, la de los A1A1 comienza a descender paulatinamente, de modo que cuando la
frecuencia de A2A2 es 1, la de A1A1 es 0.
Para los homocigóticos A2 ocurre lo opuesto.
Con los heterocigóticos se observa máxima frecuencia cuando las frecuencias de los alelos, p y q, sean
iguales. Es el momento en el que mayor nº individuos heterocigóticos se esperan en la población.

2.- Las frecuencias genotípicas de una generación son independientes de las genotípicas de la generación
anterior. Solo dependen de las alélicas.
3.- Independientemente de cuáles sean las frecuencias genotípicas iniciales, tras 1 generación de apareamiento
al azar se alcanzan las frecuencias de equilibrio:

Es decir, si se modifican las frecuencias genotípicas sin cambiar las alélicas, el equilibrio se restablece tras 1
sola generación de apareamientos al azar.

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¿Cómo podemos saber si una población está en eq de H-W?

640 en A1A1 se obtiene de multiplicar 320x2. 16 en A2A2 se obtiene de multiplicar 8x2.

Las frecuencias alélicas se calculan de la siguiente manera: 712/800=0’89 y 88/800=0’11.
En base a las frecuencias alélicas puedo calcular las frecuencias genotípicas esperadas bajo el equilibrio de H-
W.

Esta fórmula para los grados de libertad se emplea siempre que se estime chi-cuadrado de H-W.

En este ejemplo, hay entre un 10-20% de posibilidades de que se deba por azar, por tanto, acepto mi hipótesis.

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No valdría el test de chi-cuadrado sino el test exacto de Fisher (en clase nunca lo aplicaremos al ser más complejo).

En caso de relación de dominancia entre alelos (bialélico)

3 genotipos—> dos fenotipos; AA Aa aa —> A_ (AA + Aa) y a (aa).
El fenotipo recesivo “a” coincide con genotipo homocigótico recesivo “aa”
Si la población está en equilibrio de H-W podemos estimar las frecuencias alélicas.
La frecuencia de los “aa” sería q2:

Sin embargo, esto es absurdo por suponer que la muestra está en equilibrio para estimar las frecuencias
alélicas y ahora testar si la muestra está en equilibrio. Por ello, en casos de dominancia entre alelos
necesitaremos una segunda muestra de la misma población para testarlo. Si las dos muestras se corresponden
con una misma población, espero que las frecuencias alélicas en la población sean representación de las
individuales. Dom representa los individuos A_ y Rec a los individuos aa. Recordar que q se obtiene haciendo la
raíz cuadrada del valor obtenido para q2. examen

Analizamos una segunda muestra de la población (1050 individuos). La clase AA es p2, la clase Aa es 2pq y la
clase aa es q2.
Estimamos los individuos con alelos dominantes que esperaríamos en la nueva muestra de la población (N=
1050)—>(p2 + 2pq) x N = 535,5
Y los individuos homocigóticos recesivos: q2 x N = 514,5
Comparamos los observados y esperados en esta segunda muestra realizando el test de chi-cuadrado.
Cálculo: (590-535’5)2/535’3 (elegimos los valores de los dominantes para el cálculo ya que estimamos los
individuos con alelos dominantes que esperaríamos en la nueva muestra de la población).

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Locus multialélico con relaciones de dominancia y codominancia

D=desviación
Una vez estimadas las frecuencias alélicas p, q y r, testaremos si la poboblación está en equilibrio de HW:

El sumatorio nos da el valor de chi cuadrado= 2.462, con 1 grado de libertad. Se acepta la hipótesis.

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¿Qué ocurre si en una población las frec alélicas en los dos sexos son diferentes?:

En la tabla, los valores se obtienen multiplicando el valor del macho por el de la hembra que le corresponde.
No se alcanza el equilibrio si las frecuencias alélicas son diferentes en los dos sexos. Las frecuencias alélicas de
la siguiente generación son la media entre machos y hembras, por ello, no van a coincidir. Si una población, por
tener diferencias entre las frecuencias alélicas entre machos y hembras no está en equilibrio, en una sola
generación de cruces panmícticos se igualan y pasa a ser la media de las frecuencias alélicas de la generacípon
anterior y tras un nuevo cruce panmíctico, la población se encuentra ya en equilibrio de H-W.

Ejemplos:
1. Cruzamos machos de una población de distribución genotípica A1A1= 0’4; A1A2= 0’4 y A2A2 =0’2 con
hembras de otra población de distribución genotípica A1A1= 0’2; A1A2= 0’8 y A2A2= 0. ¿Qué proporciones
genotípicas observaremos en la generación F1 si una vez mezcladas se aparean al azar?

2. En una población natural se genotipan los individuos para un locus codominante con alelos A1 y A2. Las
frecuencias genotípicas en los machos son: A1A1= 0’09; A1A2= 0’10 y A2A2 =0’81. En hembras las
frecuencias genotípicas resultan ser A1A1= 0’36; A1A2= 0’15 y A2A2 =0’49. ¿Está la población en equilibrio de
Hardy-Weinberg? ¿Cuáles serán las frecuencias alélicas en la siguiente generación? ¿Cuáles serán las
frecuencias genotípicas en el equilibrio?

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Genes ligados al cromosoma X (haplo-diploidía)

La comparación se hará sólo para las hembras al ser heterocigóticas, a diferencia de los machos que no
presentan heterocigóticos. Los machos tienen la frecuencia del alelo A1 de la madre.

En los machos, los individuos A1 son pf de la generación anterior (de las hembras) y qf en la frecuencia de los
machos A2 será la frecuencia de los alelos A2 en la generación anterior de las hembras. Es decir, las
frecuencias de los machos irá cambiando paulatinamente, de manera que, en cada generación, la frecuencia de
esos alelos en los machos será la que tenían las hembras en la generación anterior. Por tanto, en este caso no
es la media y se obtendria una gráfica como la siguiente:

Las frecuencias se van igualando pero pasarán muchísimas

generaciones hasta que consigan igualándose.

Tardará muchísimo en alcanzar el equilibrio de H-W y antes de

alcanzarlo tendrán que igualarse las frecuencias alélicas.
No porque una población tenga las mismas frecuencias alélicas
en machos y hembras tiene que indicar que esté en equilibrio
de H-W.

Conclusiones de estos últimos casos:

Si los datos de la población nos los dan separados por sexos (sea el locus autosómico o ligado al sexo)
comprobaremos en primer lugar que las frecuencias alélicas son iguales en ambos sexos ya que es una
condición necesaria antes de calcular equilibrio de H-W. Es una condición necesaria aunque no suficiente.
Si son iguales, entoces pasamos a testar el equilibrio de H-W.

¿Cómo testar si dos muestras (genotipos o alelos) son iguales o no (homogéneas)? Test de contingencia:
En caso de que lo fueran, entonces testaríamos el equlibrio de HW. En el caso de los autosómicos utilizando
las frecuencias alélicas de la población total y comparando las clases genotípicas/fenotípicas esperadas en la
población total. Mientras que en el caso de loci ligados al sexo si bien las frecuencias alélicas las calcularemos
en la población total, la desviación del equilibrio la estimaremos en el sexo heterogamético.

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El test de contingencia es un test de chi-cuadrado pero ligeramente diferente al de H-W.

En resumen, sólo en el caso de que las frecuencias sean iguales, testo el equilibrio, por ello, recordemos que
debemos realizar esta prueba primero.

¿Cómo podemos saber si dos poblaciones son homogéneas?

Mediante la prueba de X2 de contingencia donde se comparan, para todo lo posible, los observados de una
muestra con los esperados de la otra.
Grados de libertad: (filas - 1) * (columnas-1)

En el ejemplo anterior vemos que son dos muestras de población y nos preguntan si pueden considerarse cada
una de estas muestras representativas de una única población.
En primer lugar se calculan los subtotales: la probabilidad de que se coja un individuo a ciegas perteneciente a
la población 1 del total (148 individuos) es 68/148. Esto se representa: p(I)=68/148.
39/148 es la probabilidad de que sea A1A1. Se representa: p(A1A1)=39/148

La probabilidad esperada de escoger a un individuo A1A1 y pertenezca a la población I es p(I) x p(A1A1)

teniendo en cuenta que debe tratarse de una muestra homogénea (una misma población). Es decir, sería
68/148 x 39/148 lo que da como resultado la frecuencia relativa. Si esta es la frecuencia relativa, la frecuencia
absoluta se obtendría multiplicando por 148 la frecuencia relativa. Sin embargo, el 148 se va con el
denominador que es también 148, por ello, en la diapositiva observamos como los totales 39 y 68 se
multiplican y dividimos entre el denominador que queda, que en este caso sería entre 148.
Los chi-cuadrados nunca se hacen con frecuencias, siempre se utilizan valores absolutos (observados-
esperados).

A continuación, debemos construir una tabla igual que la de observados pero con los valores de los esperados.
En este caso se tienen dos grados de libertad.
Como no hay casillas esperadas menores de 5, no se hace correción de Yates y directamente calculo el chi-
cuadrado.

La probabilidad de que fueran homogéneas es menor de 0,001, es decir, es altamente significativa, por ello,
rechazo mi hipóteiss y no son homogéneas pues existen diferencias en las frecuencias genotípicas.
Para las frecuencias alélicas elaboramos una tabla como la anterior que se muestra más hacia la derecha y, tras
realizar los cálculos correspondientes, comprobamos que existen diferencias también.
Por tanto, la población total no está en equilibrio de H-W pues hay una mezcla de poblaciones.

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