La Subcuenca Quillcay se localiza en la Cuenca del río Santa, perteneciente a la Vertiente
del Pacífico, se encuentra ubicada en la ciudad de Huaraz con un área de 248.35 km2y perímetro de 72,97 km, con una altitud de 3000 hasta los 6000 m.s.n.m. conformado por las microcuencas Auqui y Paria que abarca los distritos de Independencia y Huaraz. El río Quillcay tiene su origen en la quebrada Cojup, que forma el río Paria, aguas abajo; en su trayectoria y después de la confluencia del río Auqui, toma el nombre de Quillcay, atravesando la ciudad de Huaraz antes de desembocar en el río Santa.