DOMINIO ARCHAEA

AYALA HERRERA NICOLAS ELIAS

RODRÍGUEZ ARANGO REYDHIÑO
SEQUEDA VASQUEZ MIGUEL ANGEL

LEIDY LORENA MENDOZA NOVA

-BIÓLOGA, M. Sc. MICROBIOLOGÍA TROPICAL.

MICROBIOLOGÍA.

UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA
FACULTAD DE INGENIERÍA
PROGRAMA DE INGENIERÍA AMBIENTAL
MONTERÍA-CÓRDOBA.
2019.
TALLER DOMINIO ARCHAEA
Esta actividad se debe realizar en grupo de máximo tres estudiantes, será socializada en la clase
que la docente indique.
1. ¿Cómo pueden perjudicar los microoganismos los ambientes naturales?
2. ¿Cómo contribuyen los microorganismos al mantenimiento de la calidad ambiental?
3. Escribe las principales características genéticas, morfológicas y fisiológicas diferenciales
entre los dominios bacteria, Arqueobacteria y Eukarya.
4. ¿Cómo sabemos que en un ambiente natural existe una diversidad microbiana sin ,.aislar
y cultivar los microorganismos que contiene?, de ejemplos.
5. ¿Cómo podría usted distinguir por simple observación microscópica un microorganismo
fotótrofo de otro quimiótrofo?
6. ¿Cuál es la función de la bacteriorrodopsina en halobacterium? ¿Y de la halorrodopsina?
7. ¿Qué propiedades tienen en común natronococcus y halococcus?, ¿Qué propiedad
importante es diferente en ambos?
8. ¿Cómo se produce la síntesis de ATP en los Metanógenos?
9. Defina a un microorganismo halófilos extremos, realiza una lista de los principales
hábitat y da el nombre de algunos de los principales miembros de este grupo.
10. ¿Cómo consigue termoplasma que su membrana soporte condiciones tan hostiles?
11. ¿Cómo consiguen los hipertermófilos que macromoléculas tales como proteínas y ADN
no se destruyan por el calor?, explica cómo se da la estabilidad térmica de estas biomoléculas.
SOLUCIÓN.
1. Los microorganismos hacen parte de los ambientes naturales, pero en algunas ocasiones
estos seres dificultan la supervivencia de otros seres que conforman un ecosistema, tanto
de manera directa como indirecta. Algunos microorganismos infecciosos que se
encuentren en el ambiente natural causan enfermedades en poblaciones de determinada
biota afectando el equilibrio del ecosistema. Algunos microorganismos perjudiciales para
un ambiente natural que se hayan mantenido presentes en poblaciones minoritarias de un
ecosistema y que por razones externas y/o internas las condiciones químicas y físicas del
ambiente cambien y favorezcan el crecimiento de dichos microorganismos, entonces las
poblaciones de microorganismos que antes eran minoritarias ahora, controlarán en gran
parte las propiedades del ecosistema, por lo tanto en este caso dichos microorganismos
perjudicarán al ambiente natural. (Madigan , Markinto, & Parker, 2004)
Las plantas tienen numerosos enemigos, pero si hay unos especialmente peligrosos esos
son los hongos. Estos microorganismos habitan en el suelo, aunque también aparecen en
los sustratos de cultivo cuando éstos permanecen húmedos más tiempo del que deberían.
Lamentablemente, cuando se vuelven visibles la enfermedad ha avanzado mucho, por lo
que a menudo el único tratamiento eficaz sea desecharlas. Como ejemplo tenemos la
pudrición de raíces, Está causada por los hongos del género Phytophthora, Rizoctonia y
Pythium. Son muy frecuentes en los semilleros, donde infectan y acaban con las jóvenes
plantas en cuestión de días, pero también en aquellas plantas que están siendo regadas en
exceso. Los síntomas que se observarán son: ennegrecimiento de la base del tallo que se
va extendiendo hacia arriba, hojas secas que se caen, detención del crecimiento.
(Sánchez, 2017)

2. La adición continua de residuos de plantas y otra materia orgánica por medio de su

transformación por los organismos del suelo, proporciona capacidad para la
autorrecuperación de la arquitectura del suelo que ha sido dañada. Las sustancias
pegajosas sobre la piel de las lombrices y aquellas producidas por los hongos y bacterias
ayudan a aglutinar las partículas. Los rastros dejados por las lombrices son también
agregados más resistentes (compactados) que el material que circunda el suelo debido a
la mezcla de la materia orgánica, el material mineral del suelo y las secreciones de las
lombrices. La parte viva del suelo es responsable de mantener la disponibilidad de agua y
aire, proveer nutrientes a las plantas, destruir a los agentes contaminantes y mantener la
estructura del suelo. Esto contribuye a la renovación de la porosidad mediante los
procesos de excavación de túneles y formación de sustancias pegajosas asociadas con la
actividad biológica. Consecuentemente, el suelo puede almacenar más agua y actuar
como sumidero de dióxido de carbono. (Agrotecnia, 2016)

La fertilidad y el funcionamiento de los suelos dependen en una gran proporción de las

propiedades bioquímicas y microbiológicas, ya que son muy importantes para definir las
principales funciones edáficas: productiva, filtrante y degradativa. Por lo tanto, la
actividad biológica y bioquímica del suelo es de importancia capital en el mantenimiento
de la fertilidad de los hábitat terrestres y consecuentemente del funcionamiento de los
ecosistemas forestales y agrícolas.
Los compuestos químicos que exudan las raíces modifican las poblaciones de bacterias,
hongos y actinomicetos y provocan cambios en los protozoos y algas.
Desde el punto de vista de sus relaciones con las plantas, los microorganismos del suelo
se dividen en tres grandes grupos: a) saprofitos, que utilizan compuestos orgánicos
procedentes de residuos de animales, vegetales o microbianos; b) simbiontes parasíticos o
¨patógenos¨, causantes de enfermedades a las plantas; c) simbiontes, los cuales benefician
el desarrollo y nutrición vegetal. (Acuña, y otros, 2006)
Entre los beneficios para el sistema suelo-planta, pueden citarse los siguientes:
 Estimulación de la germinación de las semillas y del enraizamiento.
 Incremento en el suministro y disponibilidad de nutrientes
 Mejora de la estructura del suelo como consecuencia de la contribución
microbiana en la formación de agregados estables.
 Protección de la planta frente a estrés hídrico y abiótico.

Las bacterias: Son indicadores de la calidad del suelo que refleja la población potencial
de las bacterias en un determinado suelo, especialmente aquellas que ocupan diferentes
nichos o habitats en forma saprofítica. La función básica de las bacterias es la
descomposición y mineralización de los residuos orgánicos, de donde obtienen su fuente
energética y alimenticia. Mediante su metabolismo liberan al medio sustancias como
enzimas, proteínas, reguladores de crecimiento, metabolitos y algunos nutrientes. Los
beneficios de las bacterias para los cultivos se relacionan con un incremento en la
cantidad de raíces y un aporte importante de elementos básicos para el desarrollo y
producción. (Acuña, y otros, 2006)

Los hongos: La función básica de los hongos es la descomposición y mineralización de

los residuos orgánicos frescos o recién incorporados al suelo, por esto se les conoce como
descomponedores primarios que mediante su metabolismo libera gran cantidad de
enzimas capaces de destruir compuestos de estructuras complejas, para así obtener su
fuente energética y alimenticia. Además liberan al medio proteínas, reguladores de
crecimiento, metabolitos y algunos nutrientes. Los beneficios de los hongos para los
cultivos se relacionan con un incremento en la cantidad de raíces, una protección al
ataque de fitopatógenos y un aporte importante de elementos básicos para el desarrollo y
producción. (Acuña, y otros, 2006)

Los microorganismos y el agua.

Los microorganismos juegan un papel muy importante en el proceso de limpieza del agua
contaminada con desechos industriales. Estos desechos incluyen los desperdicios que
salen de las minas, las curtiembres, las fábricas productoras de azúcar, panela etc. que son
colocados en el agua por las industrias para poder deshacerse de ellos, sin tener en cuenta
su capacidad de destruir el medio ambiente.
 Este proceso de limpiar para remediar los daños causados por procesos industriales se
denomina BIOREMEDIACIÓN y no solo se atribuye a la limpieza del agua, también se
puede aplicar a otros espacios tales como paredes, cuadros, artesanías etc.
En procesos de bioremediación se encuentran bacterias reductoras de sulfatos, que
convierten los metales contaminantes en insoluble. Al lograr ese estado, el material
contaminante se convierte en filtrable por ende, separable del medio ambiente al que está
contaminando. Este proceso de insolubilizar el material contaminante es una de las
formas más eficaces de separación. (Divulgación de la microbiología, 2019)

3. En el siguiente cuadro se evidenciarán las principales características genéticas,

morfológicas y fisiológicas diferenciales entre los dominios bacteria, Arqueobacteria y
Eukarya.

Tomado de: https://www.youtube.com/watch?v=PFKLPL_yEII&t=125s

4. Los estudios filogenéticos realizados a nivel molecular confirman las relaciones
evolutivas existentes entre todas las células. La filogeniamolecular ha facilitado el
concepto de especie bacteriana y suministrado a los ecólogos microbianos y a los
microbiólogos clínicos la posibilidad de identificar a los microorganismos incluso sin
cultivarlos. Por otra parte" ha ampliado nuestro conocimiento de la diversidad microbiana
y revelado la sorprendente conclusión de que la mayor parte de esta diversidad que existe
en la tierra no ha sido cultivada en el laboratorio.
(Extraído de: https://es.scribd.com/document/312299158/Taller-de-Microbiologia-
Primer-Corte)

5. Los microorganismos fotótrofos o fotosintéticos, son microorganismos autosuficientes,

que aprovechan la luz solar y el calor del suelo como fuentes de energía, para sintetizar
las sustancias beneficiosas generadas por la segregación de las raíces, materia orgánica o
gases nocivos (como el sulfuro de hidrógeno). Estos microorganismos, se pueden llegar a
sintetizar con sustancias útiles, como lo son ácidos nucleicos, aminoácidos, sustancias
bioactivas y azúcares. Entonces, los microorganismos fotótrofos se podrían llegar a
distinguir por simple observación, si añadimos una de estas sustancias, (ácidos nucleicos,
aminoácidos, sustancias bioactivas y azúcares), si vemos que el microorganismo (la
bacteria) responde a esto, quiere decir, que es un microorganismo fotótrofo. Un
microorganismo quimiótrofo, son aquellos que obtienen su energía metabolizando
compuestos orgánicos producidos por otros microorganismos.
(Extraído de: https://es.scribd.com/document/352953281/Algunas-preguntas-sobre-
microorganismos)

6. La Bacteriorrodopsina es una proteína característica de las archaea, principalmente

halobacterias. La estructura de la bacteriorodopsina fue resuelta en 1990, en el primer uso
de la cristalografía de electrones para la obtención de estructuras proteínicas a nivel
atómico. Desde entonces se ha utilizado como plantilla para construir modelos del otros
receptores acoplados a proteínas g antes de que las estructuras cristalográficas estuvieran
también disponibles para esas proteínas. Su principal función en la halobacterium es que
esta actúa como bomba de protones, usa la energía de la luz para transportar protones
contra gradiente al medio extracelular a través de la membrana celular. El gradiente
protónico que resulta se convierte posteriormente en energía química mediante la ATP
sintasa. La bacteriorodopsina es una proteína transmembrana encontrada generalmente
formando parches paracristalinos bidimensionales de color púrpura, que pueden ocupar
hasta casi el 50% del área superficial de la célula de la archaea. La celda elemental de la
red hexagonal se compone de tres cadenas idénticas de proteína, cada una rotada 120
grados con respecto a las otras. Cada cadena está compuesta de siete hélices alfa
transmembrana y una molécula retiniana localizada en su interior, unida covalentemente
a la lys216, la estructura típica de las proteínas retinianas.
La Halorrodopsina utiliza la energía de la luz verde/amarilla para mover los iones de
cloruro a la célula, superando el potencial de membrana. Además de los cloruros,
 transporta otros haluros y nitratos a la célula. La captación de cloruro de potasio por las
células ayuda a mantener el equilibrio osmótico durante el crecimiento celular. Al
realizar la misma tarea, las bombas de aniones impulsadas por la luz pueden reducir
considerablemente el uso de energía metabólica. La halorrodopsina ha sido objeto de
muchos estudios y su estructura se conoce con precisión. Sus propiedades son similares a
las de la bacteriorrodopsina, y estas dos bombas de iones impulsadas por la luz
transportan cationes y aniones en direcciones opuestas.
(Extraído de: https://es.wikipedia.org/wiki/Bacteriorodopsina)

7. Halococcus es un género de Halobacteriaceae, lo que significa que requieren altos

niveles de sal, a veces tan altos como 32% de NaCl, para un crecimiento óptimo. Los
halófilos se encuentran principalmente en cuerpos de agua interiores con alta salinidad,
donde sus pigmentos (de una proteína llamada rodopsinaproteína) tiñen los colores
brillantes del sedimento. La proteína de la rodopsina y otras proteínas sirven para
proteger a Halococcus de las salinidades extremas de sus entornos.
Natronococcus este haloalcalífilo pertenece a la misma familia de los microorganismos
como Halobacterium. El estudio de Natronococcus continúa explorando qué enzimas
están presentes para sobrevivir en estas condiciones, especialmente porque no hay mucha
literatura sobre las enzimas de los haloalcalífilos. (Divulgación de la microbiología,
2019)

8. Los metanógenos son autótrofos arqueobacterias que utilizan la respiración anaeróbica

para la síntesis de ATP ellos para dicha síntesis utilizan CO2 tomado de su entorno de
crecimiento como el sustrato de carbono para el crecimiento. Ellos usan algunos CO2
como agente oxidante de una cadena de transporte de electrones que, por un mecanismo
quimiosmótico, mantiene un gradiente iónico transmembrana electroquímica que
alimenta la producción de ATP.
El agente reductor que impulsa la cadena de transporte de electrones es hidrógeno,
también tomado del entorno de crecimiento. Este hidrógeno es el producto final de
residuos del metabolismo de otros microorganismos heterótrofos.
Los metanógenos utilizan este hidrógeno y este proceso mantiene una presión parcial de
hidrógeno rebajado en el retículo- rumen. Algunos de la producción de hidrógeno
microorganismos heterótrofos muestran patrones alterados de metabolismo, ya de uso
metanogeno del hidrógeno que producen.
Este proceso es importante ya que se encuentra en el corazón de algunas de las
relaciones que se caracterizan syntrophic mejor visto en el retículo- rumen y y se conoce
como " transferencia de hidrógeno entre".
Este fenómeno es importante debido a la utilización de hidrógeno por los metanógenos
reduce la presión parcial de hidrógeno de los retículo-rumen y esto altera el patrón de
metabolismo de hidrógeno "donantes " especies asociadas syntrophic. Esto es debido a
que estos organismos tienen hidrogenasas hidrógeno y minúsculas. Subir o bajar la
presión parcial de hidrógeno en su entorno de crecimiento determina sus vías de
fermentación y por lo tanto afecta a su producción de ATP que afecta a su crecimiento.
 La ecuación muestra la reducción del CO2 por H2 para producir metano. Esta reacción
redox sostiene la respiración anaeróbica que permite la producción de ATP.

El metano producido por la reducción del dióxido de carbono se pierde desde el retículo-
rumen por eructos. Es una pérdida de alimentación de carbono porque el rumen no tiene
bacterias metanotrópicas y el anfitrión de rumiantes no puede utilizar este gas . El metano
perdido de esta manera es una razón por metanógenos contribuyen a la baja eficiencia de
conversión alimenticia del rumiante anfitrión.
(Extraído de: http://www.scielo.org.co/pdf/nova/v13n24/v13n24a06.pdf)

9. CARACTERÍSTICAS GENERALES DE HALOFILOS.

 Bacterias con diversa morfología:cocos, bacilos, formas raras

 Requieren elevadas concentraciones de NaCl (1,5M ) para crecer
 Coloreadas por la presencia de Carotenoides
 Viven a pH neutro y alcalino
 Aerobios estrictos. Unas pocas especies son anaerobias
 Quimiorganotrofos (Aminoácidos o Ácidos orgánicos)
 Algunas especies contienen Bacteriorrodopsina y usan la luz para obtener energía
 Géneros representativos: Halobacterium, Halococcus, Natronobacterium
Natronomonas

10. Thermoplasma carece de pared celular pero su membrana presenta grandes cantidades de
lipopolisacárido y glicoproteína, conteniendo ambos manosa como principal monómero
de azúcar. La estructura de lipopolisacárido parece ser:

La parte glicano de la glicoproteína, una estructura muy ramificada que contiene unas 60
unidades manosa, probablemente se enlaza mediante una unidad N-acetiglucosamina a un
residuo asparagina. Es probable que ambos componentes juntos formen una capa de
polisacárido en la superficie extrema de la membrana. Las cadenas de glicano pueden
actuar entre ellas o con las proteínas de la membrana para conferir una substancial rigidez
a la membrana Permitiendo que esta sea capaz de soportar condiciones tan hostiles.
(Divulgación de la microbiología, 2019)
11. La estabilidad de lípidos, proteínas y ADN es esencial para la vida de estos organismos,
por esto vamos a explicar las peculiaridades que les permiten resistir a estas temperaturas
extremas sin sufrir daños.
Analizando las secuencias de AA de sus proteínas podemos observar que son
prácticamente iguales a las de otros organismos mesófilos. Estudiándolos con detalle
podemos detectar mínimos cambios en la secuencia de AA que implican un plegamiento
de la proteína algo diferente, lo cual nos lleva a afirmar que su conformación espacial es
lo que le confiere la termorresistencia. También actúan como estabilizadores de proteínas
ciertas sustancias como el diinositol-P y o termosomas como los de Pyrodictium
occultum.
Con respecto al ADN ¿cómo no se separan sus hebras a esta temperatura? Existen tres
motivos principales:
-La presencia de grandes cantidades de 2,3-difosfoglicerato potásico, sustancia que evita
la desnaturalización del ADN.
-Incremento del porcentaje de guanina citosina.
-El mecanismo de Girasa Reversa( un tipo de DNA topoisomerasa), el cual introduce
vueltas positivas en la cadena de ADN lo que también lo hace más resistente a la
desnaturalización térmica.
-Además de los anteriores mecanismos existen otras proteínas implicadas en la
protección del ADN.
Bibliografía
Acuña, O., Peña, W., Serrano , E., Pocasangre , L., Rosales , F., Delgado , E., . . . Alvaro , S.
(2006). LA IMPORTANCIA DE LOS MICROORGANISMOS EN LA CALIDAD Y SALUD
DE SUELOS. Joinville-Brasil: Manuscrito inédito.
Agrotecnia. (6 de Julio de 2016). Conservación de los recursos naturales para una Agricultura
Sostenible. Obtenido de http://www.agrotecnia.com.co/novedades/conservacion-de-los-
recursos-naturales-para-una-agricultura-sostenible/
Divulgación de la microbiología. (17 de Abril de 2019). Obtenido de Portal para la divulgación
de la microbiología:
https://www.javeriana.edu.co/divulgacionmicrobiologia/bioremediacion-los-
microorganismos-ayudan-a-limpiar-el-agua-y-los-espacios/
Madigan , M. T., Markinto, J. M., & Parker, J. (2004). Brock Biología de los Microorganismos.
Madrid: Pearson prentice Hall.
Sánchez, M. (8 de Agosto de 2017). Acerca de nosotros: JARDINERIAON. Obtenido de
JARDINERIAON web site: https://www.jardineriaon.com/hongos-plantas.html