Mil aos despus de una horrible guerra apocalptica conocida como los "Siete das de fuego",
la humanidad apenas sobrevive a orillas de un bosque contaminado con gases y esporas
txicas e insectos mutantes gigantes que cubren gran parte de la Tierra, situacin que fue provocada por la guerra. El Valle del Viento es un pequeo reinado rodeado de reinos ms poderosos y hostiles que suelen tener guerras entre ellos. En el Valle del Viento, rige una profeca que predice a un salvador "vestido de azul que caminar sobre un campo de oro para unir los lazos con la Tierra y finalmente guiar al pueblo a las tierras purificadas". Nausica es la princesa del Valle del Viento y nica hija del rey Jihl, gran piloto y guerrera, es tambin compasiva y solcita de toda la vida. La princesa Nausica trata de encontrar un sentido del bosque contaminado y se resiste a ver a los insectos como enemigos, entre ellas las gigantescas criaturas trilobitas llamadas Ohm. Una noche, durante la visita del Maestro Yupa, un avin de carga del reino de Tolmekia se estrella en el Valle. Nausica se apresura a rescatar de entre los escombros a un sobreviviente, quien resulta ser la princesa Lastelle de Pejite, quien estando malherida, le ruega a Nausica que destruya el cargamento de la nave, poco despus, Lastelle muere. El cargamento es un embrin de un mortfero Dios de la Guerra, una de las armas biolgicas que causaron la guerra hace un milenio. Los tolmekianos se apoderaron del embrin, el cual haba sido encontrado en las profundidades de Pejite, y de la princesa Lastelle, pero su avin fue atacado por insectos y termin por estrellarse. Uno de los insectos emerge herido de los restos y parece dispuesto a atacar a los aldeanos, pero Nausica utiliza un pequeo silbato de insectos para calmarlo y lo gua lejos de la aldea, de nuevo hacia el bosque. A la maana siguiente, las tropas tolmekianas, encabezadas por la princesa Kushana y el oficial Kurotowa, arriban al Valle y asesinan al padre de Nausica y se apoderan el embrin del Dios de la Guerra. Kushana planea revivir al Dios de la Guerra y usarlo para quemar el bosque contaminado. Nausica mata a varios soldados tolmekianos antes de que Yupa intervenga y lograse calmarla. Kushana posteriormente anuncia su decisin de partir hacia la capital tolmekiana con Nausica y cinco rehenes del Valle. Antes de marcharse, Yupa descubre un jardn secreto con plantas del bosque cuidadas por Nausica. De acuerdo con los hallazgos de Nausica, las plantas crecieron con tierra y agua limpia, por lo que no son txicas, a diferencia del suelo del bosque que ha sido contaminado por la humanidad.