Prueba

3 Microbiología
5.1 MO’s en el suelo: Ciclo del carbón y ciclo del azufre.

Þ El suelo no hubiese sido posible sin los MO’s.
Þ El suelo y los MO’s son parte del mismo proceso evolutivo.
Þ De la vida de los microorganismos depende la actividad de la Tierra.
Þ Durante la evolución los MO’s adaptaron el medio a las condiciones que ellos
necesitaban. (Descomponer la materia o formar ácidos).
Þ Los MO’s han sido capaces de adaptarse a las condiciones cambiantes del entorno.
Ejemplo de esto:
Aparición de cianobacterias
Bacterias Bacterias
- Utilizan el sol para obtener
anaerobias anaerobias
su propia energía.
cambian su
Usaban CO2 - Aparece el O2 como hábitat para
desecho. sobrevivir al O2


Funciones de los MO’s en el suelo.

Þ Descomposición de la materia orgánica y mineralización
§ Liberación de nutrientes para la reabsorción por parte de las plantas
(reciclaje de materia orgánica)
Þ Capturar nitrógeno para ponerlo en disposición de las plantas.
Þ Hacen disponibles elementos químicos como el fosforo, hierro, potasio para los
habitantes del suelo.
Þ Sintetizan materia orgánica a partir de la energía solar. (O2)
Þ Reducción de parásitos en las plantas.
Þ Firmeza mecánica al suelo
Þ Desintoxican el suelo, libre de residuos tóxicos, incluso del uranio.
Þ Inducen formación de quelatos.

Ciclo del carbono y tipos de ciclos.
Plantas y algunas
bacteria lo consumen
Ciclo para producir su
biológico alimento
CO2 vuelve a la atm a
través de diversos
Ciclo del carbono procesos.
Regulación del clima en la tierra, transferencia de
carbono entre atmósfera y litosfera
Ciclo
biogeoquímico CO2 del aire se disuelve con silicatos à
Forman las rocas


Ciclo redox del carbono. -> CO2 es la forma más oxidada del carbono

En los procesos aeróbicos, la materia orgánica a través de la respiración
Produce CO2. Y el CO2 en condiciones aeróbicas, con los procesos de fotosíntesis que la
principal forma de obtener materia orgánica a través del CO2, o con el proceso de
quimiolitotrofia, que son aquellas bacterias que obtienen su energía a través de procesos
químicos, toman el CO2 y lo transforman en materia orgánica.

En los procesos anaerobios, mediante los

procesos de acetogenia o fotosíntesis
anoxigénica, el CO2 se transforma en
materia orgánica, a su vez esta misma
materia orgánica puede liberar ciertos gases
y con el proceso de metanogenia este es
transformado en metano, CH4, este mismo
metano, con la metanotrofia puede volver a
ser transformado en CO2. A su vez el CO2
con el mismo proceso de la metanogenia
puede transformarlo en metano. Por otra
parte, la materia orgánica con los
mecanismos de respiración anaerobia o
fermentación transforman la materia
orgánica en CO2.

Ciclo del azufre
Þ Posee una fase sedimentaria donde el S se encuentra en depósitos orgánicos e
inorgánicos.
Þ Tiene una fase gaseosa que circula en grandes escalas.
Þ El S entra de diversas formas a la atmosfera:

Depósitos de
azufre

Quema/
Gases en Aportes Dimetil de
consumo de
descomposición volcánicos sulfuro
combustible

Interface océano
/tierra

 Þ Azufre existe en muchos estados de oxidación.
Þ Sus transformaciones ocurren de forma abiótica y biótica
Þ Los 3 estados de oxidación más importante son:
§ Estado -2
• Sulfhídrico -> H-SH
• Sulfuro -> HS -

§ Estado 0
• Azufre elemental -> S0
§ Estado + 6
• Sulfato -> SO2- 4
• Reservas en rocas, minerales y océanos. SO2- 4

Þ El SO2 (dióxido de azufre), entra en el ciclo del azufre, producto de las
actividades humanas por la quema de combustibles.

Ciclo de redox del azufre.

El ácido sulfhídrico, H2S, es la forma principal de encontrar S en la atmosfera. Con un
proceso de oxidación, es decir, aerobio, genera S y a su vez si S se oxida de nuevo puede
producir, sulfato.
El sulfato es soluble en agua, que puede ser asimilada (asimilación de sulfato), por lo MO,
en forma de proteínas, estas proteínas, son SH, también por un proceso de desulfuración
puede volver a formarse H2S.
Si el mismo sulfato es reducido también puede formar H2S.
La forma más común de encontrar sulfuro en la naturaleza es a través de Dimetil sulfuro,
DMS, que algunas algas las producen.
Las algas metabolizan Dimetil sulfonio, que produce Dimetil sulfuro que cuando se reduce
forma Dimetil sulfoxio.

En las condiciones anaeróbicas,
el sulfato a través de la
asimilación de sulfato crea
aminoácidos para las proteínas
y con la desulfuración forma
H2S.
El S con procesos de
dismutación del azufre puede
producir SO-2 4 o H2S.,
además si el S se reduce forma
H2S. Con la reducción de H2S
pasa a S y se reduce de nuevo
se convierte en SO-2 4, sulfato.

MO’S en el agua: Ciclo del fosforo.

Þ Elemento esencial para todos los sistemas vivos
Þ Más abundante: esteres de fosfatos y ácidos nucleicos.
Þ P es esencial para el ATP (transferencia de energía).
Þ Fosfolípidos en la membrana celular.
Þ Es limitante para el crecimiento, no muy abundante.
Þ Disponibles en sedimentos marinos y acuáticos
Þ Fosfato reciclado activos -> mezcla entre suelo, agua, materia orgánica o
materia muerta.
Þ Industrias explotan el P, para el abono.
Þ Las transformaciones del P realizadas por MO’s son transferencias de
fosfato inorgánico a orgánico.
Þ Diversos MO’s han desarrollado sistemas de transporte de P, para regular
su adquisición.
En ambientes acuáticos, las concentraciones de fosfato, se asocian con la aparición de
cianobacterias y algas. P puede estar en forma soluble o particulada.
En ambientes marinos, la precipitación de fosfato, limita la producción primaria.
La concentración de fosfato en agua dulce –> eutrofización (acumulación de residuos
orgánicos).

MO’s y el fosfato.
Þ Algunos MO’s lo utilizan como aceptores terminales de electrones.
Þ Fosfinas -> Producto de algunas acciones microbianas
Þ Fosfato + Calcio = Insolubles y no pueden ser usados por plantas y MO’s.
Þ Nitrosomonas y Thiobacillus, solubilizan fosfato inorgánico insoluble.
Þ Las enzimas fosfatas creadas por MO’s -> procesos inversos de la mineralización
del fosfato orgánico.
Þ bacterias y hongos -> Fitasa -> liberan fosfatos inorgánicos.
Þ Actividad de MO’s pueden inmovilizar el P. Se vuelve inaccesible.

Cuando las rocas son meteorizadas, liberan
fosforo a la tierra, esta es absorbida por las Parte de este fosforo es movido por las
plantas que se las comen los animales, de esta corrientes y llega al mar, una parte queda en
forma es fosforo se añade a la cadena trófica los fondos marinos donde no se puede
terrestre, cuando un ser vivo muere o bota sus aprovechar, salvo por el a florecimiento de
excrementos, esta vuelve a la tierra y es aguas profundas. La otra parte es consumida
absorbida por el suelo. por el plancton donde los peces se lo comen
y luego las aves marinas se comen los peces.
Cuando las aves marinas hacen sus
excrementos o guano, este fosforo es
depositado nuevamente en la tierra
partiendo un ciclo nuevo.
MO’s en el aire: Ciclo del nitrógeno y ciclo del oxigeno.

Þ Medio hostil para los MO’s
Þ Movimiento a través del aire es el principal medio de dispersión de MO’s. Algunos
han desarrollado adapciones para este medio.

Ciclo del nitrogeno.
Þ Escencial para la vida
Þ Distintos estados de oxidación
Þ Procesos principales de transformaciones microbianas de N son: nitrificación,
desinitrificación, fijación del nitrogeno.
Etapas del nitrogeno:

1. Fijación.

2. Nitrificación o mineralización

3. Asimilación

4. Amonificación

5. Desnitrificación


El N2 siempre necesita ser fijado para poder comenzar el ciclo, la fijación tiene un alto
consumo energético y lo realizan las bacterias y algunas arqueas, la fijación del N2 en
condiciones aerobeas se realiza más. Una vez que entra en N2 se convierte en amonio,
NH3, en condiciones aerobias si se oxida, a través del proceso de nitrificación pasa a
ser NO2- y si se vuelve a oxidar se convierte en NO3- , este puede ser asimilado y ser
captado para formar proteinas nitrogenadas, formar grupos de proteinas, si se
amonifica este grupo de proteinas vuelve a ser amonio. Tambíen directamente el
 amonio puede ser asimilado para formar un grupo de proteínas. El NO3- puede
convertirse directamente en NH3.
En condiciones anaerobias si el NO3- es reducido pasa a ser NO2- que puede ser
asimilado como grupo de proteinas que puede volver a ser NH3, o directamente este
puede formar un grupo de proteinas. El NO2- a través de un proceso de
reducción(desnitrificación) se convierte en N que puede convertirse en NH3. A su vez
el NO2- puede transformarse en N2O o en NO que con un proceso de anammox pasa
a ser N2 de nuevo.

MO’s que pueden realizar las etapas del nitrogeno.
Nitrificación Desnitrificación Fijación Amonificación Anamox

Nitrobacte Pseudomonas Azotobacter, Muchos pueden Brocadia

Cyanobacteria hacer esto

Ciclo del oxigeno

Þ Animales y plantas lo usan para respirar
Þ Se consume O2 cuando plantas y bacterias descomponen plantas y animales
muertos, quema de madera u otros combustibles.
Þ Las plantas devuelven O2 al ambiente
Þ Ciclo de O2 y ciclo de carbono muy unidos. Por el CO2 consumido y liberando O2
de la fotosíntesis y el proceso inverso de la respiración celular.


Ingeniería genética.
v Influye en la economía del proceso
v Aumenta la baja de producción de ciertas cepas
v Adecuar el MO’s a las condiciones ambientales donde se realice el proceso
v Elimina compuestos colaterales
v Obtención de MO’s capaces de sintetizar productos de interés biológico, mediante
las técnicas de ADN recombinante.
Þ La modificación genética puede traer consecuencias negativas
Þ Legislación pone reglas estrictas como medida de seguridad para que no se liberen
MO’s modificados que no se conocen sus efectos.
Þ Amplia diversidad, solo algunas de interés industrial
Þ Cepas industriales pueden ser muy distintas a las originales.
ADN recombinante.
Proceso que permite aumentar la variabilidad genética por la unión de la info genética de
dos genotipos.
Genotipo: genes del ADN
Fenotipo: lo que se manifiesta, características físicas.
Clonación:
Obtención de organismos genéticamente idénticos.
Þ En la ingeniería genética, se aísla y se multiplica un trozo de ADN
Þ En seres vivos más grandes, se obtiene de un individuo a partir de una célula o del
núcleo de otro individuo.
Tecnología del ADN recombinante.
Þ Aislamiento y manipulación de un trozo de ADN de un microorganismo pata
introducirlo a otro -> ADN RECOMBINANTE. Se usan enzimas de restricción, las
cuales reconocen la secuencia de ADN que deben cortar, para así aislar el trozo de
ADN que nos interesa.
Þ Separación de los fragmentos -> Electroforesis, separa fragmentos de ADN por su
tamaño y carga. Se le aplica corriente a través de un gel que contiene la molécula
de interés. Permite reconocer si el gen que se extrajo está correcto.
Þ Plásmidos: fragmento de ADN que esta fuera de los
cromosomas(extracromosomal), se duplica en forma autónoma del cromosoma,
contiene los genes que codifican para su auto transferencia.
Luego de usar las enzimas de restricción y se cortó el gen de interés este se coloca en
el plásmido, que tiene una forma circular, los terminales del gen coinciden con los
terminales del plásmido finalmente se unen con ADN ligasa. Después se pone en un
organismo que pueda copiar este plásmido y replicarlo. (E. Coli). Finalmente, esta
bacteria se hace crece en un ½ de cultivo con los nutrientes necesarios, para que se
reproduzca.

E. Coli
Plásmido

Aplicaciones de la secuencia del ADN:
1. Detección de mutaciones, enfermedades etc.
2. Secuenciación de ADNs fósiles
3. Diagnóstico de enfermedades genéticas -> enfermedades hereditarias.
4. Identificación de especies y control de cruces entre animales
5. Secuenciación de genomas (conocimiento básico sobre algún genoma)
 6. Obtención de proteínas de interés, medico comercial etc.: insulina, hormona del
crecimiento
7. Obtención de vacunas recombinantes -> patógenos inactivos.
8. Diagnóstico de enfermedades de origen genético.
9. Plantas transgénicas: transgénesis = introducir un ADN extraño en un genoma, de
modo que se mantenga estable y se herede.
10. Resistencia a herbicidas, insectos y enfermedades microbiana.
11. Mejora de calidad de los productos agrícolas.
12. Síntesis de productos de interés comercial.



































Biorrefinerías => valor añadido al uso de biomasa.

Biomasa: toda la materia orgánica de origen vegetal o animal, incluyendo los materiales
procedentes de su transformación natural o artificial.

Tipos de materiales:
Þ Residuos forestales y agrícolas
Þ Residuos biodegradables
Þ Residuos sólidos urbanos

Durante el siglo XIX se utilizó mucho la biomasa como fuente de energía, calefacción,
cocción de alimentos.
Durante los años 70 existió una crisis del petróleo, y se volvió a utilizar biomasa, pero con
otras tecnologías y biomasa más elaborada.
Þ Etanol, por fermentación de azúcares(Brasil)
Þ Biogás, por fermentación anaerobia.
Los precios del petróleo se regularon, y se perdió totalmente el interés en seguir
investigando la biomasa como un fin energético.

Biorrefinerías => Instalación donde se generan, de forma sostenible, diversos productos a
partir de la biomasa.
Utilizando una base biológica para producir:
• Sustancias químicas
• Biocombustibles Biomasa como materia prima
Combinando procesos biológicos,
• Bioenergía
termoquímicos y químicos de una forma
• Productos alimentarios
optima
• Biomateriales

Las industrias que generan residuos orgánicos, se convierten en materia prima para las
biorrefinerías y así obtener una amplia gamma de productos.
Las materias primas para utilizar en una biorrefinerías son:
• Agrícola: cultivos energéticos(CE) y residuos agrícolas: caña de azúcar, tallos, paja.
• Forestal: madera, CE, residuos forestales: ramas, chopo.
• Industrial: residuos, subproductos: papel, lodos.
• Actividades domésticas: residuos orgánicos
• Acuicultura: algas.
Dos tipos de subgrupos de la materia prima.
1. Cultivadas: acuáticos, lignocelulósicos, biomasa azucarada.
2. Residuos: lignocelulósicos, aceite, orgánicos.
Dos tipos de grupos de productos formados a partir de la biomasa.
1. Productos energéticos
• Biocombustible gaseoso: biogás, biometano.
• Solidos: pellets, lignina, carbón
 • Líquidos: bioetanol, biodiesel.
2. Productos en base biológica: productos químicos, polímeros y resinas,
biomateriales, fertilizantes y productos para la alimentación animal-humana.

TIPOS DE BIORREFINERÍA.
Þ Producción energética
Þ Producción hacia la extracción de compuestos de alto valor añadido.

Producción de etanol
1 generación
Co-productos

Almidón, aceite de maíz.

Tipos de biorrefinerías 2 generación Molienda de grano
húmedo

Biocombustible, prod.
Químicos
3 generación
Parte de biomasa forestal
o agrícola

BIORREFINERÍA MATERIAL CEREAL:

Arroz, trigo, avena, cebada, maíz.
En molienda seca: Entra el cereal, y sale grano para hacer harina, almidones y terminar
siendo combustible o prod. Químicos, por otro lado, se forma paja, que crea materia
prima que se puede utilizar para combustibles, polímeros etc.
Molienda seca Molienda húmeda.

En molienda húmeda: Se macera el grano, puede hacerse un germen den grano por
conversión física-química se sacan los aceites y puede hacer combustibles, piensos,
fármacos, prod. Químicos. De la paja se hace materia prima y terminar siendo lo mismo
anteriormente.


BIORREFINERÍA MATERIAL LIGNOCELULÓSICO:

Paja, madera, caña.


Entra la biomasa LC, y se pueden sacar 3
derivados celulosa, que entrega azúcar
como materia prima, hemicelulosas
(xilosa) que se utilizan para combustibles,
prod. Químicos entre otros.
Y Lignina.

BIORREFINERÍA VERDE:

Hierba, alfalfa, trébol.

PROCESOS DE UNA BIORREFINERÍA.

Procesos Mecánicos Químicos

Bioquímicos
termoquímicos

Reducción de tamaño Hidrólisis

Gasificación Fermentación
Separación Transesterificación
Pirolisis Digestión anaerobia
Extracción


à PROCESOS TERMOQUÍMICOS.

Þ Gasificación: Se oxida parcialmente la biomasa altas temperaturas.
DME, biometanol, metanol, alcoholes, Syngas, BTL.

Þ Pirolisis: Temperaturas intermedias.
No hay O2.
Similares al Syngas(g), biodiesel(l), carbón vegetal(s).

à PROCESOS BIOQUIMICOS.

Þ Fermentación(O2): SE DEGRADA EL SUSTRATO FERMENTABLE EN BIOMASA.
(actúan MO’s)
se transforman materias primas con un alto % de carbohidratos.
Forma simple: sacarosa, caña de azúcar
Polímeros
Hemicelulosas (materiales LC, xilosa) y celulosa
Sueros lácteos
Principal producto BIOETANOL.

Þ Digestión anaerobia (Sin O2): biomasas con alta humedad.
Se produce BIOGAS (suspensión acuosa entre sólidos y líquidos) (energía eléctrica o
energía térmica)

à PROCESOS MECÁNICOS:
Þ Reducción de tamaño: se adapta la materia prima
Þ Se separan los componentes
Þ Se extrae prod. De interés industrial.

à PROCESOS QUÍMICOS
 Þ Hidrolisis: Modifican la estructura química de una molécula. Se usan ácidos,
enzimas para despolimerarze y proteínas para los azucares
Obtener glucosa a partir de celulosa.
Þ Transesterificación: Producir biodiesel a través de esteres.


FUTURO PARA LAS BIORREFINERÍAS.
Þ Área: Generación de biomasa y logística: Mejora de especies vegetales.
=>fotosíntesis para aprovechar energía solar. Tolerancia a agroquímicos.
Þ Logística: maquinarias más eficientes y nuevos métodos de transporte.
Þ Fraccionar y penetrar componentes de la biomasa: mejorar hidrolisis.
Þ Hidrolisis enzimático de la celulosa
Þ Despolimerización y proceso de la lignina
Þ Fermentación de azúcares.
Þ Modificación de polisacáridos
Þ Biopolímeros.