Una junta militar tomó el poder hasta 1966.

Durante ese tiempo las universidades fueron

permanentemente hostigadas, en especial la Central. El gobierno realizó intervenciones;
estudiantes, maestros y empleados fueron perseguidos y encarcelados. Además, aulas,
bibliotecas y laboratorios fueron destruidos 1963.
• Se permitió a la Universidad elegir sus dignatarios, y Julio E. Paredes fue reelecto como
Rector. De todos modos, la UCE fue clausurada de nuevo, y este acto causó el
descontento popular y terminó con la caída del régimen cuatro días después. El mismo
año se dictó otra ley de la educación superior que garantizaba la inviolabilidad de los
predios de la Universidad y su autonomía. 1965
•La Universidad Central fue clausurada por última vez durante el quinto mandato de
Velasco Ibarra. 1970
•Se dictó otra ley de la educación superior en. En el transcurso de seis años distinguidos
decanos ejercieron temporalmente el rectorado de la Universidad. 1971

•Se dicta la Ley Orgánica de Educación Superior que está vigente e introduce muchos
cambios con relación a la anterior. 2010