Conjunto base de mol

eculas optimizaci
on funci
on de onda Cubos de propiedades Summary

Protocolo para el calculo de

moleculas
Feromonas de la familia curculionidae

Nicolas J. Bautista H.

Grupo de Qumica Teorica

Universidad Nacional de Colombia

Seminario I 2017-I
Conjunto base de mol
eculas optimizaci
on funci
on de onda Cubos de propiedades Summary

Proceso

1 culas
Conjunto base de mole
Seleccion de moleculas
Generar archivos.mol
2 n
optimizacio
mecanica molecular
mecanica cuantica
3 n de onda
funcio
archivo .chk
formato del .chk para calculos
4 Cubos de propiedades
algoritmo de calculo de la propiedad
calculo del cubo
lectura del cubo
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on funci
on de onda Cubos de propiedades Summary

Proceso

1 culas
Conjunto base de mole
Seleccion de moleculas
Generar archivos.mol
2 n
optimizacio
mecanica molecular
mecanica cuantica
3 n de onda
funcio
archivo .chk
formato del .chk para calculos
4 Cubos de propiedades
algoritmo de calculo de la propiedad
calculo del cubo
lectura del cubo
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n de mole
Seleccio culas

Para la seleccion del conjunto base de moleculas se tomaron

aquellas que:
Sean componentes de las feromonas de agregacion.
Feromonas de agregaci on reportadas de las especies que
pertenecen a la familia curculionidae.
Moleculas con una estructura definida.
Estas feromonas reportadas se pueden encontrar mediante una
revision bibliografica o en una base de datos de feromonas
como Pherobase http://www.pherobase.com .
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n de mole
Seleccio culas

Una vez seleccionada la molecula en la feromona se procedera

a llenar una base de datos donde las moleculas tomaran la
clave XXX que corresponde a un numero de tres dgitos que
sera asignado acorde al orden de entrada. acore
Siendo de esta manera la primera molecula en ser ingresada
tomara la clave 001; en la base de datos estara la mayor
informacion de la molecula desde su numero CAS, formula
molecular, fuente, etc...
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Proceso

1 culas
Conjunto base de mole
Seleccion de moleculas
Generar archivos.mol
2 n
optimizacio
mecanica molecular
mecanica cuantica
3 n de onda
funcio
archivo .chk
formato del .chk para calculos
4 Cubos de propiedades
algoritmo de calculo de la propiedad
calculo del cubo
lectura del cubo
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Generar archivos.mol

Los archivos con la extensi

on .mol son archivos de texto los cuales
guardan la geometra y conectividad de los atomos en la molecula.
Estos archivos .mol se pueden descargar de paginas como
http://www.chemspider.com u otras bases de datos.
En caso de no encontrar la molecula en la base de datos se
puede dibujar en un editor como gabedit, avogadro,
ChemDraw3D, etc...
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Generar archivos.mol

En caso de tener que dibujar la molecula en un editor como

gabedit se debe presionar el bot
on de edicion y al finalizar dar
clic derecho sobre la fondo negro y seleccionar la opcion de
guardar como .mol file.
Se guardara con el nombre MXXX.mol donde el XXX es la
clave numerica asignada en la molecula en la base de datos.
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Seleccion de moleculas
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2 n
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3 n de onda
funcio
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formato del .chk para calculos
4 Cubos de propiedades
algoritmo de calculo de la propiedad
calculo del cubo
lectura del cubo
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lectura del cubo
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Blocks

Block Title
You can also highlight sections of your presentation in a block,
with its own title

Theorem
There are separate environments for theorems, examples,
definitions and proofs.

Example
Here is an example of an example block.
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Summary

The first main message of your talk in one or two lines.

The second main message of your talk in one or two lines.
Perhaps a third message, but not more than that.

Outlook
Something you havent solved.
Something else you havent solved.
Appendix

For Further Reading I

A. Author.
Handbook of Everything.
Some Press, 1990.
S. Someone.
On this and that.
Journal of This and That, 2(1):50100, 2000.