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Biotecnologia en Movimiento No 2 PDF
Biotecnologia en Movimiento No 2 PDF
EN MOVIMIENT
REVISTA DE DIVULGACIN DEL INSTITUTO DE BIOTECNOLOGA DE LA UNAM
UN MODELO EXPERIMENTAL
para estudiar la obesidad
EL CIDO FLICO
y las plantas
EMPRENDER LAS NUEVAS TECNOLOGAS
con compuestos que pican y los patgenos
DEL PULQUE Y LA SEQUA
LA DESAPARICIN en las plantas
de las abejas 2da. parte LOS INICIOS
del IBt 2da. parte
LA ECONOMA en el Unidad de Secuenciacin
SIGLO XXI Masiva y Bioinformtica
Disponible en: www.ibt.unam.mx
11:00-11:25 Simulando la realidad, Dra. Laura 14:30-15:00 Visita a las nuevas instalaciones
Domnguez, Facultad de Qumica, UNAM. del IBt.
D I R E C TO R I O
UNAM
EN MOVIMIENT
Dr. Jos Narro Robles
Rector REVISTA DE DIVULGACIN DEL INSTITUTO DE BIOTECNOLOGA
Dr. Eduardo Brzana Garca
Secretario General
JULIO-AGOSTO-SEPTIEMBRE 2015
Ing. Leopoldo Silva Gutirrez
Secretario Administrativo
Dr. Francisco Jos Trigo Tavera En este nmero:
Secretario de Desarrollo Institucional
M. en C. Miguel Robles Brcena 2 Presentacin del Comit Editorial
Secretario de Servicios a la Comunidad
Dr. Csar I. Astudillo Reyes Generando conocimiento en el IBt
Abogado General 3 Las nuevas tecnologas y el cmputo nos ayudan a estudiar
Dr. Carlos Armburo de la Hoz
Coordinador de la Investigacin Cientfica
detalladamente a los patgenos
Dr. Renato Dvalos Lpez 5 Por qu el pulque es viscoso?
Director General de Comunicacin Social 7 Las protenas desordenadas y la sequa en las plantas
IBt Reconocimientos a los miembros de nuestra comunidad
Dr. Octavio Tonatiuh Ramrez Reivich
Director
9 Dr. Luis Covarrubias Robles, premio de investigacin mdica
Dr. Enrique Rudio Piera Dr. Jorge Rosenkranz 2014
Secretario Acadmico 12 Dra. Blanca Jazmn Reyes Hernndez, Premio AgroBIO 2014
Dr. Enrique Galindo Fentanes
Secretario de Vinculacin Proyectos de investigacin de nuestros estudiantes
C.P. Francisco Arcos Milln
Secretario Administrativo
14 Lacasas: protenas amigables con el medio ambiente para
Dr. Gerardo Corzo Burguete descontaminar el agua
Coordinador de Infraestructura 16 Viendo dentro de los fermentadores: una forma de investigar qu tan
Jefes de Departamento eficientes son para dispersar burbujas de aire y gotas de aceite
Biologa Molecular de Plantas 18 Evolucin de una protena en el laboratorio
Dra. Patricia Len Meja
Gentica del Desarrollo y Fisiologa Molecular
Dr. Mario Zurita Ortega Propiedad intelectual, Tecnologa y Empresa
Ingeniera Celular y Biocatlisis 19 Emprender? Enchlame otra!
Dra. Gloria Saab Rincn
Medicina Molecular y Bioprocesos Unidades y Laboratorios que apoyan a la investigacin y a
Dra. Leonor Prez Martnez
Microbiologa Molecular
la industria
Dra. Guadalupe Espn Ocampo 23 Unidad de Secuenciacin Masiva y Bioinformtica, a la vanguardia de la
ciencia
Biotecnologa en Movimiento, ao 2015, No. 2,
publicacin trimestral, editada por la Universidad Cursos y tpicos en el IBt
Nacional Autnoma de Mxico, Av. Universidad
3000, Col. Universidad Nacional Autnoma de
25 Del gen al producto
Mxico, C.U. Delegacin Coyoacn C.P. 04510, a
travs del Instituto de Biotecnologa, Av. Universidad En la voz de nuestros ex-alumnos
2001, Col. Chamilpa, C.P. 62210, Cuernavaca, Mor., 27 El papel de la nutricin en la desaparicin de las abejas (2da. parte)
Tel. 3291771. Correo elctrnico biotecmov@ibt.
unam.mx. Editores responsables Enrique Galindo y
Georgina Ponce. Reserva de Derechos al uso exclu-
Historias de nuestra comunidad
sivo 04-2015-060211444700-102 ante el Instituto 29 El Departamento de Biologa Molecular del Instituto de Investigaciones Biomdicas y
Nacional del Derecho de Autor. Impresa en Grafimor, los inicios del IBt (2da. parte)
Av. Castillo de Chapultepec Nte. Lote 20 Col. Cd. Cha-
pultepec. C.P. 62398 Cuernavaca, Mor., este nmero Ciencia y cultura
se termin de imprimir el da 10 de septiembre del
2015, con un tiraje de 1000 ejemplares, impresin
31 Pobreza en la abundancia del siglo XXI
oset, 135 grs, papel couch mate
Editor
Dr. Enrique Galindo Fentanes
galindo@ibt.unam.mx
Editora ejecutiva
Dra. Georgina Ponce Romero
geop@ibt.unam.mx
Comit Editorial
Dra. Claudia Martnez Anaya
Dra. Martha Pedraza Escalona
Dr. Fernando Lledas Martnez
Dr. Jos Luis Reyes Taboada
Dr. Enrique Reynaud Garza
Dr. Adn Guerrero Crdenas
Dr. Carlos Pea Malacara
QFB Miguel Cisneros Ramrez
Fotgrafo
Sr. Sergio Trujillo Jimnez
Imgenes
Fotografa de portada
Modelo de obesidad en ratones C57BL/6NJ
Fotografa: Ricardo Campos
Diseo: M. en C. Jos Ral Prez y
Dra. Celina Garca
Ilustracin y Diseo Editorial
Sr. Dionicio Martnez Pineda
Impresin
GRAFIMOR, S. A. de C. V.
EN MOVIMIENTO 1
Presentacin
En este nmero de Biotecnologa en Movimiento compartimos la experiencia del IBt en la secuenciacin del
genoma del agente infeccioso Babesia divergens, que transmitido por garrapatas causa sntomas similares a
los de la malaria. Para los amantes del pulque que se preguntan por qu es viscoso? incluimos un artculo
sobre la microbiologa del pulque de Huitzilac, Morelos. Los lectores conocern la estrategia usada por las
semillas, a travs de las protenas desordenadas, para favorecer la sobrevivencia de las plantas durante la
sequa.
El Dr. Luis Covarrubias nos comparte sus aportaciones al entendimiento de algunas de la bases bioqumicas
de la obesidad, que le llevaron a obtener el premio Dr. Jorge Rosenkranz 2014. Por otra parte, la Dra. Jazmn
Reyes fue distinguida con el Premio AgroBIO 2014 a la mejor tesis de doctorado en biotecnologa agrcola;
en su trabajo, identific la funcin que tiene el cido flico en el crecimiento de las races.
Tres estudiantes del IBt nos comparten sus resultados sobre el funcionamiento de enzimas que descon-
taminan agua; as como un vistazo al interior de los biorreactores y de cmo algunas veces no podemos
imitar a la naturaleza cuando de evolucin se trata. Presentamos asimismo el curso Del gen al producto en
el que los estudiantes reciben un entrenamiento terico-prctico para el desarrollo de bioprocesos.
El desarrollo de un producto y la creacin de una empresa con base tecnolgica puede ser un proceso difcil,
de largo aprendizaje, aunque muy enriquecedor. Los interesados podrn conocer el camino recorrido por el
Dr. Alejandro Torres, empresario y ex-alumno del IBt.
En nuestro primer nmero de Biotecnologa en Movimiento el Dr. Miguel Corona, ex-alumno del IBt, nos
cont sobre la desaparicin de las abejas; ahora nos plantea soluciones a ese grave problema, resultado de
su investigacin en el Departamento de Agricultura de los E.E.U.U.
A aquellos que les guste la historia, les invitamos a visitar la parte final de la narrativa del Dr. Mario Zurita
sobre sus experiencias como estudiante del entonces Centro de Investigacin sobre Ingeniera Gentica y
Biotecnologa, el antecesor del IBt.
En este nmero conoceremos las actividades y alcances de la Unidad de Secuenciacin Masiva y Bioin-
formtica del IBt.
Finalmente, se incluye la resea de tres libros que hablan de la paradoja de la pobreza dentro de la abun-
dancia de la sociedad actual, que invitan a reflexionar sobre la sociedad que queremos para nuestros hijos
y nietos.
Esperamos que los lectores disfruten de este segundo nmero de Biotecnologa en Movimiento, que da
cuenta del enorme potencial de la biotecnologa en diversos campos, as como el hecho de que el cono-
cimiento bsico involucrado, juega un papel fundamental en su desarrollo.
Agradecemos los comentarios, que nos motivan, entusiasman y que sin duda contribuyen a mejorar la
calidad de Biotecnologa en Movimiento.
El Comit Editorial
biotecmov@ibt.unam.mx
2 Biotecnologa
Generando conocimiento en el IBt
y el cmputo
indirectamente su salud e intereses es una
carrera evolutiva donde el humano lucha por
erradicar al parsito y este ltimo, se adapta para
sobrevivir a los ataques constantes para eliminarlo;
es decir, tanto el ser humano como los parsitos
nos ayudan a estudiar
co-evolucionan en su lucha por la existencia.
detalladamente a
La babesiosis (http://es.wikipedia.org/wiki/Babe-
siosis) es una enfermedad parasitaria transmitida
los patgenos
por garrapatas que portan organismos unicelulares
del gnero Babesia,, con la capacidad de infectar la
sangre de prcticamente cualquier vertebrado, y
por lo tanto tambin al ser humano. Los sntomas y
la gravedad de la babesiosis son muy similares a los
EN MOVIMIENTO 3
Clulas sanguneas
de bovino infecta- la bioinformtica, que de manera
das por Babesia di- muy simple, se refiere al manejo
vergens.
e interpretacin de los datos
h t t p : / / co m m o n s.
wikimedia.org/wiki/ biolgicos en formatos digitales
File:Babesia-diver- para ser analizados en equipos
gens.jpg de cmputo.
4 Biotecnologa
Por qu
el pulque
fiere al pulque su viscosidad caracterstica. Todos
estos compuestos (polisacridos, cidos y alcohol)
definen las caractersticas sensoriales del pulque: su
sabor, olor y textura.
es viscoso?
Tradicionalmente se tuvo la idea de que la bacteria
Leuconostoc mesenteroides identificada en el pul-
que en 1953 por el Dr. Alfredo Snchez Marroqun,
un pionero en el estudio de esta bebida- es responsable de
producir un polisacrido llamado dextrana (polme-
ro de glucosa) a partir de sacarosa que es el azcar
ms abundante en el aguamiel. Las gomas o poli-
sacridos producidos por las bacterias cido-lcticas
del gnero Leuconostoc en bebidas como el pulque
Dr. Adelfo Escalante Lozada resultan de gran inters ya que aportan beneficios a
los productos en los que se usan: como la reduccin
l pulque -una bebida fermentada tradicional, de la prdida de agua, determinan las caractersticas
de naturaleza alcohlica no destilada, de as- sensoriales de viscosidad y aumentan la estabilidad.
pecto lechoso y ligeramente cida y viscosa- Este tipo de polisacridos son considerados como
se obtiene a partir de la fermentacin de la sustancias con propiedades de inters comercial, ya
savia o aguamiel de diversas variedades de maguey que pueden ser usados como aditivos o ingre-
(Agave) pulquero; es producido principalmente en dientes naturales en la produccin de diversos tipos
el centro del pas, siendo la regin colindante de Hi- de alimentos; recientemente se les ha considerado
dalgo, Tlaxcala y Estado de Mxico la zona de pro- tambin como productos funcionales que pueden
duccin ms importante. ser usados como fibra diettica o incluso como pre-
biticos (ingredientes alimenticios, usualmente car-
En la elaboracin del pulque participan diversos bohidratos).
microorganismos que al metabolizar los azcares
presentes en el aguamiel desarrollan tres tipos de En nuestro trabajo ms reciente sobre la micro-
fermentacin: una alcohlica, en la que bacterias biologa del pulque de la regin de Huitzilac en el
(como Zymomonas mobilis) y levaduras (como Estado de Morelos, realizada en colaboracin con la
Saccharomyces cerevisiae) producen alcohol; una fer- Facultad de Qumica de la UNAM, demostramos la
mentacin cida, en donde bacterias cido acticas presencia de una gran diversidad de bacterias lcti-
y cido lcticas generan cido actico y cido lc- cas, entre las que se identific a Leuconostoc citreum
tico respectivamente, son adems, las responsables y Leuconostoc kimchii como las especies ms abun-
de la ligera acidez del pulque. Al final del proceso dantes en el aguamiel durante las primeras horas
las bacterias cido lcticas del gnero Leuconostoc del proceso de fermentacin. Como resultado de
llevan a cabo una fermentacin cuyo producto es este estudio aislamos dos especies de L. kimchii, am-
una goma o polisacrido que al acumularse le con- bas productoras de dos tipos distintos de polisacri-
EN MOVIMIENTO 5
Mural La industria dos conocidos como dextranas (ver figura).
del Maguey y del
Amate (fragmento) Los resultados de este trabajo aportan in-
1951. Palacio Nacio- formacin sobre el papel de las distintas
nal, Diego Rivera. bacterias productoras de polisacridos du-
rante la fermentacin del pulque y sobre
cmo afectan su viscosidad. Actualmente
estamos realizando un estudio de las bac-
terias lcticas productoras de polisacri-
dos en muestras de pulque del Estado de
Hidalgo. Los resultados que se obtengan
permitirn determinar la diversidad de este
tipo de bacterias entre muestras de pulque
de diferente origen geogrfico y su impor-
tancia durante el proceso de fermentacin
y desarrollo de la viscosidad del pulque,
que es una de sus caractersticas ms dis-
tintivas.
Proceso de aislamien-
to de la bacteria cido Muestra de aguamiel y pulque,
lctica Leuconostoc Huitzilac, Morelos
kimchi, producto-
ra de polisacri-
Anlisis por microscopa
dos extracelulares
y algunas etapas del
electrnica de barrido
aislamiento y anlisis
de cada uno de los
dos polmeros de Colonia A
carbohidratos que
se producen en el
Colonia A 5000X
proceso.
colonia B
Aislamiento en medio de cultivo con
sacarosa para promover la produccin
del polmero
Anlisis por
microscopa
Fermentacin electrnica de barrido colonia B 5000X
en laboratorio
6 Biotecnologa
Las protenas
desordenadas
y la sequa
en las plantas
Dra. Lucero Y. Rivera Najera
E
n el contexto del cambio climtico, la sequa protenas empiezan a interaccionar entre s. Este
es ya un problema grave y determinante en es un proceso potencialmente peligroso porque
la produccin de alimentos. Es por ello que se producen agregados protecos insolubles que
el estudio detallado de las estrategias de re- comprometen el funcionamiento celular adecuado
sistencia de las plantas ante la limitacin de agua, y pueden causar la muerte de la clula. Durante
resulta central no slo para conocer los mecanismos la evolucin, la clula vegetal ha desarrollado al-
bsicos, sino tambin para planear estrategias que gunos mecanismos para evitar la agregacin de sus
integren estos conocimientos a la agricultura para protenas. Una respuesta ante el dficit hdrico es la
contender con la eventual falta de agua. sobre-produccin de las protenas llamadas LEA (su
nombre viene de las siglas en ingls: Late Embryo-
Una clula, de manera muy sencilla, es un compar- genesis Abundant), conformadas principalmente
timiento delimitado por una doble capa conforma- por aminocidos polares o con carga elctrica, lo
da por lpidos particulares (membrana) en cuyo inte- que las hace altamente hidroflicas (afines al agua).
rior hay varios compuestos, entre ellos las protenas, Una caracterstica particular de estas protenas LEA,
en un ambiente acuoso. Dentro de la clula, cada es que son muy flexibles y que, a diferencia de una
protena tiene un plegamiento que le confiere una protena ordenada que tiene una forma tridimen-
conformacin tridimensional especfica. Este arre- sional definida y ms o menos fija, las protenas LEA
glo en el espacio est determinado principalmente carecen de una estructura estable hasta que entran
por los aminocidos que las constituyen y el agua en accin como veremos ms adelante. Se puede
que los rodea. Una protena con una estructura as imaginar este tipo de protenas como un espagueti
definida se considera ordenada. que se mueve libremente en el agua.
Ante la sequa, lo que implica la prdida del agua (el En el laboratorio, trabajamos particularmente con la
solvente), las protenas (los solutos) no permanecen protena LEA denominada PvLEA6 del frijol (Phaseo-
intactas y pueden experimentar una prdida total o lus vulgaris). En un escenario de dficit hdrico, la
parcial de su estructura, razn por lo que algunas de protena PvLEA6 disminuye su flexibilidad y algunas
ellas perderan su funcin. En esta condicin algu- de sus regiones adoptan una forma que asemeja una
nas protenas dejan de ser solubles y por el incre- espiral (conformacin de hlice, figura en la pgina
mento en su concentracin por la falta de agua, las anterior). En nuestro estudio proponemos que la
La protena PvLEA6
en solucin se mueve
libremente, mien-
Protena LEA Protena LEA Protena LEA tras que cuando en
unida a su protena el medio se pierde
(en solucin) (en deshidratacin)
blanco agua, algunas re-
giones de la prote-
na se estructuran en
una conformacin
de hlice y se une
con mayor facilidad
a sus protenas blan-
co, de esta manera
las protege contra el
desplegamiento y la
agregacin.
EN MOVIMIENTO 7
Contenido de H2O
Una semilla de fri- protena PvLEA6 utiliza estas regiones en hlice para Durante la maduracin de las semillas ocurre una
jol, pierde gradual- reconocer y unirse a otras protenas que perdieron condicin natural de deshidratacin, de hecho du-
mente hasta 90 % su forma nativa al disminuir el agua (protenas blan- rante este proceso se pierde hasta el 90 % de su
de su contenido
de agua durante la co). Las protenas LEA, evitan as la formacin de los contenido de agua (ver figura). En esta condicin de
maduracin. peligrosos cmulos protenicos insolubles. Adems deshidratacin, la semilla puede permanecer latente
Modificado de encontramos que la PvLEA6 puede unirse a otra Pv- por largos perodos de tiempo, en algunas especies
http://seedgene - LEA6 y formar dmeros (parejas entre protenas Pv- incluso por siglos, hasta su rehidratacin y eventual
network.net/media/
Soy_seed_dev.jpg LEA6) estables. Una posibilidad para la funcin de germinacin. El papel de las protenas LEA durante
estas estructuras, es que PvLEA6 en forma de dme- los procesos de deshidratacin y rehidratacin en
ro, sea capaz de incrementar la eficiencia de unin las semillas es un tema actual de nuestro estudio.
con sus protenas blanco e incremente la proteccin
contra la agregacin. La falta de estructura definida Esta investigacin fue originalmente publicada en
de las protenas LEA (por ello pertenecen al grupo el siguiente artculo cientfico:
de las protenas intrnsecamente desordenadas), Rivera-Najera L. Y., Saab-Rincn G., Battaglia M.,
as como la facilidad para adoptar diferentes confor- Amero C., Pulido N. O., Garca-Hernndez E., Solr-
maciones, las vuelve elementos esenciales de respuesta zano R. M., Reyes J. L., and Covarrubias A. A. (2014)
rpida y de proteccin bajo condiciones de sequa. A group 6 late embryogenesis abundant protein
En otros laboratorios se han producido plantas en from common bean is a disordered protein with
las que por tcnicas de ingeniera gentica, se au- extended helical structure and oligomer-forming
menta artificialmente la cantidad de protenas LEA properties. Journal of Biological Chemistry, vol. 289,
en las clulas; estas plantas muestran mayor toleran- No. 46, pgs. 31995-32009
cia al dficit hdrico. Contacto: luceya12@yahoo.com.mx
8 Biotecnologa
Reconocimientos a los miembros
de nuestra comunidad
E
un gen de inters, por ejemplo, un gen que lleva
l Dr. Luis Fernando Covarrubias fue galardo- informacin para la sntesis de una hormona o un
nado con el Premio de Investigacin Mdica antibitico) lo que comnmente se denomina Inge-
Dr. Jorge Rosenkranz 2014 en la categora niera Gentica.
de Ciencia Bsica, otorgado por la empresa
ROCHE Mxico a investigaciones inditas realizadas EL RUMBO DE SUS INTERESES
por cientficos mexicanos. Actualmente el Dr. Co- El paso por el laboratorio del Dr. Bolvar result
varrubias se desempea como Investigador Titular muy productivo, ya que su trabajo experimental
C en el departamento de Gentica del Desarrollo y desarrollado durante la Licenciatura y la Maestra,
Fisiologa Molecular del Instituto de Biotecnologa contribuy a la generacin de cuatro publicaciones
de la UNAM. internacionales en la revista Gene. Esta experiencia
le dej claro que su inters cientfico no estaba en
MSICA O CIENCIA? las bacterias, sino en animales superiores. Por esta
Muy joven, el Dr. Covarrubias e indeciso sobre la carrera razn, y an sin iniciar el doctorado, decidi aden-
a elegir, pens en Medicina (quiz influenciado trarse en el campo de la Biologa del Desarrollo y rea-
por su padre, quien es Mdico), Biologa, Qumica, liz una estancia posdoctoral en el laboratorio de la
Matemticas y hasta Diseo y Msica dentro de las Dra. Beatrice Mintz en el Institute for Cancer Research,
EN MOVIMIENTO 9
Fox Chase, Filadelfia, E.U. Ah obtuvo experiencia en funcional de la muerte celular durante el desarrollo,
el desarrollo de retrovirus y de animales trans- enfatizando que el balance entre la proliferacin, la
gnicos, ya que en ese momento el laboratorio de la diferenciacin y la muerte celular es fundamental
Dra. Mintz era uno de los pioneros en la produccin para mantener un organismo sano.
de ratones transgnicos. Luego de su estancia pos-
doctoral decidi regresar a Mxico, e incorporarse DE LA INVESTIGACIN BSICA A LA APLICADA
al grupo de la Dra. Patricia Joseph, quien tambin El estudio del papel de las especies reactivas de oxge-
es investigadora del Instituto de Biotecnologa de la no en la muerte celular por apoptosis (proceso de
UNAM. En este laboratorio, no slo obtuvo el grado muerte celular programado y bajo control gentico)
de Doctor en Ciencias Biomdicas enfocado en la y su contribucin en la promocin del envejecimien-
Neurobiologa Molecular, sino tambin comenz a to, llev al grupo del Dr. Covarrubias a generar
definir varias de las lneas de investigacin que han un ratn mutante de la enzima catalasa, enzima
marcado su trayectoria cientfica. encargada de degradar el perxido de hidrgeno
en oxgeno y agua. Para sorpresa de todo su grupo
ROMPIENDO PARADIGMAS de trabajo, este ratn a pesar de carecer de la en-
Las lneas de investigacin que se comenzaron a ge- zima catalasa result viable y sin ningn fenotipo
star an estando dentro del grupo de la Dra. Joseph aparente, es decir, los ratones nacieron y crecieron
fueron el estudio de la neurognesis (produccin de forma normal y no mostraron signos de enve-
de nuevas clulas del sistema nervioso), la diferen- jecimiento prematuro, como era lo esperado. Dado
ciacin de las clulas germinales, que dan origen que la enzima catalasa se expresa abundantemente
al vulo y al espermatozoide, y la regeneracin de en el hgado, sta podra tener un papel relevante
estructuras cuando stas sufren dao parcial o total, en la degradacin de las grasas; por lo que decidieron
entre otras. El resultado de estas investigaciones alimentar a los ratones mutantes con una dieta
han permitido en varias ocasiones mostrar que alta en grasa, con el fin de hacer notar la falta de la
muchos fenmenos no son como se ha propuesto enzima. Una sorpresa ms fue encontrar que estos
en la literatura y que se han sostenido por aos. ratones, a pesar de que ganan peso por el consumo
Muestra de ello son las aportaciones del Dr. Co- elevado de grasa, no generan esteatosis heptica
varrubias y su grupo de trabajo en el entendimiento (depsitos de grasa en el hgado) ni hiperglucemia
del desarrollo de las extremidades y el desarrollo del (altos niveles de glucosa en sangre) como lo hace
paladar, ya que ellos han evidenciado la relevancia un ratn silvestre. Estos fenotipos son clsicos en las
10 Biotecnologa
personas que sufren obesidad y diabetes tipo 2, en- Guerra Crespo y con el Dr. Ren Drucker Coln, ambos
fermedades consideradas como problema nacional. investigadores del Instituto de Fisiologa Celular de la
Por estos hallazgos es que en diciembre del 2014 el UNAM.
Dr. Covarrubias recibi el Premio de Investigacin
Mdica Dr. Jorge Rosenkranz. EL CAMINO NO ES SENCILLO
Estos resultados inmersos dentro del campo de la La investigacin recientemente galardonada,
obesidad y la diabetes motivaron a una empresa inici hace ms de 15 aos y ha contado con la
farmacutica a colaborar con esta investigacin, que participacin de diversos alumnos e investigadores
es de gran importancia por el elevado incremento comprometidos. Ahora, gracias a la perseverancia
de estas enfermedades en la poblacin mundial en y al trabajo diario se comienzan a ver los frutos. El
general y en Mxico en particular. Dr. Covarrubias nos comenta que espera que sus
alumnos aprendan que con constancia y dedicacin
En el ao 2006 el Dr. Covarrubias tambin fue se pueden llegar a cumplir las metas planteadas
ganador del Premio de Investigacin Mdica Dr. superando las frustraciones comunes cuando se
Jorge Rosenkranz por la identificacin de clulas involucra uno en lo desconocido.
troncales neuronales con potencial neurognico y
capacidad para producir neuronas dopaminrgicas, LA CIENCIA POR LA CIENCIA
mismas que resultan afectadas en la enfermedad El Dr. Covarrubias hace nfasis en que la bsqueda de
de Parkinson, enfermedad neurodegenerativa que la trascendencia de los trabajos cientficos realizados
se presenta en alta frecuencia en personas de edad en los laboratorios permitir realizar investigacin de
avanzada. punta para la generacin de conocimiento nuevo y
de alto impacto. Finalmente nos comenta: Espero
Otro de los reconocimientos que recibi el Dr. que esta revista sea un excelente medio para trans-
Covarrubias en el 2014 fue el Premio CANIFARMA mitir a los jvenes que, la ciencia se debe hacer en
otorgado por la Cmara Nacional de la Industria busca de conocimiento, planteando ideas nuevas
Farmacutica por su contribucin al descubrimiento es decir, la ciencia por aprender ms de la naturale-
de posibles ambientes neurognicos (regiones del za. Si este principio se mantiene, la ciencia aplicada
cerebro que mantienen un ambiente propicio para de alto impacto est garantizada.
la neurognesis: ver el No.1 de Biotecnologa en
Movimiento, pg. 4) en el cerebro de roedores adul- Contacto: covs@ibt.unam.mx
tos. Esta distincin la comparte con la Dra. Magda
IBt UNAM
EN MOVIMIENTO 11
Dra. Blanca
Jazmn
Reyes
Hernndez
Premio
AgroBIO 2014
12 Biotecnologa
A la par de su frrea
disciplina y com-
promiso hacia el
trabajo, tiene un
gran amor hacia el
deporte.
Su trabajo doctoral se enfoc en estudiar programas mano (ver el No. 1 de Biotecnologa en Movimiento,
de desarrollo en el que participan las clulas tron- pg. 14).
cales (indiferenciadas) presentes en la punta de
la raz de A. thaliana. En esta ocasin seleccion y Jazmn manifiesta y agradece haber tenido la opor-
caracteriz una planta mutante, en la cual demostr tunidad de trabajar en el IBt y apunta: Nuestra co-
cambios en el gen de una enzima directamente munidad est siempre dispuesta a colaborar, orien-
involucrada en la sntesis de vitamina B9, tambin tar y ensear, lo que facilita que se puedan responder
conocida como cido flico. Esta mutacin ocasio- preguntas cientficas importantes.
na alteraciones drsticas en el metabolismo y distri-
bucin de esta vitamina en la planta, afectando di- A la par de su frrea disciplina y compromiso ha-
rectamente el crecimiento de la raz. Estos hallazgos cia el trabajo, tiene un gran amor hacia el deporte.
podran tener en el futuro aplicaciones directas en Ella nos comenta: Mi trabajo en el laboratorio es
el sector agrcola; principalmente para el mejora- como otro deporte que puedo realizar en equipo,
miento en el crecimiento de races, con el fin de in- donde mi profesor es mi entrenador, quien tiene la
crementar el tamao de la hojas y el contenido de experiencia y conocimiento para guiarnos; mis com-
cido flico de los frutos en plantas de consumo hu- paeros de laboratorio son parte del equipo, con los
que tambin tengo la confianza de proponer ideas y
analizar resultados.
...Mi trabajo en el laboratorio es como otro
deporte que puedo realizar en equipo, donde mi Actualmente, Jazmn est realizando su trabajo
profesor es mi entrenador, quien tiene la expe- posdoctoral en el Centro de Ciencias Genmicas
riencia y conocimiento para guiarnos; mis com- de la UNAM, involucrada en el estudio de algunos
paeros de laboratorio son parte del equipo, con aspectos moleculares y evolutivos de bacterias
los que tambin tengo la confianza de proponer asociadas a la rizsfera de las plantas.
ideas y analizar resultados...
Contacto: jazminrh@ccg.unam.mx
EN MOVIMIENTO 13
Proyectos de investigacin de
nuestros estudiantes
Lacasas:
Protenas amigables con el medio
ambiente para descontaminar el agua
M. en C. Joaqun Ramrez Ramrez
Las lacasas son enzimas que catalizan la oxidacin
de una gran variedad de compuestos qumicos, en-
tre ellos algunos compuestos contaminantes como
los fenoles. La enzima requiere nicamente el oxge-
no del aire, y genera agua como subproducto, por
lo que se considera una alternativa ambientalmente
amigable para la descontaminacin del agua.
L
que cataliza. Cuando la lacasa oxida compuestos
a contaminacin del agua es uno de los fenlicos (plaguicidas o compuestos provenientes
problemas ambientales ms importantes en de procesos de la industria del petrleo, como los
la actualidad. Los productos de desecho de hidrocarburos policclicos aromticos), se forman
muchas industrias consisten en compuestos radicales libres, que son especies qumicas suma-
txicos que persisten en el ambiente, ya que son mente reactivas capaces de reaccionar entre s y
difciles de degradar por los microorganismos. La formar polmeros insolubles. Estos ltimos pueden
biotecnologa (procesos que implican el uso de or-
ganismos vivos o sus derivados) es una de las herra-
mientas ms adecuadas para la prevencin, control
y eliminacin de contaminantes ambientales. La
...las lacasas son enzimas que catalizan la
oxidacin de una variedad de compuestos que uti-
biocatlisis ambiental se basa en el uso de enzimas lizan nicamente oxgeno, y generan agua como
(protenas que aceleran reacciones qumicas) ca- subproducto, por lo que se consideran una alter-
paces de transformar un compuesto contaminante nativa ambientalmente amigable con una poten-
en otro con menor toxicidad o mayor susceptibili- cial aplicacin en la biocatlisis ambiental...
dad a ser degradado.
14 Biotecnologa
Estructura tri-
dimensional
determinada
por rayos X de
la lacasa del
basidiomice-
to Coriolopsis
gallica a una
resolucin de
1.9 Angstroms
(pdb 4A2D)
Las visitas son organizadas por la Biol. Irma Vichido Bez y se programan los mircoles y viernes en
un horario matutino desde las 10 hrs. con grupos no mayores de 20 personas.
EN MOVIMIENTO 15
Viendo dentro de los
fermentadores:
U
n elemento fundamental de los biopro- su interior y que podra disminuir la productividad
cesos es el biorreactor, un recipiente que del proceso de fermentacin.
mantiene los microorganismos de inters
bajo las condiciones ptimas de crecimien- Es importante evaluar el efecto que tiene la
to y produccin de diversos compuestos (por ejem- presencia de una fase inmiscible en agua (el aceite)
plo, un antibitico) en procesos de fermentacin. En en los sistemas trifsicos y conocer qu tan pareci-
muchos de estos procesos se utiliza un lquido, que dos (o diferentes) son los tamaos de las gotas de
consiste en agua con sales, donde se sumerge un aceite y de las burbujas de gas, dentro de distintas
microorganismo al que se le suministra oxgeno (un zonas de un biorreactor a escala de un laboratorio.
gas) mediante la inyeccin de aire, necesario para su En este trabajo se utiliz una tcnica de anlisis de
Imgenes obtenidas respiracin. En algunos casos, la mezcla contiene imgenes que consiste en un endoscopio (tubo con
utilizando tcnica tambin aceite (otro lquido) para proporcionar una luz y ptica que facilita la visualizacin al interior
de videoendoscopa
con cmara de alta
fuente de carbono como alimento. Al agitarse, se de un sistema, rgano hueco, cavidad corporal o
velocidad. Izq. Medio produce un medio complejo conocido como siste- biorreactor) acoplado a una cmara de alta veloci-
lquido-lquido 5% ma trifsico compuesto por tres elementos: lquido dad (que capta hasta 5000 imgenes por segun-
v/v. Der. Medio lqui- lquidogas, lo que dificulta la tarea del biorreactor do) lo que permiti obtener imgenes en video
do-gas 0.5 vvm.
para homogeneizar las condiciones imperantes en del sistema trifsico en agitacin, en diferentes
lugares dentro del tanque.
16 Biotecnologa
Equipo de video-
Adems, se encontr que la presencia del endoscopa
gas produce una mejora en la dispersin del aceite acoplado a
una cmara de alta
(esto es, se generan gotas de dimetro menor) y
velocidad.
que la presencia de aceite produce una mejora en
la dispersin del gas, es decir, se obtienen menores
dimetros de burbujas (lo que es deseable, ya que
mientras ms pequeas son, ms capacidad tienen
de transferir oxgeno del gas al lquido).
Contacto:
linda@ibt.unam.mx
EN MOVIMIENTO 17
Evolucin
de una protena en el laboratorio
M
cuya actividad puede detectarse de manera sen-
uchas de las reacciones bioqumicas de cilla.
los seres vivos se llevan a cabo gracias
a la accin de las protenas (enzimas) Se realizaron varios ciclos de recombinacin y se-
que favorecen la transformacin de los leccin para obtener anticuerpos con mayor activi-
compuestos a otros productos; stas actuan al unir dad transformadora. Las variantes seleccionadas de
una molcula y transformarla de manera especfica. cada ciclo se utilizaron como inicio para el siguiente
Actualmente se busca modificar las protenas para ciclo. De esta manera es posible selecccionar de
mejorar sus propiedades. manera gradual anticuerpos con mejor actividad
de transformacin. A este proceso reiterativo que
Existen protenas en el sistema inmune que son ca- imita el proceso de evolucin que ocurre en la na-
paces de unir molculas sin transformarlas. A estas turaleza se le conoce como evolucin dirigida (ver
protenas del sistema inmune se les conoce como figura).
anticuerpos y nos ayudan a defendernos de las en-
fermedades. Este sistema permiti seleccionar anticuerpos con
mejores caractersticas, aunque desafortunada-
Los anticuerpos se han utilizado para construir en- mente no mostraron mayor actividad enzimtica.
zimas ya que son capaces de unir una molcula y Esto indica que se deben mejorar otras propie-
solamente les falta que adquieran la capacidad para dades de anticuerpo para incrementar su capaci-
transformarla. dad de transformar sustratos.
18 Biotecnologa
Propiedad Intelectual, Tecnologa
y Empresa
Seccin a cargo de Carlos Pea (carlosf@ibt.unam.mx)
El IBt tiene una muy importante capacidad de generacin pases desarrollados.
de conocimiento y una parte de l tiene el potencial de
ser explotado comercialmente, para lo que requiere de la Aunque cada vez son ms los programas que apoyan este
proteccin de los derechos de propiedad intelectual. La tipo de acciones, estamos lejos de alcanzar los niveles que,
propiedad intelectual es un elemento fundamental de la como pas, requerimos para un desarrollo competitivo.
innovacin y nuestro Instituto es la entidad acadmica de Esta seccin pretende compartir con nuestros lectores di-
la UNAM que ms patentes genera. Por otro lado, la for- versas experiencias del IBt orientadas al emprendimiento
macin de empresas de base tecnolgica contina siendo de base cientfica, desde la creacin de nuevas empresas
un tema pendiente en nuestro pas. Especficamente en el en diferentes campos de la biotecnologa, as como la pro-
caso de la Biotecnologa, la brecha es muy amplia, con los teccin intelectual del conocimiento generado.
Emprender?
Enchlame otra!
Dr. Alejandro Torres Gaviln
E
l ttulo Emprender? Enchlame otra!, tiene todos conocen la sensacin que produce la capsaici-
dos sentidos. El primero, hace referencia na y ms de alguna vez nos ha hecho sudar
al refrn mexicano para hacer enchiladas, cuando por gusto o por equivocacin le pone-
una tarea sencilla que consiste en pasar por mos una salsa picosa a nuestra comida. La capsaici-
salsa una tortilla para despus dorarla (o al revs) na pertenece a una familia de molculas conocidas
y servirla. Es decir que convertirse en pasante de como capsaicinoides y ellas son las responsables
empresario no requiere de mucho ms que tener del efecto pungente (picante) de los chiles. El pi-
el atrevimiento de cambiar de una actividad a la cor de estas molculas se cuantifica gracias a una
comercializacin de una propuesta de valor. El prueba sensorial desarrollada por Wilbur Scoville
otro motivo es porque estoy inciando en los (Scoville Heat Units, SHU). La capsaicina, la molcu-
negocios con productos relacionados con el chile, la natural ms picante, tiene un valor de 16,000,000
en particular, con anlogos de capsaicina. Seguro SHU; mientras que la homocapsaicina, la prima her-
EN MOVIMIENTO 19
mana de la capsaicina es menos picante, y tiene un y desproteccin de grupos funcionales, activacin
valor de 8,600,000 SHU. Gracias a esta escala y purificacin de compuestos intermedios y se
podemos calificar a los chiles en funcin del picor generan algunos subproductos.
y podemos encontrar que los chiles considerados
dulces, como el pimiento morrn, tienen de 100 a Mi historia comienza alrededor del 2005 con la
200 SHU; mientras que, los habaneros se encuentran publicacin de mi trabajo de maestra en la que,
entre 100,000 y 350,000 SHU. Las aplicaciones ms por motivos inherentes al objetivo particular de la
comunes de los capsaicinoides son en la industria tesis, tuve que llevar a cabo la sntesis enzimtica
de alimentos, tecnologas no letales como el gas de aproximadamente 16 compuestos estructural-
pimienta, pesticidas y rodenticidas e incluso en el mente relacionados entre ellos y muy parecidos a
recubrimiento de barcos para evitar el fouling o la la capsaicina. En el estudio de la bioqumica de unos
incrustacin de algas y moluscos en los cascos de de ellos, entrada la madrugada, despus de tomar
los barcos y tuberas. Tambin estas molculas son varias muestras y dndome de cachetadas para no
empleadas en la industria farmacutica dado que dormir por el cansancio, me llev las manos a los
producen analgesia y se han reportado como po- ojos y no los pude volver a abrir por los prximos 15
tenciales agentes que previenen ciertos tipos de minutos a pesar de los extensos lavados con agua.
cncer. Su forma ms comn de comercializacin A pesar de que ahora me resulta obvio, fue en ese
es en forma de oleorresina, una mezcla compleja de momento que me di cuenta que estaba producien-
cidos carboxlicos, carotenoides, y dems compo- do CAPSAICINOIDES!!, molculas sumamente
nentes del chile dentro de los que se encuentran irritantes y picantes. Derivado de esta picante
los capsaicinoides y aunque es posible encontrar experiencia y gracias a una colaboracin con la
a la capsaicina en forma pura y cristalina, su costo Facultad de Qumica de la UNAM, se llev a cabo un
es elevado y su disponibilidad limitada. La sntesis anlisis organolptico formal en el que encon-
qumica de estas molculas es un poco complicada tramos que algunos de estos compuestos tienen
dado que se requieren varias etapas de proteccin una pungencia similar a la de la capsaicina e incluso
mayor a la de algunos capsaicinoides naturales. Para
darles una idea sobre lo picante de estas molculas,
La escala Scoville y sobre el potencial de la tecnologa, imaginen que
Se usa para medir el picante de de los distintos tipos de chile de un bocado ingieren un puo de chile habanero
UNIDADES (~ 5 chiles habaneros naranjas de ~5.4 gr c/u). Lo
SCOVILLE inmediato sera una sensacin caliente en la lengua
EXTREMO Trinidad con extrema irritacin, acompaado del sudor en la
Moruga Scorpion
Naga viper Hasta 2 millones frente y nuca, quiz un molesto piiiiiiiii en los odos y
Hasta 1.3 millones
algunos, adems de mareos, podran estar al borde
o inmersos en alucinaciones.
Spray de
pimienta Ms tarde, me involucr en un doctorado e inclu-
Apartir de 2 millones
so, realic dos estancias postdoctorales. Fue hasta
entonces cuando hice una pausa en mi prometedo-
FUERTE ra carrera como investigador para preguntarme so-
Chile
habanero bre mis posibilidades de desarrollo en otras reas.
200 000/350 000
Pimienta
Decid entonces explorar mis capacidades de
Rocoto
de cayena
30.000/50.000
100.000/350.000 pasante de empresario y convertirme en emprende-
Chile dor.
serrano
10.000/23.000
20 Biotecnologa
pobremente y nmero 3, no tena ni idea de lo que mos que rechazar el apoyo y agradecer la amabili-
quera llevar a cabo. Con suma amabilidad y con dad de los inversionistas y la de su desinteresado
mucho aliento por parte del equipo, me di cuenta conocido. Esta experiencia fue el error nmero 4,
de que difcilmente iba a convencer a alguien de nos asociamos con co-fundadores inadecuados.
aventurarse conmigo, sobre todo tratndose de l- En retrospectiva, y despus de discutir mucho
deres acadmicos, ya que no todos tienen inters en el hecho con el equipo, esta parte de la his-
la creacin de una empresa. Siguiendo el lema de: toria potenci nuestro empeo en hacer
Falla pronto, falla barato y recomienza ya, prcti- de la tecnologa un negocio. En aquel mo-
camente en la misma semana de aquella reunin mento entend que hay en el mercado un
y revisando las bitcoras, encontr en los anlogos espacio para los anlogos de capsaicina.
de caspsaicina una puerta abierta. Tambin, hubo
que reducir el nmero de integrantes y a partir de Impulsados por el fracaso anterior y
entonces encontr en los doctores Agustn Lpez, con el apoyo de los investigadores del
Edmundo Castillo e Ignacio Regla, adems de la equipo, quienes hicieron un esfuerzo
frmula correcta, el invaluable apoyo para novatear por aportar los sobrantes casi nulos
en los negocios. de presupuestos de otros proyectos y con la
libertad que me dio mi jefe de aquel entonces,
EN MOVIMIENTO 21
debimos haber sido nosotros quienes intentramos sugera el mercado. Por su parte, el empresario puso
convencer a los dirigentes de la empresa interesada al alcance los recursos necesarios para que aquello
en nuestras invenciones, de hacer lo que nosotros ocurriera. Con este apoyo logramos consolidar la
queramos y no al revs. tecnologa y protegerla. Ahora considero que lo ms
importante fue que, entre los actores involucrados,
logramos estrechar vnculos y entender las necesi-
dades de cada uno. De hecho, en ese momento fue
...actualmente, la vinculacin entre In- cuando empec a saber el significado de pasante
no-Ba, GAFISA y el IBt es fuerte y gracias a ello con- de empresario y marc el nacimiento de la empre-
tamos con un apoyo del programa FINNOVA... sa Grupo Alimentario Farmacutica Industrial SAPI
de CV., Sociedad Annima Promotora de Inversin
(GAFISA) modalidad capsaicinoides.
Sin desilusionarnos, continuamos con la optimi-
zacin de la tecnologa y ms tarde, nos acercamos Actualmente, la vinculacin entre Inno-Ba, GAFISA
a la Dra. Karla Cedano a quin le presentamos el y el IBt es fuerte y gracias a ello contamos con un
proyecto. La energa de Karla y la de Inno-Ba (Oficina apoyo del programa FINNOVA. Como parte de
de Transferencia de Conocimiento OTC certificada GAFISA considero que estamos en el camino ade-
por CONACyT), pronto nos llevaron a entablar una cuado y para mi es de suma importancia que nues-
pltica con un empresario a quien Karla, convenci tra empresa se encuentre en contacto permanente
para que nos escuchara. Prcticamente la mesa esta- con la academia, y en particular, con la institucin
ba puesta y slo habramos de ponernos de acuerdo que desarroll la tecnologa y que dio pi a que
en cmo y cunto. Sorprendentemente, a la semana GAFISA modalidad capsaicinoides naciera. Esto
de haberle presentado el proyecto al inversionista no slo como estrategia para la optimizacin
y a Inno-Ba, la OTC ya estaba sometiendo una pro- constante de la tecnologa; sino como pilar funda-
puesta al Programa de Estmulos a la Innovacin mental del desarrollo e innovacin en los siguientes
(PEI) con una visin y ambicin mucho ms amplia pasos de GAFISA. Por otro lado, el cobijo, el respal-
de la que habamos estimado los acadmicos. Con do y articulacin de Inno-Ba ha sido fundamental.
el PEI aprobado y con Inno-Ba articulando y aceitan- Aunque han sido mucho ms que eso, su funcin
do los engranes, los acadmicos logramos escalar de intrprete y traductor de la comunicacin entre
y optimizar la tecnologa para las demandas que GAFISA y el IBt evitaron el desgaste de los vincu-
lados e incluso, en momen-
tos crticos, el rompimiento
de la relacin. Hoy, al cabo
de un tiempo, me encuentro
ms cerca de lograr la meta.
CHILE
22 Biotecnologa
Unidades y Laboratorios que apoyan
a la investigacin y a la industria
El IBt cuenta con seis unidades que dan las facilidades tc- cruciales para la comunidad universitaria y empresarial.
nolgicas de avanzada, necesarias para el desarrollo de En esta seccin, los acadmicos adscritos a las Unidades/
los proyectos de investigacin. Asimismo, contamos con Laboratorios nos comparten sus experiencias en el traba-
tres laboratorios, de carcter universitario o nacional, cuyos jo cotidiano desde sus trincheras.
servicios de apoyo a la investigacin y a la docencia son
Unidad de
Secuenciacin
Masiva y Bioinformtica,
a la vanguardia de la ciencia
U
no de los grandes problemas que ha la molcula del ADN y por esto el proceso se llama
afectado el desarrollo cientfico del pas, secuenciacin.
ha sido el rezago a nivel tecnolgico en
diferentes reas. Gracias al fenmeno de La cantidad de informacin a secuenciar depender
globalizacin que vivimos actualmente, los costos de cada organismo. Por ejemplo, una bacteria
de la tecnologa de vanguardia se han reducido puede tener toda la informacin gentica en un
considerablemente, permitiendo cerrar la brecha milln de bases, mientras que el ser humano tiene
tecnolgica que exista en la ciencia en Mxico. 3 mil millones de estos bloques. Este compendio
de informacin gentica, es lo que se conoce como
Ejemplo de ello es la Unidad de Secuenciacin Ma- el genoma de un organismo y al estudio de los
siva y Bioinformtica (USMB), que tiene como sede genomas se le denomina genmica. Analizar esta
al IBt de la UNAM (www.uusmd.unam.mx). Esta cantidad de informacin no es posible de manera
unidad se encarga de brindar servicios a usuarios manual. Sin embargo, la ventaja de poder represen-
tanto dentro como fuera de la UNAM, incluyendo tar los bloques o bases que conforman la molcula
aquellos del extranjero. Los servicios que se brin- de ADN en letras de nuestro alfabeto, hace posible
dan estn enfocados a resolver problemas en diver- crear textos que contienen toda la informacin de
sas reas de la ciencia y la tecnologa como son la un genoma.
biologa, la ecologa, la medicina y la biotecnologa,
entre otras, relacionadas con la informacin que se Dichos textos pueden ser almacenados, proce-
puede obtener a partir del ADN y que gracias a las sados, filtrados, analizados e interpretados de
nuevas tecnologas, es posible caracterizar y estudiar manera digital, haciendo uso de herramientas
en tiempos cortos a precios relativamente bajos. computacionales. Esto es lo que se conoce como
Bioinformtica.
El ADN es una cadena formada principalmente por
4 bloques (bases) que normalmente son represen-
tados por las letras A, T, G y C. Estas largas cadenas ...gracias al fenmeno de globalizacin que
no slo son las molculas responsables de la heren- vivimos actualmente, los costos de la tecnologa de
cia en los seres vivos, tambin contienen mensajes vanguardia se han reducido considerablemente,
o instrucciones que definen a cada organismo. Por permitiendo cerrar la brecha tecnolgica que
lo tanto, lo que se desea es determinar la secuencia exista en la ciencia en Mxico...
-el orden- en el que se encuentran estos bloques en
EN MOVIMIENTO 23
Cluster con capacidad con enfermedades
de analisis de 280 com-
putadoras trabajando tales como la diabetes,
simultneamente donde se estudian las
variantes genticas de
los miembros de una
familia que presenta
la patologa. En otro
proyecto, en colabo-
racin con el Servicio
Nacional de Sanidad
Inocuidad y Calidad
Agroalimentaria (SE-
NASICA), se desarroll
un mtodo para la
deteccin de elemen-
tos transgnicos (ADN
que no pertenece a
una especie y que al
ser introducido en otra
especie le transfiere
capacidades que fa-
vorecen su crecimiento
o productividad) pre-
sentes en diferentes
tipos de cultivo.
Como su nombre lo indica, la unidad se especializa
en la secuenciacin masiva de ADN y en la Bioin- Esto es muy importante debido al control que se
formtica, reas inseparables para poder analizar e requiere para cumplir con las leyes de uso de
interpretar la informacin generada. La secuenciacin organismos genticamente modificados en nues-
del genoma humano comenz en el ao de 1990. tro pas. Tambin hemos participado en resolver
problemas de acuicultura, como es la muerte de los
24 Biotecnologa
Cursos y tpicos en el IBt
Del gen
al producto
L
a biotecnologa moderna combina una serie
de herramientas tericas y experimentales
para el desarrollo de un bioproceso. En el
curso Del gen al producto, se proporcionan
los fundamentos tericos y prcticos de los biopro-
cesos modernos, mediante un anlisis secuencial
de las etapas que conforman un bioproceso
"tpico" moderno, basado en microorganismos o
clulas genticamente modificadas.
EN MOVIMIENTO 25
lacin de vas metablicas para favorecer
la produccin de un determinado me-
tabolito (producto) de inters comercial.
26 Biotecnologa
En la voz de nuestros ex-alumnos
El papel de la nutricin en
la desaparicin de las abejas:
causas y soluciones (2da. parte)
Dr. Miguel Corona Villegas
Departamento de Agricultura
de los Estados Unidos de Amrica
A
Posibles soluciones
unque es claro que el estrs nutricional cau- alimentos (incluyendo cereales como el trigo, maz, soya
sado por destruccin del hbitat es un factor y arroz, que no dependen de la polinizacin de insectos)
importante asociado a la disminucin de las al mismo tiempo resulte en la reduccin de poblaciones
poblaciones de abejas y otros polinizadores, de insectos que impactan principalmente la produccin
la solucin de este problema constituye un reto for- de frutas y verduras que tambin son sustanciales para
midable. Resulta paradjico que la revolucin verde la nutricin humana. De la solucin de esta paradoja
caracterizada por el uso de la agricultura industrial que depende nuestro futuro: debemos solucionar la nutricin
ha incrementado sustancialmente la produccin de de las abejas para asegurar nuestra propia nutricin.
EN MOVIMIENTO 27
las polticas y estrategias asociadas a la agricultura
industrial, lo cual bien podra constituir una segunda
revolucin verde.
28 Biotecnologa
Historias de nuestra comunidad
E
n mi caso particular, tuve un proyecto de exactamente a 17 nucletidos la secuencia TATAAT,
tesis de licenciatura hasta que regres Xavier secuencias que son esenciales para que la RNA
Sobern. Dentro de sus ideas y planes, polimerasa inicie la sntesis del ARN mensajero en la
Xavier quera saber cmo funcionaban los bacteria. El punto es que no sabamos si funcionaba
promotores para dar inicio a la transcripcin en E. y es ah donde entr yo en el proyecto. Hicimos
coli. Siendo Xavier un experto en sntesis qumica de construcciones en las que pusimos enfrente de este
ADN, ya haba construido un promotor consenso promotor el gen de resistencia a tetraciclina y el de
que tena en la posicin -35 la secuencia TTGACA y resistencia a cloranfenicol como reporteros, era el
EN MOVIMIENTO 29
ta mejorar la secuencia de ADN. Por ejemplo, cuan-
do hice la secuencia del operador lac y el promotor
sinttico, estbamos implementando el uso del fago
M13 como vector de cadena sencilla, lo que facilita-
ba la secuencia tipo Sanger y no le sala bien a na-
die. No recuerdo en qu artculo lo le, pero fue uno
publicado en Cell o en Nature, en el que mostraban
un gel de secuencia en M13 (impecable) y en el ma-
terial y mtodos recomendaban aumentar el incu-
lo de E. coli al momento de la infeccin con el fago
y dejar sta ms tiempo problema solucionado y
con algo tan simple. As pas con otros compaeros
y esta actitud benefici ampliamente a todo el gru-
po, incluyendo a los proyectos aplicados.
La mstica
Uno de los mejores recuerdos que tengo de ese
tiempo es que por razones obvias, los estudiantes
que estbamos ms comprometidos con la ciencia
bsica, tenamos ms afinidades. En algunos de
ellos como Luis Covarrubias, Mario Rocha, Alejan-
dro Garcarrubio, Irene Castao, Guillermo Oliver
y yo, nos atraa obsesivamente la biologa molecu-
lar de eucariotes, en particular, cmo se regulan
los genes durante la diferenciacin celular y el de-
sarrollo. No haba en ese momento en Mxico un
Dr. Mario Zurita y Dr. ao 1982. Entre tantas construcciones tambin de- grupo que realmente fuera experto en el tema. As
Francisco Bolivar cidimos ponerle la secuencia de ADN que reconoce que organizbamos journal clubs en los que slo
el represor de lactosa, el cual impide la activacin participbamos los estudiantes y discutamos estos
del metabolismo de lactosa en E. coli para ver si temas, revisando la literatura en las revistas de van-
tambin se poda regular, aunque lo pusimos ro guardia de la poca (que prcticamente siguen sien-
arriba del promotor (en el operon lac, el operador do las mismas ahora, con alguna que otra nueva) y
sobrelapa con el promotor en el sitio de inicio de la sobamos cundo podramos hacer investigacin
transcripcin), adems se nos clon por duplicado en estos temas.
y en orientacin invertida y nos dimos cuenta hasta
que secuenciamos nuestras construcciones (todo Otro recuerdo interesante, es aquel de encontrarnos
era manual, no haba kits, nosotros preparbamos los viernes a las diez de la noche en el laboratorio
las mezclas de nucletidos, etc.). De cualquier de Xavier Sobern corriendo un gel y ver que en el
manera, funcion como promotor y era regulado laboratorio del Dr. Bastarrachea, en el de Francisco
por el operador lac, estando ste en otra posicin Bolvar y en el de Alejandra Covarrubias, tambin
y en sentido invertido. Este trabajo fue mi tesis de estaban corriendo geles o purificando plsmidos
licenciatura que defend en 1982 y nunca publica- y escuchar ese hermoso sonido de las micro-cen-
mos. Aos despus salieron varios artculos de otros trfugas en todos los laboratorios del segundo piso
grupos y en buenas revistas, en las que comuni- de Biomdicas. En algunas ocasiones, al salir ya tar-
caban resultados parecidos. de el viernes o el sbado tambin visitbamos algn
bar para platicar de nuestros experimentos exitosos
Hago referencia a mi proyecto porque ste era un y sobre todo de los fallidos haba mstica
proyecto de ciencia bsica en un grupo cuya pun-
ta de lanza era un proyecto aplicado. Frecuente- En conclusin, fue un momento extraordinario para
mente, los estudiantes que tenamos en algn los estudiantes de aquel entonces, en el inicio de lo
punto un proyecto de ciencia bsica, estbamos ms que sera el IBt. As mismo, para algunos de nosotros
actualizados con la literatura general y la de biologa qued muy clara la importancia de estar rodeados
molecular. Esto inclua nuevas tcnicas, las cuales de gente que hace ciencia bsica de buena calidad
tratbamos de implementar si nos servan para el para que los proyectos aplicados, que no son trivia-
proyecto e iban desde hacer mejores preparaciones les, sean exitosos.
de plsmidos en pequea escala (mini-preps), has- Contacto: marioz@ibt.unam.mx
30 Biotecnologa
Ciencia y Cultura
Pobreza en la abundancia
del siglo
XXI
N
uestra visin del mundo est determinada de inteligencia artificial cada da hacen trabajos ms
por la escasez. A lo largo de la historia de intelectuales que muy pronto desplazarn a miles
la humanidad, todo ha sido escaso, las de contadores y abogados. Los mdicos no son
protenas, las caloras, la informacin, la una excepcin, Watson de IBM, un sistema de inteli-
educacin, el agua, todo. La escasez determin la gencia artificial famoso por haber ganado el juego
condicin humana y nuestro concepto de moralidad, Jeopardy a campeones humanos, est siendo
al grado que la gula es un pecado mortal porque entrenado para hacer diagnstico clnico y los ro-
en tiempos de escasez, lo que t te atragantas hace bots quirrgicos estn por minimizar el nmero de
hambriento a otro. En los ltimos 100 aos, todo cirujanos necesarios, es clarsimo que la economa y
cambi, no existe escasez, vivimos en una era de la sociedad van a ser profundamente transformadas
abundancia como nunca habamos visto. Gracias a por la automatizacin.
la automatizacin, el trabajo es cada vez ms innece-
sario. Segn Wikipedia, en 1870 entre el 70 y el 80 En pocas palabras, el trabajo humano se est volviendo
% de la poblacin de Estados Unidos se dedicaba a innecesario. A pesar de todo esto, la sociedad sigue
la agricultura; ahora, slo el 2 % de la poblacin lo programada para vivir en la escasez y no sabemos
hace. Cuando se compara la produccin de alimen- administrar la abundancia. Se calcula que, optimi-
tos actual con la de 1950, los granjeros modernos zando la distribucin de bienes y servicios con el
producen 262 % ms comida con 2 % menos in- objetivo de minimizar el trabajo, slo el 5 % del traba-
versin por hectrea. El aumento en el rendimiento jo y las actividades econmicas que se desarrollan
y la productividad y la reduccin del trabajo est actualmente seran necesarios, es decir, la semana
sucediendo en todas las reas de la economa. En laboral se reducira de 40 hrs a 2 hrs. Si aceptamos
este momento existen vehculos automatizados esta tendencia, nos tenemos que preguntar: Qu
como los de Google que van a desplazar a choferes y tipo de sociedad vamos a querer? Un mundo donde
transportistas, drones que desplazarn a los pilotos gracias a la abundancia generada haya suficiente de
y controladores, robots bodegueros y los sistemas todo para todos, algo as como un hotel todo inclui-
EN MOVIMIENTO 31
do para toda la humanidad. O, un mundo en donde la mayor parte de los problemas de la humanidad
todos estos bienes generados por la automatizacin se pueden resolver (agua, alimentacin, materias
estn disponibles para unos pocos y la mayora no primas, etc.). Sin embargo, no queda totalmente
tenga prcticamente nada, algo as como un campo claro qu sucede con la disparidad social que sufri-
de refugiados. mos actualmente. Bsicamente propone que en un
mundo donde hay tanta abundancia hasta los ms
Esta pregunta tan fundamental para el futuro de pobres, son ricos.
nuestra especie se plantea en tres libros que quiero
comentar. El primero se llama La Singularidad est El tercer libro es de Thomas Piketty y se llama El
cerca escrito por Ray Kurzweil quien invent el sin- capital en el siglo XXI. Ya hay quien dice que va a
tetizador digital entre otras muchas cosas y trabaja ser el libro de economa ms influyente del siglo.
actualmente como director de Ingeniera en Google. Piketty argumenta que el retorno a la inversin en
Este libro propone la naturaleza del crecimiento ex- capital (inters), es mayor que el valor del trabajo
ponencial del conocimiento y la hiptesis se apoya y mayor que el crecimiento econmico a largo
en el crecimiento de la capacidad de cmputo a lo plazo, lo que genera acumulacin de la riqueza por
largo de los aos. Con una serie de premisas bien unos cuantos y una profunda disparidad social que
fundamentadas, predice que alrededor del ao causa inestabilidad social y econmica. Piketty, no
2020, una computadora de mil dlares tendr la mis- es nada optimista y afirma que, si se mantiene el
ma capacidad de cmputo que un cerebro humano, status quo, vamos directamente a una catstrofe
lo que permitira disear mquinas tan inteligentes social y econmica y sostiene que, la nica forma
o ms que los humanos que a su vez podran disear de resolver el problema es mediante un sistema
muy rpidamente mquinas an ms inteligentes global de impuestos con una tasa progresiva a la
que repetiran el ciclo, eventualmente causando una riqueza para generar una mejor distribucin del
explosin de la inteligencia. capital y disminuir la disparidad social.
Lo que sucede despus de esta explosin es tan El mensaje de los tres libros es el siguiente: la cien-
complejo y dinmico que sencillamente no po- cia, el conocimiento y la riqueza estn creciendo de
demos imaginarlo (de ah el trmino singularidad). manera exponencial y se retroalimentan mutua-
Kurzweil es bastante optimista, pero, hay que mente acelerando an ms el crecimiento. Estamos
tener claro que las mquinas superinteligentes entrando a una era donde habr una enorme abun-
posteriores a la singularidad pueden ser benignas, dancia de bienes y servicios en la que el trabajo hu-
malignas o indiferentes con respecto a la humani- mano va a ser cada vez ms innecesario. La riqueza
dad. Si son benignas, el futuro de la humanidad va est muy mal distribuida y esta enorme disparidad
a ser paradisiaco, si son malignas o indiferentes social causa inestabilidad social y econmica. En
nuestra especie se extingue inexorablemente en consecuencia, para la supervivencia y bienestar de
este siglo. La actitud que tomen las mquinas super- nuestra especie es fundamental preguntarnos: En
inteligentes depender quiz, de la actitud que la qu tipo de mundo queremos vivir?
humanidad tome con respecto a s misma.
32 Biotecnologa
Primer lugar
Ttulo: Vbora
Autor: Edgar Enrique Neri Castro
Sptimo Lugar.
Ttulo: Ojo de gato
Autor: Edgar Enrique Neri Castro
Durante la evaporacin, estas partculas son arrastradas debido al flujo del lquido en
evaporacin formando complejos patrones de singular belleza.