7; ep ot See eee ees O aa Ben : CO Ales “O WAKA Examen de Técnicas de Anilisis Genético (curso 2013-14) Grado en Bioquimica y Ciencias Biomédicas Primera convocatoria (2-6-14) Problema 1 (a entregar en hoja aparte).- Se realizé un andlisis citogenético de Ia, region:40.del panegetomasoma,de Apis mellifera. Se disponia de-S-mmutaciones letalesdistintas de: cepes Portadoms de las siguientes deficiencias cromosémicas: ee ee Deficiencia Rotura izquierda Rotura derecha def 40A1-A3 40A7 def2 40B1-B3 40C2-C3 def 3 40A1-A3 40B1-B8 def4 40B7-C3 40c9 def’ 40A1-A3 40B1-B8 Las regiones 40A, B y C contienen 9 divisiones cada una, Se cruzaronlag.yeepassportadoras»de una mutacidnisletalsrecesiva (equilibrada con su Sorespondiente cromosoma equilibrador) con cada una de las cincoucepas.portadoras. de deleciones, obteniéndose los siguientes resultados: Mutaciones letales recesivga” Renuenes Kiara) 1G) Ple(@)Tie(d) a Te(g) [1) J] def] (0p | anes [epee + + [0 + def2 fo 2y | asa [Ore |e] en ce ecm def3 (On) CS i Ses Ee CIE def oa | el] Oa Oa |e Lee def'5 OSs [0/28 [ie ons eae eealo Donde + significa complementacion y O significa no complementacin Nola: en todas las cepas se usa un mismo cromosoma equilibrador que contiene la mutacién dominante Rough (R) que produce alas arrugadas 8) Propén un mapa que incluya las posiciones relativas de todas las mutaciones letales y de las deficiencias b) Indica cémo averiguarias si son alélicas aquellas mutaciones que tengan una misma posicién en el mapa anterior, y qué resultado fenotipico esperarias en los cruces planteados. ©) {Qué resultados esperarias al cruzar entre si las cepas portadoras de las deficientias cromosémicas? Exprésalo como una tabla.Problema 2.- Se quiere rose fer, una que en homocigosis produce y otra que en homocigosis produce alas recortadas (sw): Para ello se-cruzaron, por-separado;-hembras homocigéticas para cada una de dichas mutaciones con i lizadas en los cromosomas II y III, respectivamente). (resultado de cruzar la FI entre si tabla, En el cruce con las hembras pé, la Fl fue toda mutante para el color de ojos (aunque normal para las quetas) y la F2 también: Fenotipos Ne normal (23) 74 ch CASO), 14 st Ces 3S) 26 sw (ey at 32 cb, st Cr SeS®) C2d) cb, sw (S90 st, sw Can * X10 cb, st, sw. 0 a) A la vista de los resultados, ;qué puedes proponer en cuanto al cromosoma en que s¢ puede localizar la mutacién'w? Por qué? b) ,¥ la mutacin pe? {Por qué? ¢) En caso necesario, compruébalo mediante el test de 1a chi-cuadrado. Valores dey’ al 5% [1 gl. 3.84 [2g]. 5.99 [3gl. 7.82 4 gl — 9.49 Sgl.— 11.07 [6 gl. — 12.59 |7 gl. — 14.07Problema 3.- En EE.UU, una mmujerha' mantenido relaciones sextiales con tres hombres, uno e Tag.causasion®. ‘otro oriental (de ascendencia japonesa) y otro afroamericano. Como se ha é lo recurre a anilisis genéticos con quedado embarazada, quiere saber quién es el padre y para el a una muestra de su Se obtienen datos del grupo sanguineo (ABO) y de tres loci microsatélites (D3S, VWA y FGA): Grupo sanguineo _ [Locus D3S Lows VWA__[LocusFGA | Madre 18 ie Feto 12 aya 21/27 De los posibles padres slo conoce sus grupos sanguineos: el caucasiano es Beef Oriental es AB y el afroamericano es 0. a) En base a la informacién de los grupos sanguineos, {podrias descartar la paternidad de alguno de los hombres? b) Unicamente en base a las frecuencias de los loci microsatélites que se dan en la tabla adjunta calcula, para cada uno de los tres hombres, la probabilidad de que pudieran ser el padre, c) La mujer finalmente pide al hombre, con mayor probabilidad de ser el padre, que se someta a la prueba de paternidad. El resultado es: Grupo sanguineo [Locus D3S___|Locus VWA __|Locus FGA. Presunto B 12/15 14/20 21/26 A pesar del resultado, el hombre niega que él sea el padre. {Cual es la raz6n bayesiana de la probabilidad de que Si lo sea? Datos: Frecucncias aléligas en los distintos loci. Locus ‘Alelo Poblacién |Poblacién —_| Poblacién Poblacién eaueasiana afroamericana| genceal DIS Wie 0.015 0.008 0.014 14 » 10.134 0.087 0.100, S 16_ 0.229 0.324 0.310. 18 0162 0.064 0.150 VWA ora T06r Dato é (0277 0.196 0.250 0.088 0.080 ae 0.018 0.015™ nel eee, We tittt*™S Problema 4.- Se ha caracterizado un polimorfismo ligado‘al locus responsable'de-la enfermedad de‘Marfan localizado en el cromosoma 15 humano. El mapa del-alelo mayoritario (alelo T) se ha obtenido a partir de los datos de los fragmentos obtenidos de las digestiones (sencillas y dobles) de ADN genémico humano con las enzimas eo, Bgill-y Hindlll, transferides por la técnica de ‘Southern blot ¢ hibridados independientemente con la sonda A. a) Construye el mapa de restriccién del alelo mayoritario (alelo 1) considerando los resultados obtenidos con la sonda A. SONDA A (fragmento EcoRI de 6 kb) digestiones sencillas digestiones dobles EcoRV Bgl: 1 kb; 5 kb BgllW/HindItl: 2 kb; 7 kb EcoRV Hindill: 6 kb b) El polimorfismo ligado al locus responsable de la enfermedad de Marfan se caracteriza por la susceptibilidad a la digestién con la enzima BglII, de manera que se han descrito cuatro alelos diferentes (los alelos 11, IM y TV) que muestran diferentes patrones de restriccién Unicamente para la enzima Bgfl. Indica los mapas respectivos, s6lo para este enzima, sabiendo que al hibridar con la sonda A hemos obtenido los siguientes resultados: 68 3 alelo II: 2 kb; 7.5 kb alelo Il: 2 kb; 5,5 kb; 6,5 kb alelo IV: 2 kb; 5,5 kb ©) Al digerir el ADN genémico de 4 individuos diferentes (A, B, C y D) con el enzima Bglll, e hibridarlo con la sonda A obtenemos los siguientes resultados: Tndividuo Bandas A 2455 47,5 B NQHS SHG SH TS ic 2+6,547,5 D 2455465 Indica el genotipo de cada uno de ellos.