Bioqumica

Representacin esquemtica de la molcula de ADN, la molcula portadora de la

informacin gentica.
La bioqumica es una ciencia que estudia la composicin qumica de los seres vivos,
especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos y cidos nucleicos, adems de otras
pequeas molculas presentes en las clulas y las reacciones qumicas que sufren estos
compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energa (catabolismo) y generar
biomolculas propias (anabolismo). La bioqumica se basa en el concepto de que todo ser
vivo contiene carbono y en general las molculas biolgicas estn compuestas
principalmente de carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo yazufre.
Es la ciencia que estudia la base qumica de las molculas que componen las clulas y
los tejidos, que catalizan las reacciones qumicas del metabolismo celular como
la digestin, la fotosntesis y la inmunidad, entre otras muchas cosas.
Podemos entender la bioqumica como una disciplina cientfica integradora que aborda el
estudio de las biomolculas y biosistemas. Integra de esta forma las leyes qumico-fsicas y
la evolucin biolgica que afectan a los biosistemas y a sus componentes. Lo hace desde un
punto de vista molecular y trata de entender y aplicar su conocimiento a amplios sectores
de la medicina (terapia gentica y biomedicina), la agroalimentacin, la farmacologa.
Constituye un pilar fundamental de la biotecnologa, y se ha consolidado como una
disciplina esencial para abordar los grandes problemas y enfermedades actuales y del
futuro, tales como el cambio climtico, la escasez de recursos agroalimentarios ante el
aumento de poblacin mundial, el agotamiento de las reservas de combustibles fsiles, la
aparicin de nuevas formas de alergias, el aumento del cncer, las enfermedades genticas,
la obesidad, etc.
La bioqumica es una ciencia experimental y por ello recurrir al uso de numerosas tcnicas
instrumentales propias y de otros campos, pero la base de su desarrollo parte del hecho de
que lo que ocurre en vivo a nivel subcelular se mantiene o conserva tras el fraccionamiento
subcelular, y a partir de ah, podemos estudiarlo y extraer conclusiones.

Historia
La historia de la bioqumica moderna como la conocemos hoy en da es prcticamente
moderna; desde el siglo XIX se comenz a direccionar una buena parte de la biologa y
la qumica a la creacin de una nueva disciplina integradora: la qumica fisiolgica o la
bioqumica. Pero la aplicacin de la bioqumica y su conocimiento, probablemente
comenz hace 5000 aos con la produccin de pan usando levaduras en un proceso
conocido como fermentacin.
Es difcil abordar la historia de la bioqumica, en cuanto que, es una mezcla compleja de
qumica orgnica y biologa, y en ocasiones, se hace complicado discernir entre lo
exclusivamente biolgico y lo exclusivamente qumico orgnico y es evidente que la
contribucin a esta disciplina ha sido muy extensa. Aunque es cierto que existen datos
experimentales que son bsicos en la bioqumica.
Se suele situar el inicio de la bioqumica en los descubrimientos en 1828 de Friedrich
Whler que public un artculo acerca de la sntesis de urea, probando que los compuestos
orgnicos pueden ser creados artificialmente, en contraste con la creencia, comnmente
aceptada durante mucho tiempo, de que la generacin de estos compuestos era posible slo
en el interior de los seres vivos.
La diastasa fue la primera enzima descubierta. En 1833 se extrajo de la solucin de malta
por Anselme Payen y Jean-Franois Persoz, dos qumicos de una fbrica de azcar
francesa.1
A mediados del siglo XIX, Louis Pasteur, demostr los fenmenos de isomera qumica
existente entre las molculas de cido tartrico provenientes de los seres vivos y las
sintetizadas qumicamente en el laboratorio. Tambin estudi el fenmeno de la
fermentacin y descubri que intervenan ciertas levaduras, y por tanto no era
exclusivamente un fenmeno qumico como se haba defendido hasta ahora (entre ellos el
propio Liebig); as Pasteur escribi: la fermentacin del alcohol es un acto relacionado
con la vida y la organizacin de las clulas de las levaduras, y no con la muerte y la
putrefaccin de las clulas. Adems desarroll un mtodo de esterilizacin de la leche, el
vino y la cerveza (pasteurizacin) y contribuy enormemente a refutar la idea de la
generacin espontnea de los seres vivos.
En 1869 se descubre la nuclena y se observa que es una sustancia muy rica en fsforo. Dos
aos ms tarde, Albrecht Kossel concluye que la nuclena es rica en protenas y contiene las
bases pricas adenina y guanina y las pirimidnicas citosina y timina. En 1889 se aslan los
dos componentes mayoritarios de la nuclena:

Protenas (70 %)

Sustancias de carcter cido: cido nucleicos (30 %)

En 1878 el fisilogo Wilhelm Khne acu el trmino enzima para referirse a los
componentes biolgicos desconocidos que producan la fermentacin. La palabra enzima
fue usada despus para referirse a sustancias inertes tales como la pepsina.
En 1897 Eduard Buchner comenz a estudiar la capacidad de los extractos de levadura para
fermentar azcar a pesar de la ausencia de clulas vivientes de levadura. En una serie de
experimentos en la Universidad Humboldt de Berln, encontr que el azcar era fermentado
inclusive cuando no haba elementos vivos en los cultivos de clulas de levaduras. Llam a
la enzima que causa la fermentacin de la sacarosa, zimasa. Al demostrar que las enzimas
podran funcionar fuera de una clula viva, el siguiente paso fue demostrar cul era la
naturaleza bioqumica de esos biocatalizadores. El debate fue extenso, muchos como el
bioqumico alemn Richard Willsttter discrepaban de que la protena fuera el catalizador
enzimtico, hasta que en 1926, James B. Sumner demostr que la enzima ureasa era una
protena pura y la cristaliz. La conclusin de que las protenas puras podan ser enzimas
fue definitivamente probada en torno a 1930 por John Howard Northrop y Wendell
Meredith Stanley, quienes trabajaron con diversas enzimas digestivas como la pepsina, la
tripsina y la quimotripsina.
En 1903 Mijal Tswett inicia los estudios de cromatografa para separacin de pigmentos.
En torno a 1915 Gustav Embden y Otto Meyerhof realizan sus estudios sobre la gluclisis.
En 1920 se descubre que en las clulas hay ADN y ARN y que difieren en el azcar que
forma parte de su composicin: desoxirribosa o ribosa. El ADN reside en el ncleo. Unos
aos ms tarde, se descubre que en los espermatozoides hay fundamentalmente ADN y
protenas, y posteriormente Feulgen descubre que hay ADN en los cromosomas con su
tincin especfica para este compuesto.
En 1925 Theodor Svedberg demuestra que las protenas son macromolculas y desarrolla la
tcnica de ultracentrifugacin analtica.
En 1928, Alexander Fleming descubre la penicilina y desarrolla estudios sobre la lisozima.
Richard Willsttter (en torno 1910) estudia la clorofila y comprueba la similitud que hay
con la hemoglobina. Posteriormente Hans Fischer en torno a 1930, investiga la qumica de
lasporfirinas de las que derivan la clorofila o el grupo porfirnico de la hemoglobina.
Consigui sintetizar hemina y bilirrubina. Paralelamente Heinrich Otto Wieland formula
teoras sobre las deshidrogenaciones y explica la constitucin de muchas otras sustancias de
naturaleza compleja, como la pteridina, las hormonas sexuales o los cidos biliares.
En la dcada de 1940, Melvin Calvin concluye el estudio del ciclo de Calvin en
la fotosntesis y Albert Claude la sntesis del ATP en las mitocondrias.
En torno a 1945 Gerty Cori, Carl Cori, y Bernardo Houssay completan sus estudios sobre
el ciclo de Cori.
En 1953 James Dewey Watson y Francis Crick, gracias a los estudios previos
con cristalografa de rayos X de ADN de Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, y los
estudios de Erwin Chargaffsobre apareamiento de bases nitrogenadas, deducen la estructura
de doble hlice del ADN. En 1957, Matthew Meselson y Franklin Stahl demuestran que
la replicacin del ADN es semiconservativa.
En la segunda mitad del siglo XX, comienza la autntica revolucin de la bioqumica y la
biologa molecular moderna, especialmente gracias al desarrollo de las tcnicas
experimentales ms bsicas como la cromatografa, la centrifugacin, la electroforesis, las
tcnicas radioisotpicas y la microscopa electrnica, y las tcnicas ms complejas como
la cristalografa de rayos X, la resonancia magntica nuclear, la PCR (Kary Mullis), el
desarrollo de la inmuno-tcnicas.
Desde 1950 a 1975 , se conocen en profundidad y detalle aspectos del metabolismo celular
inimaginables hasta ahora (fosforilacin oxidativa (Peter Dennis Mitchell), ciclo de la
urea y ciclo de Krebs (Hans Adolf Krebs), as como otras rutas metablicas), se produce
toda una revolucin en el estudio de los genes y su expresin; se descifra el cdigo
gentico (Francis Crick,Severo Ochoa, Har Gobind Khorana, Robert W. Holley y Marshall
Warren Nirenberg), se descubren las enzimas de restriccin (finales de 1960, Werner
Arber, Daniel Nathans y Hamilton Smith), la ADN ligasa (en 1972, Mertz y Davis) y
finalmente en 1973 Stanley Cohen y Herbert Boyer producen el primer ser
vivo recombinante, naciendo as la ingeniera gentica, convertida en una herramienta
poderossima con la que se supera la frontera entre especies y con la que podemos obtener
un beneficio hasta ahora impensable.
De 1975 hasta principios del siglo XXI, comienza a secuenciarse el ADN (Allan
Maxam, Walter Gilbert y Frederick Sanger), comienzan a crearse las primeras industrias
biotecnolgicas(Genentech), se aumenta la creacin de frmacos y vacunas ms eficaces, se
eleva el inters por las inmunologa y las clulas madres y se descubre la
enzima telomerasa (Elizabeth Blackburn y Carol Greider). En 1989 se utiliza
la biorremediacin a gran escala en el derrame del petrolero Exxon Valdez en Alaska.
Se clonan los primeros seres vivos, se secuencia el ADN de decenas de especies y se
publica el genoma completo del hombre (Craig Venter, Celera Genomics y Proyecto
Genoma Humano), se resuelven decenas de miles de estructuras proteicas y se publican
en PDB, as como genes, en GenBank. Comienza el desarrollo de la bioinformtica y la
computacin de sistemas complejos, que se constituyen como herramientas muy poderosas
en el estudio de los sistemas biolgicos. Se crea el primer cromosoma artificial y se logra la
primera bacteria con genoma sinttico (2007, 2009, Craig Venter). Se fabrican las nucleasas
con dedos de zinc. Se inducen artificialmente clulas, que inicialmente no eran
pluripotenciales, a clulas madre pluripotenciales (Shin'ya Yamanaka). Comienzan a darse
los primeros pasos.

Ramas de la bioqumica

Esquema de una clula tpica animal con sus orgnulos y estructuras.

El pilar fundamental de la investigacin bioqumica clsica se centra en las propiedades

de las protenas, muchas de las cuales sonenzimas. Sin embargo, existen otras disciplinas
que se centran en las propiedades biolgicas
de carbohidratos (Glucobiologa)2 ylpidos (Lipobiologa)3
Por razones histricas la bioqumica del metabolismo de la clula ha sido intensamente
investigada, en importantes lneas de investigacin actuales (como el Proyecto Genoma,
cuya funcin es la de identificar y registrar todo el material gentico humano), se dirigen
hacia la investigacin del ADN, el ARN, la sntesis de protenas, la dinmica de
la membrana celular y los ciclos energticos.
Las ramas de la bioqumica son muy amplias y diversas, y han ido variando con el tiempo y
los avances de la biologa, la qumica y la fsica.

Bioqumica estructural: es un rea de la bioqumica que pretende comprender la

arquitectura qumica de las macromolculas biolgicas, especialmente de las protenas
y de los cidos nucleicos (DNA y RNA). As se intenta conocer las secuencias
peptdicas, su estructura y conformacin tridimensional, y las interacciones fsico-
qumicas atmicas que posibilitan a dichas estructuras. Uno de sus mximos retos es
determinar la estructura de una protena conociendo slo la secuencia de aminocidos,
que supondra la base esencial para el diseo racional de protenas (ingeniera de
protenas).

Qumica bioorgnica: es un rea de la qumica que se encarga del estudio de

los compuestos orgnicos (es decir, aquellos que tienen enlaces covalentes carbono-
carbono o carbono-hidrgeno) que provienen especficamente de seres vivos. Se trata
 de una ciencia ntimamente relacionada con la bioqumica clsica, ya que en la mayora
de los compuestos biolgicos participa el carbono. Mientras que la bioqumica clsica
ayuda a comprender los procesos biolgicos con base en conocimientos de estructura,
enlace qumico, interacciones moleculares y reactividad de las molculas orgnicas, la
qumica bioorgnica intenta integrar los conocimientos de sntesis orgnica,
mecanismos de reaccin, anlisis estructural y mtodos analticos con las reacciones
metablicas primarias y secundarias, la biosntesis, el reconocimiento celular y la
diversidad qumica de los organismos vivos. De all surge laQumica de Productos
Naturales (V. Metabolismo secundario).4

Enzimologa: estudia el comportamiento de los catalizadores biolgicos o enzimas,

como son algunas protenas y ciertos RNA catalticos, as como las coenzimas y
cofactores comometales y vitaminas. As se cuestiona los mecanismos de catlisis, los
procesos de interaccin de las enzimas-sustrato, los estados de transicin catalticos, las
actividades enzimticas, la cintica de la reaccin y los mecanismos de regulacin y
expresin enzimticas, todo ello desde un punto de vista bioqumico. Estudia y trata de
comprender los elementos esenciales del centro activo y de aquellos que no participan,
as como los efectos catalticos que ocurren en la modificacin de dichos elementos; en
este sentido, utilizan frecuentemente tcnicas como la mutagnesis dirigida.

Bioqumica metablica: es un rea de la bioqumica que pretende conocer los

diferentes tipos de rutas metablicas a nivel celular, y su contexto orgnico. De esta
forma son esenciales conocimientos de enzimologa y biologa celular. Estudia todas las
reacciones bioqumicas celulares que posibilitan la vida, y as como los ndices
bioqumicos orgnicos saludables, las bases moleculares de las enfermedades
metablicas o los flujos de intermediarios metablicos a nivel global. De aqu surgen
disciplinas acadmicas como laBioenergtica (estudio del flujo de energa en los
organismos vivos), la Bioqumica nutricional (estudio de los procesos
de nutricin asociados a rutas metablicas) 5 y la bioqumica clnica (estudio de las
alteraciones bioqumicas en estado de enfermedad o traumatismo).
La metabolmica es el conjunto de ciencias y tcnicas dedicadas al estudio completo
del sistema constituido por el conjunto de molculas que constituyen los intermediarios
metablicos, metabolitos primarios y secundarios, que se pueden encontrar en un
sistema biolgico.

Xenobioqumica: es la disciplina que estudia el comportamiento metablico de los

compuestos cuya estructura qumica no es propia en el metabolismo regular de un
organismo determinado. Pueden ser metabolitos secundarios de otros organismos (P.
ejemplo las micotoxinas, los venenos de serpientes y los fitoqumicos cuando ingresan
 al organismo humano) o compuestos poco frecuentes o inexistentes en la
naturaleza.6 La Farmacologa es una disciplina que estudia a los xenobiticos que
benefician al funcionamiento celular en el organismo debido a sus efectos teraputicos
o preventivos (Frmacos). La farmacologa tiene aplicaciones clnicas cuando las
sustancias son utilizadas en el diagnstico, prevencin, tratamiento y alivio de sntomas
de una enfermedad as como el desarrollo racional de sustancias menos invasivas y ms
eficaces contra dianas biomoleculares concretas. Por otro lado, la Toxicologa es el
estudio que identifica, estudia y describe, la dosis, la naturaleza, la incidencia, la
severidad, la reversibilidad y, generalmente, los mecanismos de los efectos adversos
(efectos txicos) que producen los xenobiticos. Actualmente la toxicologa tambin
estudia el mecanismo de los componentes endgenos, como los radicales libres de
oxgeno y otros intermediarios reactivos, generados por xenobiticos y endobiticos.

Inmunologa: rea de la biologa, la cual se interesa por la reaccin del organismo

frente a otros organismos como las bacterias y virus. Todo esto tomando en cuenta la
reaccin y funcionamiento del sistema inmune de los seres vivos. Es esencial en esta
rea el desarrollo de los estudios de produccin y comportamiento de los anticuerpos.

Endocrinologa: es el estudio de las secreciones internas llamadas hormonas, las

cuales son sustancias producidas por clulas especializadas cuyo fin es de afectar la
funcin de otras clulas. La endocrinologa trata la biosntesis, el almacenamiento y la
funcin de las hormonas, las clulas y los tejidos que las secretan, as como los
mecanismos de sealizacin hormonal. Existen subdisciplinas como la endocrinologa
mdica, la endocrinologa vegetal y la endocrinologa animal.

Neuroqumica: es el estudio de las molculas orgnicas que participan en la

actividad neuronal. Este trmino es empleado con frecuencia para referir a
los neurotransmisores y otras molculas como las drogas neuro-activas que influencian
la funcin neuronal.

Quimiotaxonoma: es el estudio de la clasificacin e identificacin de organismos

de acuerdo a sus diferencias y similitudes demostrables en su composicin qumica.
Los compuestos estudiados pueden ser fosfolpidos, protenas, pptidos, hetersidos,
alcaloides y terpenos. John Griffith Vaughan fue uno de los pioneros de la
quimiotaxonoma. Entre los ejemplos de las aplicaciones de la quimiotaxonoma
pueden citarse la diferenciacin de las familias Asclepiadaceae y Apocynaceae segn el
criterio de la presencia de ltex; la presencia deagarofuranos en la familia Celastraceae;
las sesquiterpenlactonas con esqueleto de germacrano que son caractersticas de la
familia Asteraceae o la presencia de abietanos en las partes areas de plantas del
 gnero Salvia del viejo Mundo a diferencia de las del Nuevo Mundo que presentan
principalmente neo-clerodanos.7

Ecologa qumica: es el estudio de los compuestos qumicos de origen biolgico

implicados en las interacciones de organismos vivos. Se centra en la produccin y
respuesta de molculas sealizadoras (semioqumicos), as como los compuestos que
influyen en el crecimiento, supervivencia y reproduccin de otros organismos
(aleloqumicos).

Virologa: rea de la biologa, que se dedica al estudio de los biosistemas ms

elementales: los virus. Tanto en su clasificacin y reconocimiento, como en su
funcionamiento y estructura molecular. Pretende reconocer dianas para la actuacin de
posibles de frmacos y vacunas que eviten su directa o preventivamente su expansin.
Tambin se analizan y predicen, en trminos evolutivos, la variacin y la combinacin
de los genomas vricos, que podran hacerlos eventualmente, ms peligrosos.
Finalmente suponen una herramienta con mucha proyeccin como vectores
recombinantes, y han sido ya utilizados en terapia gnica.

Gentica molecular e ingeniera gentica: es un rea de la bioqumica y la

biologa molecular que estudia los genes, su herencia y su expresin. Molecularmente,
se dedica al estudio del DNA y del RNA principalmente, y utiliza herramientas y
tcnicas potentes en su estudio, tales como la PCR y sus variantes, los secuenciadores
masivos, los kits comerciales de extraccin de DNA y RNA, procesos de transcripcin-
traduccin in vitro e in vivo, enzimas de restriccin, DNA ligasas Es esencial
conocer como el DNA se replica, se transcribe y se traduce a protenas (Dogma Central
de la Biologa Molecular), as como los mecanismos de expresin basal e inducible de
genes en el genoma. Tambin estudia la insercin de genes, el silenciamiento gnico y
la expresin diferencial de genes y sus efectos. Superando as las barreras y fronteras
entre especies en el sentido que el genoma de una especie podemos insertarlo en otro y
generar nuevas especies. Uno de sus mximos objetivos actuales es conocer los
mecanismos de regulacin y expresin gentica, es decir, obtener un cdigo
epigentico. Constituye un pilar esencial en todas las disciplinas biocientficas,
especialmente en biotecnologa.

Biologa Molecular: es la disciplina cientfica que tiene como objetivo el estudio de

los procesos que se desarrollan en los seres vivos desde un punto de vista molecular.
As como la bioqumica clsica investiga detalladamente los ciclos metablicos y la
integracin y desintegracin de las molculas que componen los seres vivos, la
Biologa molecular pretende fijarse con preferencia en el comportamiento biolgico de
 las macromolculas (ADN, ARN, enzimas, hormonas, etc.) dentro de la clula y
explicar las funciones biolgicas del ser vivo por estas propiedades a nivel molecular.

Biologa celular: (antiguamente citologa, de citos=clula y logos=Estudio o

Tratado ) es una rea de la biologa que se dedica al estudio de la morfologa y
fisiologa de las clulas procariotas y eucariotas. Trata de conocer sus propiedades,
estructura, composicin bioqumica, funciones, orgnulos que contienen, su interaccin
con el ambiente y su ciclo vital. Es esencial en esta rea conocer los procesos
intrnsecos a la vida celular durante el ciclo celular, como la nutricin, la respiracin, la
sntesis de componentes, los mecanismos de defensa, la divisin celular y la muerte
celular. Tambin se deben conocer los mecanismos de comunicacin de clulas
(especialmente en organismos pluricelulares) o las uniones intercelulares. Es un rea
esencialmente de observacin y experimentacin en cultivos celulares, que,
frecuentemente, tienen como objetivo la identificacin y separacin de poblaciones
celulares y el reconocimiento de orgnulos celulares. Algunas tcnicas utilizadas en
biologa celular tienen que ver con el empleo de tcnicas de citoqumica, siembra de
cultivos celulares, observacin por microscopa ptica y electrnica,
inmunocitoqumica, inmunohistoqumica, ELISA o citometra de flujo. Est
ntimamente ligada a disciplinas como histologa, microbiologa o fisiologa.

Tcnicas bioqumicas bsicas

Al ser una ciencia experimental la bioqumica requiere de numerosas tcnicas
instrumentales que posibilitan su desarrollo y ampliacin, algunas de ellas se usan
diariamente en cualquier laboratorio y otras son muy exclusivas.

Fraccionamiento subcelular, incluyen multitud de tcnicas.

Espectrofotometra

Centrifugacin

Cromatografa

Electroforesis

Tcnicas radioisotpicas

Citometra de flujo
 Inmunoprecipitacin

ELISA

Microscopio electrnico

Cristalografa de rayos X

Resonancia magntica nuclear

Espectrometra de masas

Fluorimetra

Espectroscopia de resonancia magntica nuclear

Expectativas y retos de la bioqumica

La bioqumica es una ciencia experimental que tiene un presente y un futuro prometedor, en
el sentido, que se yergue como base de la biotecnologa y la biomedicina.
La bioqumica es bsica para la formacin de organismos y alimentos transgnicos, la
biorremediacin o la terapia gnica, y se constituye como faro y esperanza de los grandes
retos que plantea el siglo XXI. No cabe duda de que los cambios que traer, beneficiarn
enormemente a la humanidad, pero el hecho intrnseco de ser un conocimiento tan poderoso
lo puede hacer peligroso, en este sentido es importante reas como la biotica que regulan
la moralidad y guan el conocimiento biolgico hacia el beneficio humano sin
transgresiones morales.
El conocimiento bioqumico tiene grandes objetivos como progresar en la terapia gnica,
por ejemplo contra el cncer o el VIH, desarrollar alimentos transgnicos ms eficientes,
resistentes, seguros y saludables, aplicar los conocimientos bioqumicos a la lucha contra el
cambio climtico y la extincin de especies, generar nuevos frmacos ms eficientes,
investigar y buscar dianas de las enfermedades, conocer los patrones de expresin gnica,
generar nuevos materiales, mejorar la eficiencia de la produccin industrial

Importantes bioqumicos espaoles

Severo Ochoa

Eladio Viuela

Margarita Salas
 Mara Antonia Blasco Marhuenda

Mariano Barbacid

Jess vila de Grado