Los Municipios del Departamento de San Marcos son:
1) Municipio de San Marcos San Marcos 2) Municipio de Ayutla Ayutla 3) Municipio de Catarina Catarina 4) Municipio de Comitancillo Comitancillo 5) Municipio de Concepción Tutuapa Concepción Tutuapa 6) Municipio de El Quetzal El Quetzal 7) Municipio de El Tumbador El Tumbador 8) Municipio de Esquipulas Palo Gordo Esquipulas Palo Gordo 9) Municipio de Ixchiguán Ixchiguán 10) Municipio de La Blanca La Blanca 11) Municipio de La Reforma La Reforma 12) Municipio de Malacatán Malacatán 13) Municipio de Nuevo Progreso Nuevo Progreso 14) Municipio de Ocós Ocós 15) Municipio de Pajapita Pajapita 16) Municipio de Río Blanco Río Blanco 17) Municipio de S. Antonio Sacatepéquez San Antonio Sacatepéquez 18) Municipio de San Cristóbal Cucho San Cristóbal Cucho 19) Municipio de San José El Rodeo San José El Rodeo 20) Municipio de San José Ojetenam San José Ojetenam 21) Municipio de San Lorenzo San Lorenzo 22) Municipio de San Miguel Ixtahuacán San Miguel Ixtahuacán 23) Municipio de San Pablo San Pablo 24) Municipio de San Pedro Sacatepéquez San Pedro Sacatepéquez 25) Municipio San Rafael Pie de la Cuesta San Rafael Pie de la Cuesta 26) Municipio de Sibinal Sibinal 27) Municipio de Sipacapa Sipacapa 28) Municipio de Tacaná Tacaná 29) Municipio de Tajumulco Tajumulco 30) Municipio de Tejutla Tejutla