Catch: relaciones evolutivas que se encuentren en las bases de datos.

Diversidad de la proteína en la familia (poca diversidad)

Deinococcus radiodurans topoisomerase IB

1. Escriba la función la proteína que ha escogido de la siguiente lista si no tiene una, o si tiene una
proteína de un microorganismo que quiere conocer su función.

Es una isomerasa

2. ¿La proteína tiene disponible estructura cristalina?, pegue una foto de ella en JMOL en
diagrama de citas, ¿Cuál es su código PDB?

Código PDB: 2F4Q

3. ¿A qué familia de proteínas pertenece?

Superfamily 1.10.132.120

4. ¿Escriba la clasificación CATH de la proteína y explíquela?, ¿Qué relaciones evolutivas puede

encontrar?

5. Elabore un alineamiento de la secuencia de su proteína con otras tres ortólogas, y elabore una
conclusión de sus resultados

Smart;

Expasy: herramientas bioinformaticas para la proteómica

Scop: busca relaciones entre proteínas,

Formato fasta: https://web.expasy.org/cgi-bin/protparam/protparam
MPSRTELLAEEYLRREGHDPQKFRYVHPDGTPYTDADGLARIARLAVPPAYQDVYVSPDAENELQAFGRD
AAGRLQYRYHPDFVQAGALKKWQRLTRFAGALPTLKVATTADLRASGLPPRKVMALMTRLLHVARFRVGS
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Pymol: