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de la morfologa
canina
El estudio del genoma canino revela el modo en que pequeos cambios genticos
originan grandes diferencias morfolgicas en el seno de una misma especie
Elaine A. Ostrander
U
n pequins pesa apenas un kilogramo; En las etapas iniciales del proyecto sobre
un San Bernardo puede superar los 80 el genoma del perro se elaboraron mapas que
kilogramos. Ambos perros, aunque de habran de guiar la exploracin del genoma en
aspecto sumamente distinto, pertenecen a la cuestin. Se allegaron recursos que facilitaron
misma especie: Canis familiaris. Cmo se ex- la manipulacin de extensos fragmentos de
plica esa enorme variabilidad interracial y, al ADN canino y la numeracin de sus 38 pares
propio tiempo, la tenaz conformidad que se de autosomas (cromosomas no sexuales), as
observa dentro de una misma raza? Esa sencilla como de los cromosomas X e Y. Por n, en
observacin se ha convertido en una cuestin 2003, se obtuvo una secuencia parcial de un
CONCEPTOS BASICOS fundamental para los genticos expertos en caniche estndar que comprenda casi el 80
El grado de variacin mamferos. por ciento de los 2800 millones de pares de
morfolgica observado El proyecto genoma canino, emprendi- bases que forman el genoma del perro. No
en el perro sobrepasa el do a principios de los aos noventa del siglo tard en secuenciarse el genoma del bxer,
de todos los mamferos pasado, se propona identicar los genes que que dio lugar a lo que se considera hoy la
terrestres actuales. contribuan a las enfermedades que sufran los secuencia canina de referencia.
La secuenciacin del ge-
perros de raza pura. La mayora de las razas La existencia de un borrador de alta calidad
noma canino ha facilitado caninas existen desde hace escasos siglos. Exhi- para el genoma canino ha cambiado la forma
la identicacin de los ben una diversidad gentica limitada, ya que de trabajar de los genticos. Antes utilizaban
genes que determinan las suelen descender de un nmero reducido de el criterio del gen candidato para determinar
diferencias interraciales fundadores, obtenidos mediante el cruzamien- los genes responsables de una enfermedad o
en cuanto al tamao, for- to de individuos estrechamente emparentados de un rasgo de inters. Segn ese criterio, si
ma y aspecto del cuerpo. entre s. Adems, las razas experimentan a me- conocemos parte de la funcin de un gen o
nudo cuellos de botella, asociados al aumento a qu familia pertenece, podremos, a buen
Los conocimientos genti-
y disminucin de su popularidad. Por culpa seguro, estimar las consecuencias de la dis-
cos tambin han arrojado
de esa estructura poblacional, las enfermedades funcin del gen. Pero ese planteamiento, de
luz sobre la denicin del
concepto de raza. Existen
genticas afectan con mayor frecuencia a los coste elevado, est abocado con frecuencia al
ms de 150 razas caninas; perros de raza pura que a los de raza mixta. fracaso. De ah que los genticos de animales
exhiben una diversidad Los cientcos utilizan poblaciones caninas de compaa opten por estrategias genmicas
gentica limitada, ya que para determinar la base gentica de las en- ms renadas, adquiridas tras el xito del pro-
provienen del cruzamiento fermedades que afectan a humanos y perros: yecto genoma canino.
de individuos estrecha- cncer, sordera, epilepsia, diabetes, cataratas La aplicacin de los nuevos recursos exige
mente emparentados y cardiopatas, entre otras. Una estrategia que un conocimiento profundo de la estructura
entre s. benecia simultneamente al ser humano y a de la raza, la solidez y las limitaciones de las
su mejor amigo. tcnicas moleculares actuales, junto con la con-
or
slo por el aspecto del perro, sino tambin a ADN hasta un tamao manejable de un milln 3. LOS MARCADORES MOLECU-
partir del genoma. aproximado de bases. Una vez acotada una LARES acotan la variabilidad
En una segunda etapa de la investigacin, regin, se empiezan a seleccionar genes candi- del genoma. Se aplican a la
aplicamos una prueba de asignacin para eva- datos para la contrastacin de mutaciones. identicacin de los genes
luar la posibilidad de identicar la raza de un responsables de determinados
perro en razn de su perl gentico, en exclu- Secuenciacin del genoma canino rasgos. En el caso de los perros,
siva. En un estudio ciego (donde el programa La primera secuencia del genoma canino se se han aplicado a la denicin
informtico desconoca la procedencia racial public en 2003, tarea liderada por Ewen de raza. Los marcadores que
permiten averiguar la herencia
de los datos), el 99 por ciento de los perros Kirkness, del estadounidense Instituto de
de segmentos de ADN cromo-
recibi una asignacin racial correcta, fundada Investigacin Genmica. Los genomas se se-
smico corresponden a las
en su perl de ADN, sin ms. cuencian en miles de segmentos traslapantes.
repeticiones microsatlites (iz-
Para examinar la relacin ancestral entre Para asegurarse de que se registra el genoma quierda) y a los polimorsmos
las razas, Heidi Parker, de nuestro laboratorio, entero por lo menos una vez, deben realizarse de un solo nucletido (derecha).
utiliz los datos del mismo conjunto de perros siete u ocho iteraciones, o lecturas, de todo Una repeticin microsatlite
y se aprest a determinar qu razas caninas el genoma. podra corresponder a un par
guardaban mayor parentesco mutuo. Para ello, El genoma de 2003, procedente de un ca- de nucletidos (indicados aqu
empleamos el programa informtico structure, niche estndar, corresponda a una secuencia mediante letras); los marcado-
desarrollado por el equipo de Jonathan Prit- de sondeo; se secuenci slo 1,5 veces, de res basados en repeticiones CA
chard, de la Universidad de Chicago. El pro- modo que los datos nales comprendan cerca son comunes. En este ejemplo,
grama identica las subpoblaciones genticas del 80 por ciento del genoma. A ese trabajo le el dinucletido se reitera 8, 9 y
dentro de un grupo, a partir de los patrones sigui la publicacin del borrador del genoma 13 veces en diversas posiciones
de las frecuencias allicas, que se suponen de- del bxer, con una redundancia de 7,5x. El del genoma. Se produce un
rivadas de un acervo gnico comn. proyecto lo dirigieron Kerstin Lindblad-Toh polimorsmo de un solo nu-
El anlisis inicial de structure orden las 85 y sus colaboradores, del Instituto Broad. Tras cletido (PNS) cuando el mismo
razas en cuatro grupos logenticos, generando millones de lecturas exitosas, la versin nal fragmento de ADN vara de una
un nuevo sistema de clasicacin canina. El incluye casi el 99 por ciento del genoma. copia de un cromosoma a otra
primer grupo comprende los perros de origen Ambas secuenciaciones han resultado su- en un nico nucletido.
asitico y africano (los linajes ms antiguos), mamente tiles. La secuencia determinada
as como los lobos. El segundo grupo abarca con una redundancia de 1,5x permiti vis-
los perros de tipo mastn, con cabeza grande lumbrar la organizacin del genoma canino,
y cuadrada y cuerpo voluminoso y robusto. El el nmero de genes y la disposicin de los
tercer grupo corresponde a los perros pastores elementos de repeticin. Constituy toda una
y lebreles. El cuarto a terriers, galgos y otros sorpresa encontrarse con una cifra elevada de
cazadores modernos. A medida que se han elementos nucleares cortos dispersos (SINE,
aadido ms razas caninas al estudio, han ido de short interspersed nuclear element), re-
emergiendo nuevos grupos. partidos por todo el genoma, que en ocasiones
Esos datos son extremadamente tiles para se alojaban en posiciones con capacidad de
los estudios de cartografa gentica de las en- alterar la expresin gnica. Por ejemplo, la
fermedades. En algunos casos, se analizan de insercin de un SINE en el gen que codica
BARBARA AULICINO/American Scientist
forma simultnea los perros de las razas que el receptor de la hipocretina (hormona neuro-
pertenecen al mismo grupo, para aumentar el pptido que se halla en el hipotlamo) provoca
valor estadstico del estudio. Ello facilita no narcolepsia en el dobermann pinscher. De
slo la identicacin de las regiones genmicas modo semejante, un SINE insertado en el
donde se reside el gen de la enfermedad, sino gen SILV (relacionado con la pigmentacin)
tambin los estudios de cartografa na que se es responsable del merle, el patrn moteado
proponen reducir la regin de ligamiento de del pelaje de un perro.
Malamute de Alaska
Basenji mediante un programa informtico, las distintas
Shar-pei subpoblaciones genticas dentro de un grupo
Husky siberiano de 85 razas de perro. Las razas se dividieron en
Galgo afgano
Saluki cuatro grupos segn la dominancia de un conjun-
Terrier tibetano to especco de alelos (barra vertical). El primer
Lhasa apso grupo abarca perros de origen asitico y africano,
Samoyedo
Pequins que se piensa corresponden a los linajes ms
Shih-tzu antiguos (amarillo). El segundo grupo comprende
Lebrel irlands los perros pastores y lebreles (verde), mientras
San Bernardo
que el tercero incluye cazadores modernos como
Perros pastores
Galgo ingls
Pastor belga los terriers y los galgos (naranja). El cuarto grupo
Pastor belga tervuren contiene, sobre todo, perros de tipo mastn, con
Borzoi, galgo ruso
Collie cabeza poderosa y cuadrada, y cuerpo grande y
Pastor de Shetland robusto (azul). (Los puntos que aparecen junto a
Carlino, pug los nombres de la raza corresponden, de arriba a
Komondor
Whippet abajo, a las ilustraciones de la derecha.)
Caniche estndar
Bichn de pelo rizado
Keeshond
Terrier de Manchester La secuencia de la hembra bxer, obtenida
Elkound noruego con una redundancia de 7,5x, abarca la ma-
Kubasz
Gran dans, dogo alemn yora de los 2400 millones de bases en una
Springer spaniel gals suma total de 31,5 millones de iteraciones de
Doberman pinscher secuencias. Se estima que la secuencia cubre
Schnauzer estndar
Galgo italiano ms del 99 por ciento del genoma eucariota;
Antiguo pastor ingls, bobtail describe alrededor de 19.000 genes. En un
Perro de agua americano
Schnauzer enano 75 por ciento de los genes, es elevada la ho-
Terrier australiano mologa (grado de semejanza atribuido a la
Perros modernos/cazadores
Bullmastiff
Terranova Con otros grupos de investigacin nos hemos
Pastor alemn venido interesando durante varios aos por la
Bulldog francs identicacin de los genes que determinan las
Bull terrier enano
Bulldog diferencias interraciales en punto al tamao,
Bxer forma y aspecto corporales. Las razas caninas
Mastn ingls
Boyero de montaa berns varan no slo en el tamao general del cuer-
Gran boyero suizo po, sino tambin en la longitud, forma de la
Podenco ibicenco
Peso
5. CUANDO SE CARACTERIZA
cabeza y otros rasgos, todos ellos controla- de maniesto la existencia de 44 supuestos
UNA RAZA CANINA por sus
dos genticamente por lo menos en parte. El locus de caracteres cuantitativos (LCC) en
rasgos fsicos, suele utilizarse
grado de variacin morfolgica observado en 22 cromosomas que determinan el fenotipo la altura promedio del perro
el perro sobrepasa el de todos los mamferos esqueltico del perro de agua portugus. Los desde la cruz respecto al peso
terrestres actuales. LCC se deducen a partir de anlisis estads- promedio de los machos de la
El primer estudio molecular importante ticos complejos; indican los sitios del genoma raza en cuestin. Ese cociente
sobre la base gentica de la morfologa cani- que contribuyen, coordinados, a la formacin representa una relacin entre
na lo llevaron a cabo Gordon Lark y Kevin de un rasgo concreto. Reviste especial inte- velocidad y fuerza: los perros
Chase, de la Universidad de Utah. El proyecto rs CFA15, un locus del cromosoma 15 que con un cociente elevado entre
Georgie (denominado as en memoria de un mostr una tenaz asociacin con el tamao altura y peso (azul) tienden a
perro mascota) se centr en el perro de agua corporal. Aunque existen otros seis locus rela- presentar extremidades largas
portugus. Dicha raza resulta muy adecuada cionados con el tamao corporal canino, nos y delgadas, mientras que los
para ese tipo de estudios, pues deriva de un centramos inicialmente en CFA15 debido a la perros ms pesados tienen
nmero limitado de fundadores procedentes en fuerza de su efecto y a su proximidad a un huesos ms gruesos (verde).
su mayora de dos perreras, que llegaron a los gen candidato de inters. Ese es uno de los componentes
EE.UU. a principios de los aos cincuenta. Para encontrar el gen en CFA15, se busca- principales, o grupos de rasgos
El estndar de la raza admite un grado no- ron los PNS en una regin de 15 millones de correlacionados entre s, que se
table de variabilidad en el tamao corporal, pares de bases; se cre, luego, el genotipo del utilizan en el estudio de los fac-
si lo comparamos con otras razas. Apoyan el conjunto de marcadores resultante en todos tores genticos que controlan la
proyecto dueos y criadores que se han pro- los perros de agua portugueses de los que se variacin morfolgica entre las
puesto mejorar el vigor de la raza mediante dispona informacin sobre el tamao. La dis- razas caninas.
la colaboracin con los cientcos. tribucin de esos marcadores exhibi un solo
Hasta la fecha, se han recogido muestras de pico cerca del gen del factor de crecimiento
BARBARA AULICINO Y LINDA HUFF; ADAPTADO DE PARKER Y OSTRANDER 2005/American Scientist
CORTESIA DE KEVIN CHASE (fotograas y datos de la grca); ADAPTADO DE CHASE ET AL. 2005 (grca)/American Scientist
15 interacta con otro locus en portugus presentan un tamao un 15 por
el cromosoma X para aumentar Dimorsmo sexual ciento inferior al de los machos. Chase, Lark
el tamao de los machos y dis- El proyecto Georgie destaca por el nmero de y sus colaboradores sealaron que en las hem-
minuir el de las hembras. En los supuestos loci que se descubrieron en el anli- bras existe un haplotipo especco dominante
machos es dominante el haplo-
tipo (conguracin allica) A,
asociado a un tamao corporal
importante. En las hembras es
dominante el haplotipo B, que
se asocia a un tamao corporal
chico. Segn las reglas clsicas
de la herencia, los machos Macho AB
homocigticos AA (con el alelo
A en ambas copias de sus cro- Macho AA
rango
ce mediante una inhibicin de los principales mutante. Esos hallazgos no resultaron del todo en el Laboratorio Nacional
genes estimuladores del crecimiento, como el sorprendentes, puesto que el fenotipo mus- Lawrence de Berkeley, en el
locus de CFA15. culoso del whippet guardaba semejanza con Proyecto del Genoma Humano
fenmenos observados en ratones, vacunos, y en el Centro Fred Hutchinson
de Investigaciones Oncolgi-
Perros ms veloces ovejas y en un solo caso humano, causados cas, donde dirigi el programa
Las investigaciones mencionadas y otras todos ellos por una mutacin en el gen de la de gentica.
similares se centran en rasgos complejos o miostatina. Sin embargo, la versin canina de American Scientist Magazine.
multignicos. Pero el estudio de la morfolo- esa mutacin revesta particular inters para