La criminalística posee una metodología basada en las ciencias naturales.
La metodología científica es el conjunto de conocimientos que permite llegar a la verdad se divide en general y especial. Los componentes principales de la metodología científica son: análisis, síntesis y demostración. Se habla de método científico cuando se trata de un procedimiento lógico y ordenado. Sus periodos son: 1. Planteamiento del problema 2. Recopilación de datos 3. Ordenación y clasificación de los datos 4. Diseño de la comprobación de la hipótesis 5. Deducción 6. Verificación o comprobación de la misma Para Rafael Moreno, el método inductivo y deductivo son los que más se usa en los procedimientos en la ciencia de la criminalística El primero se usa estudiando un hecho particular controlando variables en la ley de lo general (de lo general a lo particular) El segundo es aquel para interpretar hechos particulares a través de una ley general establecida El método deductivo tiene tres etapas: 1. Observación 2. Hipótesis 3. Experimentación