El 2 de mayo de 1519 muri en Cloux; su testamento legaba a Melzi todos sus
libros, manuscritos y dibujos, que el discpulo se encarg de retornar a Italia.
Como suele suceder con los grandes genios, se han tejido en torno a su muerte algunas leyendas; una de ellas, inspirada por Vasari, pretende que Leonardo, arrepentido de no haber llevado una existencia regida por las leyes de la Iglesia, se confes largamente y, con sus ltimas fuerzas, se incorpor del lecho mortuorio para recibir, antes de expirar, los sacramentos.