TALLER BIOINFORMATICA

Carolina Ayala Hoyos

COD: 142-93081812916

PUNTO 1.
Al realizar las búsquedas en las bases de datos (GenBank, EMBL, DDBJ), puede notarse
que todas comparten la misma información, aunque presentan diferencias en cuanto
al criterio de búsqueda, como organizan la información, los formatos en que la
presentan es diferente y cada una establece sus propios límites. Por ejemplo al buscar
“la secuencia de nucleótidos del gen Cyt b” en las diferentes bases de datos, un
resumen de cómo se presenta la información es el siguiente:

EMBL: proporciona el número de la secuencia, la versión en la que puede ser

presentada ya sea en formato FASTA, TEXT o XML. Luego en una forma de tabla
aparecen los campos: organismo, tipo de molécula, topología, división taxonómica,
versión de la secuencia, entre otros. Seguidamente de manera gráfica se presenta la
secuencia de nucleótidos y otras características como el CDS, el producto del gen, la
secuencia de aminoácidos de la proteína que codifico dicho gen, entre muchas otras.

NCBI: el orden de los vínculos anteriores es diferentes, aquí no se presentan

tabulados, sino uno debajo del otro, además la secuencia de nucleótidos en el registro
solo aparece en formato de texto, donde se muestran cada una de las pares de bases,
el modo grafico se puede observar al darle click en esta opción. Además presenta un
código único de acceso para GenBank.

DDBJ: hay una opción denominada “getEntry” que al darle click se nos pide el número
de acceso para la obtención de datos. Al ingresar el número de acceso ya sea de la
bases de datos DDBJ/GenBank/EMBL, nos lleva directamente al registro de NCBI
antes descrito.

PUNTO 2.
PARTE A. Secuencias de nucleótidos
Lutzomyia dubitans cytochrome b (cytb) gene, partial cds; mitochondrial gene
for mitochondrial product
GenBank: AY316735.1
Organism: Lutzomyia dubitans
Nucleotide sequence:
CCAAATAAATTAGGGGGAGTTATCGCTCTTGTTATATCTATTGCAATTTTATTTTTTCTTCCTATC
TTACATTTAAGTAATTCTCAAGGGCTTCAATTCTATCCTATTGCTCAAATTCTATTTTGATATATA
TTAATTATGTAATTTTATTAACATGAATTGGAGCCCGACCTGTTGAAGACCCTTATATTCTTACTG
GACAAATCCTTACCGTAATTTACTTTTTATATTTTATTATAAGCCCTATCAGATCTAAAATTTGAG
ATACAATCTTAAATAATTAA
Lutzomyia cruciata haplotype 2 cytochrome b (cytb) gene, partial cds;
mitochondrial
GenBank: KC791197.1
Organism: Lutzomyia cruciata
Nucleotide sequence:
TATTTTTATTACCTATTCTTCACTTAAGAAAAACTCAAGGACTTCAATTTTATCCATTGAATCAAATTAT
ATTTTGATATATATTAATTATTGTTATTTTATTAACATGAATTGGAGCTCGCCCAGTTGAAGACCCCTAT
ATCTTAACAGGACAAATTCTTACTGTTCTATACTTTTTATACTATCTAATTAATCCCTTAATCTCTAAAA
TCTGAGATCAAACTCTAAATTAAATAGTTAATAAGCTTAAATAGCATATGTCTTGAAAACAT

Lutzomyia ayacuchensis mitochondrial cyt b gene, cytochrome b, partial

sequence
GenBank: AB761142.1
Organism: Lutzomyia ayacuchensis
Nucleotide sequence:
ACATATTTGTCGAGATGTTAACTATGGTTGACTATTACGAACACTTCATGCAAACGGAGCATCTTT
TTTCTTTATTTGTATTTATGCACATATTGGACGAGGAATCTATTATAATTCTTATCTATATATCCC
TACCTGATCTATCGGTGTTTTAATTTTATTTGTTGTTATAGGAACCGCTTTTATAGGGTATGTATT
ACCTTGAGGACAAATATCTTTTTGAGGGGCAACTGTTATTACTAATCTCCTTTCAGCAATTCCTTA
TTTAGGAAATATGCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGATTTGCTGTAGATAATGCAACATTAACTCG
ATTTTTTACCTTTCATTTCCTTTTCCCTTTTATTATTGCTGCCATAACAATAATTCATTTATTATT
TTTACATCAAACAGGATCTAATAACCCTCTAGGATTAAATAGTAACTCAGATAAAATTCCCTTTCA
TCCTTATTTTTCTTTTAAGGACTTAATTGGATTTATTATTATAGTTATATTATTAACTATTTTAAC
AATTTTATCTCCTTATTTTTTAGGAGACCCCGATAATTTTATCCCCGCTAATCCCCTAGTAACCCC
TCCTCACATTCAACCAGAATGGTATTTTCTATTTGCTTATGCTATTCTACGGTCTATCCCCAATAA
ATTAGGGGGAGTAATTGCCCTTGTTATATCTATTGCAATTTTATTTATCTTACCTTTTATCCATAT
AAATAAAATACAAGGACTACAATTTTACCCCCTAAACCAAATTTTATTTTGATATATATTGATTAT
TGTAATTTTATTAACCTGAATTGGAGCTCGACCAGTTGAAGCCCCCTATATTCTTACAGGACAAAT
TTTAACTGTAGTATATTTCTTATATTTTATTTTAAACCCTCTAATTATTAAAATCTGAGATACTTC
CTTAAATAATTAAAGTTAATAAGCTTAAATAGCAATTGTTTT

Lutzomyia verrucarum isolate Sihua18 cytochrome b (cytb) gene, partial cds;

mitocondrial
GenBank: FJ437334.1
Organism: Lutzomyia verrucarum
Nucleotide sequence:
CTAATTGGATTTATTATTATAGTAATAGCCTTAGCAATTTTAACAATTTTAGCTCCTTATTTTTTA
GGAGACCCAGATAATTTTATTCCTGCTAACCCTTTAGTGACACCCCCCCATATTCAACCAGAATGA
TATTTTCTTTTCGCTTATGCAATTTTACGTTCAATCCCTAACAAACTTGGAGGAGTTATTGCTTTA
GTAATATCAATCGCTATTTTATTTTTTCTTCCTATTCTTCATATAAGAAAAACACAAGGCCTCCAA
TTCTATCCTTTAAATCAAATCTTATTTTGATATATATTAATTATTGTAATTTTATTAACATGAATT
GGGGCACGCCCAGTTGAAGATCCATATATTTTAACAGGTCAAATTCTAACTGTTGTCTATTTTCTC
TACTATATTATAAGTCCTTTAACTTCTAAAATCTGAGATAAAATTTTAAATCAATAGTTAATAAGC
TTAAATAGCAATTGTTTTGAAAACATTAGATAGAAACTTAAATTTTCTATTAACTTTACTAAAAAT
AATTACTTAAAATAAAAAAATTTTTAACCCAATAAAAAAACAAATAAAACATAAAGACGCTGGTAA
ATAACTTTTTCAAACTAAATATATTAATTTATCATATCGATATCGAGGTAACGTT
Lutzomyia cruzi clone LC2.6 cytochrome b (cytb) gene, partial cds;
mitochondrial gene for mitochondrial product
GenBank: AY090530.1
Organism: Lutzomyia cruzi
Nucleotide sequence:
GCTCTTGTTATATCAATTGCTATTTTATTTTTTCTCCCAATTCTTCATACTAGTAAAAGTCAAGGACTTC
AATTTTATCCAATAAATCAAATTTTATTTTGATACATATTTATTATTGTAATTTTATTAACATGAATTGG
GGCACGACCTGTTGAAGACCCTTATATTTTAACCGGCCAAATTTTAACTGTATTATATTTCTTATATTAT
ATTATTAATCCTATTGTCTCAAAAATCTGAGATAAAACTTTAAATTATTAGTTAA

Lutzomyia longipalpis cytochrome b (cytb) gene, partial cds; mitochondrial

gene for mitochondrial product
GenBank: AF448542.1
Organism: Lutzomyia longipalpis
Nucleotide sequence:
CCTAATAAATTAGGGGGTGTTATTGCTCTTGTTATATCAATTGCTATTTTATTTTTTCTCCCAATTCTTC
ATACTAGTAAAAGCCAAGGACTTCAATTTTATCCAATTAATCAAATCTTATTTTGATATATATTTATTAT
TGTAATTTTATTAACATGAATTGGAGCACGGCCTGTTGAGGACCCTTATATTTTAACTGGTCAAATTTTA
ACTGTACTTTATTTTTTATATTATATTATTAATCCTATTGTCTCAAAAATCTGAGATAAAACTTTAAATT
ATTAG

Lutzomyia trapidoi isolate B001 cytochrome b (cytb) gene, partial cds;

mitochondrial
GenBank: JQ322939.1
Organism: Lutzomyia trapidoi
Nucleotide sequence:
GAATGATATTTTTTATTTGCTTATGCCATTTTACGATCAATTCCAAATAAATTAGGGGGAGTAATTGCCT
TAGTTATATCAATTGCTATCCTATTTTTTTTACCTATTTTACATATAAGAAAAAATCAAGGACTTCAATT
TTATCCAATTAACCAAGTCTTATTTTGATATATACTAATTATTGTTATTTTATTAACATGAATTGGCGCC
CGTCCTGTTGAGGCCCCTTATATTATTACAGGTCAATTATTAACAGTAATTTATTTTCTCTATTACATTA
TTAACCCCTTAACCTCAAAAATCTGAGATAACTACTTATCAAATTAATCTTAGTTGATAAGCTTTAAAAA
GCAATTGTTTTGAAAACATTAGATAGAAATTTAAACTTTCTATTAACTTTACTAAATTTAATAAACTAAA
ATAAAAAAAATTTTAACCCAATAAAAAACAAAATAAAACACAAAGACCTCGGCAAAAATCTCTTTCAAAC
TAAATATATCAATTTATCATA

Lutzomyia evansi voucher VHET PPCO2481 cytochrome b gene, partial cds;

tRNA-Ser gene, complete sequence; and NADH dehydrogenase subunit 1 gene,
partial cds; mitochondrial
GenBank: EF457572.1
Organism: Lutzomyia evansi
Nucleotide sequence:
TTTTTATTTGCCTATGCAATTCTTCGATCAATTCCAAATAAATTAGGGGGAGTCATTGCCTTAGTCATAT
CAATTGCAATTTTATTCTTACTCCCTATTCTTCATATAAGAAAAATACAAGGACTACAATTTTATCCTTT
AAATCAAATTCTATTTTGATATATATTAATTATTGTTATCTTATTGACATGAATTGGAGCTCGACCTGTA
GAAGACCCCTATATTTTAACTGGGCAAATCCTAACTGTTATTTACTTCTTATATTATATTATCAACCCAT
TAATTTCTAAAATTTGAGATAAAACTTTAAATTAATAAATTATTTAGTTAATAAGCTTTAATAGCAATTG
TTTTGAAAACATTAGATAGAAACTCAAATTTTCTATTAACTTTACTAAAAATAATTATTTAAAATAAAAA
AATCTTTAATCCAATAAAAAAACATATAAAACATAAAGATGCAGGCAAGTAACTTTTTCATACTAAATAT
ATTAATTT

Lutzomyia columbiana isolate Lcoccum1 cytochrome b gene, partial cds; tRNA-

Ser gene, complete sequence; and NADH dehydrogenase subunit 1 gene, partial
cds; mitochondrial genes for mitochondrial products
GenBank: AF403485.1
Organism: Lutzomyia columbiana
Nucleotide sequence:
TTTCTTTTCGCCTATGCAATTCTCCGATCAATCCCCAATAAACTTGGAGGAGTAATTGCCCTAGTAATAT
CAATTGCTATTCTATTTTTTCTTCCTATTCTTCATATAAGAAAAATACAAGGACTTCAATTTTATCCTTT
AAATCAAATCTTATTTTGATATATATTAATTATTGTAATTTTATTAACTTGAATTGGAGCCCGTCCAGTT
GAAAACCCCTATATTCTTACAGGTCAAATCCTTACAATTGTTTACTTCTTATACTATATTATAAGCCCTT
TAATCTCTAAAATTTGAGATAAAATTTTAAACTAATAGTTAATAAGCTTTAATAGCAATTGTTTTGAAAA
CATTAGATAGAAACTTAAATTTTCTATTAGCTTTACTAAAAATTATTACCTAAAATAAAAAAATTTTTAA
TCCAATAAAAAAACAAATAAAACATAAAGAAGCCGGTAAATAACTCTTTCAAACTAAATATATTAATTT

Lutzomyia ovallesi cytochrome b (cytb) gene, partial cds; mitochondrial gene

for mitochondrial product
GenBank: AF448541.1
Organism: Lutzomyia ovallesi
Nucleotide sequence:
CCCAATAAATTAGGAGGAGTAATTGCTTTAGTTATATCAATTGCAATCCTATTTTTACTCCCAATTCTTC
ATATAAGAAAAATACAAGGCTTACAATTTTATCCATTAAATCAAATTTTATTTTGATATATATTAATTAT
TGTAATTTTATTGACATGAATTGGAGCCCGCCCTGTCGAAGACCCCTATATCTTAACAGGCCAAATTTTA
ACAGTTATTTACTTTTTATACTATATCATAAATCCGCTTGTTTCTAAAATCTGAGATAAAATTTTAAACC
AATAA

PARTE B. Secuencias de aminoácidos.

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia cruciata]
GenBank: AGK65608.1
Organism: Lutzomyia cruciata
Amino acid sequence:
FLLPILHLSKTQGLQFYPLNQIMFWYMLIIVILLTWIGARPVEDPYILTGQILTVLYFLYYLINPL
ISKIWDQTLN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia dubitans

GenBank: AAP83447.1
Organism: Lutzomyia dubitans
Amino acid sequence:
PNKLGGVIALVMSIAILFFLPILHLSNSQGLQFYPIAQILFWYMLIIVILLTWIGARPVEDPYILT
GQILTVIYFLYFIMSPISSKIWDTILNN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia verrucarum]

GenBank: ACM69105.1
Organism: Lutzomyia verrucarum
Amino acid sequence:
DLIGFIIMVMALVILTILAPYFLGDPDNFIPANPLVTPPHIQPEWYFLFAYAILRSIPNKL
GGVIALVMSIAILFFLPILHMSKTQGLQFYPLNQILFWYMLIIVILLTWIGARPVEDPYIL
TGQILTVVYFLYYIMSPLTSKIWDKILNQ

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia cruzi]

GenBank: AAM09288.1
ORGANISM: Lutzomyia cruzi
Amino acid sequence:
ALVMSIAILFFLPILHTSKSQGLQFYPMNQILFWYMFIIVILLTWIGARPVEDPYILTGQILTVLY
FLYYIINPIVSKIWDKTLNY

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia longipalpis]

GenBank: AAP87549.1
ORGANISM: Lutzomyia longipalpis
Amino acid sequence:
ALVMSIAILFFLPILHTSKSQGLQFYPMNQILFWYMFIIVILLTWIGARPVEDPYILTGQILTVLY
FLYYIINPIVSKIWDKTLNY

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia trapidoi]

GenBank: AFK94099.1
ORGANISM: Lutzomyia trapidoi
Amino acid sequence:
EWYFLFAYAILRSIPNKLGGVIALVMSIAILFFLPILHMSKNQGLQFYPINQVLFWYMLIIVILLT
WIGARPVEAPYIITGQLLTVIYFLYYIINPLTSKIWDNYLSN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia evansi]

GenBank: ABR22637.1
ORGANISM: Lutzomyia evansi
Amino acid sequence:
FLFAYAILRSIPNKLGGVIALVMSIAILFLLPILHMSKMQGLQFYPLNQILFWYMLIIVILLTWIG
ARPVEDPYILTGQILTVIYFLYYIINPLISKIWDKTLN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia columbiana]

GenBank: AAM89984.1
ORGANISM: Lutzomyia columbiana
Amino acid sequence:
FLFAYAILRSIPNKLGGVIALVMSIAILFFLPILHMSKMQGLQFYPLNQILFWYMLIIVILLTWIG
ARPVENPYILTGQILTIVYFLYYIMSPLISKIWDKILN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia ovallesi]

GenBank: AAN76743.1
Organism: Lutzomyia ovallesi
Amino acid sequence:
PNKLGGVIALVMSIAILFLLPILHMSKMQGLQFYPLNQILFWYMLIIVILLTWIGARPVEDPYILT
GQILTVIYFLYYIMNPLVSKIWDKILNQ

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Lutzomyia gomezi]

GenBank: ABM53784.1
ORGANISM: Lutzomyia gomezi
Amino acid sequence:
EWYFLFAYAILRSIPNKLGGVIALVMSIAILFFLPITHMSKSQGLQFYPVNQILFWYMFVIVILLT
WIGARPVEDPYIITGQILTVIYFLYYIINPVVSKIWDKILNN

PUNTO 3.
PARTE A. Secuencias de nucleótidos.
Phlebotomus longicuspis isolate MA15 cytochrome b (cytb) gene, partial cds;
mitocondrial
GenBank: EU980374.1
ORGANISM: Phlebotomus longicuspis
Nucleotide sequence:
ATTGCACTAGTTATATCAATTGCTATCTTATTTATTTTACCAATTTTACATACTAACAAATCACAA
GGATTACAATTTTATCCTATTAATCAAATTCTATTTTGATATATAGTTATTATTATTATCTTATTA
ACATGAATTGGGGCTCGCCCTGTTGAAGCCCCTTTTATTTTAACAGGACAAATTCTAACAGTTCTT
TATTTTTCTTATTATATTTTAAATCCTATAATTTCAAAGATTTGAGATAATTTTCTAAAATAATTC
TTTATTTAGTTAATGAGCTTGAATAGCAATTGTTTTGAAAACATTGGATAGAAATTAAAATTTTCT
ATTAACTTTACTAAATTTAATT

Phlebotomus papatasi cytochrome b (Cytb) gene, partial cds; mitochondrial

gene for mitochondrial product
GenBank: AF161214.1
ORGANISM: Phlebotomus papatasi
Nucleotide sequence:
TTCTGAGGAGCAACAGTTATTACAAATCTTTTATCCGCCATCCCTTATCTAGGAACAATATTAGTT
CAATGAATCTGAGGAGGATTTGCTGTAGATAATGCAACTTTAACACGATTTTTTACATTCCACTTT
TTATTCCCATTTATTATTGCTGCTATAACTATAATTCATTTATTATTCCTCCATCAAACAGGTTCT
AATAACCCCTTAGGATTAAATAGAGATTCAGATAAAATCCCCTTTCATCCTTATTTCTCTTTTAAG
GATTTAATTGGATTTATTGTTATAATTATAATATTAAGAATTCTAACAATCACAGCCCCTTATTTT
CTTGGAGATCCAGATAATTTTATTCCAGCAAATCCTCTTGTAACCCCTCCTCATATTCAACCAGAA
TGATACTTCCTATTTGCTTATGCAATTTTACGTTCAATTCCAAATAAATTAGGAGGAGTAATTGCC
CTTGTTATATCAATTGCTATCCTTTTCCTTATACCTTTACTCCATACAAATCAATCACAAGGACTT
CAATTTTACCCATTAAATCAAATCCTATTCTGATATATAGTAATTACTATTATTCTATTAACATGA
ATCGGAGCTCGTCCTGTTGAAACTCCTTATATTTTAACAGGACAAATTTTAACTGTTCTTTACTTC
TCTTATTATATTTTAAATCCAATTATTTCAAAATTCTGAGATAACTTATTAAATAAT

Brumptomyia devenanzii cytochrome b (cytb) gene, partial cds; mitochondrial

gene for mitochondrial product
GenBank: AF448545.1
ORGANISM: Brumptomyia devenanzii
Nucleotide sequence:
CCCAATAAACTGGGGGGAGTAATTGCTCTTGTTATATCTATCGCAATTTTATTTTTCCTGCCTTTC
CTGCACTTAAATAAATCTCAAGGATTACAATTTTATCCTTTAAATCAAATTTTATTTTGATATATA
GTAATTATTATTATCCTTTTAACCTGAATTGGGGCTCGTCCTGTAGAAGACCCCTACGTTCTTACT
GGCCAAATTCTTACTGTTCTCTATTTTGCTTATTATATTCTAAATCCTTTAATTTCTAAAATTTGA
GATAATATTTTAAACAATTAA

Sergentomyia sclerosiphon isolate mada70 cytochrome b gene, partial cds;

mitochondrial
GenBank: EU143780.1
ORGANISM: Sergentomyia sclerosiphon
Nucleotide sequence:
TATGATAAATTAATATATTTAGTTTGAAAGAGTTATTTACCTTTATCATTATGTTTTTTAATATTT
TTTATTAGTTTAAAAATAATATTATTATATAATTAAATTTAGTAAAGTTAATAGAATATTTTATTT
TCTATCTATTGTTTTCAAAACAATTGCTATTCAAGCTCATTAACTATTAATTTAATAAATTATCTC
ATATTTTAATAATTATAGGATTTAATAAATAATATAAGAAATATAGTACAGTTAAAATTTGTCCCG
TTAAAATATAAGGATCTTCAACAGGGCGGGCTCCAATTCATGTAAGAAGAATAATAATAATAACTA
TATATCAAAATAAGATTTGATTTAAAGGATAGAATTGTAAACCTTGAGATTTTCTAACATGAATAA
TTGGTAAAATAAATAAAATTGCAATAGATATAACTAGAGCAATTACTCCTCCTAATTTATTAGGAA
TAGATCGTAGGATAGCATATGCAAATAGAAAATATCATTCAG

Sergentomyia anka isolate mada72 cytochrome b gene, partial cds;

mitochondrial
GenBank: EU143782.1
ORGANISM: Sergentomyia anka
Nucleotide sequence:
TATGATAAATTAATATATTTAGTTTGAAAGAGTTATTTACCTTTATCGTTATGTTTTTTAATATTT
TTTATTAGTTTAAAAATAATATTATTATATAATTAAATTTAGTAAAGTTAATAGAATATTTTATTT
TCTATCTATTGTTTTCAAAACAATTGCTATTCAAGCTCATTAACTATTAATTTAATAAATTATCTC
ACATTTTAATAATTATAGGGTTTAATAAATAATATAAGAAATATAATACAGTTAAAATTTGTCCAG
TTAAAATATAAGGGTCTTCAACAGGGCGGGCTCCAATTCATGTAAGAAGAATAATAATAATTACTA
TATATCAAAATAAGATTTGGTTTAAAGGATAGAATTGTAAACCTTGAGATTTTCTAACATGAATAA
TTGGTAAAATAAATAAAATTGCAATAGATATAACTAGAGCAATTACTCCTCCTAATTTATTAGGAA
TAGATCGAAGAATTGCATATGCGAATAGAAAATATCATTCAG

PARTE B. Secuencias de aminoácidos.

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Phlebotomus longicuspis]
GenBank: ACH72661.1
ORGANISM: Phlebotomus longicuspis
Amino acid sequence:
IALVMSIAILFILPILHTNKSQGLQFYPINQILFWYMVIIIILLTWIGARPVEAPFILTGQILTVL
YFSYYILNPMISKIWDNFLK

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Phlebotomus papatasi]

GenBank: AAD45005.1
ORGANISM: Phlebotomus papatasi
Amino acid sequence:
FWGATVITNLLSAIPYLGTMLVQWIWGGFAVDNATLTRFFTFHFLFPFIIAAMTMIHLLFLHQTGS
NNPLGLNSDSDKIPFHPYFSFKDLIGFIVMIMMLSILTITAPYFLGDPDNFIPANPLVTPPHIQPE
WYFLFAYAILRSIPNKLGGVIALVMSIAILFLMPLLHTNQSQGLQFYPLNQILFWYMVITIILLTW
IGARPVETPYILTGQILTVLYFSYYILNPIISKFWDNLLNN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Brumptomyia devenanzii]

GenBank: AAN76747.1
ORGANISM: Brumptomyia devenanzii
Amino acid sequence:
PNKLGGVIALVMSIAILFFLPFLHLNKSQGLQFYPLNQILFWYMVIIIILLTWIGARPVEDPYVLT
GQILTVLYFAYYILNPLISKIWDNILNN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Sergentomyia sclerosiphon]

GenBank: ABX57760.1
ORGANISM: Sergentomyia sclerosiphon
Amino acid sequence:
EWYFLFAYAILRSIPNKLGGVIALVMSIAILFILPIIHVSKSQGLQFYPLNQILFWYMVIIIILLT
WIGARPVEDPYILTGQILTVLYFLYYLLNPMIIKMWDNLLN

Cytochrome b, partial (mitochondrion) [Sergentomyia anka]

GenBank: ABX57762.1
ORGANISM: Sergentomyia anka
Amino acid sequence:
EWYFLFAYAILRSIPNKLGGVIALVMSIAILFILPIIHVSKSQGLQFYPLNQILFWYMVIIIILLT
WIGARPVEDPYILTGQILTVLYFLYYLLNPMIIKMWDNLLN
 PUNTO 4
Los resultados obtenidos de las búsquedas con la opción “Entrez nucleotide y Entrez
protein” a nivel general muestran el mismo tipo de información como: especie a la que
se realiza la descripción, el gen utilizado, la ubicación de este gen y para que codifica,
así como también el número de acceso propio de la secuencia, la taxonomía del
organismo, entre otros. Como dato relevante los registros muestran la secuencia de
nucleótidos o de la proteína, en pares de bases o aminoácidos respectivamente, en
formato FASTA o tipo gráfico. Además al realizar la búsqueda por Entrez nucleotide en
el registro aparece un campo denominado CDS el cual nos indica la parte de la
secuencia del gen que codifica a la proteína y dándole click nos lleva directamente al
registro de la proteína.

PUNTO 5

1
2 3
5
4
6
7
8
9
10
11

12
13
14
15

16

17
18

1. Número de acceso de GenBank, propio de cada secuencia e irrepetible.

2. FASTA: Nos proporciona la secuencia de nucleótidos o de proteínas en un
formato basado en texto, y en el que los pares de bases o los aminoácidos se
representan usando códigos de una única letra.
3. GRAPHICS: Nos proporciona la secuencia de nucleótidos o de proteínas de
manera gráfica.
4. LOCUS: Código de referencia.
5. Indica el Numero de pares de bases de la secuencia de nucleótidos del gen Cyt
b de Brumptomyia devenanzii , así mismo que se trata de un ADN linear, por ser
un organismo eucariota.
6. Muestra el nombre del gen, localización en la célula y organismo del que fue
aislado.
7. ACCESSION: Nuevamente el número de acceso que identifica a cada secuencia.
8. VERSION: es el código que nos indica cuando ha sido modificada la secuencia.
9. KEYWORDS: hace referencia a las palabras claves, que facilitan nuestra
búsqueda.
10. SOURCE: hace referencia a la procedencia del gen, es decir de donde se aislo, en
este caso es un gen mitocondrial de Brumptomyia devenanzii.
11. ORGANISM: brinda información acerca de la clasificación taxonómica del
organismo del que ha sido aislado el gen.
12. REFERENCE: Desde la primera base hasta la 285 hace referencia al gen.
13. Nombre de los autores.
14. Título de la publicación.
15. Revista donde se encuentra publicado.
16. FEATURES: se refiere a la información acerca de los genes y sus productos
17. CDS: indica la parte de la secuencia que codifica para la proteína.
18. Secuencia de nucleótidos.
Los resultados a partir de la búsqueda por “Entrez Genome” de Leishmania major
muestra lo siguiente: nombre del microorganismo, una descripción corta y luego la
clasificación taxonómica del mismo. Más abajo se nos proporciona otra descripción
pero un poco más detallada y las características generales de Leishmania major, como
su morfología, cuales son las enfermedades que causa, distribución, lugares donde la
enfermedad es endémica o donde hay mayor prevalencia, modo de trasmisión del
parasito, entre otros. Seguidamente se muestran cuatro publicaciones hechas acerca
del genoma del microrganismo y dándole click nos lleva a los artículos registrados en
Pubmed y por último la totalidad de números de cromosomas que presenta.

Al darle click en uno de los cromosomas se abre la opción “Map Wiever”, como se
observa en la siguiente imagen:
Donde se muestran cada una de las bandas del cromosoma, el número de genes que
posee y su posición en el cromosoma.